Avaliação da prevalência de viremia do zika vírus em doadores de sangue do Hospital Israelita Albert Einstein no período de maio de 2016 a maio de 2018

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2021
Autor(a) principal: Lira, Sanny Marcele da Costa
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5134/tde-19082021-131219/
Resumo: INTRODUÇÃO: O zika vírus (ZIKV) é um vírus de RNA pertencente ao gênero Flavivírus e foi inicialmente isolado na Floresta Zika, Uganda em 1947. A ocorrência de algumas epidemias ao redor do mundo demonstrou que a presença de doadores de sangue virêmicos assintomáticos proporciona um aumento do risco de transmissão transfusional(TT).Embora o curso clínico das infecções adquiridas por transfusão nos receptores de sangue ainda seja desconhecido, a triagem de doadores através dos testes de ácidos nucléicos (NAT) é uma alternativa importante na manutenção da segurança transfusional. Neste estudo desenvolvemos, validamos e implementamos um teste de NAT in house para detecção do RNA do zika vírus em amostras de doadores de sangue do Departamento de Hemoterapia e Terapia Celular do Hospital Israelita Albert Einstein. MÉTODOS: Tubos primários de plasma provenientes de candidatos à doação de sangue foram submetidos à extração do RNA em uma plataforma automatizada. São utilizados inicializadores e sondas para o ZIKV e para o póliovírus(PV) que funciona como o controle interno da reação, em uma reação duplex.O controle positivo utilizado é um sobrenadante de cultura de ZIKV da linhagem asiática e os controles negativos são amostras de plasma de doadores previamente testados para ZIKV. A reação de cadeia de polimerase em tempo real foi realizada em um termociclador utilizando o protocolo estabelecido pelo fornecedor. RESULTADOS: Entre maio de 2016 e maio de 2018, 3.369 amostras foram coletadas de 3.221 doadores de sangue (intervalo de confiança, 95%; supondo a prevalência do ZIKV RNA de 5%); 31 (0,92%) foram consideradas falso positivas, pois não foram confirmadas reatividades na repetição em duplicata, 14 amostras (0,42%) apresentaram resultado inválido devido às falhas nos controles internos, 4 (0,12%) tiveram volume insuficiente de amostra e em duas (0,05%) houve falha no pipetador automático. Nenhuma amostra foi positiva para o RNA do zika vírus. CONCLUSÕES: Foi possível validar e determinar as características analíticas da metodologia aplicada que se mostrou factível em sua utilização na rotina de triagem laboratorial de doadores de sangue. Este método representa uma alternativa para garantir a segurança transfusional durante epidemias do zika vírus. Não foi identificada nenhuma amostra positiva para o ZIKV RNA, em concordância com o pequeno número de casos autóctones na cidade de São Paulo durante o período do estudo
id USP_4e635e691468441d52ba66cd261f61e2
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-19082021-131219
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str
spelling Avaliação da prevalência de viremia do zika vírus em doadores de sangue do Hospital Israelita Albert Einstein no período de maio de 2016 a maio de 2018Prevalence of zika virus RNA in blood donors at Albert Einstein hospital from may, 2016 to may, 2018Blood donorsBlood safetyBlood transfusionDoadores de sangueFlavivirusFlavivírusReação em cadeia da polimerase em tempo realReal-time polymerase chain reactionSegurança do sangueTransfusão de sangueZika virusZika vírusINTRODUÇÃO: O zika vírus (ZIKV) é um vírus de RNA pertencente ao gênero Flavivírus e foi inicialmente isolado na Floresta Zika, Uganda em 1947. A ocorrência de algumas epidemias ao redor do mundo demonstrou que a presença de doadores de sangue virêmicos assintomáticos proporciona um aumento do risco de transmissão transfusional(TT).Embora o curso clínico das infecções adquiridas por transfusão nos receptores de sangue ainda seja desconhecido, a triagem de doadores através dos testes de ácidos nucléicos (NAT) é uma alternativa importante na manutenção da segurança transfusional. Neste estudo desenvolvemos, validamos e implementamos um teste de NAT in house para detecção do RNA do zika vírus em amostras de doadores de sangue do Departamento de Hemoterapia e Terapia Celular do Hospital Israelita Albert Einstein. MÉTODOS: Tubos primários de plasma provenientes de candidatos à doação de sangue foram submetidos à extração do RNA em uma plataforma automatizada. São utilizados inicializadores e sondas para o ZIKV e para o póliovírus(PV) que funciona como o controle interno da reação, em uma reação duplex.O controle positivo utilizado é um sobrenadante de cultura de ZIKV da linhagem asiática e os controles negativos são amostras de plasma de doadores previamente testados para ZIKV. A reação de cadeia de polimerase em tempo real foi realizada em um termociclador utilizando o protocolo estabelecido pelo fornecedor. RESULTADOS: Entre maio de 2016 e maio de 2018, 3.369 amostras foram coletadas de 3.221 doadores de sangue (intervalo de confiança, 95%; supondo a prevalência do ZIKV RNA de 5%); 31 (0,92%) foram consideradas falso positivas, pois não foram confirmadas reatividades na repetição em duplicata, 14 amostras (0,42%) apresentaram resultado inválido devido às falhas nos controles internos, 4 (0,12%) tiveram volume insuficiente de amostra e em duas (0,05%) houve falha no pipetador automático. Nenhuma amostra foi positiva para o RNA do zika vírus. CONCLUSÕES: Foi possível validar e determinar as características analíticas da metodologia aplicada que se mostrou factível em sua utilização na rotina de triagem laboratorial de doadores de sangue. Este método representa uma alternativa para garantir a segurança transfusional durante epidemias do zika vírus. Não foi identificada nenhuma amostra positiva para o ZIKV RNA, em concordância com o pequeno número de casos autóctones na cidade de São Paulo durante o período do estudoINTRODUCTION: Zika Virus (ZIKV) is a single stranded RNA genome virus, positive-sense, non-segmented, belonging to the family Flaviviridae, genus Flavivirus and it was initially isolated in the Zika Forest, Uganda in 1947. During the occurrence of some outbreaks around the world, the presence of asymptomatic viremic blood donors have been demonstrated, posing a risk for its transfusion transmission (TT). While the clinical outcome of TT zika is unknow and unpredictable, nucleic acid test (NAT) screening has been proposed to ensure the blood safety. This study developed, validated and implemented an \"inhouse\" method to detect zika RNA in blood samples donations from the Hemotherapy and Cell Therapy Department at Hospital Israelita Albert Einstein. METHODS: Primary plasma tubes from donors were submitted to nucleic acid extraction on an automated platform. An amplification mixture containing primers and probes for zika and Polio vaccine virus (PV), as an internal control, in duplex, are added. The positive control of the reaction of a ZIKV culture supernatant from the Asian lineage and negative controls were plasma samples from donors previously tested for ZIKV. Real-Time polymerase chain reaction is then performed in a thermocycler using the protocol established by the amplification mixture supplier. RESULTS: From May 2016 to May 2018, 3,369 samples were collected from 3,221 blood donors (confidence coefficient, 95%; supposed ZIKV RNA prevalence, 5%),31 (0.92%) were considered false positive since they did not confirm initial reactivity when repeated in duplicates,14 (0.42%) had their results invalid due to repeat failure in the internal control,4 (0.12%) volume insufficient sample and 2 (0.05%) automatic pipettor failures. No zika RNA reactive sample was identified. CONCLUSION: It was possible to determine the analytical characteristics of the developed method and the test showed feasible to be incorporated into the blood screening routine. This method represents an alternative to warrant the safety of the blood supply during zika virus epidemics. No zika RNA+ donation was detected in our screening blood donors routine what can be correlated to the very low number of autochtonous zika cases in São Paulo city during the study period. However, a generic NAT system covering a group of flaviviruses which are circulating in the region such as ZIKV, DENV and YFV among others, could be an useful toolBiblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPLevi, José EduardoLira, Sanny Marcele da Costa2021-04-01info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5134/tde-19082021-131219/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2021-08-20T12:05:02Zoai:teses.usp.br:tde-19082021-131219Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212021-08-20T12:05:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Avaliação da prevalência de viremia do zika vírus em doadores de sangue do Hospital Israelita Albert Einstein no período de maio de 2016 a maio de 2018
Prevalence of zika virus RNA in blood donors at Albert Einstein hospital from may, 2016 to may, 2018
title Avaliação da prevalência de viremia do zika vírus em doadores de sangue do Hospital Israelita Albert Einstein no período de maio de 2016 a maio de 2018
spellingShingle Avaliação da prevalência de viremia do zika vírus em doadores de sangue do Hospital Israelita Albert Einstein no período de maio de 2016 a maio de 2018
Lira, Sanny Marcele da Costa
Blood donors
Blood safety
Blood transfusion
Doadores de sangue
Flavivirus
Flavivírus
Reação em cadeia da polimerase em tempo real
Real-time polymerase chain reaction
Segurança do sangue
Transfusão de sangue
Zika virus
Zika vírus
title_short Avaliação da prevalência de viremia do zika vírus em doadores de sangue do Hospital Israelita Albert Einstein no período de maio de 2016 a maio de 2018
title_full Avaliação da prevalência de viremia do zika vírus em doadores de sangue do Hospital Israelita Albert Einstein no período de maio de 2016 a maio de 2018
title_fullStr Avaliação da prevalência de viremia do zika vírus em doadores de sangue do Hospital Israelita Albert Einstein no período de maio de 2016 a maio de 2018
title_full_unstemmed Avaliação da prevalência de viremia do zika vírus em doadores de sangue do Hospital Israelita Albert Einstein no período de maio de 2016 a maio de 2018
title_sort Avaliação da prevalência de viremia do zika vírus em doadores de sangue do Hospital Israelita Albert Einstein no período de maio de 2016 a maio de 2018
author Lira, Sanny Marcele da Costa
author_facet Lira, Sanny Marcele da Costa
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Levi, José Eduardo
dc.contributor.author.fl_str_mv Lira, Sanny Marcele da Costa
dc.subject.por.fl_str_mv Blood donors
Blood safety
Blood transfusion
Doadores de sangue
Flavivirus
Flavivírus
Reação em cadeia da polimerase em tempo real
Real-time polymerase chain reaction
Segurança do sangue
Transfusão de sangue
Zika virus
Zika vírus
topic Blood donors
Blood safety
Blood transfusion
Doadores de sangue
Flavivirus
Flavivírus
Reação em cadeia da polimerase em tempo real
Real-time polymerase chain reaction
Segurança do sangue
Transfusão de sangue
Zika virus
Zika vírus
description INTRODUÇÃO: O zika vírus (ZIKV) é um vírus de RNA pertencente ao gênero Flavivírus e foi inicialmente isolado na Floresta Zika, Uganda em 1947. A ocorrência de algumas epidemias ao redor do mundo demonstrou que a presença de doadores de sangue virêmicos assintomáticos proporciona um aumento do risco de transmissão transfusional(TT).Embora o curso clínico das infecções adquiridas por transfusão nos receptores de sangue ainda seja desconhecido, a triagem de doadores através dos testes de ácidos nucléicos (NAT) é uma alternativa importante na manutenção da segurança transfusional. Neste estudo desenvolvemos, validamos e implementamos um teste de NAT in house para detecção do RNA do zika vírus em amostras de doadores de sangue do Departamento de Hemoterapia e Terapia Celular do Hospital Israelita Albert Einstein. MÉTODOS: Tubos primários de plasma provenientes de candidatos à doação de sangue foram submetidos à extração do RNA em uma plataforma automatizada. São utilizados inicializadores e sondas para o ZIKV e para o póliovírus(PV) que funciona como o controle interno da reação, em uma reação duplex.O controle positivo utilizado é um sobrenadante de cultura de ZIKV da linhagem asiática e os controles negativos são amostras de plasma de doadores previamente testados para ZIKV. A reação de cadeia de polimerase em tempo real foi realizada em um termociclador utilizando o protocolo estabelecido pelo fornecedor. RESULTADOS: Entre maio de 2016 e maio de 2018, 3.369 amostras foram coletadas de 3.221 doadores de sangue (intervalo de confiança, 95%; supondo a prevalência do ZIKV RNA de 5%); 31 (0,92%) foram consideradas falso positivas, pois não foram confirmadas reatividades na repetição em duplicata, 14 amostras (0,42%) apresentaram resultado inválido devido às falhas nos controles internos, 4 (0,12%) tiveram volume insuficiente de amostra e em duas (0,05%) houve falha no pipetador automático. Nenhuma amostra foi positiva para o RNA do zika vírus. CONCLUSÕES: Foi possível validar e determinar as características analíticas da metodologia aplicada que se mostrou factível em sua utilização na rotina de triagem laboratorial de doadores de sangue. Este método representa uma alternativa para garantir a segurança transfusional durante epidemias do zika vírus. Não foi identificada nenhuma amostra positiva para o ZIKV RNA, em concordância com o pequeno número de casos autóctones na cidade de São Paulo durante o período do estudo
publishDate 2021
dc.date.none.fl_str_mv 2021-04-01
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5134/tde-19082021-131219/
url https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5134/tde-19082021-131219/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1815258305426096128