Prospecção de anticorpos monoclonais humanos anti-Zika por phage display
Ano de defesa: | 2019 |
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Tipo de documento: | Dissertação |
Tipo de acesso: | Acesso aberto |
Idioma: | por |
Instituição de defesa: |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
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Link de acesso: | https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-15092023-094854/ |
Resumo: | O vírus Zika (ZIKV) é um vírus emergente transmitido por artrópodes (arbovírus) e tem causado grande preocupação global, particularmente devido às síndromes congênitas e neurológicas associadas a esse vírus. Os sintomas clínicos iniciais da maioria dos arbovírus são muito semelhantes, tornando o diagnóstico clínico incerto e o diagnóstico laboratorial por sorologia com baixa acurácia entre os vírus antigenicamente relacionados, o que resulta na subnotificação das doenças por eles causadas. O ZIKV pertencente ao gênero Flavivirus, da família Flaviviridae, que também inclui alguns outros patógenos humanos importantes, como o vírus da dengue (DENV). Nestas infecções, a caracterização da imunidade humoral por meio do uso de anticorpos monoclonais associado a estudos estruturais representa um componente importante no fornecimento de informações quanto ao perfil antigênico, sendo essencial para o desenvolvimento de novos métodos de diagnóstico, terapêuticos e vacinas efetivas. Diante disso, foi objetivo do presente estudo o emprego da técnica phage display usando uma biblioteca de genes de anticorpos humanos para seleção de anticorpos monoclonais contra o ZIKV. Foram realizadas duas estratégias de biosseleção, a primeira foi uma biosseleção direta contra partículas de ZIKV, na segunda foi realizada uma abordagem de subtrativa, aplicando etapas de seleção negativa e positiva contra o ZIKV e o DENV2, sorotipo de DENV mais circulante atualmente no país e o mais associado a casos severos dentre os sorotipos. Após os ciclos de biosseleção, foi realizado um Sequenciamento de Nova Geração (NGS) das regiões VH e VL do DNA fagomídeo e análise dos dados obtidos. Posteriormente, foi realizado o desenho de fragmentos variáveis de cadeia única (scFvs) seguido de análises in silico dessas estruturas. Os resultados obtidos indicam que foram selecionadas sequências VHs e VLs com elevado enriquecimento na biosseleção, sugerindo uma elevada afinidade ao ZIKV e DENV2. Além disso, na segunda estratégia, foi possível obter sequências na seleção para o ZIKV que não se manifestaram ao longo da seleção para DENV2 e vice-versa. As análises in silico sugerem as possíveis interações dos scFvs com a proteína E do ZIKV e algumas das propriedades envolvidas nessas interações. A partir disso, esperamos poder contribuir para geração de novas perspectivas para o desenvolvimento de plataformas diagnósticas mais precisas para o ZIKV, contribuindo para maior eficiência no controle epidemiológico e, assim, melhor controle de dispersão e medidas contra infecções pelo ZIKV. |
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Prospecção de anticorpos monoclonais humanos anti-Zika por phage displayProspection of human antibody fragments anti-Zika by phage displayPhage DisplayDiagnosisDiagnósticoPhage DisplayZika virusZika vírusO vírus Zika (ZIKV) é um vírus emergente transmitido por artrópodes (arbovírus) e tem causado grande preocupação global, particularmente devido às síndromes congênitas e neurológicas associadas a esse vírus. Os sintomas clínicos iniciais da maioria dos arbovírus são muito semelhantes, tornando o diagnóstico clínico incerto e o diagnóstico laboratorial por sorologia com baixa acurácia entre os vírus antigenicamente relacionados, o que resulta na subnotificação das doenças por eles causadas. O ZIKV pertencente ao gênero Flavivirus, da família Flaviviridae, que também inclui alguns outros patógenos humanos importantes, como o vírus da dengue (DENV). Nestas infecções, a caracterização da imunidade humoral por meio do uso de anticorpos monoclonais associado a estudos estruturais representa um componente importante no fornecimento de informações quanto ao perfil antigênico, sendo essencial para o desenvolvimento de novos métodos de diagnóstico, terapêuticos e vacinas efetivas. Diante disso, foi objetivo do presente estudo o emprego da técnica phage display usando uma biblioteca de genes de anticorpos humanos para seleção de anticorpos monoclonais contra o ZIKV. Foram realizadas duas estratégias de biosseleção, a primeira foi uma biosseleção direta contra partículas de ZIKV, na segunda foi realizada uma abordagem de subtrativa, aplicando etapas de seleção negativa e positiva contra o ZIKV e o DENV2, sorotipo de DENV mais circulante atualmente no país e o mais associado a casos severos dentre os sorotipos. Após os ciclos de biosseleção, foi realizado um Sequenciamento de Nova Geração (NGS) das regiões VH e VL do DNA fagomídeo e análise dos dados obtidos. Posteriormente, foi realizado o desenho de fragmentos variáveis de cadeia única (scFvs) seguido de análises in silico dessas estruturas. Os resultados obtidos indicam que foram selecionadas sequências VHs e VLs com elevado enriquecimento na biosseleção, sugerindo uma elevada afinidade ao ZIKV e DENV2. Além disso, na segunda estratégia, foi possível obter sequências na seleção para o ZIKV que não se manifestaram ao longo da seleção para DENV2 e vice-versa. As análises in silico sugerem as possíveis interações dos scFvs com a proteína E do ZIKV e algumas das propriedades envolvidas nessas interações. A partir disso, esperamos poder contribuir para geração de novas perspectivas para o desenvolvimento de plataformas diagnósticas mais precisas para o ZIKV, contribuindo para maior eficiência no controle epidemiológico e, assim, melhor controle de dispersão e medidas contra infecções pelo ZIKV.Zika Virus (ZIKV) is an emerging arthropod-borne virus (arbovirus) and has caused great global concern, particularly because of the congenital and neurological syndromes associated with this virus. The initial clinical symptoms of most arboviruses are very similar, making clinical diagnosis uncertain and laboratory diagnosis by serology with low accuracy among antigenically related viruses, which results in underreporting of diseases caused by them. ZIKV belongs to the Flavivirus genus, Flaviviridae family, which also includes some other important human pathogens, such as dengue virus (DENV). In these infections, the characterization of humoral immunity through the use of monoclonal antibodies associated to structural studies represents an important component in providing information on the antigen profile, being essential for the development of new diagnostic methods, therapeutics and effective vaccines. Therefore, the objective of this study was the use of the phage display technique employing a human antibody gene library for monoclonal antibody selection against ZIKV. Two biopanning strategies were performed, the first was a direct biopanning against ZIKV particles, the second was a subtractive approach, performing negative and positive selection steps against ZIKV and DENV2, the most circulating DENV serotype currently in the country and the most associated with severe cases among the serotypes. After the biopanning rounds, a Next Generation Sequencing (NGS) of the VH and VL regions of the phagemid DNA followed by analysis of the obtained data was performed. Subsequently, single-chain variable fragments (scFvs) were designed and in silico analyzes of these structures was performed. The obtained results indicate that it was selected VHs and VLs sequences with high enrichment on the biopanning, suggesting a high affinity to ZIKV and DENV2. In addition, in the second strategy, it was possible to obtain sequences in the selection for ZIKV that did not manifest throughout the selection for DENV2 and vice versa. In silico analyzes suggest the possible interactions of scFvs with ZIKV protein E and some of the properties involved in these interactions. Based on that, we hope to contribute to the generation of new perspectives for the development of accurate ZIKV diagnostic platforms, generating greater efficiency in epidemiological control and thus better dispersion control and measures against ZIKV infections.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPGaspari, Elizabeth Natal dePrudencio, Carlos RobertoSilva, Isaura Beatriz Borges2019-12-10info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-15092023-094854/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPReter o conteúdo por motivos de patente, publicação e/ou direitos autoriais.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2023-09-19T11:02:03Zoai:teses.usp.br:tde-15092023-094854Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212023-09-19T11:02:03Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
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