Identificação de cianobactérias em biofilmes de superfícies externas de prédios históricos : análise morfológica e molecular

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2003
Autor(a) principal: Crispim, Cézar Augusto
Orientador(a): Freire, Joao Ruy Jardim
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Não Informado pela instituição
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: http://hdl.handle.net/10183/67623
Resumo: Atualmente existe uma crescente preocupação com a preservação de monumentos que fazem parte do patrimônio histórico e cultural de povos e nações, e tem-se observado que dentre os vários fatores que contribuem para a degradação destes monumentos, há a ação de uma microbiota fototrófica ativa e diversa, formada principalmente por cianobactérias e algas. Foram estudadas em Porto Alegre seis igrejas com importância histórica, utilizando-se técnicas de microbiologia tradicionais e de biologia molecular. Um método rápido e simples para a amplificação por PCR foi desenvolvido, não sendo necessário o cultivo das células. Foram encontrados oito gêneros de cianobactérias filamentosas e quatro gêneros de cianobactérias cocóides. Vários dos grupos identificados são reconhecidos como degradadores de pedras (o grupo Pleurocapsa, Synechocystis, Gloeocapsa, Microcoleus, Scytonema e Mastigocladus). Alguns produtos de PCR foram seqüenciados e submetidos ao algoritmo BLAST, com o intuito de verificar o nível de similaridade com as seqüências depositadas de outras cianobactérias. Foi observado que o nível de similaridade da maioria das amostras foi baixo, provavelmente em função do fato de que a maioria das seqüências depositadas nos bancos de dados é proveniente de espécies aquáticas, as quais são consideravelmente diferentes das cianobactérias presentes em biofilmes em construções. Os dendrogramas construídos utilizando-se o "bootstrapping" mostraram que as amostras filamentosas nos biofilmes estudados geralmente agruparam-se com espécies semelhantes presentes nos bancos de dados. Contudo, de acordo com os resultados deste estudo e da literatura corrente, ainda há muitos problemas em relação à taxonomia de cianobactérias, o que indica a necessidade de mais estudos nesta área.
id URGS_7a1df4630608c667cbfc916c1aff1cf0
oai_identifier_str oai:www.lume.ufrgs.br:10183/67623
network_acronym_str URGS
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
repository_id_str
spelling Crispim, Cézar AugustoFreire, Joao Ruy Jardim2013-03-14T01:39:12Z2003http://hdl.handle.net/10183/67623000391082Atualmente existe uma crescente preocupação com a preservação de monumentos que fazem parte do patrimônio histórico e cultural de povos e nações, e tem-se observado que dentre os vários fatores que contribuem para a degradação destes monumentos, há a ação de uma microbiota fototrófica ativa e diversa, formada principalmente por cianobactérias e algas. Foram estudadas em Porto Alegre seis igrejas com importância histórica, utilizando-se técnicas de microbiologia tradicionais e de biologia molecular. Um método rápido e simples para a amplificação por PCR foi desenvolvido, não sendo necessário o cultivo das células. Foram encontrados oito gêneros de cianobactérias filamentosas e quatro gêneros de cianobactérias cocóides. Vários dos grupos identificados são reconhecidos como degradadores de pedras (o grupo Pleurocapsa, Synechocystis, Gloeocapsa, Microcoleus, Scytonema e Mastigocladus). Alguns produtos de PCR foram seqüenciados e submetidos ao algoritmo BLAST, com o intuito de verificar o nível de similaridade com as seqüências depositadas de outras cianobactérias. Foi observado que o nível de similaridade da maioria das amostras foi baixo, provavelmente em função do fato de que a maioria das seqüências depositadas nos bancos de dados é proveniente de espécies aquáticas, as quais são consideravelmente diferentes das cianobactérias presentes em biofilmes em construções. Os dendrogramas construídos utilizando-se o "bootstrapping" mostraram que as amostras filamentosas nos biofilmes estudados geralmente agruparam-se com espécies semelhantes presentes nos bancos de dados. Contudo, de acordo com os resultados deste estudo e da literatura corrente, ainda há muitos problemas em relação à taxonomia de cianobactérias, o que indica a necessidade de mais estudos nesta área.There is today an increasing concern about the preservation of monuments, which are part of the historic and cultural heritage of peoples and nations. Among severa) factors contributing to the degradation of these monuments, the action of an active and diverse microflora, formed principally by cyanobacteria and algae, has been emphasized. Six churches of historic importance were studied in Porto Alegre, using traditional microbiological and molecular methods. A simple and fast PCR amplification methodology was developed, which did not require the culturing of samples. Eight genera of filamentous and four genera of coccoid cyanobacteria were identified in the biofilms. Severa) of the groups detected are known to degrade stone (the Pleurocapsa group, Synechocystis, Gloeocapsa, Microcoleus, Scytonema and Mastígocladus). Soormnee PCR products were sequenced and submitted to the BLAST algorithm, in order to verify the levei of similarity with sequences deposited for other cyanobacteria. The leve) of homology of most samples was low, probably because most of the deposited sequences are from aquatic cyanobacteria species, which are considerably different from those present in biofilms on buildings. The dendrograms, constructed by bootstrapping, showed that the filamentous samples in the biofilms generally grouped with similar species in data banks. However, according to the results of this study and the current literature, there are many problems with the present taxonomy of cyanobacteria, which indicates the need for further studies in this area.application/pdfporBacteriaIdentificação de cianobactérias em biofilmes de superfícies externas de prédios históricos : análise morfológica e molecularIdentification of cyanobacteria in biofilms on external surfaces of historic buildings: morphological and molecular analysis info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisUniversidade Federal do Rio Grande do SulFaculdade de AgronomiaPrograma de Pós-Graduação em Agronomia. Curso de Pós-Graduação em Microbiologia Agricola e do AmbientePorto Alegre, BR-RS2003mestradoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGSinstname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)instacron:UFRGSORIGINAL000391082.pdf000391082.pdfTexto completoapplication/pdf7630699http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/67623/1/000391082.pdf7d21f03326ac5f170cc2768766a90537MD51TEXT000391082.pdf.txt000391082.pdf.txtExtracted Texttext/plain163075http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/67623/2/000391082.pdf.txt69ed0cf6210ea1dad5f6c59f9a916de8MD52THUMBNAIL000391082.pdf.jpg000391082.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1405http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/67623/3/000391082.pdf.jpgc591a3c89c0ae5cdaa53423d0712af6eMD5310183/676232018-10-05 08:04:58.101oai:www.lume.ufrgs.br:10183/67623Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttps://lume.ufrgs.br/handle/10183/2PUBhttps://lume.ufrgs.br/oai/requestlume@ufrgs.br||lume@ufrgs.bropendoar:18532018-10-05T11:04:58Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Identificação de cianobactérias em biofilmes de superfícies externas de prédios históricos : análise morfológica e molecular
dc.title.alternative.en.fl_str_mv Identification of cyanobacteria in biofilms on external surfaces of historic buildings: morphological and molecular analysis
title Identificação de cianobactérias em biofilmes de superfícies externas de prédios históricos : análise morfológica e molecular
spellingShingle Identificação de cianobactérias em biofilmes de superfícies externas de prédios históricos : análise morfológica e molecular
Crispim, Cézar Augusto
Bacteria
title_short Identificação de cianobactérias em biofilmes de superfícies externas de prédios históricos : análise morfológica e molecular
title_full Identificação de cianobactérias em biofilmes de superfícies externas de prédios históricos : análise morfológica e molecular
title_fullStr Identificação de cianobactérias em biofilmes de superfícies externas de prédios históricos : análise morfológica e molecular
title_full_unstemmed Identificação de cianobactérias em biofilmes de superfícies externas de prédios históricos : análise morfológica e molecular
title_sort Identificação de cianobactérias em biofilmes de superfícies externas de prédios históricos : análise morfológica e molecular
author Crispim, Cézar Augusto
author_facet Crispim, Cézar Augusto
author_role author
dc.contributor.author.fl_str_mv Crispim, Cézar Augusto
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Freire, Joao Ruy Jardim
contributor_str_mv Freire, Joao Ruy Jardim
dc.subject.por.fl_str_mv Bacteria
topic Bacteria
description Atualmente existe uma crescente preocupação com a preservação de monumentos que fazem parte do patrimônio histórico e cultural de povos e nações, e tem-se observado que dentre os vários fatores que contribuem para a degradação destes monumentos, há a ação de uma microbiota fototrófica ativa e diversa, formada principalmente por cianobactérias e algas. Foram estudadas em Porto Alegre seis igrejas com importância histórica, utilizando-se técnicas de microbiologia tradicionais e de biologia molecular. Um método rápido e simples para a amplificação por PCR foi desenvolvido, não sendo necessário o cultivo das células. Foram encontrados oito gêneros de cianobactérias filamentosas e quatro gêneros de cianobactérias cocóides. Vários dos grupos identificados são reconhecidos como degradadores de pedras (o grupo Pleurocapsa, Synechocystis, Gloeocapsa, Microcoleus, Scytonema e Mastigocladus). Alguns produtos de PCR foram seqüenciados e submetidos ao algoritmo BLAST, com o intuito de verificar o nível de similaridade com as seqüências depositadas de outras cianobactérias. Foi observado que o nível de similaridade da maioria das amostras foi baixo, provavelmente em função do fato de que a maioria das seqüências depositadas nos bancos de dados é proveniente de espécies aquáticas, as quais são consideravelmente diferentes das cianobactérias presentes em biofilmes em construções. Os dendrogramas construídos utilizando-se o "bootstrapping" mostraram que as amostras filamentosas nos biofilmes estudados geralmente agruparam-se com espécies semelhantes presentes nos bancos de dados. Contudo, de acordo com os resultados deste estudo e da literatura corrente, ainda há muitos problemas em relação à taxonomia de cianobactérias, o que indica a necessidade de mais estudos nesta área.
publishDate 2003
dc.date.issued.fl_str_mv 2003
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2013-03-14T01:39:12Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10183/67623
dc.identifier.nrb.pt_BR.fl_str_mv 000391082
url http://hdl.handle.net/10183/67623
identifier_str_mv 000391082
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
instname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
instacron:UFRGS
instname_str Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
instacron_str UFRGS
institution UFRGS
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
bitstream.url.fl_str_mv http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/67623/1/000391082.pdf
http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/67623/2/000391082.pdf.txt
http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/67623/3/000391082.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv 7d21f03326ac5f170cc2768766a90537
69ed0cf6210ea1dad5f6c59f9a916de8
c591a3c89c0ae5cdaa53423d0712af6e
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
repository.mail.fl_str_mv lume@ufrgs.br||lume@ufrgs.br
_version_ 1831315923237076992