Avaliação de método molecular para detecção direta de Fusarium em água
| Ano de defesa: | 2015 |
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| Tipo de documento: | Dissertação |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
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| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
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| Departamento: |
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| País: |
Não Informado pela instituição
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| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5134/tde-11012016-151540/ |
Resumo: | Pacientes imunocomprometidos estão vulneráveis a infecções oportunistas. O gênero Fusarium é um fungo que causa infecções importantes especialmente em pacientes com neutropenia grave. O ambiente pode ser a fonte de Fusarium, em especial a água. A detecção de Fusarium na água é realizada normalmente pela cultura que é difícil e demorada, mas necessária para a prevenção da exposição de pacientes susceptíveis. Um método mais rápido é necessário. O objetivo do estudo foi desenvolver uma técnica molecular para a detecção de Fusarium direta em água. Um método de extração de DNA direto a partir da água foi desenvolvido para 3 espécies de Fusarium (moniliforme, oxysporum e solani). O método de extração desenvolvido foi reprodutível e acoplado a uma reação de polimerase em cadeia gênero-específica para a detecção do Fusarium em água. Os limites de detecção foram 10 células/litro e 1 célula/litro para os métodos molecular e cultura, respectivamente |
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Avaliação de método molecular para detecção direta de Fusarium em águaEvaluation of a molecular method for direct detection of Fusarium spp in waterÁguaCulture techniquesDNADNAEnvironmentFusariumFusariumMeio ambientePolymerase chain reactionReação em cadeia da polimeraseTécnicas de culturaWaterPacientes imunocomprometidos estão vulneráveis a infecções oportunistas. O gênero Fusarium é um fungo que causa infecções importantes especialmente em pacientes com neutropenia grave. O ambiente pode ser a fonte de Fusarium, em especial a água. A detecção de Fusarium na água é realizada normalmente pela cultura que é difícil e demorada, mas necessária para a prevenção da exposição de pacientes susceptíveis. Um método mais rápido é necessário. O objetivo do estudo foi desenvolver uma técnica molecular para a detecção de Fusarium direta em água. Um método de extração de DNA direto a partir da água foi desenvolvido para 3 espécies de Fusarium (moniliforme, oxysporum e solani). O método de extração desenvolvido foi reprodutível e acoplado a uma reação de polimerase em cadeia gênero-específica para a detecção do Fusarium em água. Os limites de detecção foram 10 células/litro e 1 célula/litro para os métodos molecular e cultura, respectivamenteImmunosuppressed patients are vulnerable to opportunistic infections. The genus Fusarium is a fungus that causes severe infections especially in patients with prolonged neutropenia. The environment may be a source of Fusarium, in particular, water. The detection of Fusarium in water is carried out by culturing which is difficult because it is time consuming, but is necessary to prevent exposure of susceptible patients. A faster method is necessary. The objective of this study was to develop a molecular technique for direct detection of Fusarium in water. A direct DNA extraction method from water was developed for 3 species of Fusarium (moniliforme, oxysporum and solani). We developed a reproducible efficient extraction method and coupled it to a genus-specific PCR in order to detect Fusarium in water. The detection limits were 10 cells/L and 1 cell/L for the molecular and cultures method, respectivelyBiblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPLevin, Anna Sara ShaffermanGraça, Mariana Geraldi2015-10-19info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5134/tde-11012016-151540/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2017-09-04T21:06:17Zoai:teses.usp.br:tde-11012016-151540Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212017-09-04T21:06:17Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
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Pacientes imunocomprometidos estão vulneráveis a infecções oportunistas. O gênero Fusarium é um fungo que causa infecções importantes especialmente em pacientes com neutropenia grave. O ambiente pode ser a fonte de Fusarium, em especial a água. A detecção de Fusarium na água é realizada normalmente pela cultura que é difícil e demorada, mas necessária para a prevenção da exposição de pacientes susceptíveis. Um método mais rápido é necessário. O objetivo do estudo foi desenvolver uma técnica molecular para a detecção de Fusarium direta em água. Um método de extração de DNA direto a partir da água foi desenvolvido para 3 espécies de Fusarium (moniliforme, oxysporum e solani). O método de extração desenvolvido foi reprodutível e acoplado a uma reação de polimerase em cadeia gênero-específica para a detecção do Fusarium em água. Os limites de detecção foram 10 células/litro e 1 célula/litro para os métodos molecular e cultura, respectivamente |
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