Phanerochaete chrysosporium: mapa genético, expressão heteróloga e padrão de transcrição de genes de celulase

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 1997
Autor(a) principal: Vallim, Marcelo Afonso
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
CELULASES
EXPRESSÃO GÊNICA
FUNGOS LIGNOCELULOLÍTICOS
MAPEAMENTO GENÉTICO
Link de acesso: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-20210104-190506/
Resumo: O fungo Phanerochaete chrysosporium é conhecido por sua capacidade de degradar lignina e celulose. Entretanto, não se tem muito conhecimento a respeito da genética deste fungo, bem como da expressão de seus genes codificando para celulases, o que possibilitaria a construção de 1 linhagens as quais podem ser empregadas em bioprocessos como delignificaçao e sacarificação da celulose. Neste trabalho, 13 novos genes foram mapeados. Foi determinada a ligação entre cbh1-5 e aad (3,38 unidades mapa). O resultado do mapeamento genético associado ao mapeamento físico pela separação de cromossomos e hibridização, possibilitará a ampliação do mapa já existente. Seis genes distintos codificando para celobiohidrolase 1 (CBH 1) foram isolados e caracterizados em P. chrysopsporium, mas seus produtos enzimáticos não são conhecidos. Também neste trabalho, o gene cbh1-1 foi expresso em levedura. Entretanto, nenhuma atividade enzimática pôde ser detectada para este gene, bem como para o controle positivo cbh1-4.O padrão de transcrição de seis genes codificando para CBH I, um para CBH II e um para CDH foi determinado quando P. chrysosporium foi cultivado em lascas de madeira. Este padrão de transcrição difere do previamente descrito, quando este fungo está crescendo em meio de cultura definido, suplementado com celulose. Isto sugere que a transcrição de diferentes cbhs é regulada de acordo com o substrato presente no meio de cultura.
id USP_60880ead8b7f24821c7ca2df34b0de4d
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-20210104-190506
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str
spelling Phanerochaete chrysosporium: mapa genético, expressão heteróloga e padrão de transcrição de genes de celulasePhanerochaete chrysosporium: genetic mapping, heterologous expression and transcription pattern of cellulase genesCELULASESEXPRESSÃO GÊNICAFUNGOS LIGNOCELULOLÍTICOSMAPEAMENTO GENÉTICOO fungo Phanerochaete chrysosporium é conhecido por sua capacidade de degradar lignina e celulose. Entretanto, não se tem muito conhecimento a respeito da genética deste fungo, bem como da expressão de seus genes codificando para celulases, o que possibilitaria a construção de 1 linhagens as quais podem ser empregadas em bioprocessos como delignificaçao e sacarificação da celulose. Neste trabalho, 13 novos genes foram mapeados. Foi determinada a ligação entre cbh1-5 e aad (3,38 unidades mapa). O resultado do mapeamento genético associado ao mapeamento físico pela separação de cromossomos e hibridização, possibilitará a ampliação do mapa já existente. Seis genes distintos codificando para celobiohidrolase 1 (CBH 1) foram isolados e caracterizados em P. chrysopsporium, mas seus produtos enzimáticos não são conhecidos. Também neste trabalho, o gene cbh1-1 foi expresso em levedura. Entretanto, nenhuma atividade enzimática pôde ser detectada para este gene, bem como para o controle positivo cbh1-4.O padrão de transcrição de seis genes codificando para CBH I, um para CBH II e um para CDH foi determinado quando P. chrysosporium foi cultivado em lascas de madeira. Este padrão de transcrição difere do previamente descrito, quando este fungo está crescendo em meio de cultura definido, suplementado com celulose. Isto sugere que a transcrição de diferentes cbhs é regulada de acordo com o substrato presente no meio de cultura.The white-rot fungus Phanerochaete chrysosporium is well known for its ability to degrade lignin-cellulose substrate. However, not much is known about its genetics and cellulase gene expressíon, that would allow the construction of strains whích can be employed in bioprocess such as biopulping and cellulose saccharification. This work presents the genetic mapping results for 13 new genes. These results when associated with physic mapping by chromosome separation and hybridization will amplify the already existing genetic map. A significant linkage was determined between cbh1-5 and aad (3,38 map units). Six genes coding for cellobiohydrolase I(CBH 1) were isolated, nevertheless their enzymatic product are not known. This work also presents the attempt to express cbh1-1 in Saccharomyces cerevisiae. However, no enzymatic activity was observed for this gene, as well as for the positive control cbh1-4. The transcription pattern of six genes coding for CBH I, one for CBH II and one for CDH was determined when P. chrysosporium is growing on wood chips. The transcription pattern found here is different from the previously determined when this sarne fungus is growing on defined media supplemented with cellulose. This finding suggests that differential cbhs transcription is depending upon the substrate typeBiblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPPizzirani-Kleiner, Aline AparecidaVallim, Marcelo Afonso1997-12-12info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-20210104-190506/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2021-01-07T22:52:02Zoai:teses.usp.br:tde-20210104-190506Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212021-01-07T22:52:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Phanerochaete chrysosporium: mapa genético, expressão heteróloga e padrão de transcrição de genes de celulase
Phanerochaete chrysosporium: genetic mapping, heterologous expression and transcription pattern of cellulase genes
title Phanerochaete chrysosporium: mapa genético, expressão heteróloga e padrão de transcrição de genes de celulase
spellingShingle Phanerochaete chrysosporium: mapa genético, expressão heteróloga e padrão de transcrição de genes de celulase
Vallim, Marcelo Afonso
CELULASES
EXPRESSÃO GÊNICA
FUNGOS LIGNOCELULOLÍTICOS
MAPEAMENTO GENÉTICO
title_short Phanerochaete chrysosporium: mapa genético, expressão heteróloga e padrão de transcrição de genes de celulase
title_full Phanerochaete chrysosporium: mapa genético, expressão heteróloga e padrão de transcrição de genes de celulase
title_fullStr Phanerochaete chrysosporium: mapa genético, expressão heteróloga e padrão de transcrição de genes de celulase
title_full_unstemmed Phanerochaete chrysosporium: mapa genético, expressão heteróloga e padrão de transcrição de genes de celulase
title_sort Phanerochaete chrysosporium: mapa genético, expressão heteróloga e padrão de transcrição de genes de celulase
author Vallim, Marcelo Afonso
author_facet Vallim, Marcelo Afonso
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Pizzirani-Kleiner, Aline Aparecida
dc.contributor.author.fl_str_mv Vallim, Marcelo Afonso
dc.subject.none.fl_str_mv
dc.subject.por.fl_str_mv CELULASES
EXPRESSÃO GÊNICA
FUNGOS LIGNOCELULOLÍTICOS
MAPEAMENTO GENÉTICO
topic CELULASES
EXPRESSÃO GÊNICA
FUNGOS LIGNOCELULOLÍTICOS
MAPEAMENTO GENÉTICO
description O fungo Phanerochaete chrysosporium é conhecido por sua capacidade de degradar lignina e celulose. Entretanto, não se tem muito conhecimento a respeito da genética deste fungo, bem como da expressão de seus genes codificando para celulases, o que possibilitaria a construção de 1 linhagens as quais podem ser empregadas em bioprocessos como delignificaçao e sacarificação da celulose. Neste trabalho, 13 novos genes foram mapeados. Foi determinada a ligação entre cbh1-5 e aad (3,38 unidades mapa). O resultado do mapeamento genético associado ao mapeamento físico pela separação de cromossomos e hibridização, possibilitará a ampliação do mapa já existente. Seis genes distintos codificando para celobiohidrolase 1 (CBH 1) foram isolados e caracterizados em P. chrysopsporium, mas seus produtos enzimáticos não são conhecidos. Também neste trabalho, o gene cbh1-1 foi expresso em levedura. Entretanto, nenhuma atividade enzimática pôde ser detectada para este gene, bem como para o controle positivo cbh1-4.O padrão de transcrição de seis genes codificando para CBH I, um para CBH II e um para CDH foi determinado quando P. chrysosporium foi cultivado em lascas de madeira. Este padrão de transcrição difere do previamente descrito, quando este fungo está crescendo em meio de cultura definido, suplementado com celulose. Isto sugere que a transcrição de diferentes cbhs é regulada de acordo com o substrato presente no meio de cultura.
publishDate 1997
dc.date.none.fl_str_mv 1997-12-12
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-20210104-190506/
url https://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-20210104-190506/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1865492552279392256

Registros relacionados