Identificação e caracterização genômica de tripanossomatídeos em animais domésticos e dípteros flebotomíneos (Diptera: Psychodidae: Phlebotominae) de áreas endêmicas para leishmanioses no estado de São Paulo

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2024
Autor(a) principal: Leonel, João Augusto Franco
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Cat
Dog
Link de acesso: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-27022025-103618/
Resumo: Estudos de caracterização e diversidade de Leishmania spp. vem sendo impulsionados, principalmente, pelos avanços das tecnologias de sequenciamento. Este estudo, teve o objetivo de diagnosticar, isolar e caracterizar por sequenciamento genômico (Whole Genomic Sequencing WGS), protozoários tripanossomatídeos de cães, gatos e dípteros flebotomíneos de áreas endêmicas para leishmanioses no estado de São Paulo, Brasil. A infecção por Leishmania (Leishmania) infantumfoi detectada em cães de áreas endêmicas e não endêmicas para leishmaniose visceral (LV). Gatos infectados por L. (L.) infantum e coinfectados por Crithidia fasciculata foram diagnosticados, apenas em áreas endêmicas para LV. A infecção por Leishmania (Leishmania) amazonensis foi identificada em um gato de município endêmico para leishmaniose tegumentar (LT). Vetores primários e secundários de LT e LV foram capturados, e a infecção por L. (L.) infantum detectada em fêmeas de Lutzomyia (Lutzomyia) longipalpis de área endêmica para LV. As análises genômicas, baseadas nas variantes de polimorfismos únicos (SNPs) mostraram maior taxa de SNPs nos isolados de L. (L.) infantum oriundos dos gatos. A PCA evidenciou divergências genéticas entre os isolados obtidos dos gatos, e desses com os dos cães. A predição de efeito variante retornou maiores impactos nos isolados dos gatos, localizados em genes do parasita, relacionados a processos biológicos, patogenicidade e resistência a fármacos. A diversidade entre os isolados refletiu, possivelmente, o hospedeiro, município e ano do isolado. Os resultados contribuem com novas informações sobre a infecção por Leishmaniinae em cães e gatos. Além de evidenciar a adaptabilidade genética de L. (L.) infantum frente a desafios impostos por diferentes hospedeiros e áreas geográficas no estado paulista. Contribuindo com o melhor entendimento da epidemiologia do parasita no estado.
id USP_102e597d53b9937b80a85f2eb82da491
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-27022025-103618
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str
spelling Identificação e caracterização genômica de tripanossomatídeos em animais domésticos e dípteros flebotomíneos (Diptera: Psychodidae: Phlebotominae) de áreas endêmicas para leishmanioses no estado de São PauloIdentification and genomic characterization of trypanosomatids in domestic animals and phlebotomine sandflies (Diptera: Psychodidae: Phlebotominae) from leishmaniases endemic areas in the state of São PauloCrithidia fasciculataCrithidia fasciculataLeishmania sppLeishmania sppCãoCatDiversidadeDiversityDogGatoEstudos de caracterização e diversidade de Leishmania spp. vem sendo impulsionados, principalmente, pelos avanços das tecnologias de sequenciamento. Este estudo, teve o objetivo de diagnosticar, isolar e caracterizar por sequenciamento genômico (Whole Genomic Sequencing WGS), protozoários tripanossomatídeos de cães, gatos e dípteros flebotomíneos de áreas endêmicas para leishmanioses no estado de São Paulo, Brasil. A infecção por Leishmania (Leishmania) infantumfoi detectada em cães de áreas endêmicas e não endêmicas para leishmaniose visceral (LV). Gatos infectados por L. (L.) infantum e coinfectados por Crithidia fasciculata foram diagnosticados, apenas em áreas endêmicas para LV. A infecção por Leishmania (Leishmania) amazonensis foi identificada em um gato de município endêmico para leishmaniose tegumentar (LT). Vetores primários e secundários de LT e LV foram capturados, e a infecção por L. (L.) infantum detectada em fêmeas de Lutzomyia (Lutzomyia) longipalpis de área endêmica para LV. As análises genômicas, baseadas nas variantes de polimorfismos únicos (SNPs) mostraram maior taxa de SNPs nos isolados de L. (L.) infantum oriundos dos gatos. A PCA evidenciou divergências genéticas entre os isolados obtidos dos gatos, e desses com os dos cães. A predição de efeito variante retornou maiores impactos nos isolados dos gatos, localizados em genes do parasita, relacionados a processos biológicos, patogenicidade e resistência a fármacos. A diversidade entre os isolados refletiu, possivelmente, o hospedeiro, município e ano do isolado. Os resultados contribuem com novas informações sobre a infecção por Leishmaniinae em cães e gatos. Além de evidenciar a adaptabilidade genética de L. (L.) infantum frente a desafios impostos por diferentes hospedeiros e áreas geográficas no estado paulista. Contribuindo com o melhor entendimento da epidemiologia do parasita no estado.Studies on the characterization and diversity of Leishmania spp. have been driven mainly by advances in sequencing technologies. This study aimed to diagnose, isolate and characterize by Whole Genomic Sequencing (WGS) trypanosomatid protozoa from dogs, cats and phlebotomine dipterans from leishmaniases endemic areas in the state of São Paulo, Brazil. Leishmania (Leishmania) infantum infection was detected in dogs from endemic and non-endemic areas for visceral leishmaniasis (VL). Cats infected with L. (L.) infantum and co-infected with Crithidia fasciculatawere diagnosed only in VL endemic areas. Infection with Leishmania (Leishmania) amazonensis was identified in a cat from a municipality endemic for tegumentary leishmaniasis (TL). Primary and secondary vectors of TL and VL were captured, and infection with L. (L.) infantum detected in female Lutzomyia (Lutzomyia) longipalpis from an VL endemic. Genomic analysis based on single nucleotide polymorphisms (SNPs) showed a higher rate of SNPs in L. (L.) infantum isolates from cats. PCA showed genetic divergences between isolates obtained from cats, and between these and isolates from dogs. Variant effect prediction returned greater impacts in the cat isolates, located in parasite genes related to biological processes, pathogenicity and drug resistance. The diversity between isolates possibly reflected the host, municipality and year of isolation. The results provide new information about Leishmaniinae infection in dogs and cats. They also show the genetic adaptability of L. (L.) infantum to the challenges posed by different hosts and geographical areas in the state of São Paulo. Contributing to a better understanding of the epidemiology of the parasite in the state.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPOliveira, Trícia Maria Ferreira de SousaLeonel, João Augusto Franco2024-12-04info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-27022025-103618/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2026-03-12T13:15:09Zoai:teses.usp.br:tde-27022025-103618Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212026-03-12T13:15:09Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Identificação e caracterização genômica de tripanossomatídeos em animais domésticos e dípteros flebotomíneos (Diptera: Psychodidae: Phlebotominae) de áreas endêmicas para leishmanioses no estado de São Paulo
Identification and genomic characterization of trypanosomatids in domestic animals and phlebotomine sandflies (Diptera: Psychodidae: Phlebotominae) from leishmaniases endemic areas in the state of São Paulo
title Identificação e caracterização genômica de tripanossomatídeos em animais domésticos e dípteros flebotomíneos (Diptera: Psychodidae: Phlebotominae) de áreas endêmicas para leishmanioses no estado de São Paulo
spellingShingle Identificação e caracterização genômica de tripanossomatídeos em animais domésticos e dípteros flebotomíneos (Diptera: Psychodidae: Phlebotominae) de áreas endêmicas para leishmanioses no estado de São Paulo
Leonel, João Augusto Franco
Crithidia fasciculata
Crithidia fasciculata
Leishmania spp
Leishmania spp
Cão
Cat
Diversidade
Diversity
Dog
Gato
title_short Identificação e caracterização genômica de tripanossomatídeos em animais domésticos e dípteros flebotomíneos (Diptera: Psychodidae: Phlebotominae) de áreas endêmicas para leishmanioses no estado de São Paulo
title_full Identificação e caracterização genômica de tripanossomatídeos em animais domésticos e dípteros flebotomíneos (Diptera: Psychodidae: Phlebotominae) de áreas endêmicas para leishmanioses no estado de São Paulo
title_fullStr Identificação e caracterização genômica de tripanossomatídeos em animais domésticos e dípteros flebotomíneos (Diptera: Psychodidae: Phlebotominae) de áreas endêmicas para leishmanioses no estado de São Paulo
title_full_unstemmed Identificação e caracterização genômica de tripanossomatídeos em animais domésticos e dípteros flebotomíneos (Diptera: Psychodidae: Phlebotominae) de áreas endêmicas para leishmanioses no estado de São Paulo
title_sort Identificação e caracterização genômica de tripanossomatídeos em animais domésticos e dípteros flebotomíneos (Diptera: Psychodidae: Phlebotominae) de áreas endêmicas para leishmanioses no estado de São Paulo
author Leonel, João Augusto Franco
author_facet Leonel, João Augusto Franco
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Oliveira, Trícia Maria Ferreira de Sousa
dc.contributor.author.fl_str_mv Leonel, João Augusto Franco
dc.subject.por.fl_str_mv Crithidia fasciculata
Crithidia fasciculata
Leishmania spp
Leishmania spp
Cão
Cat
Diversidade
Diversity
Dog
Gato
topic Crithidia fasciculata
Crithidia fasciculata
Leishmania spp
Leishmania spp
Cão
Cat
Diversidade
Diversity
Dog
Gato
description Estudos de caracterização e diversidade de Leishmania spp. vem sendo impulsionados, principalmente, pelos avanços das tecnologias de sequenciamento. Este estudo, teve o objetivo de diagnosticar, isolar e caracterizar por sequenciamento genômico (Whole Genomic Sequencing WGS), protozoários tripanossomatídeos de cães, gatos e dípteros flebotomíneos de áreas endêmicas para leishmanioses no estado de São Paulo, Brasil. A infecção por Leishmania (Leishmania) infantumfoi detectada em cães de áreas endêmicas e não endêmicas para leishmaniose visceral (LV). Gatos infectados por L. (L.) infantum e coinfectados por Crithidia fasciculata foram diagnosticados, apenas em áreas endêmicas para LV. A infecção por Leishmania (Leishmania) amazonensis foi identificada em um gato de município endêmico para leishmaniose tegumentar (LT). Vetores primários e secundários de LT e LV foram capturados, e a infecção por L. (L.) infantum detectada em fêmeas de Lutzomyia (Lutzomyia) longipalpis de área endêmica para LV. As análises genômicas, baseadas nas variantes de polimorfismos únicos (SNPs) mostraram maior taxa de SNPs nos isolados de L. (L.) infantum oriundos dos gatos. A PCA evidenciou divergências genéticas entre os isolados obtidos dos gatos, e desses com os dos cães. A predição de efeito variante retornou maiores impactos nos isolados dos gatos, localizados em genes do parasita, relacionados a processos biológicos, patogenicidade e resistência a fármacos. A diversidade entre os isolados refletiu, possivelmente, o hospedeiro, município e ano do isolado. Os resultados contribuem com novas informações sobre a infecção por Leishmaniinae em cães e gatos. Além de evidenciar a adaptabilidade genética de L. (L.) infantum frente a desafios impostos por diferentes hospedeiros e áreas geográficas no estado paulista. Contribuindo com o melhor entendimento da epidemiologia do parasita no estado.
publishDate 2024
dc.date.none.fl_str_mv 2024-12-04
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-27022025-103618/
url https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-27022025-103618/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1865492436126531584