Caracterização energética e estrutural da interação DNA-cisplatina pela teoria do funcional da densidade
| Ano de defesa: | 2007 |
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| Tipo de documento: | Dissertação |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Universidade Federal de Uberlândia
BR Programa de Pós-graduação em Física Ciências Exatas e da Terra UFU |
| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
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| Departamento: |
Não Informado pela instituição
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| País: |
Não Informado pela instituição
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| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | https://repositorio.ufu.br/handle/123456789/15679 |
Resumo: | Study of the DNA-cisplatin system using the Density Functional Theory(DFT), compares the eficiency of the correlation and exchange functionals LDA and GGA (PBE) in the simulation of the nitrogen bases as well as the basis sets DZP and DZ. Taking DZP and LDA options and with the use of the norm-conserved pseudopotentials Ceperley-Alder, simulate the sistems; cisplatina, isolated DNA bases, pairs of bases, DNA fragment with two pairs of bases GG and on the DNA-ciplatin system attached in GG and GA bases. It presents script of execution for the gradual approach of the real structure of the DNA. Reedits for these structures facts established in scientific literature, as it presents new facts for the electronic distribution of the DNA. Argues based in the interaction of dipoles between cisplatin and DNA, the existence of a potential barrier that restricts the possibility of the bond for the case of the linking in sequence GA of the DNA. |
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Caracterização energética e estrutural da interação DNA-cisplatina pela teoria do funcional da densidadeTeoria do funcional da densidadeAproximação de densidade localAproximação de gradiente generalizadoDNACisplatinaDensity functional theoryLocal density approximationGeneralized gradient approximationCisplatinCNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::FISICAStudy of the DNA-cisplatin system using the Density Functional Theory(DFT), compares the eficiency of the correlation and exchange functionals LDA and GGA (PBE) in the simulation of the nitrogen bases as well as the basis sets DZP and DZ. Taking DZP and LDA options and with the use of the norm-conserved pseudopotentials Ceperley-Alder, simulate the sistems; cisplatina, isolated DNA bases, pairs of bases, DNA fragment with two pairs of bases GG and on the DNA-ciplatin system attached in GG and GA bases. It presents script of execution for the gradual approach of the real structure of the DNA. Reedits for these structures facts established in scientific literature, as it presents new facts for the electronic distribution of the DNA. Argues based in the interaction of dipoles between cisplatin and DNA, the existence of a potential barrier that restricts the possibility of the bond for the case of the linking in sequence GA of the DNA.Mestre em FísicaEstudo do sistema DNA-cisplatina usando a teoria do funcional da densidade (DFT) compara a eficiência dos funcionais de correlação e troca LDA e GGA(PBE) na simulação das bases nitrogenadas como também os conjuntos de base DZP e DZ. Fazendo as opções DZP e LDA e com a utilização de pseudopotenciais Ceperley-Alder de norma conservada executa cálculos de simulação da cisplatina, bases isoladas, pares de bases, fragmento de DNA com dois pares de bases GG e do sistema DNA-ciplatina ligada em conjunto de bases GG e AG. Apresenta roteiro de execução para a gradual aproximação da estrutura de fato do DNA. Reedita para essas estruturas resultados estabelecidos na literatura científica, como apresenta novos resultados para a distribuição eletrônica do DNA. Apresenta argumenta ção, baseada na interação de dipolos entre cisplatina e DNA para a existência de uma barreira de potencial que restringe a possibilidade da ligação para o caso da ligação na sequencia guanina-adenina do DNA.Universidade Federal de UberlândiaBRPrograma de Pós-graduação em FísicaCiências Exatas e da TerraUFUTakahashi, Eduardo Kojyhttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4787968U8Barbosa Neto, Newton Martinshttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4794204Y8Santos, Helio Ferreira doshttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4723841J5Paiva, Humberto Alencar de2016-06-22T18:43:14Z2007-11-292016-06-22T18:43:14Z2007-06-12info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfapplication/pdfPAIVA, Humberto Alencar de. Caracterização energética e estrutural da interação DNA-cisplatina pela teoria do funcional da densidade. 2007. 99 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Exatas e da Terra) - Universidade Federal de Uberlândia, Uberlândia, 2007.https://repositorio.ufu.br/handle/123456789/15679porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFUinstname:Universidade Federal de Uberlândia (UFU)instacron:UFU2017-07-11T11:08:17Zoai:repositorio.ufu.br:123456789/15679Repositório InstitucionalONGhttp://repositorio.ufu.br/oai/requestdiinf@dirbi.ufu.bropendoar:2017-07-11T11:08:17Repositório Institucional da UFU - Universidade Federal de Uberlândia (UFU)false |
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