Estudo da relação quantitativa entre estrutura e atividade antioxidante de compostos flavonóides

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2004
Autor(a) principal: Weber, Karen Cacilda
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/75/75131/tde-21072025-170153/
Resumo: O presente trabalho teve como intuito a investigação dos requerimentos estruturais necessários à atividade antioxidante de uma série de 22 compostos flavonóides, representados por diversos descritores moleculares, utilizando métodos quimiométricos para a construção de modelos qualitativos e quantitativos da relação estrutura-atividade. Partindo das estruturas otimizadas pelo método MM+ e, posteriormente , pelo método semi-empírico AM1, propriedades eletrônicas, geométricas e topológicas foram calculadas. Após uma redução do número de variáveis calculadas, e tendo sido eliminadas as variáveis apresentando altas correlações entre si, algumas variáveis foram testadas em diversas combinações nas análises exploratórias PCA e HCA. As variáveis selecionadas dessa maneira foram testadas com os métodos de classificação KNN e SIMCA. O melhor modelo encontrado foi aquele obtido com as seguintes variáveis: polarizabilidade ( α), carga total sobre o substituinte 5 (QS5) e carga total sobre o substituinte 3\' (QS3\'). A aplicação do método PCA resultou na separação dos compostos em dois grupos: compostos mais antioxidants (log TEAC > 0,41) e menos antioxidants (log TEAC ≤ 0,41). Este resultado foi confirmado pela análise HCA. O método KNN classificou corretamente os compostos em duas classes, que correspondem aos dois grupos obtidos pelo PCA, quando se calculam as distâncias até 5 vizinhos mais próximos. Com o método SIMCA, obteve-se classificações igualmente corretas para as amostras e esta metodologia indicou a variável QS3\' como tendo a maior influência no modelo. As variáveis α, QS5 e QS3\' foram utilizadas na regressão pelo método MLR, que apresentou desvio padrão e coeficiente de correlação melhores do que os modelos apresentados anteriormente na literatura. A Análise de Discriminantes por Passos (SOA) foi utilizada neste trabalho com o intuito de selecionar outras variáveis para serem incluídas no estudo de regressão com o método PLS, a saber : μ (Momento de Dipolo), QC3 (carga sobre o carbono 3) e QC7 (carga sobre o carbono 7). Para o modelo PLS, o menor erro de validação foi obtido utilizando-se 4 fatores . Os coeficientes de correlação calculados com o PLS foram r = 0,95 e q = 0,90. Os resultados obtidos neste trabalho concordam com resultados de estudos anteriores e podem fornecer subsídios para a busca de novos compostos flavonóides com atividade antioxidante.
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Após uma redução do número de variáveis calculadas, e tendo sido eliminadas as variáveis apresentando altas correlações entre si, algumas variáveis foram testadas em diversas combinações nas análises exploratórias PCA e HCA. As variáveis selecionadas dessa maneira foram testadas com os métodos de classificação KNN e SIMCA. O melhor modelo encontrado foi aquele obtido com as seguintes variáveis: polarizabilidade ( α), carga total sobre o substituinte 5 (QS5) e carga total sobre o substituinte 3\' (QS3\'). A aplicação do método PCA resultou na separação dos compostos em dois grupos: compostos mais antioxidants (log TEAC > 0,41) e menos antioxidants (log TEAC ≤ 0,41). Este resultado foi confirmado pela análise HCA. O método KNN classificou corretamente os compostos em duas classes, que correspondem aos dois grupos obtidos pelo PCA, quando se calculam as distâncias até 5 vizinhos mais próximos. Com o método SIMCA, obteve-se classificações igualmente corretas para as amostras e esta metodologia indicou a variável QS3\' como tendo a maior influência no modelo. As variáveis α, QS5 e QS3\' foram utilizadas na regressão pelo método MLR, que apresentou desvio padrão e coeficiente de correlação melhores do que os modelos apresentados anteriormente na literatura. A Análise de Discriminantes por Passos (SOA) foi utilizada neste trabalho com o intuito de selecionar outras variáveis para serem incluídas no estudo de regressão com o método PLS, a saber : μ (Momento de Dipolo), QC3 (carga sobre o carbono 3) e QC7 (carga sobre o carbono 7). Para o modelo PLS, o menor erro de validação foi obtido utilizando-se 4 fatores . Os coeficientes de correlação calculados com o PLS foram r = 0,95 e q = 0,90. Os resultados obtidos neste trabalho concordam com resultados de estudos anteriores e podem fornecer subsídios para a busca de novos compostos flavonóides com atividade antioxidante.The present work had the aim to investigate structural requirements needed to the antioxidant activity of a set of 22 flavonoid compounds , represented by several molecular descriptors, by using chemometric methods in the building of qualitative and qunatitative structure­ activity relationships. From the structures optimized by the MM+ method and, subsequently , by the AM1 semiempirical method, eletronic, geometric and topological properties were calculated. After the reduction in the number of the computed variables, obtained by eliminating those that have a high degree of correlation, some variables were tested in different combinations with the exploratory analysis PCA and HCA. The variables selected by this way were tested with the classification methods KNN and SIMCA. The best model found was the one obtained with the following variables: polarizab1lity (α), total charge at substitutent 5 (QS5) and total charge at substitutent 3\' (QS3\'). The PCA method divided the set of compounds studied into two groups: more antioxidant compounds (log TEAC > 0,41) and less antioxidant compounds (log TEAC ≤ 0,41). This result was confirmed by the HCA analysis. The KNN method classified correctly the compounds into two classes, corresponding to the two groups obtained by PCA, when the distances to the 5 nearest neighbors are computed. The SIMCA method also classified correctly the samples and this methodology indicated the QS3\' variable as having the greatest influence in the model. The variables α, QS5 e QS3\' were used in the MLR regression study, which presented standard deviation and correlation coefficient better than the models previously reported in the literature. The Stepwise Discriminant Analysis (SOA) was used in this work with the aim to select other variables to be included in the regression study with the PLS method, namely: μ (Dipolar Moment), QC3 (charge at carbon 3) and QC7 (charge at carbon 7). For the PLS model, the lower errar of validation was obtained using 4 factors. The correlation coefficients calculated with PLS were r = 0,95 and q = 0,90. The results obtained in this work are in agreement with the ones reported in the literature and can bring improvements to the search for new flavonoid compounds with antioxidant activity.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPSilva, Albérico Borges Ferreira daWeber, Karen Cacilda2004-05-19info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/75/75131/tde-21072025-170153/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2025-07-22T11:12:02Zoai:teses.usp.br:tde-21072025-170153Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212025-07-22T11:12:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
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