Variabilidade dos genes HLA-DOA e HLA-DOB: polimorfismos, haplótipos e aspectos evolutivos

• Ano de defesa: 2024
• Autor(a) principal: Silva, Isabelle Mira da [UNESP]
• Orientador(a): Castelli, Erick da Cruz [UNESP]
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Estadual Paulista (Unesp)
• Palavras-chave em Português: HLA-DOA e HLA-DOB; Imunogenética; NGS; Populações humanas; Alelos novos
• Link de acesso: https://hdl.handle.net/11449/259958

Os genes HLA-DOA e HLA-DOB codificam as duas subunidades que compõem a molécula HLA-DO, responsáveis por mediar o processamento e carregamento de antígenos em moléculas HLA de classe II. Estes genes exibem menor polimorfismo em comparação com outros genes HLA. No entanto, estes polimorfismos podem influenciar significativamente a suscetibilidade à infecções por patógenos e ao desenvolvimento de doenças autoimunes. Em nosso estudo, avaliamos 5.349 amostras de diferentes populações ao redor do mundo, incluindo o Brasil. Utilizamos um pipeline de bioinformática direcionado para a avaliação de genes HLA, o que nos permitiu caracterizar a diversidade genética observada nos genes HLA-DOA e HLA-DOB e encontrar variantes até então desconhecidas. Apesar de levantados, os alelos relacionados aos genes foram pouco frequentes e restritos a determinadas regiões biogeográficas, como por exemplo o DOA*01:01:11 e DOB*01:03:01 presente no continente africado, europeu e americano (sul e norte). Adicionalmente, avaliamos os perfis de frequência alélica para cada região biogeográfica. Além disso, mesmo incluindo dados de população brasileira (miscigenadas), esses genes apresentaram-se bastante conservados, principalmente à nível de isoformas proteicas, sendo para ambos a presença majoritária de DOA*01:01 e DOB*01:01. Mas além disso, em termos de sequência (de DNA e da proteína codificada) quando comparados aos genes vizinhos, possivelmente devido a forças evolutivas mantendo a estrutura da molécula HLA-DO devido à sua importante função.