Investigação dos mecanismos de maturação de hepatócitos derivados de células iPS humanas in vitro
| Ano de defesa: | 2025 |
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| Tipo de documento: | Tese |
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Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
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| Programa de Pós-Graduação: |
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| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41131/tde-23022026-194508/ |
Resumo: | INTRODUÇÃO: O fígado desempenha um papel crucial na regulação metabólica, imunológica e homeostática. As doenças hepáticas crônicas e agudas são responsáveis por aproximadamente 2 milhões de mortes por ano mundialmente. Para doenças hepáticas graves, a única opção terapêutica é o transplante hepático parcial ou total. A engenharia de tecidos hepáticos usando a tecnologia de células-tronco pluripotentes induzidas humanas (hiPSC) apresenta uma alternativa aos métodos tradicionais. No entanto, a diferenciação de hiPSCs em hepatócitos in vitro resulta em células com fenótipo predominantemente fetal, dificultando a modelagem do desenvolvimento embrionário e de doenças hepáticas. A proteína topoisomerase II (TOP2) e seu fator de transcrição, forkhead box M1 (FOXM1), são silenciados durante o desenvolvimento embrionário tardio do fígado, correlacionando-se com a diferenciação terminal de hepatócitos, mas seus papéis permanecem desconhecidos. OBJETIVOS: Este projeto visa investigar os mecanismos moleculares envolvidos na maturação de hepatócitos derivados de iPSCs humanas em resposta à inibição química de TOP2 ou FOXM1. MÉTODOS: hiPSCs foram diferenciadas em células semelhantes a hepatócitos (HLCs). Os HLCs foram tratados com etoposídeo, um inibidor de TOP2, e RCM-1, um inibidor de FOXM1. A maturação dos HLCs e os mecanismos moleculares foram avaliados por diversos ensaios, especialmente citometria de fluxo, imunofluorescência, RT-qPCR, RNA-seq, ATAC-seq, Hi-C e proteômica. RESULTADOS: A inibição subtóxica de TOP2 reduziu a condensação da cromatina nuclear sem causar danos ao DNA. A análise de RNA-seq revelou que a inibição de TOP2 foi seletiva para TOP2A e induziu a parada do ciclo celular, acompanhada por regulação negativa de FOXM1. O ATAC-seq demonstrou que a inibição de TOP2A diminuiu a acessibilidade global da cromatina e modulou a via Wnt/-catenina. A análise dos domínios da cromatina por Hi-C não revelou diferenças significativas, reforçando a inibição seletiva de TOP2A. A análise proteômica indicou que a inibição de FOXM1 modulou a abundância de TOP2A, replicou a parada do ciclo celular induzida pela inibição de TOP2A e reduziu a abundância de proteínas de hepatócitos fetais (HBG1/2, UGT2B7, and AFP). A inibição prolongada do FOXM1 foi associada ao aumento da poliploidização dos hepatócitos, aumento da atividade do CYP450 e melhora do metabolismo lipídico. CONCLUSÕES: Nossos achados sugerem que a inibição de FOXM1 10 promove a diferenciação terminal de hepatócitos humanos derivados de iPSCs, destacando papéis potenciais de FOXM1 e TOP2A na modelagem do desenvolvimento, regeneração e patologia hepáticos. CONTRIBUIÇÕES: Esta tese sugere que o FOXM1 é necessário para converter hepatócitos proliferativos em quiescentes. A regeneração hepática requer a reversão da quiescência hepática e a ativação da proliferação. Portanto, propomos a tese de que o FOXM1 é o regulador mestre da interconversão entre proliferação e quiescência em hepatócitos humanos, potencialmente explicando a capacidade regenerativa única do fígado. Esta tese requer validação por meio de trabalhos acadêmicos subsequentes de antítese e síntese. |
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Investigação dos mecanismos de maturação de hepatócitos derivados de células iPS humanas in vitroInvestigation on the maturation mechanisms of human iPSC-derived hepatocytes in vitroCélulas iPSC humanasFígadoFOXM1FOXM1HepatócitosHepatocytesHuman iPSCsLiverPoliploidização.Polyploidization.TOP2ATOP2AINTRODUÇÃO: O fígado desempenha um papel crucial na regulação metabólica, imunológica e homeostática. As doenças hepáticas crônicas e agudas são responsáveis por aproximadamente 2 milhões de mortes por ano mundialmente. Para doenças hepáticas graves, a única opção terapêutica é o transplante hepático parcial ou total. A engenharia de tecidos hepáticos usando a tecnologia de células-tronco pluripotentes induzidas humanas (hiPSC) apresenta uma alternativa aos métodos tradicionais. No entanto, a diferenciação de hiPSCs em hepatócitos in vitro resulta em células com fenótipo predominantemente fetal, dificultando a modelagem do desenvolvimento embrionário e de doenças hepáticas. A proteína topoisomerase II (TOP2) e seu fator de transcrição, forkhead box M1 (FOXM1), são silenciados durante o desenvolvimento embrionário tardio do fígado, correlacionando-se com a diferenciação terminal de hepatócitos, mas seus papéis permanecem desconhecidos. OBJETIVOS: Este projeto visa investigar os mecanismos moleculares envolvidos na maturação de hepatócitos derivados de iPSCs humanas em resposta à inibição química de TOP2 ou FOXM1. MÉTODOS: hiPSCs foram diferenciadas em células semelhantes a hepatócitos (HLCs). Os HLCs foram tratados com etoposídeo, um inibidor de TOP2, e RCM-1, um inibidor de FOXM1. A maturação dos HLCs e os mecanismos moleculares foram avaliados por diversos ensaios, especialmente citometria de fluxo, imunofluorescência, RT-qPCR, RNA-seq, ATAC-seq, Hi-C e proteômica. RESULTADOS: A inibição subtóxica de TOP2 reduziu a condensação da cromatina nuclear sem causar danos ao DNA. A análise de RNA-seq revelou que a inibição de TOP2 foi seletiva para TOP2A e induziu a parada do ciclo celular, acompanhada por regulação negativa de FOXM1. O ATAC-seq demonstrou que a inibição de TOP2A diminuiu a acessibilidade global da cromatina e modulou a via Wnt/-catenina. A análise dos domínios da cromatina por Hi-C não revelou diferenças significativas, reforçando a inibição seletiva de TOP2A. A análise proteômica indicou que a inibição de FOXM1 modulou a abundância de TOP2A, replicou a parada do ciclo celular induzida pela inibição de TOP2A e reduziu a abundância de proteínas de hepatócitos fetais (HBG1/2, UGT2B7, and AFP). A inibição prolongada do FOXM1 foi associada ao aumento da poliploidização dos hepatócitos, aumento da atividade do CYP450 e melhora do metabolismo lipídico. CONCLUSÕES: Nossos achados sugerem que a inibição de FOXM1 10 promove a diferenciação terminal de hepatócitos humanos derivados de iPSCs, destacando papéis potenciais de FOXM1 e TOP2A na modelagem do desenvolvimento, regeneração e patologia hepáticos. CONTRIBUIÇÕES: Esta tese sugere que o FOXM1 é necessário para converter hepatócitos proliferativos em quiescentes. A regeneração hepática requer a reversão da quiescência hepática e a ativação da proliferação. Portanto, propomos a tese de que o FOXM1 é o regulador mestre da interconversão entre proliferação e quiescência em hepatócitos humanos, potencialmente explicando a capacidade regenerativa única do fígado. Esta tese requer validação por meio de trabalhos acadêmicos subsequentes de antítese e síntese.INTRODUCTION: The liver plays a crucial role in metabolic, immunological, and homeostatic regulation. Chronic and acute liver diseases are responsible for approximately 2 million deaths per year worldwide. For severe liver disease, the only therapeutic option is partial or total liver transplantation. Liver tissue engineering using human induced pluripotent stem cell (hiPSC) technology presents an alternative to traditional methods. However, the differentiation of hiPSCs into hepatocytes in vitro produces cells with a predominantly fetal phenotype, hampering in vitro modeling of the liver embryonic development and disease. The protein topoisomerase II (TOP2) and its transcription factor, forkhead box M1 (FOXM1), are silenced during late embryonic development of the liver, correlating with terminal hepatocyte differentiation, but their roles in this process remain unknown. OBJECTIVES: This project aims to investigate the molecular mechanisms involved in the maturation of human iPSC-derived hepatocytes in response to chemical inhibition of TOP2 or FOXM1. METHODS: hiPSCs were differentiated into hepatocyte-like cells (HLCs). The HLCs were treated with etoposide, a TOP2 inhibitor, and RCM-1, a FOXM1 inhibitor. The maturation of the HLCs and the molecular mechanisms were evaluated by several assays, especially flow cytometry, immunofluorescence, RT-qPCR, RNA-seq, ATAC-seq, Hi-C, and proteomics. RESULTS: Subtoxic inhibition of TOP2 reduced nuclear chromatin condensation without causing DNA damage. RNA-seq analysis revealed that TOP2 inhibition was selective for TOP2A and induced cell cycle arrest, accompanied by FOXM1 downregulation. ATAC-seq demonstrated that TOP2A inhibition decreased global chromatin accessibility and modulated the Wnt/-catenin pathway. Chromatin domain analysis by Hi-C did not reveal significant differences, reinforcing the selective inhibition of TOP2A. Proteomic analysis indicated that FOXM1 inhibition modulated the abundance of TOP2A, replicated cell cycle arrest induced by TOP2A inhibition, and reduced the abundance of fetal hepatocyte proteins (HBG1/2, UGT2B7, and AFP). Prolonged inhibition of FOXM1 was associated with increased hepatocyte polyploidization, increased CYP450 activity, and improved lipid metabolism. CONCLUSIONS: Our findings suggest that FOXM1 inhibition promotes terminal differentiation of human hepatocytes derived from iPSCs, highlighting potential roles of FOXM1 and TOP2A in shaping liver development, regeneration, and pathology. 12 CONTRIBUTIONS: Through this thesis, we propose that FOXM1 is required to convert proliferative into quiescent hepatocytes. Liver regeneration requires reversal of hepatic quiescence and activation of proliferation. Therefore, our thesis is that FOXM1 is the master regulator of the tradeoff between proliferation and quiescence in human hepatocytes, potentially explaining the unique regenerative capacity of the liver. This thesis requires validation through subsequent academic antitheses and syntheses.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPZatz, MayanaSilva, Kayque Alves Telles2025-12-17info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41131/tde-23022026-194508/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2026-02-24T18:41:02Zoai:teses.usp.br:tde-23022026-194508Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212026-02-24T18:41:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
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INTRODUÇÃO: O fígado desempenha um papel crucial na regulação metabólica, imunológica e homeostática. As doenças hepáticas crônicas e agudas são responsáveis por aproximadamente 2 milhões de mortes por ano mundialmente. Para doenças hepáticas graves, a única opção terapêutica é o transplante hepático parcial ou total. A engenharia de tecidos hepáticos usando a tecnologia de células-tronco pluripotentes induzidas humanas (hiPSC) apresenta uma alternativa aos métodos tradicionais. No entanto, a diferenciação de hiPSCs em hepatócitos in vitro resulta em células com fenótipo predominantemente fetal, dificultando a modelagem do desenvolvimento embrionário e de doenças hepáticas. A proteína topoisomerase II (TOP2) e seu fator de transcrição, forkhead box M1 (FOXM1), são silenciados durante o desenvolvimento embrionário tardio do fígado, correlacionando-se com a diferenciação terminal de hepatócitos, mas seus papéis permanecem desconhecidos. OBJETIVOS: Este projeto visa investigar os mecanismos moleculares envolvidos na maturação de hepatócitos derivados de iPSCs humanas em resposta à inibição química de TOP2 ou FOXM1. MÉTODOS: hiPSCs foram diferenciadas em células semelhantes a hepatócitos (HLCs). Os HLCs foram tratados com etoposídeo, um inibidor de TOP2, e RCM-1, um inibidor de FOXM1. A maturação dos HLCs e os mecanismos moleculares foram avaliados por diversos ensaios, especialmente citometria de fluxo, imunofluorescência, RT-qPCR, RNA-seq, ATAC-seq, Hi-C e proteômica. RESULTADOS: A inibição subtóxica de TOP2 reduziu a condensação da cromatina nuclear sem causar danos ao DNA. A análise de RNA-seq revelou que a inibição de TOP2 foi seletiva para TOP2A e induziu a parada do ciclo celular, acompanhada por regulação negativa de FOXM1. O ATAC-seq demonstrou que a inibição de TOP2A diminuiu a acessibilidade global da cromatina e modulou a via Wnt/-catenina. A análise dos domínios da cromatina por Hi-C não revelou diferenças significativas, reforçando a inibição seletiva de TOP2A. A análise proteômica indicou que a inibição de FOXM1 modulou a abundância de TOP2A, replicou a parada do ciclo celular induzida pela inibição de TOP2A e reduziu a abundância de proteínas de hepatócitos fetais (HBG1/2, UGT2B7, and AFP). A inibição prolongada do FOXM1 foi associada ao aumento da poliploidização dos hepatócitos, aumento da atividade do CYP450 e melhora do metabolismo lipídico. CONCLUSÕES: Nossos achados sugerem que a inibição de FOXM1 10 promove a diferenciação terminal de hepatócitos humanos derivados de iPSCs, destacando papéis potenciais de FOXM1 e TOP2A na modelagem do desenvolvimento, regeneração e patologia hepáticos. CONTRIBUIÇÕES: Esta tese sugere que o FOXM1 é necessário para converter hepatócitos proliferativos em quiescentes. A regeneração hepática requer a reversão da quiescência hepática e a ativação da proliferação. Portanto, propomos a tese de que o FOXM1 é o regulador mestre da interconversão entre proliferação e quiescência em hepatócitos humanos, potencialmente explicando a capacidade regenerativa única do fígado. Esta tese requer validação por meio de trabalhos acadêmicos subsequentes de antítese e síntese. |
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