Controle de um sistema para imageamento hiperespectral de lesões de pele
| Ano de defesa: | 2024 |
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| Orientador(a): | |
| Banca de defesa: | |
| Tipo de documento: | Dissertação |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
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| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
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| Departamento: |
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| País: |
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| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/82/82131/tde-18062025-095748/ |
Resumo: | O imageamento hiperespectral (HSI) emergiu como uma tecnologia promissora no monitoramento e acompanhamento de lesões cutâneas, além de possibilitar a estimativa das concentrações de cromóforos e fluoróforos da pele. No entanto, em virtude as características ópticas do sistema e grande volume de dados associado as técnicas hiperespectrais tende ser a um desafio em âmbito de hardware e software. Assim, o presente trabalho desenvolveu um sistema de aquisição de imagens hiperespectral, focado em otimizar o tempo de aquisição do conjunto dados e contraste das imagens, além de possuir modularidade e suporte a integração com bibliotecas de redes neurais e inteligência artificial. O sistema contou com o uso de uma câmera digital monocromática CMOS, acoplada a uma lente objetiva e a um filtro sintonizável de cristal líquido (LCTF), com banda espectral do visível. Foram levantados modelos físicos para cada componente do sistema, visando melhorar o tempo de aquisição e e contraste das imagens e utilizou-se a técnica de varredura espectral para coletar as imagens. Elaborou-se também um software específico para o controle da instrumentação e aquisição das imagens hiperespectrais, no qual desenvolveu-se a biblioteca de controle do LCTF e utilizou-se a biblioteca Instrumental para a câmera. Coletou-se dados de dois experimentos: oclusão e modelos murinos. O experimento de oclusão consistiu-se coletar imagens da mão de um voluntário em três etapas: repouso, oclusão e a liberação. O outro experimento monitorou a evolução de tumores de melanomas em 4 animais, em três momentos: na inoculação, um dia após a inoculação e no dia da extração do tumor. Estimou-se os mapas saturação de oxigenação tecidual a partir do método da razão. Extraiu-se, então, a curva de perfil de SO2 da região vascularizada e tomou-se a média dos pixels dessa região dos mapas do experimento de oclusão. No experimento em modelo murino, extraiu-se a curva de perfil de SO2 da região tumoral e tomou-se a média dos pixels dessa região. Da análise dos resultados, verificou-se deficiências quanto à fonte luminosa para comprimentos de onda abaixo de 420 nm e limitações de tempo da câmera no processo de aquisição. O funcionamento das bibliotecas isoladas se mostrou consistente e, após a integração, o comportamento se manteve. Os resultados do experimentos de oclusão apresentaram comportamentos coerentes com a desoxigenação e reoxigenação. Enquanto que os resultados do modelo murino, mostram uma progressão de SO2 na região do tumor e a formação de zonas de depleção nas vizinhanças do melanoma. Portanto, verificou-se a viabilidade e a confiança da instrumentação e software desenvolvidos para aplicações para extração de parâmetros óticos da pele e monitoramento de lesões de pele. |
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Controle de um sistema para imageamento hiperespectral de lesões de peleControl of a system for hyperspectral imaging of skin lesionsacquisition timedeoxyhemoglobindesoxiemoglobinahyperspectral imagingimageamento hiperespectraloxiemoglobinaoxyhemoglobinpixelclockpixelclockspectral scanningtempo de aquisiçãovarredura espectralO imageamento hiperespectral (HSI) emergiu como uma tecnologia promissora no monitoramento e acompanhamento de lesões cutâneas, além de possibilitar a estimativa das concentrações de cromóforos e fluoróforos da pele. No entanto, em virtude as características ópticas do sistema e grande volume de dados associado as técnicas hiperespectrais tende ser a um desafio em âmbito de hardware e software. Assim, o presente trabalho desenvolveu um sistema de aquisição de imagens hiperespectral, focado em otimizar o tempo de aquisição do conjunto dados e contraste das imagens, além de possuir modularidade e suporte a integração com bibliotecas de redes neurais e inteligência artificial. O sistema contou com o uso de uma câmera digital monocromática CMOS, acoplada a uma lente objetiva e a um filtro sintonizável de cristal líquido (LCTF), com banda espectral do visível. Foram levantados modelos físicos para cada componente do sistema, visando melhorar o tempo de aquisição e e contraste das imagens e utilizou-se a técnica de varredura espectral para coletar as imagens. Elaborou-se também um software específico para o controle da instrumentação e aquisição das imagens hiperespectrais, no qual desenvolveu-se a biblioteca de controle do LCTF e utilizou-se a biblioteca Instrumental para a câmera. Coletou-se dados de dois experimentos: oclusão e modelos murinos. O experimento de oclusão consistiu-se coletar imagens da mão de um voluntário em três etapas: repouso, oclusão e a liberação. O outro experimento monitorou a evolução de tumores de melanomas em 4 animais, em três momentos: na inoculação, um dia após a inoculação e no dia da extração do tumor. Estimou-se os mapas saturação de oxigenação tecidual a partir do método da razão. Extraiu-se, então, a curva de perfil de SO2 da região vascularizada e tomou-se a média dos pixels dessa região dos mapas do experimento de oclusão. No experimento em modelo murino, extraiu-se a curva de perfil de SO2 da região tumoral e tomou-se a média dos pixels dessa região. Da análise dos resultados, verificou-se deficiências quanto à fonte luminosa para comprimentos de onda abaixo de 420 nm e limitações de tempo da câmera no processo de aquisição. O funcionamento das bibliotecas isoladas se mostrou consistente e, após a integração, o comportamento se manteve. Os resultados do experimentos de oclusão apresentaram comportamentos coerentes com a desoxigenação e reoxigenação. Enquanto que os resultados do modelo murino, mostram uma progressão de SO2 na região do tumor e a formação de zonas de depleção nas vizinhanças do melanoma. Portanto, verificou-se a viabilidade e a confiança da instrumentação e software desenvolvidos para aplicações para extração de parâmetros óticos da pele e monitoramento de lesões de pele.Hyperspectral imaging (HSI) has emerged as a promising technology for monitoring and tracking skin lesions, in addition to enabling the estimation of chromophore and fluorophore concentrations in the skin. However, due to the optical characteristics of the system and the large volume of data associated with hyperspectral techniques, it poses challenges in both hardware and software domains. Therefore, this work developed a hyperspectral imaging acquisition system focused on optimizing data acquisition time and image contrast, while also offering modularity and support for integration with neural network and artificial intelligence libraries. The system utilized a monochromatic CMOS digital camera, coupled with an objective lens and a liquid crystal tunable filter (LCTF), operating within the visible spectral band. Physical models were developed for each component of the system to improve acquisition time and image contrast, and the spectral scanning technique was used to collect the images. A specific software was also developed to control the instrumentation and acquire hyperspectral images, where the LCTF control library was developed and the Instrumental library was used for the camera. Data from two experiments were collected: occlusion and murine models. The occlusion experiment involved collecting images of a volunteers hand in three stages: rest, occlusion, and release. The other experiment monitored the progression of melanoma tumors in 4 animals at three time points: at inoculation, one day after inoculation, and on the day of tumor extraction. Tissue oxygenation saturation maps were estimated using the ratio method. The SO2 profile curve of the vascularized region was extracted, and the pixel averages of that region were taken from the occlusion experiment maps. In the murine model experiment, the SO2 profile curve of the tumor region was extracted, and the pixel averages of that region were taken. Analysis of the results revealed deficiencies in the light source for wavelengths below 420 nm and limitations in the cameras acquisition time. The isolated libraries functioned consistently, and after integration, the behavior remained stable. The occlusion experiment results showed patterns consistent with deoxygenation and reoxygenation. In contrast, the murine model results demonstrated a progression of SO2 in the tumor region and the formation of depletion zones in the vicinity of the melanoma. Therefore, the viability and reliability of the developed instrumentation and software for applications in extracting skin optical parameters and monitoring skin lesions were confirmed.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPGarcia, Marlon RodriguesVieira, Bruno Freitas2024-06-24info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/82/82131/tde-18062025-095748/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2025-06-23T14:32:02Zoai:teses.usp.br:tde-18062025-095748Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212025-06-23T14:32:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
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