Unificando dados de interações bióticas: terminologia, análise de dados, padronização e proposta de um esquema de dados para interações planta-polinizador.

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2023
Autor(a) principal: Salim, José Augusto
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/3/3141/tde-03012024-110904/
Resumo: As interações bióticas são essenciais para a biodiversidade, comunidades ecológicas e o funcionamento dos ecossistemas, mas os dados primários encontram-se limitados em termos de acessibilidade e padronização. Com o aumento da disponibilidade de dados de interação biótica, há uma crescente demanda pela documentação adequada dos dados, a fim de aprimorar a agregação, reutilização e interoperabilidade dos dados. Embora a adoção do padrão Darwin Core para dados de biodiversidade seja amplamente difundida, sua aplicação em dados de interações bióticas é limitada devido `a falta de esquemas de dados especializados, vocabulários e diretrizes. Este estudo tem como objetivo desenvolver um modelo de dados utilizando o padrão Darwin Core para compartilhamento de dados de interações bióticas, juntamente com um vocabulário de termos especializado para a padronização de dados de interações planta-polinizador. Inicialmente uma revisão dos conceitos e terminologia utilizados na comunidade de pesquisa foi realizada, destacando os principais elementos de dados que estão alinhados com o conhecimento estado-da-arte na área. Os conjuntos de dados existentes também foram explorados em relação aos formatos, metadados e padronização empregados. A revisão das publicações científicas enfatiza a importância de alinhar a terminologia utilizada pela comunidade, a fim de garantir clareza e consistência na interpretação e análise dos dados de interações bióticas. A revisão dos conjuntos de dados existentes revelou limitações na interoperabilidade e na reutilização dos dados, destacando a necessidade de formatos padronizados e inclusão de metadados. Com base nesses achados, o novo esquema de dados e o vocabulário de termos visam capturar uma representação contextualizada e mais realista das interações bióticas. O processo de desenvolvimento adotado enfatiza uma abordagem voltada para a comunidade, priorizando o envolvimento e a contribuição da comunidade. O vocabulário desenvolvido representa um passo significativo em direção à integração de dados e interoperabilidade no campo da Biologia da Polinização. No geral, os resultados contribuem para o avanço na padronização dos dados de interações bióticas.
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Embora a adoção do padrão Darwin Core para dados de biodiversidade seja amplamente difundida, sua aplicação em dados de interações bióticas é limitada devido `a falta de esquemas de dados especializados, vocabulários e diretrizes. Este estudo tem como objetivo desenvolver um modelo de dados utilizando o padrão Darwin Core para compartilhamento de dados de interações bióticas, juntamente com um vocabulário de termos especializado para a padronização de dados de interações planta-polinizador. Inicialmente uma revisão dos conceitos e terminologia utilizados na comunidade de pesquisa foi realizada, destacando os principais elementos de dados que estão alinhados com o conhecimento estado-da-arte na área. Os conjuntos de dados existentes também foram explorados em relação aos formatos, metadados e padronização empregados. A revisão das publicações científicas enfatiza a importância de alinhar a terminologia utilizada pela comunidade, a fim de garantir clareza e consistência na interpretação e análise dos dados de interações bióticas. A revisão dos conjuntos de dados existentes revelou limitações na interoperabilidade e na reutilização dos dados, destacando a necessidade de formatos padronizados e inclusão de metadados. Com base nesses achados, o novo esquema de dados e o vocabulário de termos visam capturar uma representação contextualizada e mais realista das interações bióticas. O processo de desenvolvimento adotado enfatiza uma abordagem voltada para a comunidade, priorizando o envolvimento e a contribuição da comunidade. O vocabulário desenvolvido representa um passo significativo em direção à integração de dados e interoperabilidade no campo da Biologia da Polinização. No geral, os resultados contribuem para o avanço na padronização dos dados de interações bióticas.Biotic interactions are essential for biodiversity, ecological communities, and ecosystem functioning, but primary data are limited in terms of accessibility and standardization. As the availability of biotic interaction data increases, there has been a growing demand to properly document data to enhance data aggregation, reuse and interoperability. While the adoption of the Darwin Core standard for biodiversity data is widespread, its application to biotic interactions data is limited due to the lack of specialized data schemas, vocabularies and guidelines. This study aims to develop a data model using the Darwin Core standard for sharing biotic interactions data, along with a specialized vocabulary of terms for the standardization of plant-pollinator interactions data. This was initially addressed by reviewing the concepts and terminology used in the research community, highlighting the key data elements that align with state-of-the-art knowledge in the field. The existing datasets were also explored for formats, metadata and data standardization. The review of scientific publications emphasizes the importance of aligning the existing terminology within the community of practice to ensure clarity and consistency in the interpretation and analysis of biotic interactions data. The review of existing datasets revealed the limitations in interoperability and data reuse, emphasizing the need for standardized formats and metadata annotation. Based on these findings, the novel data schema and vocabulary of terms aim to capture a contextualized and more realistic representation of biotic interactions and facilitate data sharing and analysis. The development process emphasizes a community-driven approach, prioritizing the engagement and input of the community of practice. The developed vocabulary represents a significant step towards data exchange and interoperability in the field of Pollination Biology. Overall, the findings contribute to the advancement of standardizing biotic interactions data.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPSaraiva, Antonio MauroSalim, José Augusto2023-10-02info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/3/3141/tde-03012024-110904/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2024-10-09T12:45:10Zoai:teses.usp.br:tde-03012024-110904Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212024-10-09T12:45:10Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
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