Espécies formadas no centro férrico da hemoglobina de Glossoscolex paulistus em função do pH: troca de ligantes e desenovelamento polipeptídico
| Ano de defesa: | 2005 |
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Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
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| Programa de Pós-Graduação: |
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| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/75/75132/tde-12022026-082656/ |
Resumo: | A complexidade do equilíbrio entre diferentes ligantes axiais coordenados ao ferro do heme é peculiar às hemoglobinas. No presente trabalho, a espontânea troca de ligantes coordenados ao centro férrico da hemoglobina extracelular gigante de Glossoscolex paulistus como função do pH é estudada usando espectroscopia de absorção no Uv-Vis, ressonância paramagnética eletrônica e espectroscopia de dicroismo circular. Esta hemoglobina é uma proteína de 3,1 MDa organizada como uma dupla camada hexagonal oligomérica, apresentando um significativo efeito cooperativo. À coexistência de diferentes espécies foi sugerida em quase todos os valores de pH, à exceção do pH 7,0, onde somente a espécie aquometa está presente. Como função da acidificação ou alcalinização, quatro espécies foram identificadas, coexistindo com a espécie aquometa: a) hemicromo de baixo spin \"puro\" (Tipo II), com um comum estado de spin (dxy)2(dxz, dyz)3; b) hemicromo de \"forte g máximo\", também chamado hemicromo HALS (baixo spin altamente anisotrópico) (Tipo I), também mostrando um estado de spin usual (dxy)2(dxz, dyz)3; c) hemicromo com um não usual estado de spin (dxz, dyz)4(dxy)1 (Tipo III) e; d) espécies pentacoordenadas alto spin. Provavelmente, as espécies pentacoordenadas ácidas apresentam como quinto ligante água ou imidazol oriundo da histidina proximal e as espécies pentacoordenadas básicas devem ter como quinto ligante hidroxila e imidazolato proveniente da histidina proximal. O mecanismo de formação das espécies pentacoordenadas é relacionado com um processo inicial de desnaturação. Entretanto, é importante mencionar que assim como a espécie aquometa, o hemicromo de Tipo II permanece presente mesmo em valores de pH distantes da neutralidade, indicando que as transições não são completas. O hemicromo baixo spin \"puro\" apresenta uma orientação paralela dos planos dos anéis imidazólicos enquanto o hemicromo HALS evidencia uma orientação perpendicular. Os mecanismos de formação dos hemicromos e pentacoordenados são fortemente dependentes do pH e da solvatação em função das ligações de hidrogênio entre os ligantel axial e o resíduo de aminoácido distal desenvolver uma função crítica para determinar tanto o número de coordenação como os ligantes axiais. Estes mecanismos são discutidos em detalhes no presente trabalho. |
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Espécies formadas no centro férrico da hemoglobina de Glossoscolex paulistus em função do pH: troca de ligantes e desenovelamento polipeptídicoSpecies formed at the ferric center of the Glossoscolex paulistus hemoglobin as a function of ph: ligand exchange and polypeptide unfoldingGlossoscolex paulistusGlossoscolex paulistuscentro férricoextracellular hemoglobinferric centerhemichromehemicromohemoglobina extracelularA complexidade do equilíbrio entre diferentes ligantes axiais coordenados ao ferro do heme é peculiar às hemoglobinas. No presente trabalho, a espontânea troca de ligantes coordenados ao centro férrico da hemoglobina extracelular gigante de Glossoscolex paulistus como função do pH é estudada usando espectroscopia de absorção no Uv-Vis, ressonância paramagnética eletrônica e espectroscopia de dicroismo circular. Esta hemoglobina é uma proteína de 3,1 MDa organizada como uma dupla camada hexagonal oligomérica, apresentando um significativo efeito cooperativo. À coexistência de diferentes espécies foi sugerida em quase todos os valores de pH, à exceção do pH 7,0, onde somente a espécie aquometa está presente. Como função da acidificação ou alcalinização, quatro espécies foram identificadas, coexistindo com a espécie aquometa: a) hemicromo de baixo spin \"puro\" (Tipo II), com um comum estado de spin (dxy)2(dxz, dyz)3; b) hemicromo de \"forte g máximo\", também chamado hemicromo HALS (baixo spin altamente anisotrópico) (Tipo I), também mostrando um estado de spin usual (dxy)2(dxz, dyz)3; c) hemicromo com um não usual estado de spin (dxz, dyz)4(dxy)1 (Tipo III) e; d) espécies pentacoordenadas alto spin. Provavelmente, as espécies pentacoordenadas ácidas apresentam como quinto ligante água ou imidazol oriundo da histidina proximal e as espécies pentacoordenadas básicas devem ter como quinto ligante hidroxila e imidazolato proveniente da histidina proximal. O mecanismo de formação das espécies pentacoordenadas é relacionado com um processo inicial de desnaturação. Entretanto, é importante mencionar que assim como a espécie aquometa, o hemicromo de Tipo II permanece presente mesmo em valores de pH distantes da neutralidade, indicando que as transições não são completas. O hemicromo baixo spin \"puro\" apresenta uma orientação paralela dos planos dos anéis imidazólicos enquanto o hemicromo HALS evidencia uma orientação perpendicular. Os mecanismos de formação dos hemicromos e pentacoordenados são fortemente dependentes do pH e da solvatação em função das ligações de hidrogênio entre os ligantel axial e o resíduo de aminoácido distal desenvolver uma função crítica para determinar tanto o número de coordenação como os ligantes axiais. Estes mecanismos são discutidos em detalhes no presente trabalho.The complexity of the equilibrium among different axial ligands coordinated to the heme iron is peculiar to the hemoglobins. In the present work, the spontaneous exchange of ligands coordinated to the ferric center of the giant extracellular hemoglobin of Glossoscolex paulistus as a function of pH has been studied using UV-Vis absorption spectroscopy, electron paramagnetic resonance and circular dichroism spectroscopy. This hemoglobin is a double layer hexagonal oligomeric assembled 3.1 MDa protein, presenting a significative cooperative effect. The coexistence of different species was suggested in almost all pH values, except at pH 7.0, where only the aquomet species is present. As a function of the acidification or alkalization, four species were identified, coexisting with the aquomethemoglobin: (i) a \"pure\" low-spin hemichrome (Type II), with an commom spin state (dxy)2(dxz, dyz)3; (ii) a strong gmax hemichrome, also called HALS (Highly Anisotropic Low Spin) hemichrome (Type I), also showing an usual spin state (dxy)2(dxz, dyz)3; (iii) a hemichrome with an unusual spin state (dxz, dyz)4(dxy)1 (Type III); (iv) and high-spin pentacoordinate species. Probably, the acidic pentacoordinate species presents water and imidazole from proximal histidine as fifth ligand and the basic pentacoordinate species must have as fifth ligand hidroxyl and imidazolate from proximal histidine. The mechanism of formation of the pentacoordinate species is related with an initial denaturation process. However, it is worth to mention that as the aquomet species, the hemichrome of Type II remains present even in pH values far the neutrality, indicating that the transitions are not complete. The \"pure\" low-spin hemichrome presents a parallel orientation of the imidazole ring planes while the HALS hemichrome shows a perpendicular orientation. The hemichromes and pentacoordinate formation mechanisms are strongly pH-dependent and solvation dependent because the hydrogen bond between the axial ligands and the distal amino acid residue plays a critical role to determine as the coordination number as the axial ligands. These mechanisms are discussed in detail in the present work.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPImasato, HidetakeMoreira, Leonardo Marmo2005-10-19info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/75/75132/tde-12022026-082656/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2026-02-13T19:14:02Zoai:teses.usp.br:tde-12022026-082656Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212026-02-13T19:14:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
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