Desenvolvimento de um software para geração de redes complexas formadas a partir de estimativas de conectividade cerebral: um estudo da espessura cortical no cérebro de indivíduos saudáveis e pacientes com epilepsia.

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2014
Autor(a) principal: Cunha, Heitor Hakime
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/59/59135/tde-14032014-104256/
Resumo: O cérebro humano é considerado uma rede complexa em termos estruturais e funcionais em diferentes escalas. A caracterização da arquitetura desta rede pode ser considerada uma importante ferramenta no auxílio ao estudo de diferentes doenças neurodegenerativas. No presente estudo propusemos um software desenvolvido em JAVA para investigar esta arquitetura com base na correlação estatística de características morfológicas entre diferentes regiões do córtex. Foram utilizados dados de espessura cortical obtidos a partir de imagens de ressonância magnética de 191 indivíduos saudáveis e 93 pacientes com epilepsia. Foi proposto um modelo não linear para considerar o efeito da idade na espessura cortical com identificação de duas etapas: amadurecimento e envelhecimento. Os pacientes, quando comparados aos controles, apresentaram uma redução significativa na espessura cortical fundamentalmente nas regiões para-central, pericalcarina e do pré-cuneo no hemisfério direito. Esta diminuição também se manifestou ao longo da idade, com uma maior taxa de queda na região parahipocampal direita. Considerando a conectividade anatômica aqui calculada, o grupo de pacientes evidenciou alterações em 31\\% das possíveis conexões e de forma difusa. Adicionalmente, nas redes cerebrais dos pacientes houve uma diminuição de 15\\% no comprimento médio do caminho e no coeficiente de agrupamento. Aplicando-se um algoritmo de agrupamento, foram detectadas três comunidades para os indivíduos saudáveis e seis comunidades para os pacientes, confirmando uma quebra de organização estrutural neste ultimo grupo. Com este software esperamos trazer à comunidade mais uma ferramenta para análise das conexões cerebrais e suas modificações em determinadas patologias, contribuindo com seu entendimento e possível diagnóstico.
id USP_0d3ac7cc290c3d2eece7fa98b5c960e9
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-14032014-104256
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str
spelling Desenvolvimento de um software para geração de redes complexas formadas a partir de estimativas de conectividade cerebral: um estudo da espessura cortical no cérebro de indivíduos saudáveis e pacientes com epilepsia.Development of a software to generate complex networks from estimates of brain connectivity: A study of cortical thickness in the brain of healthy subjects and patients with epilepsy.AgingBrain connectivityComplex networksConectividade cerebralCortical thicknessEnvelhecimentoEpilepsiaEpilepsy.Espessura cortiçaImagens por ressonância magnéticaMagnetic resonance imagingRedes complexasO cérebro humano é considerado uma rede complexa em termos estruturais e funcionais em diferentes escalas. A caracterização da arquitetura desta rede pode ser considerada uma importante ferramenta no auxílio ao estudo de diferentes doenças neurodegenerativas. No presente estudo propusemos um software desenvolvido em JAVA para investigar esta arquitetura com base na correlação estatística de características morfológicas entre diferentes regiões do córtex. Foram utilizados dados de espessura cortical obtidos a partir de imagens de ressonância magnética de 191 indivíduos saudáveis e 93 pacientes com epilepsia. Foi proposto um modelo não linear para considerar o efeito da idade na espessura cortical com identificação de duas etapas: amadurecimento e envelhecimento. Os pacientes, quando comparados aos controles, apresentaram uma redução significativa na espessura cortical fundamentalmente nas regiões para-central, pericalcarina e do pré-cuneo no hemisfério direito. Esta diminuição também se manifestou ao longo da idade, com uma maior taxa de queda na região parahipocampal direita. Considerando a conectividade anatômica aqui calculada, o grupo de pacientes evidenciou alterações em 31\\% das possíveis conexões e de forma difusa. Adicionalmente, nas redes cerebrais dos pacientes houve uma diminuição de 15\\% no comprimento médio do caminho e no coeficiente de agrupamento. Aplicando-se um algoritmo de agrupamento, foram detectadas três comunidades para os indivíduos saudáveis e seis comunidades para os pacientes, confirmando uma quebra de organização estrutural neste ultimo grupo. Com este software esperamos trazer à comunidade mais uma ferramenta para análise das conexões cerebrais e suas modificações em determinadas patologias, contribuindo com seu entendimento e possível diagnóstico.The human brain can be characterized as a complex network structurally and functionally in different levels. The description of the architecture of this network can be considered an important tool in understanding different neurodegenerative diseases. In the present study, we developed a software in JAVA to investigate this architecture based on statistical correlation of morphological characteristics between different cortex areas. It was used a database of cortical thickness obtained from magnetic resonance images of 191 healthy subjects and 93 patients with epilepsy. It was implemented a non-linear model to consider the effect of age in cortical thickness with identification of 2 stages: maturation and aging. The patients, when compared to healthy subjects, showed a significant reduction in cortical thickness, particularly at the areas precentral, pericalcarine and pré-cuneus of right hemisphere. This decrease also could be noted through the age, with a higher decrease rate at the right parahipocampal area. Considering the anatomical connectivity calculated, the patients group showed diffuse changes in 31\\% of the possible connections. Furthermore, in the patients brain network it was found a decrease of 15\\% in the characteristic path length and clustering coefficient. By applying a clustering algorithm, 3 clusters were detected in the healthy subjects and 6 clusters in the patients, confirming a breakdown of the structural organization in this last group. With our software we hope to bring to the community another tool to improve the brain connectivity analysis and its modifications in some pathologies, contributing with its understanding and possible diagnosis.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPSalmon, Carlos Ernesto GarridoCunha, Heitor Hakime2014-02-13info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/59/59135/tde-14032014-104256/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2016-07-28T16:11:49Zoai:teses.usp.br:tde-14032014-104256Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212016-07-28T16:11:49Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Desenvolvimento de um software para geração de redes complexas formadas a partir de estimativas de conectividade cerebral: um estudo da espessura cortical no cérebro de indivíduos saudáveis e pacientes com epilepsia.
Development of a software to generate complex networks from estimates of brain connectivity: A study of cortical thickness in the brain of healthy subjects and patients with epilepsy.
title Desenvolvimento de um software para geração de redes complexas formadas a partir de estimativas de conectividade cerebral: um estudo da espessura cortical no cérebro de indivíduos saudáveis e pacientes com epilepsia.
spellingShingle Desenvolvimento de um software para geração de redes complexas formadas a partir de estimativas de conectividade cerebral: um estudo da espessura cortical no cérebro de indivíduos saudáveis e pacientes com epilepsia.
Cunha, Heitor Hakime
Aging
Brain connectivity
Complex networks
Conectividade cerebral
Cortical thickness
Envelhecimento
Epilepsia
Epilepsy.
Espessura cortiça
Imagens por ressonância magnética
Magnetic resonance imaging
Redes complexas
title_short Desenvolvimento de um software para geração de redes complexas formadas a partir de estimativas de conectividade cerebral: um estudo da espessura cortical no cérebro de indivíduos saudáveis e pacientes com epilepsia.
title_full Desenvolvimento de um software para geração de redes complexas formadas a partir de estimativas de conectividade cerebral: um estudo da espessura cortical no cérebro de indivíduos saudáveis e pacientes com epilepsia.
title_fullStr Desenvolvimento de um software para geração de redes complexas formadas a partir de estimativas de conectividade cerebral: um estudo da espessura cortical no cérebro de indivíduos saudáveis e pacientes com epilepsia.
title_full_unstemmed Desenvolvimento de um software para geração de redes complexas formadas a partir de estimativas de conectividade cerebral: um estudo da espessura cortical no cérebro de indivíduos saudáveis e pacientes com epilepsia.
title_sort Desenvolvimento de um software para geração de redes complexas formadas a partir de estimativas de conectividade cerebral: um estudo da espessura cortical no cérebro de indivíduos saudáveis e pacientes com epilepsia.
author Cunha, Heitor Hakime
author_facet Cunha, Heitor Hakime
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Salmon, Carlos Ernesto Garrido
dc.contributor.author.fl_str_mv Cunha, Heitor Hakime
dc.subject.por.fl_str_mv Aging
Brain connectivity
Complex networks
Conectividade cerebral
Cortical thickness
Envelhecimento
Epilepsia
Epilepsy.
Espessura cortiça
Imagens por ressonância magnética
Magnetic resonance imaging
Redes complexas
topic Aging
Brain connectivity
Complex networks
Conectividade cerebral
Cortical thickness
Envelhecimento
Epilepsia
Epilepsy.
Espessura cortiça
Imagens por ressonância magnética
Magnetic resonance imaging
Redes complexas
description O cérebro humano é considerado uma rede complexa em termos estruturais e funcionais em diferentes escalas. A caracterização da arquitetura desta rede pode ser considerada uma importante ferramenta no auxílio ao estudo de diferentes doenças neurodegenerativas. No presente estudo propusemos um software desenvolvido em JAVA para investigar esta arquitetura com base na correlação estatística de características morfológicas entre diferentes regiões do córtex. Foram utilizados dados de espessura cortical obtidos a partir de imagens de ressonância magnética de 191 indivíduos saudáveis e 93 pacientes com epilepsia. Foi proposto um modelo não linear para considerar o efeito da idade na espessura cortical com identificação de duas etapas: amadurecimento e envelhecimento. Os pacientes, quando comparados aos controles, apresentaram uma redução significativa na espessura cortical fundamentalmente nas regiões para-central, pericalcarina e do pré-cuneo no hemisfério direito. Esta diminuição também se manifestou ao longo da idade, com uma maior taxa de queda na região parahipocampal direita. Considerando a conectividade anatômica aqui calculada, o grupo de pacientes evidenciou alterações em 31\\% das possíveis conexões e de forma difusa. Adicionalmente, nas redes cerebrais dos pacientes houve uma diminuição de 15\\% no comprimento médio do caminho e no coeficiente de agrupamento. Aplicando-se um algoritmo de agrupamento, foram detectadas três comunidades para os indivíduos saudáveis e seis comunidades para os pacientes, confirmando uma quebra de organização estrutural neste ultimo grupo. Com este software esperamos trazer à comunidade mais uma ferramenta para análise das conexões cerebrais e suas modificações em determinadas patologias, contribuindo com seu entendimento e possível diagnóstico.
publishDate 2014
dc.date.none.fl_str_mv 2014-02-13
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/59/59135/tde-14032014-104256/
url http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/59/59135/tde-14032014-104256/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1815258116974968832