Caracterização de novos componentes moleculares da fagocitose associada à LC3 (LAP) em macrófagos
| Ano de defesa: | 2025 |
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| Tipo de documento: | Dissertação |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
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| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
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| Departamento: |
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| País: |
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| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17147/tde-14012026-172806/ |
Resumo: | Macrófagos são células do sistema imunológico inato capazes de reconhecer e fagocitar uma ampla variedade de alvos, contribuindo por esse processo para funções primordiais como manutenção da homeostasia e controle das infecções. Durante a fagocitose induzida pela ativação de certos receptores, pode ocorrer a conjugação de proteínas autofágicas da família ATG8, como LC3, na membrana simples do fagossomo, processo conhecido como a fagocitose associada à LC3 (LAP). LAP modula a resposta de macrófagos frente a estímulos como patógenos, imunocomplexos e células mortas. A proteína Rubicon (RUBCN) desempenha um papel essencial em LAP, associado a geração de fosfatidil-inositol-3-fosfato (PI3P) e a produção de espécies reativas de oxigênio (ROS) intrafagosomal, dois eventos-chave na via. O objetivo deste estudo é caracterizar novos componentes da via de LAP, identificados previamente em uma varredura proteômica baseada em biotinilação por proximidade (Turbo-ID) de alvos que interagem com RUBCN. Especificamente, avaliamos o possível papel de SH2 Domain-Containing Inositol 5\'-Phosphatase 1 (SHIP-1), uma inositol fosfatase, e Voltage-dependent anion channel 2 (VDAC2), um canal transportador presente na membrana externa de mitocôndrias. Para isso, caracterizamos primeiramente uma abordagem de depleção in vitro de SHIP-1 e VDAC2 em macrófagos primários e imortalizados derivados de medula óssea (BMDM), utilizando a técnica de CRISPR/Cas9. Por ensaios de microscopia confocal e immunoblot, demonstramos que SHIP-1 e VDAC2 são requeridos para a lipidação de LC3. Particularmente, encontramos que VDAC2 se localiza no fagossomo durante LAP, e a sua depleção reduziu o recrutamento de diversos componentes da cascata de sinalização de LAP para o fagossomo. Portanto, nossos dados sugerem que SHIP-1 e VDAC2 são fortes candidatos para componentes ou reguladores da via de LAP. |
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Caracterização de novos componentes moleculares da fagocitose associada à LC3 (LAP) em macrófagosCharacterization of novel components of LC-3 associated phagocytosis (LAP) in macrophagesFagocitose associada à LC3LC3-associated phagocytosisMacrófagoMacrophageSHIP-1SHIP-1VDAC2VDAC2Macrófagos são células do sistema imunológico inato capazes de reconhecer e fagocitar uma ampla variedade de alvos, contribuindo por esse processo para funções primordiais como manutenção da homeostasia e controle das infecções. Durante a fagocitose induzida pela ativação de certos receptores, pode ocorrer a conjugação de proteínas autofágicas da família ATG8, como LC3, na membrana simples do fagossomo, processo conhecido como a fagocitose associada à LC3 (LAP). LAP modula a resposta de macrófagos frente a estímulos como patógenos, imunocomplexos e células mortas. A proteína Rubicon (RUBCN) desempenha um papel essencial em LAP, associado a geração de fosfatidil-inositol-3-fosfato (PI3P) e a produção de espécies reativas de oxigênio (ROS) intrafagosomal, dois eventos-chave na via. O objetivo deste estudo é caracterizar novos componentes da via de LAP, identificados previamente em uma varredura proteômica baseada em biotinilação por proximidade (Turbo-ID) de alvos que interagem com RUBCN. Especificamente, avaliamos o possível papel de SH2 Domain-Containing Inositol 5\'-Phosphatase 1 (SHIP-1), uma inositol fosfatase, e Voltage-dependent anion channel 2 (VDAC2), um canal transportador presente na membrana externa de mitocôndrias. Para isso, caracterizamos primeiramente uma abordagem de depleção in vitro de SHIP-1 e VDAC2 em macrófagos primários e imortalizados derivados de medula óssea (BMDM), utilizando a técnica de CRISPR/Cas9. Por ensaios de microscopia confocal e immunoblot, demonstramos que SHIP-1 e VDAC2 são requeridos para a lipidação de LC3. Particularmente, encontramos que VDAC2 se localiza no fagossomo durante LAP, e a sua depleção reduziu o recrutamento de diversos componentes da cascata de sinalização de LAP para o fagossomo. Portanto, nossos dados sugerem que SHIP-1 e VDAC2 são fortes candidatos para componentes ou reguladores da via de LAP.Macrophages are cells of the innate immune system capable of recognizing and phagocytosing a wide variety of targets, thereby contributing to key functions such as the maintenance of homeostasis and infection control. During phagocytosis induced by the activation of certain receptors, proteins from the ATG8 family, such as LC3, can be conjugated to the single membrane of the phagosome. A process known as LC3-associated phagocytosis (LAP). LAP modulates the macrophage response to stimuli such as pathogens, immune complexes, and dead cells. The protein Rubicon (RUBCN) plays an essential role in LAP, being associated with the generation of phosphatidylinositol-3-phosphate (PI3P), and the production of intraphagosomal reactive oxygen species (ROS), two key events in this pathway. The aim of this study is to characterize novel components of the LAP pathway, previously identified in a proximity biotinylation-based proteomic screen (TurboID) of targets interacting with RUBCN. Specifically, we evaluated the possible role of SH2 Domain-Containing Inositol 5\'-Phosphatase 1 (SHIP-1), an inositol phosphatase, and Voltage-Dependent Anion Channel 2 (VDAC2), a transport channel located in the outer mitochondrial membrane. To this end, we first characterized an in vitro depletion approach for SHIP-1 and VDAC2 in primary and immortalized bone marrow-derived macrophages (BMDMs), using CRISPR/Cas9. Through confocal microscopy and immunoblot assays, we demonstrated that SHIP-1 and VDAC2 are required for LC3 lipidation. Notably, we found that VDAC2 localizes to the phagosome during LAP, and its depletion reduced the recruitment of several components of the LAP signaling cascade to the phagosome. Therefore, our data suggests that SHIP-1 and VDAC2 are strong candidates for components or regulators of the LAP pathway.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPCunha, Larissa Dias daFreitas Filho, Edismauro GarciaAlves, Carolina Bifano de Assis2025-10-02info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17147/tde-14012026-172806/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2026-01-23T13:51:01Zoai:teses.usp.br:tde-14012026-172806Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212026-01-23T13:51:01Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
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