Identificação e caracterização genômica de tripanossomatídeos em animais domésticos e dípteros flebotomíneos (Diptera: Psychodidae: Phlebotominae) de áreas endêmicas para leishmanioses no estado de São Paulo
| Ano de defesa: | 2024 |
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| Tipo de documento: | Tese |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
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| Instituição de defesa: |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
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| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
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| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-27022025-103618/ |
Resumo: | Estudos de caracterização e diversidade de Leishmania spp. vem sendo impulsionados, principalmente, pelos avanços das tecnologias de sequenciamento. Este estudo, teve o objetivo de diagnosticar, isolar e caracterizar por sequenciamento genômico (Whole Genomic Sequencing WGS), protozoários tripanossomatídeos de cães, gatos e dípteros flebotomíneos de áreas endêmicas para leishmanioses no estado de São Paulo, Brasil. A infecção por Leishmania (Leishmania) infantumfoi detectada em cães de áreas endêmicas e não endêmicas para leishmaniose visceral (LV). Gatos infectados por L. (L.) infantum e coinfectados por Crithidia fasciculata foram diagnosticados, apenas em áreas endêmicas para LV. A infecção por Leishmania (Leishmania) amazonensis foi identificada em um gato de município endêmico para leishmaniose tegumentar (LT). Vetores primários e secundários de LT e LV foram capturados, e a infecção por L. (L.) infantum detectada em fêmeas de Lutzomyia (Lutzomyia) longipalpis de área endêmica para LV. As análises genômicas, baseadas nas variantes de polimorfismos únicos (SNPs) mostraram maior taxa de SNPs nos isolados de L. (L.) infantum oriundos dos gatos. A PCA evidenciou divergências genéticas entre os isolados obtidos dos gatos, e desses com os dos cães. A predição de efeito variante retornou maiores impactos nos isolados dos gatos, localizados em genes do parasita, relacionados a processos biológicos, patogenicidade e resistência a fármacos. A diversidade entre os isolados refletiu, possivelmente, o hospedeiro, município e ano do isolado. Os resultados contribuem com novas informações sobre a infecção por Leishmaniinae em cães e gatos. Além de evidenciar a adaptabilidade genética de L. (L.) infantum frente a desafios impostos por diferentes hospedeiros e áreas geográficas no estado paulista. Contribuindo com o melhor entendimento da epidemiologia do parasita no estado. |
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Identificação e caracterização genômica de tripanossomatídeos em animais domésticos e dípteros flebotomíneos (Diptera: Psychodidae: Phlebotominae) de áreas endêmicas para leishmanioses no estado de São PauloIdentification and genomic characterization of trypanosomatids in domestic animals and phlebotomine sandflies (Diptera: Psychodidae: Phlebotominae) from leishmaniases endemic areas in the state of São PauloCrithidia fasciculataCrithidia fasciculataLeishmania sppLeishmania sppCãoCatDiversidadeDiversityDogGatoEstudos de caracterização e diversidade de Leishmania spp. vem sendo impulsionados, principalmente, pelos avanços das tecnologias de sequenciamento. Este estudo, teve o objetivo de diagnosticar, isolar e caracterizar por sequenciamento genômico (Whole Genomic Sequencing WGS), protozoários tripanossomatídeos de cães, gatos e dípteros flebotomíneos de áreas endêmicas para leishmanioses no estado de São Paulo, Brasil. A infecção por Leishmania (Leishmania) infantumfoi detectada em cães de áreas endêmicas e não endêmicas para leishmaniose visceral (LV). Gatos infectados por L. (L.) infantum e coinfectados por Crithidia fasciculata foram diagnosticados, apenas em áreas endêmicas para LV. A infecção por Leishmania (Leishmania) amazonensis foi identificada em um gato de município endêmico para leishmaniose tegumentar (LT). Vetores primários e secundários de LT e LV foram capturados, e a infecção por L. (L.) infantum detectada em fêmeas de Lutzomyia (Lutzomyia) longipalpis de área endêmica para LV. As análises genômicas, baseadas nas variantes de polimorfismos únicos (SNPs) mostraram maior taxa de SNPs nos isolados de L. (L.) infantum oriundos dos gatos. A PCA evidenciou divergências genéticas entre os isolados obtidos dos gatos, e desses com os dos cães. A predição de efeito variante retornou maiores impactos nos isolados dos gatos, localizados em genes do parasita, relacionados a processos biológicos, patogenicidade e resistência a fármacos. A diversidade entre os isolados refletiu, possivelmente, o hospedeiro, município e ano do isolado. Os resultados contribuem com novas informações sobre a infecção por Leishmaniinae em cães e gatos. Além de evidenciar a adaptabilidade genética de L. (L.) infantum frente a desafios impostos por diferentes hospedeiros e áreas geográficas no estado paulista. Contribuindo com o melhor entendimento da epidemiologia do parasita no estado.Studies on the characterization and diversity of Leishmania spp. have been driven mainly by advances in sequencing technologies. This study aimed to diagnose, isolate and characterize by Whole Genomic Sequencing (WGS) trypanosomatid protozoa from dogs, cats and phlebotomine dipterans from leishmaniases endemic areas in the state of São Paulo, Brazil. Leishmania (Leishmania) infantum infection was detected in dogs from endemic and non-endemic areas for visceral leishmaniasis (VL). Cats infected with L. (L.) infantum and co-infected with Crithidia fasciculatawere diagnosed only in VL endemic areas. Infection with Leishmania (Leishmania) amazonensis was identified in a cat from a municipality endemic for tegumentary leishmaniasis (TL). Primary and secondary vectors of TL and VL were captured, and infection with L. (L.) infantum detected in female Lutzomyia (Lutzomyia) longipalpis from an VL endemic. Genomic analysis based on single nucleotide polymorphisms (SNPs) showed a higher rate of SNPs in L. (L.) infantum isolates from cats. PCA showed genetic divergences between isolates obtained from cats, and between these and isolates from dogs. Variant effect prediction returned greater impacts in the cat isolates, located in parasite genes related to biological processes, pathogenicity and drug resistance. The diversity between isolates possibly reflected the host, municipality and year of isolation. The results provide new information about Leishmaniinae infection in dogs and cats. They also show the genetic adaptability of L. (L.) infantum to the challenges posed by different hosts and geographical areas in the state of São Paulo. Contributing to a better understanding of the epidemiology of the parasite in the state.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPOliveira, Trícia Maria Ferreira de SousaLeonel, João Augusto Franco2024-12-04info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-27022025-103618/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2026-03-12T13:15:09Zoai:teses.usp.br:tde-27022025-103618Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212026-03-12T13:15:09Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
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Estudos de caracterização e diversidade de Leishmania spp. vem sendo impulsionados, principalmente, pelos avanços das tecnologias de sequenciamento. Este estudo, teve o objetivo de diagnosticar, isolar e caracterizar por sequenciamento genômico (Whole Genomic Sequencing WGS), protozoários tripanossomatídeos de cães, gatos e dípteros flebotomíneos de áreas endêmicas para leishmanioses no estado de São Paulo, Brasil. A infecção por Leishmania (Leishmania) infantumfoi detectada em cães de áreas endêmicas e não endêmicas para leishmaniose visceral (LV). Gatos infectados por L. (L.) infantum e coinfectados por Crithidia fasciculata foram diagnosticados, apenas em áreas endêmicas para LV. A infecção por Leishmania (Leishmania) amazonensis foi identificada em um gato de município endêmico para leishmaniose tegumentar (LT). Vetores primários e secundários de LT e LV foram capturados, e a infecção por L. (L.) infantum detectada em fêmeas de Lutzomyia (Lutzomyia) longipalpis de área endêmica para LV. As análises genômicas, baseadas nas variantes de polimorfismos únicos (SNPs) mostraram maior taxa de SNPs nos isolados de L. (L.) infantum oriundos dos gatos. A PCA evidenciou divergências genéticas entre os isolados obtidos dos gatos, e desses com os dos cães. A predição de efeito variante retornou maiores impactos nos isolados dos gatos, localizados em genes do parasita, relacionados a processos biológicos, patogenicidade e resistência a fármacos. A diversidade entre os isolados refletiu, possivelmente, o hospedeiro, município e ano do isolado. Os resultados contribuem com novas informações sobre a infecção por Leishmaniinae em cães e gatos. Além de evidenciar a adaptabilidade genética de L. (L.) infantum frente a desafios impostos por diferentes hospedeiros e áreas geográficas no estado paulista. Contribuindo com o melhor entendimento da epidemiologia do parasita no estado. |
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