Uso de microarray para determinação da expressão gênica diferencial em oócitos Bos Taurus Indicus e Bos Taurus Taurus submetidos ao estresse térmico

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2014
Autor(a) principal: Ticianelli, Janahi Sousa [UNESP]
Orientador(a): Lopes, Fabíola de Paula [UNESP]
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: http://hdl.handle.net/11449/123297
http://www.athena.biblioteca.unesp.br/exlibris/bd/cathedra/08-05-2015/000827001.pdf
Resumo: Divergências genéticas de termotolerância foram demonstradas entre animais Bos taurus taurus (Holandesa) e Bos taurus indicus (Nelore). O efeito deletério do estresse térmico sobre o potencial de desenvolvimento do oócito é maior para Bos taurus taurus em comparação aos oócitos Bos taurus indicus. Portanto, o presente estudo determinou o perfil do transcriptoma em oócitos das raças Nelore e Holandesa submetidos ao estresse térmico durante a maturação in vitro (MIV), bem como a abundância de RNAm de genes candidatos em oócitos e células do cumulus submetidos aos mesmos tratamentos. Vacas não lactantes das raças Holandesa e Nelore foram submetidas à aspiração folicular guiada por ultra-som durante a estação fria. Os complexos cumulus-oócitos (CCOs) foram aleatoriamente distribuídos nos tratamentos controle (38,5 °C por 22 horas) e estresse térmico (41 °C por 12 horas, seguido de 38,5 °C por 10 horas) durante a MIV. Oócitos desnudados foram submetidos à análise de microarray bovino (Affymetrix). Genes com fold change de pelo menos 1,5 e P<0,05 foram considerados diferencialmente expressos. A análise de microarray demonstrou 127, 9 e 6 genes diferencialmente expressos entre Raça, Temperatura e interação Raça x Temperatura, respectivamente. Os genes diferencialmente expressos foram avaliados por RT-PCR em oócitos e nas suas respectivas células de cumulus. Houve uma correlação positiva entre o fold change do microarray e do RT-PCR dos oócitos para os genes KIF3A, CLDN11, BIRC3, DAP, MT1E, CCT4, DICER1 e DENND3. Em particular, o gene membro da família cinesina 3A (KIF3A) foi induzido em oócitos de Holandesa, enquanto que os genes da proteína associada à morte (DAP) e de tráfego intracelular de membrana domínio DENN/MADD 3 (DENND3) foram reprimidos em oócitos de Holandesa quando comparados a Nelore. A abundância relativa do RNAm da molécula antioxidante metalotioneína 1E ...
id UNSP_d69487d6cdadbe466e595c5b645e2b70
oai_identifier_str oai:repositorio.unesp.br:11449/123297
network_acronym_str UNSP
network_name_str Repositório Institucional da UNESP
repository_id_str
spelling Ticianelli, Janahi Sousa [UNESP]Universidade Estadual Paulista (Unesp)Mingoti, Gisele ZiccalVisintin, José AntônioNogueira, Marcelo Fábio GouveiaLandim, Fernanda da CruzLopes, Fabíola de Paula [UNESP]2015-05-14T16:53:19Z2015-05-14T16:53:19Z2014-03-27TICIANELLI, Janahi Sousa. Uso de microarray para determinação da expressão gênica diferencial em oócitos Bos Taurus Indicus e Bos Taurus Taurus submetidos ao estresse térmico. 2014. 136 f. Tese (doutorado) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Instituto de Biociências de Botucatu, 2014.http://hdl.handle.net/11449/123297000827001http://www.athena.biblioteca.unesp.br/exlibris/bd/cathedra/08-05-2015/000827001.pdf33004064052P0Divergências genéticas de termotolerância foram demonstradas entre animais Bos taurus taurus (Holandesa) e Bos taurus indicus (Nelore). O efeito deletério do estresse térmico sobre o potencial de desenvolvimento do oócito é maior para Bos taurus taurus em comparação aos oócitos Bos taurus indicus. Portanto, o presente estudo determinou o perfil do transcriptoma em oócitos das raças Nelore e Holandesa submetidos ao estresse térmico durante a maturação in vitro (MIV), bem como a abundância de RNAm de genes candidatos em oócitos e células do cumulus submetidos aos mesmos tratamentos. Vacas não lactantes das raças Holandesa e Nelore foram submetidas à aspiração folicular guiada por ultra-som durante a estação fria. Os complexos cumulus-oócitos (CCOs) foram aleatoriamente distribuídos nos tratamentos controle (38,5 °C por 22 horas) e estresse térmico (41 °C por 12 horas, seguido de 38,5 °C por 10 horas) durante a MIV. Oócitos desnudados foram submetidos à análise de microarray bovino (Affymetrix). Genes com fold change de pelo menos 1,5 e P<0,05 foram considerados diferencialmente expressos. A análise de microarray demonstrou 127, 9 e 6 genes diferencialmente expressos entre Raça, Temperatura e interação Raça x Temperatura, respectivamente. Os genes diferencialmente expressos foram avaliados por RT-PCR em oócitos e nas suas respectivas células de cumulus. Houve uma correlação positiva entre o fold change do microarray e do RT-PCR dos oócitos para os genes KIF3A, CLDN11, BIRC3, DAP, MT1E, CCT4, DICER1 e DENND3. Em particular, o gene membro da família cinesina 3A (KIF3A) foi induzido em oócitos de Holandesa, enquanto que os genes da proteína associada à morte (DAP) e de tráfego intracelular de membrana domínio DENN/MADD 3 (DENND3) foram reprimidos em oócitos de Holandesa quando comparados a Nelore. A abundância relativa do RNAm da molécula antioxidante metalotioneína 1E ...Genetic divergences in thermotolerance have been demonstrated between Bos taurus taurus (Holstein) and Bos taurus indicus (Nelore) animals. The deleterious effect of heat stress on oocyte developmental potential is greater for Bos taurus taurus as compared to Bos taurus indicus oocytes. Therefore, the present study determined transcriptome profile in Nelore and Holstein oocytes subjected heat shock during in vitro maturation (IVM) as well as mRNA abundance of selected candidate genes in Nelore and Holstein heat-shocked oocytes and cumulus cells. Non-lactating Holstein and Nelore cows were subjected to ultrasound-guided follicle aspiration during the cool season. Cumulus-oocyte complexes (COCs) were randomly assigned to control (38.5°C for 22 hours) and heat shock (41°C for 12 hours followed by 38.5°C for 10 hours) treatments during IVM. Denuded oocytes were subjected to Affymetrix bovine microarray. Genes with fold change of at least 1.5 and P< 0.05 were considered differently expressed. Microarray analyses demonstrated 127, 9 and 6 genes differentially expressed between Breed, Temperature and Breed x Temperature interaction, respectively. Selected differentially expressed genes were evaluated by RTPCR in oocytes and respective cumulus cells. There was a positive correlation between oocyte microarray and RT-PCR fold change for the genes KIF3A, CLDN11, BIRC3, DAP, MT1E, CCT4, DICER1 and DENND3. In particular, the member of the kinesin family 3A (KIF3A) gene was up-regulated in Holstein oocytes, while the deathassociated protein (DAP) and the protein trafficking gene DENN/MADD domain containing 3 (DENND3) were down-regulated in Holstein oocytes as compared to Nelore. The mRNA relative abundance of the antioxidant molecule metallothionein 1E (MT1E) was higher in Holstein cumulus cells, whereas, claudin 11 (CLDN11) that participates in cellular tight junctions, was higher in Nelore. Moreover, heat shock down regulated MT1E mRNA abundance ...Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)FAPESP: 2007/53323-0136 f.porUniversidade Estadual Paulista (Unesp)Alephreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESPBovino - ReproduçãoExpressão gênicaOócitosHolandês (Bovino)Nelore (Zebu)Cattle - ReproductionUso de microarray para determinação da expressão gênica diferencial em oócitos Bos Taurus Indicus e Bos Taurus Taurus submetidos ao estresse térmicoinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessCiências Biológicas (Farmacologia) - IBBFarmacologiaEstresse térmico bovinoUniversidade Estadual Paulista (UNESP), Instituto de Biociências, BotucatuPublicationab63624f-c491-4ac7-bd2c-767f17ac838dvirtual::154660-1ab63624f-c491-4ac7-bd2c-767f17ac838dvirtual::154660-1ORIGINAL000827001.pdfapplication/pdf1244164https://repositorio.unesp.br/bitstreams/967e43c7-fe9e-4996-88f1-1f24e3e3f95e/download53be6cbd163a4c6a3a3afa2dbf6acc42MD51trueAnonymousREADTEXT000827001.pdf.txtWritten by FormatFilter org.dspace.app.mediafilter.TikaTextExtractionFilter on 2023-12-24T06:18:12Z (GMT).Extracted texttext/plain103031https://repositorio.unesp.br/bitstreams/6182cc53-7309-427c-acb4-15b7f64986ce/download8c9b09b6e5d2768905bfbf4d02e9f9b9MD54falseAnonymousREADTHUMBNAIL000827001.pdf.jpgWritten by FormatFilter org.dspace.app.mediafilter.ImageMagickPdfThumbnailFilter on 2016-11-10T20:56:13Z (GMT).IM Thumbnailimage/jpeg4097https://repositorio.unesp.br/bitstreams/334150ff-d184-4abe-b78e-2c3e082b646e/downloadc6bb9db5fc9630af1666abb5bc0a5a38MD53falseAnonymousREAD11449/1232972026-03-11T17:42:35.334161Zopen.accessoai:repositorio.unesp.br:11449/123297https://repositorio.unesp.brRepositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestrepositoriounesp@unesp.bropendoar:29462026-03-11T17:42:35Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false
dc.title.pt.fl_str_mv Uso de microarray para determinação da expressão gênica diferencial em oócitos Bos Taurus Indicus e Bos Taurus Taurus submetidos ao estresse térmico
title Uso de microarray para determinação da expressão gênica diferencial em oócitos Bos Taurus Indicus e Bos Taurus Taurus submetidos ao estresse térmico
spellingShingle Uso de microarray para determinação da expressão gênica diferencial em oócitos Bos Taurus Indicus e Bos Taurus Taurus submetidos ao estresse térmico
Ticianelli, Janahi Sousa [UNESP]
Bovino - Reprodução
Expressão gênica
Oócitos
Holandês (Bovino)
Nelore (Zebu)
Cattle - Reproduction
title_short Uso de microarray para determinação da expressão gênica diferencial em oócitos Bos Taurus Indicus e Bos Taurus Taurus submetidos ao estresse térmico
title_full Uso de microarray para determinação da expressão gênica diferencial em oócitos Bos Taurus Indicus e Bos Taurus Taurus submetidos ao estresse térmico
title_fullStr Uso de microarray para determinação da expressão gênica diferencial em oócitos Bos Taurus Indicus e Bos Taurus Taurus submetidos ao estresse térmico
title_full_unstemmed Uso de microarray para determinação da expressão gênica diferencial em oócitos Bos Taurus Indicus e Bos Taurus Taurus submetidos ao estresse térmico
title_sort Uso de microarray para determinação da expressão gênica diferencial em oócitos Bos Taurus Indicus e Bos Taurus Taurus submetidos ao estresse térmico
author Ticianelli, Janahi Sousa [UNESP]
author_facet Ticianelli, Janahi Sousa [UNESP]
author_role author
dc.contributor.institution.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.contributor.committeeMember.none.fl_str_mv Mingoti, Gisele Ziccal
Visintin, José Antônio
Nogueira, Marcelo Fábio Gouveia
Landim, Fernanda da Cruz
dc.contributor.author.fl_str_mv Ticianelli, Janahi Sousa [UNESP]
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Lopes, Fabíola de Paula [UNESP]
contributor_str_mv Lopes, Fabíola de Paula [UNESP]
dc.subject.por.fl_str_mv Bovino - Reprodução
Expressão gênica
Oócitos
Holandês (Bovino)
Nelore (Zebu)
Cattle - Reproduction
topic Bovino - Reprodução
Expressão gênica
Oócitos
Holandês (Bovino)
Nelore (Zebu)
Cattle - Reproduction
description Divergências genéticas de termotolerância foram demonstradas entre animais Bos taurus taurus (Holandesa) e Bos taurus indicus (Nelore). O efeito deletério do estresse térmico sobre o potencial de desenvolvimento do oócito é maior para Bos taurus taurus em comparação aos oócitos Bos taurus indicus. Portanto, o presente estudo determinou o perfil do transcriptoma em oócitos das raças Nelore e Holandesa submetidos ao estresse térmico durante a maturação in vitro (MIV), bem como a abundância de RNAm de genes candidatos em oócitos e células do cumulus submetidos aos mesmos tratamentos. Vacas não lactantes das raças Holandesa e Nelore foram submetidas à aspiração folicular guiada por ultra-som durante a estação fria. Os complexos cumulus-oócitos (CCOs) foram aleatoriamente distribuídos nos tratamentos controle (38,5 °C por 22 horas) e estresse térmico (41 °C por 12 horas, seguido de 38,5 °C por 10 horas) durante a MIV. Oócitos desnudados foram submetidos à análise de microarray bovino (Affymetrix). Genes com fold change de pelo menos 1,5 e P<0,05 foram considerados diferencialmente expressos. A análise de microarray demonstrou 127, 9 e 6 genes diferencialmente expressos entre Raça, Temperatura e interação Raça x Temperatura, respectivamente. Os genes diferencialmente expressos foram avaliados por RT-PCR em oócitos e nas suas respectivas células de cumulus. Houve uma correlação positiva entre o fold change do microarray e do RT-PCR dos oócitos para os genes KIF3A, CLDN11, BIRC3, DAP, MT1E, CCT4, DICER1 e DENND3. Em particular, o gene membro da família cinesina 3A (KIF3A) foi induzido em oócitos de Holandesa, enquanto que os genes da proteína associada à morte (DAP) e de tráfego intracelular de membrana domínio DENN/MADD 3 (DENND3) foram reprimidos em oócitos de Holandesa quando comparados a Nelore. A abundância relativa do RNAm da molécula antioxidante metalotioneína 1E ...
publishDate 2014
dc.date.issued.fl_str_mv 2014-03-27
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2015-05-14T16:53:19Z
dc.date.available.fl_str_mv 2015-05-14T16:53:19Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv TICIANELLI, Janahi Sousa. Uso de microarray para determinação da expressão gênica diferencial em oócitos Bos Taurus Indicus e Bos Taurus Taurus submetidos ao estresse térmico. 2014. 136 f. Tese (doutorado) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Instituto de Biociências de Botucatu, 2014.
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11449/123297
dc.identifier.aleph.none.fl_str_mv 000827001
dc.identifier.file.none.fl_str_mv http://www.athena.biblioteca.unesp.br/exlibris/bd/cathedra/08-05-2015/000827001.pdf
dc.identifier.capes.none.fl_str_mv 33004064052P0
identifier_str_mv TICIANELLI, Janahi Sousa. Uso de microarray para determinação da expressão gênica diferencial em oócitos Bos Taurus Indicus e Bos Taurus Taurus submetidos ao estresse térmico. 2014. 136 f. Tese (doutorado) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Instituto de Biociências de Botucatu, 2014.
000827001
33004064052P0
url http://hdl.handle.net/11449/123297
http://www.athena.biblioteca.unesp.br/exlibris/bd/cathedra/08-05-2015/000827001.pdf
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 136 f.
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
publisher.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.source.none.fl_str_mv Aleph
reponame:Repositório Institucional da UNESP
instname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron:UNESP
instname_str Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron_str UNESP
institution UNESP
reponame_str Repositório Institucional da UNESP
collection Repositório Institucional da UNESP
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.unesp.br/bitstreams/967e43c7-fe9e-4996-88f1-1f24e3e3f95e/download
https://repositorio.unesp.br/bitstreams/6182cc53-7309-427c-acb4-15b7f64986ce/download
https://repositorio.unesp.br/bitstreams/334150ff-d184-4abe-b78e-2c3e082b646e/download
bitstream.checksum.fl_str_mv 53be6cbd163a4c6a3a3afa2dbf6acc42
8c9b09b6e5d2768905bfbf4d02e9f9b9
c6bb9db5fc9630af1666abb5bc0a5a38
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)
repository.mail.fl_str_mv repositoriounesp@unesp.br
_version_ 1878343985335894016