Cálculo de um escore poligênico baseado no transcriptoma cortico-estriatal e suas implicações no transtorno de déficit de atenção/hiperatividade (TDAH)
| Ano de defesa: | 2024 |
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| Tipo de documento: | Dissertação |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
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| Instituição de defesa: |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
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| Programa de Pós-Graduação: |
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| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42137/tde-03102025-141812/ |
Resumo: | O Transtorno de Déficit de Atenção e Hiperatividade (TDAH) é uma condição do neurodesenvolvimento caracterizada por sintomas elevados e prejudiciais de desatenção, hiperatividade e/ou impulsividade. Fatores biológicos influenciam a etiologia do TDAH, caracterizado como um transtorno multifatorial altamente poligênico. Assim, o objetivo geral da presente dissertação de mestrado foi avaliar o papel de escores de risco poligênico baseados em transcriptoma (ePRS, de escore de risco poligênico baseado em expressão) do TDAH em relação a aspectos clínicos desse transtorno. A predição da expressão foi realizada em uma amostra clínica que possui informações de varredura genômica, a Adult ADHD Porto Alegre Cohort (N = 1665). O programa PrediXcan foi empregado para estimar a expressão gênica tecido-específica com dados genotípicos individuais e para avaliar a associação direta com o TDAH. As áreas cerebrais escolhidas para calcular o escore foram o núcleo caudado (NC) e o córtex cingulado anterior (ACC), já associadas com o TDAH na literatura. Além disso, o estudo de sequenciamento de RNA (RNA seq) em tecido post mortem de casos com TDAH e controles utilizado como referência para direcionar os genes presentes nos escores focou nessas duas áreas. Embora aproximadamente 200 transcritos tiveram um valor-P menor do que 0,05 na comparação de expressão predita entre casos e controles, nenhum sobreviveu à correção para múltiplos testes. Além disso, não houve replicações de genes diferencialmente expressos que foram significativos no estudo de RNA seq de referência. Em relação aos escores, tanto o ePRS NC quanto o ePRS-ACC e o PRS convencional para TDAH não foram associados com o status caso-controle, tampouco com a gravidade do TDAH ou com o volume do NC e a área de superfície do ACC rostral ou caudal em uma subamostra com dados de neuroimagem. As medidas de neuroimagem foram significativas entre casos e controles. Portanto, os ePRSs e o PRS de TDAH ainda não se mostram como sendo ferramentas associadas com TDAH de adultos em uma amostra de brasileiros. Embora a miscigenação possa ter um impacto substancial nessas associações devido ao viés eurocêntrico observado nos bancos de dados utilizados como referência, é importante ressaltar que as análises de sensibilidade envolvendo um subgrupo de euro-brasileiros também não resultaram em achados significativos. |
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Cálculo de um escore poligênico baseado no transcriptoma cortico-estriatal e suas implicações no transtorno de déficit de atenção/hiperatividade (TDAH)Calculation of a polygenic score based on the cortico striatal transcriptome and its implications in attention-deficit/hyperactivity disorder (ADHD)ADHDanterior cingulate cortexcaudate nucleuscórtex cingulado anteriorePRSePRSnúcleo caudadoTDAHTWASTWASO Transtorno de Déficit de Atenção e Hiperatividade (TDAH) é uma condição do neurodesenvolvimento caracterizada por sintomas elevados e prejudiciais de desatenção, hiperatividade e/ou impulsividade. Fatores biológicos influenciam a etiologia do TDAH, caracterizado como um transtorno multifatorial altamente poligênico. Assim, o objetivo geral da presente dissertação de mestrado foi avaliar o papel de escores de risco poligênico baseados em transcriptoma (ePRS, de escore de risco poligênico baseado em expressão) do TDAH em relação a aspectos clínicos desse transtorno. A predição da expressão foi realizada em uma amostra clínica que possui informações de varredura genômica, a Adult ADHD Porto Alegre Cohort (N = 1665). O programa PrediXcan foi empregado para estimar a expressão gênica tecido-específica com dados genotípicos individuais e para avaliar a associação direta com o TDAH. As áreas cerebrais escolhidas para calcular o escore foram o núcleo caudado (NC) e o córtex cingulado anterior (ACC), já associadas com o TDAH na literatura. Além disso, o estudo de sequenciamento de RNA (RNA seq) em tecido post mortem de casos com TDAH e controles utilizado como referência para direcionar os genes presentes nos escores focou nessas duas áreas. Embora aproximadamente 200 transcritos tiveram um valor-P menor do que 0,05 na comparação de expressão predita entre casos e controles, nenhum sobreviveu à correção para múltiplos testes. Além disso, não houve replicações de genes diferencialmente expressos que foram significativos no estudo de RNA seq de referência. Em relação aos escores, tanto o ePRS NC quanto o ePRS-ACC e o PRS convencional para TDAH não foram associados com o status caso-controle, tampouco com a gravidade do TDAH ou com o volume do NC e a área de superfície do ACC rostral ou caudal em uma subamostra com dados de neuroimagem. As medidas de neuroimagem foram significativas entre casos e controles. Portanto, os ePRSs e o PRS de TDAH ainda não se mostram como sendo ferramentas associadas com TDAH de adultos em uma amostra de brasileiros. Embora a miscigenação possa ter um impacto substancial nessas associações devido ao viés eurocêntrico observado nos bancos de dados utilizados como referência, é importante ressaltar que as análises de sensibilidade envolvendo um subgrupo de euro-brasileiros também não resultaram em achados significativos.Attention Deficit Hyperactivity Disorder (ADHD) is a neurodevelopmental condition characterized by elevated and detrimental symptoms of inattention, hyperactivity, and/or impulsivity. Biological factors influence the etiology of ADHD, characterized as a highly polygenic multifactorial disorder. Therefore, the overall objective of this master\'s dissertation was to evaluate the role of polygenic risk scores based on transcriptome (ePRS, expression based polygenic risk score) of ADHD in relation to clinical aspects of this disorder. Gene expression prediction was conducted in a clinical sample with genomic information, the Adult ADHD Porto Alegre Cohort (N = 1665). The PrediXcan program was employed to estimate tissue-specific gene expression using individual genotypic data and to assess the direct association with ADHD. The chosen brain areas for score calculation were the caudate nucleus (NC) and the anterior cingulate cortex (ACC), both previously associated with ADHD in the literature. Additionally, the RNA sequencing (RNA seq) study on post-mortem tissue from ADHD cases and controls served as a reference to select the genes included in the calculated scores, focused on these two areas. Although approximately 200 transcripts showed a P-value lower than 0.05 in the comparison of predicted expression between cases and controls, none survived multiple tests correction. Furthermore, there were no replications of differentially expressed genes that were significant in the reference RNA seq study. Regarding the scores, both ePRS-NC and ePRS-ACC, as well as the conventional PRS for ADHD, were not associated with case-control status, nor with the severity of ADHD or the volume of NC and the rostral or caudal surface area of ACC in a subsample with neuroimaging data. The neuroimaging measures were significant between cases and controls. Therefore, the ePRSs and the PRS for ADHD do not yet appear to be tools associated with adult ADHD in Brazilians. Although admixture may have a substantial impact on these associations due to the Eurocentric bias observed in the reference databases used, it is important to note that sensitivity analyses involving a subgroup of Euro-Brazilians also did not result in significant findings.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPRovaris, Diego LuizMoraes, Beatriz Lugli Machado de2024-02-01info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42137/tde-03102025-141812/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPReter o conteúdo por motivos de patente, publicação e/ou direitos autoriais.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2025-10-06T13:42:02Zoai:teses.usp.br:tde-03102025-141812Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212025-10-06T13:42:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
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