O papel do [18F]FDG PET/CT na predição histológica do câncer de pulmão de não pequenas células: uma abordagem de aprendizado de máquina baseada em radiômica.
| Ano de defesa: | 2025 |
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Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
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Resumo: | Introdução: Em oncologia clínica, a biópsia de tecido neoplásico e a investigação histopatológica são ferramentas diagnósticas valiosas na avaliação de casos de câncer de pulmão não pequenas células (CPNPC). Apesar de a avaliação histopatológica ser o procedimento padrão-ouro nesta caracterização, ela pode apresentar vieses relacionados à qualidade do procedimento executado ou à amostra biopsiada. A imagem metabólica de [18F]FDG PET/CT é amplamente utilizada no acompanhamento do CPNPC, auxiliando na identificação de metástases e melhorando o estadiamento e o planejamento terapêutico. Porém, a imagem metabólica pode ser melhor explorada na caracterização histológica dos tipos de CPNPC por atributos radiômicos, complementando a informação preliminar apresentada pela avaliação histopatológica. O objetivo deste estudo foi avaliar como as imagens de [18F]FDG PET/CT em CPNPC, podem apresentar atributos radiômicos que caracterizem a heterogeneidade metabólica tumoral entre diferentes classes histológicas. Materiais e métodos: Exploramos 115 imagens de [18F]FDG-PET-CT de pacientes diagnosticados com CPNPC, com confirmação histopatológica para as classes de adenocarcinoma (Adc.) e carcinoma de células escamosas (CCE). Um total de 2.082 atributos radiômicos de primeira, segunda e ordem superior, foram extraídos das imagens de PET, por meio de seis métodos distintos de segmentação. Os atributos radiômicos extraídos pelo método de segmentação manual, foram associados a outras variáveis clínicas, demográficas e genômicas, antes de serem utilizados para a construção de modelos de aprendizado de máquina para predição de classe histológica. Nós selecionamos cinco métodos de seleção de atributos (ANOVA, MI, PCA, LASSO e RFECV) e seis métodos preditores (SVM, kNN, GNB, DT, RF e XGBoost), os quais foram combinados de forma cruzada para compor 30 modelos de aprendizado de máquina que fossem capazes de diferenciar as classes histológicas de CPNPC de Adc e CCE. As métricas de performance F1-score e AUC foram avaliadas ao longo das etapas de validação e teste para os modelos de aprendizagem, e os atributos de maior importância para cada modelo foram representados em uma distribuição SHAP para melhor interpretabilidade dos resultados. Os atributos radiômicos e não radiômicos de maior frequência entre os métodos avaliados, foram ranqueados de acordo com a sua importância como bioassinaturas da classe investigada e a performance do modelo de classificação que ele estivesse associado. Resultados: Os modelos que apresentaram maior AUC na identificação de casos de CCE foram os de ANOVA/SVM (0,94) para a etapa de validação e PCA/GNB e RFECV/SVM (0,86) para a etapa de teste. Na representação dos atributos radiômicos que representaram melhor as características fenotípicas de cada classe histológica temos o gradiente/GLCM/ldn para CCE e Wavelet (HLH)/GLSZM/Small Area High Gray Level Emphasis para os casos de Adc. Conclusão: Por fim, o presente estudo foi capaz de identificar e caracterizar um rol de assinaturas radiômicas, obtidas a partir de imagem de [18F] FDG PET/CT, que evidenciaram, de forma reprodutível e estável, características fenotípicas do metabolismo tumoral em nódulo primário para as classes histológicas de Adc e CCE em casos de CPNPC. |
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O papel do [18F]FDG PET/CT na predição histológica do câncer de pulmão de não pequenas células: uma abordagem de aprendizado de máquina baseada em radiômica.The role of [18F] FDG PET/CT in histological prediction of non-small cell lung cancer: a radiomics-based machine learning approachaprendizado de máquinacâncer de pulmãolung cancermachine learningradiômicaradiomicsIntrodução: Em oncologia clínica, a biópsia de tecido neoplásico e a investigação histopatológica são ferramentas diagnósticas valiosas na avaliação de casos de câncer de pulmão não pequenas células (CPNPC). Apesar de a avaliação histopatológica ser o procedimento padrão-ouro nesta caracterização, ela pode apresentar vieses relacionados à qualidade do procedimento executado ou à amostra biopsiada. A imagem metabólica de [18F]FDG PET/CT é amplamente utilizada no acompanhamento do CPNPC, auxiliando na identificação de metástases e melhorando o estadiamento e o planejamento terapêutico. Porém, a imagem metabólica pode ser melhor explorada na caracterização histológica dos tipos de CPNPC por atributos radiômicos, complementando a informação preliminar apresentada pela avaliação histopatológica. O objetivo deste estudo foi avaliar como as imagens de [18F]FDG PET/CT em CPNPC, podem apresentar atributos radiômicos que caracterizem a heterogeneidade metabólica tumoral entre diferentes classes histológicas. Materiais e métodos: Exploramos 115 imagens de [18F]FDG-PET-CT de pacientes diagnosticados com CPNPC, com confirmação histopatológica para as classes de adenocarcinoma (Adc.) e carcinoma de células escamosas (CCE). Um total de 2.082 atributos radiômicos de primeira, segunda e ordem superior, foram extraídos das imagens de PET, por meio de seis métodos distintos de segmentação. Os atributos radiômicos extraídos pelo método de segmentação manual, foram associados a outras variáveis clínicas, demográficas e genômicas, antes de serem utilizados para a construção de modelos de aprendizado de máquina para predição de classe histológica. Nós selecionamos cinco métodos de seleção de atributos (ANOVA, MI, PCA, LASSO e RFECV) e seis métodos preditores (SVM, kNN, GNB, DT, RF e XGBoost), os quais foram combinados de forma cruzada para compor 30 modelos de aprendizado de máquina que fossem capazes de diferenciar as classes histológicas de CPNPC de Adc e CCE. As métricas de performance F1-score e AUC foram avaliadas ao longo das etapas de validação e teste para os modelos de aprendizagem, e os atributos de maior importância para cada modelo foram representados em uma distribuição SHAP para melhor interpretabilidade dos resultados. Os atributos radiômicos e não radiômicos de maior frequência entre os métodos avaliados, foram ranqueados de acordo com a sua importância como bioassinaturas da classe investigada e a performance do modelo de classificação que ele estivesse associado. Resultados: Os modelos que apresentaram maior AUC na identificação de casos de CCE foram os de ANOVA/SVM (0,94) para a etapa de validação e PCA/GNB e RFECV/SVM (0,86) para a etapa de teste. Na representação dos atributos radiômicos que representaram melhor as características fenotípicas de cada classe histológica temos o gradiente/GLCM/ldn para CCE e Wavelet (HLH)/GLSZM/Small Area High Gray Level Emphasis para os casos de Adc. Conclusão: Por fim, o presente estudo foi capaz de identificar e caracterizar um rol de assinaturas radiômicas, obtidas a partir de imagem de [18F] FDG PET/CT, que evidenciaram, de forma reprodutível e estável, características fenotípicas do metabolismo tumoral em nódulo primário para as classes histológicas de Adc e CCE em casos de CPNPC.Introduction: In clinical oncology, neoplastic tissue biopsy and histopathological investigation are valuable diagnostic tools for assessing non-small cell lung cancer (NSCLC) cases. Although histopathological evaluation is the gold standard for this characterization, it may present biases related to the quality of the procedure performed or the biopsy sample. Metabolic imaging with [18F] FDG PET/CT is widely used in NSCLC follow-up, assisting in metastasis identification and improving staging and treatment planning. However, metabolic imaging can be further explored for histological characterization of NSCLC subtypes through radiomic features, complementing the preliminary information provided by histopathological evaluation. The aim of this study was to assess how [18F] FDG PET/CT imaging in NSCLC can provide radiomic features that characterize tumor metabolic heterogeneity across different histological subtypes. Materials and Methods: We analyzed 115 [18F] FDG PET/CT images from NSCLC patients with histopathological confirmation for adenocarcinoma (Adc.) and squamous cell carcinoma (SCC). A total of 2,082 first-, second-, and higher-order radiomic features were extracted from PET images using six different segmentation methods. Radiomic features extracted via manual segmentation were associated with other clinical, demographic, and genomic variables before being used to build machine learning models for histological class prediction. We selected five feature selection methods (ANOVA, MI, PCA, LASSO, and RFECV) and six predictive algorithms (SVM, kNN, GNB, DT, RF, and XGBoost), combining them in a cross-validation framework to construct 30 machine learning models for distinguishing Adc and SCC subtypes of NSCLC. Performance metrics, including F1-score and AUC, were evaluated during validation and testing phases. The most important features for each model were visualized using SHAP distributions for better interpretability. The most frequently selected radiomic and non-radiomic features across methods were ranked based on their significance as a biosignature for the investigated class and the classification models performance. Results: Histological prediction models with the highest AUC for SCC identification were ANOVA/SVM (0.94) in the validation phase and PCA/GNB and RFECV/SVM (0.86) in the test phase. The most representative radiomic features for each histological subtype included gradient/GLCM/ldn for SCC and Wavelet (HLH)/GLSZM/Small Area High Gray Level Emphasis for Adc cases. Conclusion: This study successfully identified and characterized a set of radiomic signatures derived from [18F] FDG PET/CT imaging, which reproducibly and stably highlighted phenotypic metabolic characteristics of primary tumor nodules in Adc and SCC subtypes of NSCLC.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPAna, Lauro WichertSuzuki, Larissa Cristina dos Santos RomualdoSantos, Leonardo Alexandre2025-05-21info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/82/82131/tde-19012026-152313/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2026-01-20T14:03:02Zoai:teses.usp.br:tde-19012026-152313Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212026-01-20T14:03:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
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