Estudo de pequenos RNAs regulatórios na resposta a estresses em Caulobacter crescentus
| Ano de defesa: | 2025 |
|---|---|
| Autor(a) principal: | |
| Orientador(a): | |
| Banca de defesa: | |
| Tipo de documento: | Dissertação |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
|
| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
|
| Departamento: |
Não Informado pela instituição
|
| País: |
Não Informado pela instituição
|
| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-04122025-114207/ |
Resumo: | Em resposta a mudanças ambientais, as bactérias possuem mecanismos regulatórios sofisticados, sendo que a regulação pós-transcricional mediada por pequenos RNAs (sRNAs) destaca-se devido ao seu rápido efeito através da interação direta com o mRNA. Em Caulobacter crescentus, uma alfaproteobacteria não patogênica, poucos sRNAs foram caracterizados até o momento, o que torna essencial expandir o conhecimento sobre seu papel regulatório. Este estudo teve como objetivo caracterizar dois sRNAs que apresentaram aumento de expressão em baixa temperatura. Linhagens mutantes foram construídas para cada sRNA e seu comportamento foi avaliado sob diferentes condições de estresse (estresse por frio, congelamento, osmótico e oxidativo), além de análises de crescimento, motilidade e formação de biofilme. Para investigar seu impacto na expressão gênica, análises transcriptômicas globais por RNA-seq foram realizadas comparando as linhagens superexpressando esses sRNAs com os mutantes. Foram também avaliados os perfis de transcrição por qRT-PCR em diferentes condições, como fase estacionária, privação de glicose e crescimento em meio mínimo. Observou-se um maior acúmulo do sRNA R0009 durante o crescimento em meio mínimo com glicose. A deleção dos sRNAs não afetou a morfologia celular, e um dos mutantes (R0009) apresentou um ligeiro aumento na taxa de crescimento, bem como um aumento na formação de biofilme. O RNA-seq indicou poucas alterações na expressão gênica, o que pode sugerir que esses sRNAs possam atuar na regulação da tradução e não na estabilidade do mRNA. Esses resultados sugerem que os sRNAs analisados podem participar da regulação de vias relacionadas ao crescimento e à formação de biofilme em C. crescentus. |
| id |
USP_70190a549ee0591e787d97b3db0fabb9 |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:teses.usp.br:tde-04122025-114207 |
| network_acronym_str |
USP |
| network_name_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
| repository_id_str |
|
| spelling |
Estudo de pequenos RNAs regulatórios na resposta a estresses em Caulobacter crescentusStudy of small regulatory RNAs in the response to stresses in Caulobacter crescentusBiologia molecularGene regulationMicrobiologiaMicrobiologyMolecular biologyPost-transcriptional regulationRegulação gênicaRegulação pós-transcricionalResposta a estressesStress responseEm resposta a mudanças ambientais, as bactérias possuem mecanismos regulatórios sofisticados, sendo que a regulação pós-transcricional mediada por pequenos RNAs (sRNAs) destaca-se devido ao seu rápido efeito através da interação direta com o mRNA. Em Caulobacter crescentus, uma alfaproteobacteria não patogênica, poucos sRNAs foram caracterizados até o momento, o que torna essencial expandir o conhecimento sobre seu papel regulatório. Este estudo teve como objetivo caracterizar dois sRNAs que apresentaram aumento de expressão em baixa temperatura. Linhagens mutantes foram construídas para cada sRNA e seu comportamento foi avaliado sob diferentes condições de estresse (estresse por frio, congelamento, osmótico e oxidativo), além de análises de crescimento, motilidade e formação de biofilme. Para investigar seu impacto na expressão gênica, análises transcriptômicas globais por RNA-seq foram realizadas comparando as linhagens superexpressando esses sRNAs com os mutantes. Foram também avaliados os perfis de transcrição por qRT-PCR em diferentes condições, como fase estacionária, privação de glicose e crescimento em meio mínimo. Observou-se um maior acúmulo do sRNA R0009 durante o crescimento em meio mínimo com glicose. A deleção dos sRNAs não afetou a morfologia celular, e um dos mutantes (R0009) apresentou um ligeiro aumento na taxa de crescimento, bem como um aumento na formação de biofilme. O RNA-seq indicou poucas alterações na expressão gênica, o que pode sugerir que esses sRNAs possam atuar na regulação da tradução e não na estabilidade do mRNA. Esses resultados sugerem que os sRNAs analisados podem participar da regulação de vias relacionadas ao crescimento e à formação de biofilme em C. crescentus.In response to environmental changes, bacteria possess sophisticated regulatory mechanisms, with post-transcriptional regulation mediated by small RNAs (sRNAs) standing out due to its rapid effect through direct interaction with mRNA. In Caulobacter crescentus, a non-pathogenic alphaproteobacterium, few sRNAs have been characterized to date, making it essential to expand knowledge about their regulatory roles. This study aimed to characterize two sRNAs that showed increased expression at low temperature. Mutant strains were constructed for each sRNA, and their behavior was evaluated under different stress conditions (cold, freezing, osmotic, and oxidative stress), as well as through analyses of growth, motility, and biofilm formation. To investigate their impact on gene expression, global transcriptomic analyses by RNA-seq were performed, comparing strains overexpressing these sRNAs with the mutants. Transcriptional profiles were also evaluated by qRT-PCR under different conditions, such as stationary phase, glucose deprivation, and growth in minimal medium. A higher accumulation of the sRNA R0009 was observed during growth in minimal medium with glucose. Deletion of the sRNAs did not affect cell morphology, and one of the mutants (R0009) displayed a slight increase in growth rate, as well as enhanced biofilm formation. RNA-seq revealed few changes in gene expression, which may suggest that these sRNAs act at the level of translational regulation rather than mRNA stability. Altogether, these results indicate that the analyzed sRNAs may participate in the regulation of pathways related to growth and biofilm formation in C. crescentus.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPMarques, Marilis do ValleNeves, Wanderson Souza2025-10-29info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-04122025-114207/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPReter o conteúdo por motivos de patente, publicação e/ou direitos autoriais.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2025-12-04T16:42:02Zoai:teses.usp.br:tde-04122025-114207Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212025-12-04T16:42:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
| dc.title.none.fl_str_mv |
Estudo de pequenos RNAs regulatórios na resposta a estresses em Caulobacter crescentus Study of small regulatory RNAs in the response to stresses in Caulobacter crescentus |
| title |
Estudo de pequenos RNAs regulatórios na resposta a estresses em Caulobacter crescentus |
| spellingShingle |
Estudo de pequenos RNAs regulatórios na resposta a estresses em Caulobacter crescentus Neves, Wanderson Souza Biologia molecular Gene regulation Microbiologia Microbiology Molecular biology Post-transcriptional regulation Regulação gênica Regulação pós-transcricional Resposta a estresses Stress response |
| title_short |
Estudo de pequenos RNAs regulatórios na resposta a estresses em Caulobacter crescentus |
| title_full |
Estudo de pequenos RNAs regulatórios na resposta a estresses em Caulobacter crescentus |
| title_fullStr |
Estudo de pequenos RNAs regulatórios na resposta a estresses em Caulobacter crescentus |
| title_full_unstemmed |
Estudo de pequenos RNAs regulatórios na resposta a estresses em Caulobacter crescentus |
| title_sort |
Estudo de pequenos RNAs regulatórios na resposta a estresses em Caulobacter crescentus |
| author |
Neves, Wanderson Souza |
| author_facet |
Neves, Wanderson Souza |
| author_role |
author |
| dc.contributor.none.fl_str_mv |
Marques, Marilis do Valle |
| dc.contributor.author.fl_str_mv |
Neves, Wanderson Souza |
| dc.subject.por.fl_str_mv |
Biologia molecular Gene regulation Microbiologia Microbiology Molecular biology Post-transcriptional regulation Regulação gênica Regulação pós-transcricional Resposta a estresses Stress response |
| topic |
Biologia molecular Gene regulation Microbiologia Microbiology Molecular biology Post-transcriptional regulation Regulação gênica Regulação pós-transcricional Resposta a estresses Stress response |
| description |
Em resposta a mudanças ambientais, as bactérias possuem mecanismos regulatórios sofisticados, sendo que a regulação pós-transcricional mediada por pequenos RNAs (sRNAs) destaca-se devido ao seu rápido efeito através da interação direta com o mRNA. Em Caulobacter crescentus, uma alfaproteobacteria não patogênica, poucos sRNAs foram caracterizados até o momento, o que torna essencial expandir o conhecimento sobre seu papel regulatório. Este estudo teve como objetivo caracterizar dois sRNAs que apresentaram aumento de expressão em baixa temperatura. Linhagens mutantes foram construídas para cada sRNA e seu comportamento foi avaliado sob diferentes condições de estresse (estresse por frio, congelamento, osmótico e oxidativo), além de análises de crescimento, motilidade e formação de biofilme. Para investigar seu impacto na expressão gênica, análises transcriptômicas globais por RNA-seq foram realizadas comparando as linhagens superexpressando esses sRNAs com os mutantes. Foram também avaliados os perfis de transcrição por qRT-PCR em diferentes condições, como fase estacionária, privação de glicose e crescimento em meio mínimo. Observou-se um maior acúmulo do sRNA R0009 durante o crescimento em meio mínimo com glicose. A deleção dos sRNAs não afetou a morfologia celular, e um dos mutantes (R0009) apresentou um ligeiro aumento na taxa de crescimento, bem como um aumento na formação de biofilme. O RNA-seq indicou poucas alterações na expressão gênica, o que pode sugerir que esses sRNAs possam atuar na regulação da tradução e não na estabilidade do mRNA. Esses resultados sugerem que os sRNAs analisados podem participar da regulação de vias relacionadas ao crescimento e à formação de biofilme em C. crescentus. |
| publishDate |
2025 |
| dc.date.none.fl_str_mv |
2025-10-29 |
| dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| format |
masterThesis |
| status_str |
publishedVersion |
| dc.identifier.uri.fl_str_mv |
https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-04122025-114207/ |
| url |
https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-04122025-114207/ |
| dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
| language |
por |
| dc.relation.none.fl_str_mv |
|
| dc.rights.driver.fl_str_mv |
Reter o conteúdo por motivos de patente, publicação e/ou direitos autoriais. info:eu-repo/semantics/openAccess |
| rights_invalid_str_mv |
Reter o conteúdo por motivos de patente, publicação e/ou direitos autoriais. |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
| dc.coverage.none.fl_str_mv |
|
| dc.publisher.none.fl_str_mv |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP |
| publisher.none.fl_str_mv |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP |
| dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP instname:Universidade de São Paulo (USP) instacron:USP |
| instname_str |
Universidade de São Paulo (USP) |
| instacron_str |
USP |
| institution |
USP |
| reponame_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
| collection |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
| repository.name.fl_str_mv |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP) |
| repository.mail.fl_str_mv |
virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br |
| _version_ |
1865492187810103296 |