Planejamento, síntese e avaliação biológica de análogos de fumiquinazolinas

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2024
Autor(a) principal: Marchiori, Marcelo Fiori
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/60/60138/tde-20082025-080108/
Resumo: A via phosphoinositide 3-kinase (PI3K)/alpha-serine/protein kinase B (Akt)/mammalian target of rapamycin (mTOR), mais conhecida como PI3K/Akt/mTOR ou PAM, é uma importante via de sinalização intracelular diretamente relacionada ao controle do ciclo celular e, consequentemente, à diversas patologias relacionadas ao envelhecimento e longevidade, como câncer, diabetes tipo 2 (DM2), doenças cardíacas e neurodegenerativas (Doença de Alzheimer e Parkinson). Desse modo, estudos têm enfatizado que a inibição desta via pode ser uma estratégia interessante para o tratamento de patologias relacionadas à idade. Inibidores seletivos para a subunidade mTORC1 do complexo multiproteico mTOR mostraram efeitos de inibição parcial da via PAM, não sendo efetivos na regressão tumoral. Ainda, há na literatura a descrição de inibidores seletivos mTORC1, mTORC2 e PI3K utilizados na tentativa de modular essa via celular, porém, todos apresentando desvantagens, principalmente, relacionada às suas toxicidades. Assim, inibidores duplos PI3K/mTOR foram desenvolvidos, sendo que esta dupla inibição bloqueia a fosforilação de proteínas \"dowstream\" na via PAM em mais de uma etapa e, consequentemente, promoveu a inibição da proliferação celular em diversas linhagens de células tumorais ao induzir os processos de apoptose e autofagia. No entanto, apesar de efetivos, estes derivados não conseguiram superar algumas desvantagens já observadas nos seus precedentes como a baixa eficácia contra alguns tipos de câncer, a necessidade de utilização em terapia combinada e a ocorrência de efeitos colaterais. Neste contexto, o presente projeto propõe o planejamento e a síntese de potenciais inibidores da via PAM pelo bloqueio concomitante dos alvos PI3K e mTOR para potencial prevenção e/ou tratamento de patologias relacionadas ao envelhecimento, como Alzheimer e câncer. As estruturas propostas foram planejadas a partir de modelos farmacofóricos gerados pela sobreposição de potentes inibidores PI3K/mTOR pelo programa Discovery Studio e PharmaGist e possuem um sistema rígido de três anéis heterociclos fundidos como esqueleto central. Ademais, as estruturas propostas são análogas de alcaloides naturais denominados fumiquinazolinas e foram escolhidas devido a possível empregabilidade da rota sintética \"one pot\" para geração de grande diversidade estrutural a partir de aminoácidos e/ou heterocíclicos como reagentes. Simulações de docking virtual para entendimento do possível modo de ligação entre os compostos obtidos e os sítios ativos (PI3K e mTOR) bem como otimização estrutural destes possíveis inibidores foram propostas. Por fim, após obtenção, isolamento e purificação, os derivados sintetizados foram submetidos à diferentes ensaios biológicos, como ensaios celulares para avaliar a potencial neuroproteção e neurorecuperação na linhagem SH-SY5Y, assim como ensaios antimicrobianos, e ensaios antitumorais em diferentes linhagens. Entre todos os resultados, o mais promissor foi a atividade antitumoral de dois compostos da Classe 03 - série nafitílica (MFD_55 e MFD_56).
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Inibidores seletivos para a subunidade mTORC1 do complexo multiproteico mTOR mostraram efeitos de inibição parcial da via PAM, não sendo efetivos na regressão tumoral. Ainda, há na literatura a descrição de inibidores seletivos mTORC1, mTORC2 e PI3K utilizados na tentativa de modular essa via celular, porém, todos apresentando desvantagens, principalmente, relacionada às suas toxicidades. Assim, inibidores duplos PI3K/mTOR foram desenvolvidos, sendo que esta dupla inibição bloqueia a fosforilação de proteínas \"dowstream\" na via PAM em mais de uma etapa e, consequentemente, promoveu a inibição da proliferação celular em diversas linhagens de células tumorais ao induzir os processos de apoptose e autofagia. No entanto, apesar de efetivos, estes derivados não conseguiram superar algumas desvantagens já observadas nos seus precedentes como a baixa eficácia contra alguns tipos de câncer, a necessidade de utilização em terapia combinada e a ocorrência de efeitos colaterais. Neste contexto, o presente projeto propõe o planejamento e a síntese de potenciais inibidores da via PAM pelo bloqueio concomitante dos alvos PI3K e mTOR para potencial prevenção e/ou tratamento de patologias relacionadas ao envelhecimento, como Alzheimer e câncer. As estruturas propostas foram planejadas a partir de modelos farmacofóricos gerados pela sobreposição de potentes inibidores PI3K/mTOR pelo programa Discovery Studio e PharmaGist e possuem um sistema rígido de três anéis heterociclos fundidos como esqueleto central. Ademais, as estruturas propostas são análogas de alcaloides naturais denominados fumiquinazolinas e foram escolhidas devido a possível empregabilidade da rota sintética \"one pot\" para geração de grande diversidade estrutural a partir de aminoácidos e/ou heterocíclicos como reagentes. Simulações de docking virtual para entendimento do possível modo de ligação entre os compostos obtidos e os sítios ativos (PI3K e mTOR) bem como otimização estrutural destes possíveis inibidores foram propostas. Por fim, após obtenção, isolamento e purificação, os derivados sintetizados foram submetidos à diferentes ensaios biológicos, como ensaios celulares para avaliar a potencial neuroproteção e neurorecuperação na linhagem SH-SY5Y, assim como ensaios antimicrobianos, e ensaios antitumorais em diferentes linhagens. Entre todos os resultados, o mais promissor foi a atividade antitumoral de dois compostos da Classe 03 - série nafitílica (MFD_55 e MFD_56).The phosphoinositide 3-kinase (PI3K)/alpha-serine/protein kinase B (Akt)/mammalian target of rapamycin (mTOR) pathway, more commonly known as PI3K/Akt/mTOR or PAM, is a crucial intracellular signaling pathway directly related to cell cycle control and, consequently, to various age-related pathologies such as cancer, type 2 diabetes (DM2), cardiovascular diseases, and neurodegenerative diseases (Alzheimer\'s and Parkinson\'s). Therefore, studies have emphasized that inhibiting this pathway could be an interesting strategy for treating age-related diseases. Selective inhibitors for the mTORC1 subunit of the multiprotein mTOR complex have shown partial inhibition effects on the PAM pathway, but they have not been effective in tumor regression. Additionally, the literature describes selective mTORC1, mTORC2, and PI3K inhibitors used in attempts to modulate this cellular pathway, but all have disadvantages, primarily related to their toxicities. Consequently, dual PI3K/mTOR inhibitors were developed; this dual inhibition blocks the phosphorylation of downstream proteins in the PAM pathway at multiple stages, thereby inhibiting cell proliferation in various tumor cell lines by inducing apoptosis and autophagy. However, despite their effectiveness, these derivatives have not overcome some of the previously observed disadvantages, such as low efficacy against certain cancer types, the need for combination therapy, and the occurrence of side effects. In this context, the present project proposes the design and synthesis of potential PAM pathway inhibitors through the concurrent blockade of PI3K and mTOR targets to potentially prevent and/or treat age-related diseases such as Alzheimer\'s and cancer. The proposed structures were designed based on pharmacophore models generated by the superposition of potent PI3K/mTOR inhibitors using the Discovery Studio and PharmaGist programs and feature a rigid system of three fused heterocyclic rings as the central skeleton. Furthermore, the proposed structures are analogs of natural alkaloids called fumiquinazolines and were chosen due to the possible employability of the \"one pot\" synthetic route to generate significant structural diversity from amino acids and/or heterocycles as reagents. Virtual docking simulations to understand the possible binding mode between the obtained compounds and the active sites (PI3K and mTOR), as well as structural optimization of these potential inhibitors, were proposed. Finally, after obtaining, isolating, and purifying the synthesized derivatives, they were subjected to various biological assays, such as cellular assays to evaluate potential neuroprotection and neurorecovery in the SH-SY5Y lineage, as well as antimicrobial assays, and antitumor assays in different lineages. Among all the results, the most promising was the antitumor activity of two compounds from Class 03 -naphthyl series (MFD_55 and MFD_56)Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPCarvalho, IvoneMarchiori, Marcelo Fiori2024-09-12info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/60/60138/tde-20082025-080108/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPReter o conteúdo por motivos de patente, publicação e/ou direitos autoriais.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2025-09-16T13:49:02Zoai:teses.usp.br:tde-20082025-080108Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212025-09-16T13:49:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
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