Determinação da assinatura termodinâmica de inibidores da cisteíno protease cruzaína

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2021
Autor(a) principal: Rosini, Fabiana
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
ITC
Link de acesso: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/75/75133/tde-17022022-152722/
Resumo: O reconhecimento bimolecular pode ocorrer por interveniência de diferentes interações não-covalentes: ligação hidrogênio, forças de van der Waals e hidrofóbicas, interações π-π, eletrostáticas. Através da ITC (calorimetria de titulação isotérmica), a mudança de calor quando um composto interage com uma proteína alvo permite a determinação precisa da afinidade, bem como as forças que dirigem o processo. A titulação na presença de ligantes fornece informações sobre as forças que controlam a interação e permite a identificação dos complexos intermoleculares que são relevantes para o planejamento baseado em estrutura. A ITC é a única técnica que mede diretamente a entalpia de interação (ΔH). Os sistemas bioquímicos exibem caracteristicamente compensação entalpia-entropia (EEC) em que o aumento da entalpia é compensado por uma penalidade entrópica, reduzindo a magnitude da mudança na afinidade. Ao caracterizar as relações estrutura-atividade (SAR), a maioria dos grupos envolvidos na interação pode ser observada como contribuindo para ΔH, mas não para a afinidade. Assim, os valores de ΔH podem destacar uma possível descontinuidade na SAR, de modo que os dados estruturais experimentais provavelmente serão particularmente valiosos no planejamento molecular. Neste trabalho, tivemos como objetivo usar a ITC para determinar a assinatura termodinâmica de inibidores da cisteíno protease cruzaína com o principal objetivo de avaliar eventuais descontinuidades na SAR. Além disso, a calorimetria diferencial de varredura (DSC) foi empregada para avaliar as mudanças na temperatura de transição da proteína (Tm) que ocorre quando da interação do ligante. Enquanto a ITC permite avaliar a contribuição do ligante para o complexo, a DSC permite a correlação da termodinâmica que impulsiona a interação com as alterações conformacionais na macromolécula. As duas técnicas foram utilizadas para o estudo de moléculas biotivas contra o Trypanosoma cruzi, causador da doença de Chagas, que ainda é uma doença negligenciada.
id USP_43249db7085b041a860343e068074e38
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-17022022-152722
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str
spelling Determinação da assinatura termodinâmica de inibidores da cisteíno protease cruzaínaDetermination of thermodynamic signature of cruzain cysteine protease inhibitorsassinatura termodinâmicacalorimetria de titulação isotérmicacisteíno-proteasescruzaincruzaínacysteine proteasesdoença de Chagasenthalpic-entropic compensationITCn-DSCnano calorimetria diferencial da varredurathermodynamic signatureO reconhecimento bimolecular pode ocorrer por interveniência de diferentes interações não-covalentes: ligação hidrogênio, forças de van der Waals e hidrofóbicas, interações π-π, eletrostáticas. Através da ITC (calorimetria de titulação isotérmica), a mudança de calor quando um composto interage com uma proteína alvo permite a determinação precisa da afinidade, bem como as forças que dirigem o processo. A titulação na presença de ligantes fornece informações sobre as forças que controlam a interação e permite a identificação dos complexos intermoleculares que são relevantes para o planejamento baseado em estrutura. A ITC é a única técnica que mede diretamente a entalpia de interação (ΔH). Os sistemas bioquímicos exibem caracteristicamente compensação entalpia-entropia (EEC) em que o aumento da entalpia é compensado por uma penalidade entrópica, reduzindo a magnitude da mudança na afinidade. Ao caracterizar as relações estrutura-atividade (SAR), a maioria dos grupos envolvidos na interação pode ser observada como contribuindo para ΔH, mas não para a afinidade. Assim, os valores de ΔH podem destacar uma possível descontinuidade na SAR, de modo que os dados estruturais experimentais provavelmente serão particularmente valiosos no planejamento molecular. Neste trabalho, tivemos como objetivo usar a ITC para determinar a assinatura termodinâmica de inibidores da cisteíno protease cruzaína com o principal objetivo de avaliar eventuais descontinuidades na SAR. Além disso, a calorimetria diferencial de varredura (DSC) foi empregada para avaliar as mudanças na temperatura de transição da proteína (Tm) que ocorre quando da interação do ligante. Enquanto a ITC permite avaliar a contribuição do ligante para o complexo, a DSC permite a correlação da termodinâmica que impulsiona a interação com as alterações conformacionais na macromolécula. As duas técnicas foram utilizadas para o estudo de moléculas biotivas contra o Trypanosoma cruzi, causador da doença de Chagas, que ainda é uma doença negligenciada.Bimolecular recognition can occur via distinct non-covalent interactions: hydrogen bonding, van der Waals and hydrophobic forces, π-π, electrostatic interactions. Through ITC (isothermal titration calorimetry), the heat change when a compound interacts with a target protein allows accurate determination of the affinity as well as the forces driving the process. Titration in the presence of ligands provides information about the forces that control the interaction and allows the identification of intermolecular complexes that are relevant for structure-based design. ITC is the only technique that directly measures the enthalpy of interaction (ΔH). Biochemical systems characteristically exhibit enthalpy-entropy compensation (EEC) in which the increase in enthalpy is offset by an entropic penalty, reducing the magnitude of the change in affinity. When characterizing the structure-activity relationships (SAR), most of the groups involved in the interaction can be observed as contributing to ΔH, but not to affinity. so the experimental structural data are likely to be particularly valuable in molecular design. In this work, we aimed to use the ITC to determine the thermodynamic signature of cysteine protease cruzi inhibitors with the main objective of evaluating eventual discontinuities in the SAR. In addition, differential scanning calorimetry (DSC) was employed to assess changes in protein transition temperature (Tm) that occur upon ligand interaction. While the ITC allows the assessment of the ligand\'s contribution to the complex, the DSC allows the correlation of the thermodynamics that drives the interaction with the conformational changes in the macromolecule. Both techniques were used to study bioactive molecules against Trypanosoma cruzi, which causes Chagas disease, which is still a neglected disease.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPMontanari, Carlos AlbertoRosini, Fabiana2021-12-16info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/75/75133/tde-17022022-152722/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2022-02-18T12:21:02Zoai:teses.usp.br:tde-17022022-152722Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212022-02-18T12:21:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Determinação da assinatura termodinâmica de inibidores da cisteíno protease cruzaína
Determination of thermodynamic signature of cruzain cysteine protease inhibitors
title Determinação da assinatura termodinâmica de inibidores da cisteíno protease cruzaína
spellingShingle Determinação da assinatura termodinâmica de inibidores da cisteíno protease cruzaína
Rosini, Fabiana
assinatura termodinâmica
calorimetria de titulação isotérmica
cisteíno-proteases
cruzain
cruzaína
cysteine proteases
doença de Chagas
enthalpic-entropic compensation
ITC
n-DSC
nano calorimetria diferencial da varredura
thermodynamic signature
title_short Determinação da assinatura termodinâmica de inibidores da cisteíno protease cruzaína
title_full Determinação da assinatura termodinâmica de inibidores da cisteíno protease cruzaína
title_fullStr Determinação da assinatura termodinâmica de inibidores da cisteíno protease cruzaína
title_full_unstemmed Determinação da assinatura termodinâmica de inibidores da cisteíno protease cruzaína
title_sort Determinação da assinatura termodinâmica de inibidores da cisteíno protease cruzaína
author Rosini, Fabiana
author_facet Rosini, Fabiana
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Montanari, Carlos Alberto
dc.contributor.author.fl_str_mv Rosini, Fabiana
dc.subject.por.fl_str_mv assinatura termodinâmica
calorimetria de titulação isotérmica
cisteíno-proteases
cruzain
cruzaína
cysteine proteases
doença de Chagas
enthalpic-entropic compensation
ITC
n-DSC
nano calorimetria diferencial da varredura
thermodynamic signature
topic assinatura termodinâmica
calorimetria de titulação isotérmica
cisteíno-proteases
cruzain
cruzaína
cysteine proteases
doença de Chagas
enthalpic-entropic compensation
ITC
n-DSC
nano calorimetria diferencial da varredura
thermodynamic signature
description O reconhecimento bimolecular pode ocorrer por interveniência de diferentes interações não-covalentes: ligação hidrogênio, forças de van der Waals e hidrofóbicas, interações π-π, eletrostáticas. Através da ITC (calorimetria de titulação isotérmica), a mudança de calor quando um composto interage com uma proteína alvo permite a determinação precisa da afinidade, bem como as forças que dirigem o processo. A titulação na presença de ligantes fornece informações sobre as forças que controlam a interação e permite a identificação dos complexos intermoleculares que são relevantes para o planejamento baseado em estrutura. A ITC é a única técnica que mede diretamente a entalpia de interação (ΔH). Os sistemas bioquímicos exibem caracteristicamente compensação entalpia-entropia (EEC) em que o aumento da entalpia é compensado por uma penalidade entrópica, reduzindo a magnitude da mudança na afinidade. Ao caracterizar as relações estrutura-atividade (SAR), a maioria dos grupos envolvidos na interação pode ser observada como contribuindo para ΔH, mas não para a afinidade. Assim, os valores de ΔH podem destacar uma possível descontinuidade na SAR, de modo que os dados estruturais experimentais provavelmente serão particularmente valiosos no planejamento molecular. Neste trabalho, tivemos como objetivo usar a ITC para determinar a assinatura termodinâmica de inibidores da cisteíno protease cruzaína com o principal objetivo de avaliar eventuais descontinuidades na SAR. Além disso, a calorimetria diferencial de varredura (DSC) foi empregada para avaliar as mudanças na temperatura de transição da proteína (Tm) que ocorre quando da interação do ligante. Enquanto a ITC permite avaliar a contribuição do ligante para o complexo, a DSC permite a correlação da termodinâmica que impulsiona a interação com as alterações conformacionais na macromolécula. As duas técnicas foram utilizadas para o estudo de moléculas biotivas contra o Trypanosoma cruzi, causador da doença de Chagas, que ainda é uma doença negligenciada.
publishDate 2021
dc.date.none.fl_str_mv 2021-12-16
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/75/75133/tde-17022022-152722/
url https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/75/75133/tde-17022022-152722/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1865491202707554304