Análise das relações entre gêneros da subfamília neoplecostominae (Siluriformes: Loricariidae) com base em sequências de DNA

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2010
Autor(a) principal: Roxo, Fábio Fernandes [UNESP]
Orientador(a): Oliveira, Claudio de [UNESP], Zawadzki, Claudio Henrique [UNESP]
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Peixe - Genetica
Filogenia
Link de acesso: http://hdl.handle.net/11449/92430
Resumo: Estudos morfológicos e moleculares direcionados a indivíduos da família Loricariidae, popularmente conhecidos com cascudos, têm revelado incertezas nos padrões de relacionamentos de algumas de suas subfamílias. Baseado nestes questionamentos foi realizado uma análise filogenética incluindo representantes de todos os gêneros da subfamília Neoplecostominae. Tal análise, baseada em Máxima Parcimônia, Análise Bayesiana e Análise de Distancia Genética (Neighbor-joining) foi executada em uma matriz de 4676 caracteres com sequências parciais dos genes COI, CytB, 16S rRNA, 12S rRNA e F-4 Reticulon. Nesta matriz 1155 caracteres apresentaram-se informativos nas análises de parcimônia. Como grupos externos foram utilizadas as espécies Hemipsilichthys gobio e Hemipsilichthys papilatus, subfamília Delturinae, amostras de Hypostomus nigromaculatus (subfamília Hypostominae), Hypoptopoma inexpectatum (subfamília Hypoptopomatinae) e Corumbataia cuestae (subfamília Otothyrinae). Segundo proposta recente de relações na família Loricariidae o gênero Pseudotocinclus foi incluído nas análises. Os resultados mostraram que a subfamília Neoplecostominae é monofilética, com sua atual composição, incluindo Pseudotocinclus. Três subgrupos foram reconhecidos no grupo interno. O primeiro é formado pelas espécies Pareiorhina carrancas, uma nova espécie de Pareiorhina (Pareiorhina sp. 1), um novo gênero de Neoplecostominae e as espécies do gênero Neoplecostomus exceto Neoplecostomus ribeirensis. O segundo pelos gêneros...
id UNSP_b4aa629fb94ec099fb03cabfa91be303
oai_identifier_str oai:repositorio.unesp.br:11449/92430
network_acronym_str UNSP
network_name_str Repositório Institucional da UNESP
repository_id_str
spelling Roxo, Fábio Fernandes [UNESP]Universidade Estadual Paulista (Unesp)Benine, Ricardo CardosoLangeani Neto, FranciscoOliveira, Claudio de [UNESP]Zawadzki, Claudio Henrique [UNESP]2014-06-11T19:26:02Z2014-06-11T19:26:02Z2010-02-25ROXO, Fábio Fernandes. Análise das relações entre gêneros da subfamília neoplecostominae (Siluriformes: Loricariidae) com base em sequências de DNA. 2010. 69 f. Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual Paulista, Instituto de Biociências de Botucatu, 2010.http://hdl.handle.net/11449/92430000627247roxo_ff_me_botib.pdf33004064026P902974198821611140000-0002-4143-7212Estudos morfológicos e moleculares direcionados a indivíduos da família Loricariidae, popularmente conhecidos com cascudos, têm revelado incertezas nos padrões de relacionamentos de algumas de suas subfamílias. Baseado nestes questionamentos foi realizado uma análise filogenética incluindo representantes de todos os gêneros da subfamília Neoplecostominae. Tal análise, baseada em Máxima Parcimônia, Análise Bayesiana e Análise de Distancia Genética (Neighbor-joining) foi executada em uma matriz de 4676 caracteres com sequências parciais dos genes COI, CytB, 16S rRNA, 12S rRNA e F-4 Reticulon. Nesta matriz 1155 caracteres apresentaram-se informativos nas análises de parcimônia. Como grupos externos foram utilizadas as espécies Hemipsilichthys gobio e Hemipsilichthys papilatus, subfamília Delturinae, amostras de Hypostomus nigromaculatus (subfamília Hypostominae), Hypoptopoma inexpectatum (subfamília Hypoptopomatinae) e Corumbataia cuestae (subfamília Otothyrinae). Segundo proposta recente de relações na família Loricariidae o gênero Pseudotocinclus foi incluído nas análises. Os resultados mostraram que a subfamília Neoplecostominae é monofilética, com sua atual composição, incluindo Pseudotocinclus. Três subgrupos foram reconhecidos no grupo interno. O primeiro é formado pelas espécies Pareiorhina carrancas, uma nova espécie de Pareiorhina (Pareiorhina sp. 1), um novo gênero de Neoplecostominae e as espécies do gênero Neoplecostomus exceto Neoplecostomus ribeirensis. O segundo pelos gêneros...Morphological and molecular studies of samples of the family Loricariidae revealed that the relationship between it members are not well resolved. Based on this fact, in the present work we realized an analysis including samples of all genera of the subfamily Neoplecostominae. The analysis based in Maxima Parsimonious, Bayesian Analysis and Genetic Distance (Neighbor-joining) in a matrix of 4676 characters with partial sequences of the genes COI, CytB, 16S rRNA, 12S rRNA and F-4 Reticulon. In this matrix 1155 characters was parsimonious informative. We used as outgroups samples of the species Hemipsilichthys gobio and Hemipsilichthys papilatus (subfamily Delturinae), Hypostomus nigromaculatus (subfamily Hypostominae), Hypoptopoma inexpectatum (subfamily Hypoptopomatinae), and Corumbataia cuestae (subfamily Otothyrinae). Following recent results about the relationship of the family Loricariidae the genus Pseudotocinclus was included in the present analysis. The results showed that the subfamily Neoplecostominae is monophyletic, including Pseudotocinclus. Three subgroups were recognized. The first one is composed by the species Pareiorhina carrancas, Pareiorhina sp. 1 (new species), a new genus of Neoplecostominae and all species of Neoplecostomus genus except Neoplecostomus ribeirensis. The second group is composed by Kronichthys, Isbrueckerichthys and Pareiorhaphis genera and the species Neoplecostomus ribeirensis. Kronichthys formed sister group with Pareiorhaphis and these two formed sister group with Isbrueckerichthys plus Neoplecostomus ribeirensis. The third group is the most basal found in the subfamily Neoplecostominae, composed by the species Pareiorhina rudolphi, Pareiorhina sp. 2, Pseudotocinclus juquiae and Pseudotocinclus tietensis. Thus, the genera Pareiorhina and Neoplecostomus do not appeared monophyletic, and we found ... (Complete abstract click electronic access below)Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)69 f. : il., mapas, tabs.porUniversidade Estadual Paulista (Unesp)Alephreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESPPeixe - GeneticaFilogeniaAnálise das relações entre gêneros da subfamília neoplecostominae (Siluriformes: Loricariidae) com base em sequências de DNAinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessCiências Biológicas (Genética) - IBBGenéticaGenética animalUniversidade Estadual Paulista (UNESP), Instituto de Biociências, Botucatu0297419882161114[1]0000-0002-4143-7212[1]Publicationab63624f-c491-4ac7-bd2c-767f17ac838dvirtual::152999-1ab63624f-c491-4ac7-bd2c-767f17ac838dvirtual::152999-1fa517d17-486d-47e0-80a6-213dd0cc52favirtual::200760-1fa517d17-486d-47e0-80a6-213dd0cc52favirtual::200760-1ORIGINALroxo_ff_me_botib.pdfapplication/pdf4492015https://repositorio.unesp.br/bitstreams/1e13769b-0e3b-452f-97db-66108c1df7b1/download64d4acdcf86b743022114254d49de6c4MD51trueAnonymousREADTEXTroxo_ff_me_botib.pdf.txtWritten by FormatFilter org.dspace.app.mediafilter.TikaTextExtractionFilter on 2023-11-27T06:09:35Z (GMT).Extracted texttext/plain101513https://repositorio.unesp.br/bitstreams/a5d6b32e-d531-41e2-8f1d-bb39938b8ad6/downloade029d66c12065b41d669ba5decb322b5MD54falseAnonymousREADTHUMBNAILroxo_ff_me_botib.pdf.jpgWritten by FormatFilter org.dspace.app.mediafilter.ImageMagickPdfThumbnailFilter on 2016-11-16T12:35:16Z (GMT).IM Thumbnailimage/jpeg4473https://repositorio.unesp.br/bitstreams/fd4a7666-4259-41b9-aaae-bef5939d197e/downloadfe77ed7e46b1d9899cc8ef2d192040edMD53falseAnonymousREAD11449/924302026-03-11T19:01:14.379804Zopen.accessoai:repositorio.unesp.br:11449/92430https://repositorio.unesp.brRepositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestrepositoriounesp@unesp.bropendoar:29462026-03-11T19:01:14Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false
dc.title.pt.fl_str_mv Análise das relações entre gêneros da subfamília neoplecostominae (Siluriformes: Loricariidae) com base em sequências de DNA
title Análise das relações entre gêneros da subfamília neoplecostominae (Siluriformes: Loricariidae) com base em sequências de DNA
spellingShingle Análise das relações entre gêneros da subfamília neoplecostominae (Siluriformes: Loricariidae) com base em sequências de DNA
Roxo, Fábio Fernandes [UNESP]
Peixe - Genetica
Filogenia
title_short Análise das relações entre gêneros da subfamília neoplecostominae (Siluriformes: Loricariidae) com base em sequências de DNA
title_full Análise das relações entre gêneros da subfamília neoplecostominae (Siluriformes: Loricariidae) com base em sequências de DNA
title_fullStr Análise das relações entre gêneros da subfamília neoplecostominae (Siluriformes: Loricariidae) com base em sequências de DNA
title_full_unstemmed Análise das relações entre gêneros da subfamília neoplecostominae (Siluriformes: Loricariidae) com base em sequências de DNA
title_sort Análise das relações entre gêneros da subfamília neoplecostominae (Siluriformes: Loricariidae) com base em sequências de DNA
author Roxo, Fábio Fernandes [UNESP]
author_facet Roxo, Fábio Fernandes [UNESP]
author_role author
dc.contributor.institution.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.contributor.committeeMember.none.fl_str_mv Benine, Ricardo Cardoso
Langeani Neto, Francisco
dc.contributor.author.fl_str_mv Roxo, Fábio Fernandes [UNESP]
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Oliveira, Claudio de [UNESP]
Zawadzki, Claudio Henrique [UNESP]
contributor_str_mv Oliveira, Claudio de [UNESP]
Zawadzki, Claudio Henrique [UNESP]
dc.subject.por.fl_str_mv Peixe - Genetica
Filogenia
topic Peixe - Genetica
Filogenia
description Estudos morfológicos e moleculares direcionados a indivíduos da família Loricariidae, popularmente conhecidos com cascudos, têm revelado incertezas nos padrões de relacionamentos de algumas de suas subfamílias. Baseado nestes questionamentos foi realizado uma análise filogenética incluindo representantes de todos os gêneros da subfamília Neoplecostominae. Tal análise, baseada em Máxima Parcimônia, Análise Bayesiana e Análise de Distancia Genética (Neighbor-joining) foi executada em uma matriz de 4676 caracteres com sequências parciais dos genes COI, CytB, 16S rRNA, 12S rRNA e F-4 Reticulon. Nesta matriz 1155 caracteres apresentaram-se informativos nas análises de parcimônia. Como grupos externos foram utilizadas as espécies Hemipsilichthys gobio e Hemipsilichthys papilatus, subfamília Delturinae, amostras de Hypostomus nigromaculatus (subfamília Hypostominae), Hypoptopoma inexpectatum (subfamília Hypoptopomatinae) e Corumbataia cuestae (subfamília Otothyrinae). Segundo proposta recente de relações na família Loricariidae o gênero Pseudotocinclus foi incluído nas análises. Os resultados mostraram que a subfamília Neoplecostominae é monofilética, com sua atual composição, incluindo Pseudotocinclus. Três subgrupos foram reconhecidos no grupo interno. O primeiro é formado pelas espécies Pareiorhina carrancas, uma nova espécie de Pareiorhina (Pareiorhina sp. 1), um novo gênero de Neoplecostominae e as espécies do gênero Neoplecostomus exceto Neoplecostomus ribeirensis. O segundo pelos gêneros...
publishDate 2010
dc.date.issued.fl_str_mv 2010-02-25
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2014-06-11T19:26:02Z
dc.date.available.fl_str_mv 2014-06-11T19:26:02Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv ROXO, Fábio Fernandes. Análise das relações entre gêneros da subfamília neoplecostominae (Siluriformes: Loricariidae) com base em sequências de DNA. 2010. 69 f. Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual Paulista, Instituto de Biociências de Botucatu, 2010.
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11449/92430
dc.identifier.aleph.none.fl_str_mv 000627247
dc.identifier.file.none.fl_str_mv roxo_ff_me_botib.pdf
dc.identifier.capes.none.fl_str_mv 33004064026P9
dc.identifier.lattes.none.fl_str_mv 0297419882161114
dc.identifier.orcid.none.fl_str_mv 0000-0002-4143-7212
identifier_str_mv ROXO, Fábio Fernandes. Análise das relações entre gêneros da subfamília neoplecostominae (Siluriformes: Loricariidae) com base em sequências de DNA. 2010. 69 f. Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual Paulista, Instituto de Biociências de Botucatu, 2010.
000627247
roxo_ff_me_botib.pdf
33004064026P9
0297419882161114
0000-0002-4143-7212
url http://hdl.handle.net/11449/92430
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 69 f. : il., mapas, tabs.
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
publisher.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.source.none.fl_str_mv Aleph
reponame:Repositório Institucional da UNESP
instname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron:UNESP
instname_str Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron_str UNESP
institution UNESP
reponame_str Repositório Institucional da UNESP
collection Repositório Institucional da UNESP
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.unesp.br/bitstreams/1e13769b-0e3b-452f-97db-66108c1df7b1/download
https://repositorio.unesp.br/bitstreams/a5d6b32e-d531-41e2-8f1d-bb39938b8ad6/download
https://repositorio.unesp.br/bitstreams/fd4a7666-4259-41b9-aaae-bef5939d197e/download
bitstream.checksum.fl_str_mv 64d4acdcf86b743022114254d49de6c4
e029d66c12065b41d669ba5decb322b5
fe77ed7e46b1d9899cc8ef2d192040ed
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)
repository.mail.fl_str_mv repositoriounesp@unesp.br
_version_ 1878343751957479424

Registros relacionados