Meta-análise integrativa da expressão gênica global no músculo esquelético de peixes

• Ano de defesa: 2022
• Autor(a) principal: Perez, Érika Stefani [UNESP]
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Estadual Paulista (Unesp)
• Palavras-chave em Português: Meta-análise; Peixes; Crescimento do músculo esquelético; Meta-analysis; Fish; Skeletal muscle growth
• Link de acesso: http://hdl.handle.net/11449/217318

O crescimento muscular dos peixes, o qual desperta grande interesse do setor produtivo, é regulado por múltiplos genes que fazem deste, um complexo processo ainda pouco compreendido. Nesse contexto, a reanálise do perfil de mRNAs é uma estratégia significativa que permite a compreensão do crescimento desse tecido. Com base nisso, os objetivos deste estudo foram reanalisar, integrar e comparar o perfil de mRNAs do músculo esquelético de peixes, bem como encontrar possíveis genes alvos envolvidos com o crescimento e manutenção do fenótipo muscular. Foi realizada uma meta-análise utilizando palavras-chave no banco de dados GEO Datasets e European Nucleotide Archive. Os dados de microarray foram reanalisados e partir dos genes diferencialmente expressos (GDEs) de cada dataset foi realizada uma análise individual que identificou as vias mais comuns dos estudos (p<0.05). Essas vias, presentes em pelo menos dois datasets, tiveram seus genes selecionados para a construção da rede de interação molecular. Com base nessa rede, foi obtida a importante relação entre ribossomos e ciclo celular em que alguns genes foram selecionados para investigação através de RT-qPCR: rps27a, eef1a2, ccnd1, cdkn1a e pcna, além da mtor. As investigações foram realizadas em pacus (P.mesopotamicus) de 12g submetidos ao jejum de 4 dias (J4d) e realimentação de 3 dias (R3d), e em pacus com 30g submetidos ao jejum de 15 dias (J15d) e realimentação de 6 horas (R6h) e 15 dias (R15d). O período mais curto de jejum (J4d) promoveu um aumento na expressão da mtor. A expressão de rps27a, ccnd1, cdkn1a e do pcna foi reduzida em R3d comparada ao J4d. No período mais prolongado de jejum e realimentação, a expressão da mtor foi reduzida em R15d em comparação à R6h, assim como do pcna. Considerando a expressão de rps27a, houve uma diminuição em R15d comparado ao grupo J15d, enquanto a expressão de eef1a2 não se alterou. A expressão de ccnd1 foi elevada em J15d e R6h em comparação aos grupos C e R15d. Alterações importantes também foram observadas na expressão da cdkn1a que manteve altos níveis no grupo Controle (C) e J15d e diminuição em R6h e R15d. Considerando a importante relação entre os ribossomos e o ciclo celular obtida pela meta-análise, a investigaçãodesses genes selecionados demonstra estratégias adotadas pela musculatura que inclui a manutenção da capacidade traducional, sustentada pela biogênese dos ribossomos, a otimização da polimerização proteica e o reparo do tecido diante do estresse decorrente da falta de alimento. Além disso, considerando o ciclo-celular, a expressão de seus reguladores é modulada frente à redução e ao reestabelecimento das condições pró-proliferação, visando a sobrevivência celular durante o estresse nutricional. Dessa maneira, nosso estudo pode fornecer novos insights acerca da importância dos genes que regulam a tradução, transcrição e replicação, como marcadores associados à manutenção do fenótipo e função muscular, visando o crescimento dos peixes.