Avaliação de método molecular para detecção direta de Fusarium em água

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2015
Autor(a) principal: Graça, Mariana Geraldi
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
DNA
Link de acesso: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5134/tde-11012016-151540/
Resumo: Pacientes imunocomprometidos estão vulneráveis a infecções oportunistas. O gênero Fusarium é um fungo que causa infecções importantes especialmente em pacientes com neutropenia grave. O ambiente pode ser a fonte de Fusarium, em especial a água. A detecção de Fusarium na água é realizada normalmente pela cultura que é difícil e demorada, mas necessária para a prevenção da exposição de pacientes susceptíveis. Um método mais rápido é necessário. O objetivo do estudo foi desenvolver uma técnica molecular para a detecção de Fusarium direta em água. Um método de extração de DNA direto a partir da água foi desenvolvido para 3 espécies de Fusarium (moniliforme, oxysporum e solani). O método de extração desenvolvido foi reprodutível e acoplado a uma reação de polimerase em cadeia gênero-específica para a detecção do Fusarium em água. Os limites de detecção foram 10 células/litro e 1 célula/litro para os métodos molecular e cultura, respectivamente
id USP_4b5d96031a1238d8517cbfd1540cd02e
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-11012016-151540
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str
spelling Avaliação de método molecular para detecção direta de Fusarium em águaEvaluation of a molecular method for direct detection of Fusarium spp in waterÁguaCulture techniquesDNADNAEnvironmentFusariumFusariumMeio ambientePolymerase chain reactionReação em cadeia da polimeraseTécnicas de culturaWaterPacientes imunocomprometidos estão vulneráveis a infecções oportunistas. O gênero Fusarium é um fungo que causa infecções importantes especialmente em pacientes com neutropenia grave. O ambiente pode ser a fonte de Fusarium, em especial a água. A detecção de Fusarium na água é realizada normalmente pela cultura que é difícil e demorada, mas necessária para a prevenção da exposição de pacientes susceptíveis. Um método mais rápido é necessário. O objetivo do estudo foi desenvolver uma técnica molecular para a detecção de Fusarium direta em água. Um método de extração de DNA direto a partir da água foi desenvolvido para 3 espécies de Fusarium (moniliforme, oxysporum e solani). O método de extração desenvolvido foi reprodutível e acoplado a uma reação de polimerase em cadeia gênero-específica para a detecção do Fusarium em água. Os limites de detecção foram 10 células/litro e 1 célula/litro para os métodos molecular e cultura, respectivamenteImmunosuppressed patients are vulnerable to opportunistic infections. The genus Fusarium is a fungus that causes severe infections especially in patients with prolonged neutropenia. The environment may be a source of Fusarium, in particular, water. The detection of Fusarium in water is carried out by culturing which is difficult because it is time consuming, but is necessary to prevent exposure of susceptible patients. A faster method is necessary. The objective of this study was to develop a molecular technique for direct detection of Fusarium in water. A direct DNA extraction method from water was developed for 3 species of Fusarium (moniliforme, oxysporum and solani). We developed a reproducible efficient extraction method and coupled it to a genus-specific PCR in order to detect Fusarium in water. The detection limits were 10 cells/L and 1 cell/L for the molecular and cultures method, respectivelyBiblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPLevin, Anna Sara ShaffermanGraça, Mariana Geraldi2015-10-19info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5134/tde-11012016-151540/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2017-09-04T21:06:17Zoai:teses.usp.br:tde-11012016-151540Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212017-09-04T21:06:17Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Avaliação de método molecular para detecção direta de Fusarium em água
Evaluation of a molecular method for direct detection of Fusarium spp in water
title Avaliação de método molecular para detecção direta de Fusarium em água
spellingShingle Avaliação de método molecular para detecção direta de Fusarium em água
Graça, Mariana Geraldi
Água
Culture techniques
DNA
DNA
Environment
Fusarium
Fusarium
Meio ambiente
Polymerase chain reaction
Reação em cadeia da polimerase
Técnicas de cultura
Water
title_short Avaliação de método molecular para detecção direta de Fusarium em água
title_full Avaliação de método molecular para detecção direta de Fusarium em água
title_fullStr Avaliação de método molecular para detecção direta de Fusarium em água
title_full_unstemmed Avaliação de método molecular para detecção direta de Fusarium em água
title_sort Avaliação de método molecular para detecção direta de Fusarium em água
author Graça, Mariana Geraldi
author_facet Graça, Mariana Geraldi
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Levin, Anna Sara Shafferman
dc.contributor.author.fl_str_mv Graça, Mariana Geraldi
dc.subject.por.fl_str_mv Água
Culture techniques
DNA
DNA
Environment
Fusarium
Fusarium
Meio ambiente
Polymerase chain reaction
Reação em cadeia da polimerase
Técnicas de cultura
Water
topic Água
Culture techniques
DNA
DNA
Environment
Fusarium
Fusarium
Meio ambiente
Polymerase chain reaction
Reação em cadeia da polimerase
Técnicas de cultura
Water
description Pacientes imunocomprometidos estão vulneráveis a infecções oportunistas. O gênero Fusarium é um fungo que causa infecções importantes especialmente em pacientes com neutropenia grave. O ambiente pode ser a fonte de Fusarium, em especial a água. A detecção de Fusarium na água é realizada normalmente pela cultura que é difícil e demorada, mas necessária para a prevenção da exposição de pacientes susceptíveis. Um método mais rápido é necessário. O objetivo do estudo foi desenvolver uma técnica molecular para a detecção de Fusarium direta em água. Um método de extração de DNA direto a partir da água foi desenvolvido para 3 espécies de Fusarium (moniliforme, oxysporum e solani). O método de extração desenvolvido foi reprodutível e acoplado a uma reação de polimerase em cadeia gênero-específica para a detecção do Fusarium em água. Os limites de detecção foram 10 células/litro e 1 célula/litro para os métodos molecular e cultura, respectivamente
publishDate 2015
dc.date.none.fl_str_mv 2015-10-19
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5134/tde-11012016-151540/
url http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5134/tde-11012016-151540/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1865492002610610176