Epigenética e epilepsia: análise da metilação do DNA da KvDMR1 e do gene Pgk1 em modelo animal
| Ano de defesa: | 2018 |
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| Tipo de documento: | Dissertação |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
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| Instituição de defesa: |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
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| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
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| País: |
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| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-02082024-085909/ |
Resumo: | A linhagem Wistar Audiogenic Rat (WAR) é uma variante endogâmica desenvolvida por seleção genética de um progenitor Wistar, sendo baseada no padrão de resposta comportamental epiléptica sensível à estimulação sonora. Várias alterações fisiológicas e moleculares vêm sendo descritas em WARs, mas pouco ainda se sabe quanto às alterações genéticas e epigenéticas relacionadas à suscetibilidade, estabelecimento ou consequências dessas crises. Este estudo teve como objetivo comparar o padrão de metilação do DNA da KvDMR1, localizada numa região controladora de imprinting (ICR1) e do gene ligado ao X Pgk1 em amostras do encéfalo, placenta, coração e fígado de filhotes das linhagens WAR e Wistar. Foram utilizadas amostras de dez filhotes recém-nascidos da linhagem Wistar e nove da linhagem Wistar Audiogenic Rats (WAR). A análise quantitativa de metilação do DNA da KvDMR1 e do gene Pgk1 foi realizada pelo Método de Digestão Enzimática Sensível à Metilação Associada à PCR em Tempo Real com as enzimas HpaII e MspI, para a KvDMR1, e HhaI, para o gene Pgk1. Os resultados obtidos para a KvDMR1 mostraram que apenas a placenta apresentou diferença significativa (p = 0,0137) entre as linhagens Wistar e WAR. Amostras de tecido do coração dos animais da linhagem WAR mostraram-se hipermetiladas para a KvDMR1, com diferença estatística significativa em relação aos outros tecidos da linhagem (p < 0,05). Nenhum tecido mostrou diferença estatística significativa entre as duas linhagens para a metilação do gene Pgk1. O padrão de metilação do gene Pgk1 nos animais da linhagem WAR mostrou diferença estatística significativa entre machos e fêmeas para todos os tecidos (p > 0,05), enquanto nos Wistar a diferença entre os dois sexos foi observada apenas para o encéfalo (p = 0,0030). O padrão de metilação da KvDMR1 na placenta dos animais WAR e Wistar não foram congruentes com a curva de crescimento diferenciada em estudo publicado com esses animais. O coração dos animais WAR mostrou maiores porcentagens de metilação para a KvDMR1. Esses dados apontam associação com cardiopatias já relatadas nessa linhagem e em humanos, visto que genes regulados por essa região perfazem mais da metade dos casos da Síndrome do QT Longo humana. O gene Pgk1 mostrou uma maior porcentagem de metilação para o encéfalo em relação à placenta em ambas as linhagens quando analisados independente do sexo. Esses dados são confluentes com dados publicados para a expressão desse gene em animais WAR e Wistar. Foi verificado também um dimorfismo sexual no padrão de metilação do encéfalo nesses animais. Esses dados vão de acordo com estudos que indicam implicações na utilização desse gene como housekeeping na análise de transcritos por qPCR. Os achados do presente estudo são inéditos para a KvDMR1 e reforçam alguns dados na literatura para o gene Pgk1, contribuindo para o entendimento dos mecanismos epigenéticos em um modelo para epilepsia. |
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Epigenética e epilepsia: análise da metilação do DNA da KvDMR1 e do gene Pgk1 em modelo animalEpigenetics and epilepsy: DNA methylation analysis of KvDMR1 and Pgk1 gene in animal modelWistar audiogenic ratsEpigenéticaEpigeneticsEpilepsiaEpilepsyMethylation of DNAMetilação do DNAWistar audiogenic ratsA linhagem Wistar Audiogenic Rat (WAR) é uma variante endogâmica desenvolvida por seleção genética de um progenitor Wistar, sendo baseada no padrão de resposta comportamental epiléptica sensível à estimulação sonora. Várias alterações fisiológicas e moleculares vêm sendo descritas em WARs, mas pouco ainda se sabe quanto às alterações genéticas e epigenéticas relacionadas à suscetibilidade, estabelecimento ou consequências dessas crises. Este estudo teve como objetivo comparar o padrão de metilação do DNA da KvDMR1, localizada numa região controladora de imprinting (ICR1) e do gene ligado ao X Pgk1 em amostras do encéfalo, placenta, coração e fígado de filhotes das linhagens WAR e Wistar. Foram utilizadas amostras de dez filhotes recém-nascidos da linhagem Wistar e nove da linhagem Wistar Audiogenic Rats (WAR). A análise quantitativa de metilação do DNA da KvDMR1 e do gene Pgk1 foi realizada pelo Método de Digestão Enzimática Sensível à Metilação Associada à PCR em Tempo Real com as enzimas HpaII e MspI, para a KvDMR1, e HhaI, para o gene Pgk1. Os resultados obtidos para a KvDMR1 mostraram que apenas a placenta apresentou diferença significativa (p = 0,0137) entre as linhagens Wistar e WAR. Amostras de tecido do coração dos animais da linhagem WAR mostraram-se hipermetiladas para a KvDMR1, com diferença estatística significativa em relação aos outros tecidos da linhagem (p < 0,05). Nenhum tecido mostrou diferença estatística significativa entre as duas linhagens para a metilação do gene Pgk1. O padrão de metilação do gene Pgk1 nos animais da linhagem WAR mostrou diferença estatística significativa entre machos e fêmeas para todos os tecidos (p > 0,05), enquanto nos Wistar a diferença entre os dois sexos foi observada apenas para o encéfalo (p = 0,0030). O padrão de metilação da KvDMR1 na placenta dos animais WAR e Wistar não foram congruentes com a curva de crescimento diferenciada em estudo publicado com esses animais. O coração dos animais WAR mostrou maiores porcentagens de metilação para a KvDMR1. Esses dados apontam associação com cardiopatias já relatadas nessa linhagem e em humanos, visto que genes regulados por essa região perfazem mais da metade dos casos da Síndrome do QT Longo humana. O gene Pgk1 mostrou uma maior porcentagem de metilação para o encéfalo em relação à placenta em ambas as linhagens quando analisados independente do sexo. Esses dados são confluentes com dados publicados para a expressão desse gene em animais WAR e Wistar. Foi verificado também um dimorfismo sexual no padrão de metilação do encéfalo nesses animais. Esses dados vão de acordo com estudos que indicam implicações na utilização desse gene como housekeeping na análise de transcritos por qPCR. Os achados do presente estudo são inéditos para a KvDMR1 e reforçam alguns dados na literatura para o gene Pgk1, contribuindo para o entendimento dos mecanismos epigenéticos em um modelo para epilepsia.The Wistar Audiogenic Rat (WAR) strain is a strain variant developed by genetic selection of a Wistar progenitor and is based on the pattern of epileptic behavioral response sensitive to sound stimulation. Several physiological and molecular changes have been described in WARs, but little is known about the genetic and epigenetic alterations related to the susceptibility, establishment or consequences of these seizures. The aim of this study was to compare the DNA methylation pattern of KvDMR1, located in an imprinting control region (ICR1) and the Pgk1 X-linked gene in brain, placenta, heart and liver samples from newborn from WAR and Wistar strains. Samples of ten newborn of the Wistar strain and nine of Wistar Audiogenic Rats (WAR) were used. Quantitative methylation analysis were assessed by the methylation-sensitive enzymatic digestion associated with real-time PCR method with HpaII and MspI enzymes, for KvDMR1, and HhaI, for the Pgk1 gene. The results obtained for KvDMR1 showed that only the placenta had a significant difference (p = 0.0137) between the Wistar and WAR lines. Tissue samples from the heart of the animals of the WAR strain were hypermethylated for KvDMR1, with a statistically significant difference in relation to the other tissues of the lineage (p < 0.05). No tissue showed significant statistical difference between the two strains for the methylation of the Pgk1 gene. The Pgk1 gene methylation pattern in animals of the WAR strain showed a significant statistical difference between males and females for all tissues (p > 0.05), whereas in Wistar the difference between the two sexes was observed only for the brain (p = 0.0030). The methylation pattern of KvDMR1 in the placenta of WAR and Wistar animals was not congruent with the differentiated growth curve in a study published with these animals. The heart of WAR animals was hypermethylated to KvDMR1. These data point to an association with heart diseases already reported in this lineage and in humans, since genes regulated by this region account for more than half of the cases of human Long QT Syndrome. The Pgk1 gene showed a higher percentage of methylation to the encephalon in relation to the placenta in both lineages when analyzed independently of the sex. These data are confluent with published data for expression of this gene in WAR and Wistar animals. It was also verified a sexual dimorphism in the methylation pattern of the encephalon in these animals. These data are in accordance with studies that indicate implications for the use of this gene as housekeeping in the analysis of transcripts by qPCR. The findings of this study are unprecedented for KvDMR1 and reinforce some data in the literature for the Pgk1 gene, contributing to the understanding of epigenetic mechanisms in a model for epilepsy.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPRamos, Ester SilveiraSilva, José Hugo do Rêgo2018-10-09info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-02082024-085909/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2024-08-06T13:15:02Zoai:teses.usp.br:tde-02082024-085909Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212024-08-06T13:15:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
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A linhagem Wistar Audiogenic Rat (WAR) é uma variante endogâmica desenvolvida por seleção genética de um progenitor Wistar, sendo baseada no padrão de resposta comportamental epiléptica sensível à estimulação sonora. Várias alterações fisiológicas e moleculares vêm sendo descritas em WARs, mas pouco ainda se sabe quanto às alterações genéticas e epigenéticas relacionadas à suscetibilidade, estabelecimento ou consequências dessas crises. Este estudo teve como objetivo comparar o padrão de metilação do DNA da KvDMR1, localizada numa região controladora de imprinting (ICR1) e do gene ligado ao X Pgk1 em amostras do encéfalo, placenta, coração e fígado de filhotes das linhagens WAR e Wistar. Foram utilizadas amostras de dez filhotes recém-nascidos da linhagem Wistar e nove da linhagem Wistar Audiogenic Rats (WAR). A análise quantitativa de metilação do DNA da KvDMR1 e do gene Pgk1 foi realizada pelo Método de Digestão Enzimática Sensível à Metilação Associada à PCR em Tempo Real com as enzimas HpaII e MspI, para a KvDMR1, e HhaI, para o gene Pgk1. Os resultados obtidos para a KvDMR1 mostraram que apenas a placenta apresentou diferença significativa (p = 0,0137) entre as linhagens Wistar e WAR. Amostras de tecido do coração dos animais da linhagem WAR mostraram-se hipermetiladas para a KvDMR1, com diferença estatística significativa em relação aos outros tecidos da linhagem (p < 0,05). Nenhum tecido mostrou diferença estatística significativa entre as duas linhagens para a metilação do gene Pgk1. O padrão de metilação do gene Pgk1 nos animais da linhagem WAR mostrou diferença estatística significativa entre machos e fêmeas para todos os tecidos (p > 0,05), enquanto nos Wistar a diferença entre os dois sexos foi observada apenas para o encéfalo (p = 0,0030). O padrão de metilação da KvDMR1 na placenta dos animais WAR e Wistar não foram congruentes com a curva de crescimento diferenciada em estudo publicado com esses animais. O coração dos animais WAR mostrou maiores porcentagens de metilação para a KvDMR1. Esses dados apontam associação com cardiopatias já relatadas nessa linhagem e em humanos, visto que genes regulados por essa região perfazem mais da metade dos casos da Síndrome do QT Longo humana. O gene Pgk1 mostrou uma maior porcentagem de metilação para o encéfalo em relação à placenta em ambas as linhagens quando analisados independente do sexo. Esses dados são confluentes com dados publicados para a expressão desse gene em animais WAR e Wistar. Foi verificado também um dimorfismo sexual no padrão de metilação do encéfalo nesses animais. Esses dados vão de acordo com estudos que indicam implicações na utilização desse gene como housekeeping na análise de transcritos por qPCR. Os achados do presente estudo são inéditos para a KvDMR1 e reforçam alguns dados na literatura para o gene Pgk1, contribuindo para o entendimento dos mecanismos epigenéticos em um modelo para epilepsia. |
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