Caracterização abrangente de pequeno RNA em portadores de HTLV-1 assintomáticos e doentes, com ATLL e HAM/TSP

• Ano de defesa: 2017
• Autor(a) principal: Souza, Daniela Raguer Valadão de [UNIFESP]
• Orientador(a): Sanabani, Sabri Saeed Mohammed Ahmed Al [UNIFESP]
• Tipo de documento: Tese
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• dARK ID: ark:/48912/001300001p9q9
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
• Palavras-chave em Português: HTLV-1; ATLL; HAM; TSP; smRNA; Sequenciamento segunda geração; Paraparesia espástica tropical
• Palavras-chave em Inglês: HTLV-1; ATLL; HAM; TSP; smRNA; Second generation sequencing; Paraparesis, tropical spastic
• Link de acesso: https://sucupira.capes.gov.br/sucupira/public/consultas/coleta/trabalhoConclusao/viewTrabalhoConclusao.jsf?popup=true&id_trabalho=5249700; https://repositorio.unifesp.br/handle/11600/50770

O vírus da leucemia de células T humanas de tipo I (HTLV-1) é o agente etiológico de um espectro de manifestações clínicas, variando de infecção assintomática a uma série de distúrbios em humanos. Duas são mais notáveis, uma doença maligna, a leucemia / linfoma de células T adultas (ATLL), e outra uma desordem neurológica crônica, a mielopatia associada ao HTLV-1 / paraparesia espástica tropical (HAM / TSP). Pequenos RNAs (sRNA) não codificantes evoluíram para desempenhar papéis importantes nas interações vírus-hospedeiro. No presente estudo, utilizamos a abordagem massiva de sequenciamento paralelo (MPS) para investigar a expressão característica do sRNA durante o desenvolvimento de ATLL e HAM/TSP em pacientes infectados com HTLV-1 e identificar genes de sRNA conhecidos e novos residentes em células mononucleares do sangue periférico (PBMCs). De forma a realizar um perfil imparcial de sRNA, 44 amostras de indivíduos infectados por HTLV-1, previamente conhecidos em termos de clonalidade e carga proviral (PVL), foram submetidas à análise. Os participantes foram categorizados em quatro grupos: portadores assintomáticos policlonais (ACs-P) (n=8), portadores assintomáticos monoclonais (ACs-M) (n=8), doentes com HAM/TSP (n=16) e doentes com ATLL (n=12). A estratégia de análise envolveu a comparação do grupo de assintomáticos policlonais com os demais grupos, a saber (ACs-P vs ACs-M), (ACs-P vs HAM/TSP) e (ACs-p vs ATLL). Nos grupos ACs-P vs ACs-M apenas um miRNA (miRNA 33a-5p) mostrou-se significativamente regulado para baixo (p<0,001). Nos grupos ACs-P vs HAM/TSP, 15 sRNAs apresentaram-se significativamente desregulados (p<0,001), 11 foram regulados para baixo e 4 regulados para cima. Os cinco melhores sRNAs mais expressivos foram os miRNAs 651, 151b, 154-3p, 18b-5p e 539-3p. Nos grupos ACs-P vs ATLL, 27 sRNAs mostraram-se significativamente desregulados (p<0,001), 16 regulados para baixo e 11 regulados para cima. Os 5 principais sRNAs mais significativamente e diferencialmente expressos foram os miRNAs 577, 3194-5p, 4772-5p, 296-5p e 3934-5p. A maioria dos miRNAs aqui apresentados já é descrita como envolvido em outros processos oncológicos, no entanto, apenas o miR-1 já fora relacionado à infecção pelo HTLV-1. Uma análise mais aprofundada da expressão desses 4 grupos revelou um perfil de expressão caracteristicamente único e muito significativo em pacientes com ATLL na forma leucêmica aguda. Acredita-se que os 10 seguintes possíveis biomarcadores desempenham um papel importante na progressão da doença para a forma leucêmica aguda: miRNAs 3200-3p, 732-5p, 3688-3p, 3200-5p, 183-5p, 144-5p, 296-5p, 451a , 577 e 193a-5p. Destes miRNAs, sugere-se que o cluster mir-144-451 esteja intimamente envolvido na patogênese da ATLL. Além disso, sua alta expressão em ATLL aguda pode ser usada como um potencial biomarcador para diagnóstico da doença. Este estudo caracterizou o pequeno RNA em PBMCs de pacientes com HTLV-1 em diferentes contextos clínicos usando a tecnologia MPS pela primeira vez, o que proporciona uma oportunidade para uma maior compreensão da função de regulação de sRNA durante o curso da infecção pelo HTLV-1. Os pequenos RNAs aqui descritos podem servir como biomarcadores ou alvos terapêuticos no futuro.