Montagem de cDNAs que representam regiões sobrepostas de todo o genoma de um vírus brasileiro de dengue tipo 3 e análises da diversidade da proteína do envelope (E)

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2008
Autor(a) principal: Amarilla Ortiz, Alberto Anastacio
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17147/tde-19122025-172441/
Resumo: A dengue é uma doença infecciosa causada pelo vírus da dengue (gênero Flavivírus, família Flaviviridae), e transmitida pela picada de mosquitos do gênero Aedes, principalmente Aedes aegypti. Esta doença é um importante problema de saúde pública em todo o mundo; segundo a Organização Mundial de Saúde, cerca de 50 a 100 milhões de pessoas são infectadas anualmente em mais de 100 países de todos os continentes. A dengue apresenta-se em três formas clínicas principais; doença febril indiferenciada, febre clássica do dengue (FD) e dengue hemorrágica com ou sem choque (DHF/DSS). Recentemente, viu-se um dramático aumento do número de casos de DHF/DSS nas Américas, e este aumento coincidiu com a introdução do vírus dengue tipo 3 (DENV-3), genótipo III. Neste trabalho, três fragmentos sobrepostos que representam todo o genoma viral foram construídos a partir de um isolado brasileiro (D3BR/RP1/2003) de DENV-3. Os três fragmentos encontram-se inseridos em vetores plasmidiais, sendo que dois fragmentos representam a metade 5\' do genoma viral e o terceiro a metade 3\'. Estes fragmentos serão utilizados futuramente para construção de um clone infeccioso, o qual servirá como ferramenta para estudar os processos relacionados à patogênese, replicação, mecanismos de escape do sistema imune, e até para a produção de vacinas. A diversidade genética dos DENV-3 isolados em todo mundo foi estudada analisando o gene da proteína E. A análise filogenética mostrou que o D3BR/RP1/2003 pertence ao genótipo III. Por outro lado, esta análise mostrou a existência de agrupamentos genéticos distintos dentro de três dos quatro genótipos conhecidos de DENV-3. Assim, observamos que o genótipo I possui duas linhagens e duas sub-linhagens; o genótipo II está constituído por duas linhagens e 4 sub-linhagens; e o genótipo III compreende duas linhagens e duas sub-linhagens. Estes dados poderão fornecer informações para melhor entendimento da evolução destes vírus e até para a seleção de um candidato a vacina.
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A dengue apresenta-se em três formas clínicas principais; doença febril indiferenciada, febre clássica do dengue (FD) e dengue hemorrágica com ou sem choque (DHF/DSS). Recentemente, viu-se um dramático aumento do número de casos de DHF/DSS nas Américas, e este aumento coincidiu com a introdução do vírus dengue tipo 3 (DENV-3), genótipo III. Neste trabalho, três fragmentos sobrepostos que representam todo o genoma viral foram construídos a partir de um isolado brasileiro (D3BR/RP1/2003) de DENV-3. Os três fragmentos encontram-se inseridos em vetores plasmidiais, sendo que dois fragmentos representam a metade 5\' do genoma viral e o terceiro a metade 3\'. Estes fragmentos serão utilizados futuramente para construção de um clone infeccioso, o qual servirá como ferramenta para estudar os processos relacionados à patogênese, replicação, mecanismos de escape do sistema imune, e até para a produção de vacinas. A diversidade genética dos DENV-3 isolados em todo mundo foi estudada analisando o gene da proteína E. A análise filogenética mostrou que o D3BR/RP1/2003 pertence ao genótipo III. Por outro lado, esta análise mostrou a existência de agrupamentos genéticos distintos dentro de três dos quatro genótipos conhecidos de DENV-3. Assim, observamos que o genótipo I possui duas linhagens e duas sub-linhagens; o genótipo II está constituído por duas linhagens e 4 sub-linhagens; e o genótipo III compreende duas linhagens e duas sub-linhagens. Estes dados poderão fornecer informações para melhor entendimento da evolução destes vírus e até para a seleção de um candidato a vacina.Dengue is an infectious disease caused by dengue virus (genus Flavivirus, family Flaviviridae), and transmitted by the bite of mosquitoes of the Aedes genus, mainly Aedes aegypti. This disease is an important problem of public health worldwide; according to the World Health Organization, about 50 the 100 million people are infected annually in more than 100 countries of all continents. Dengue can be presented in three main clinical forms; undifferentiated febrile illness, classic dengue fever (DF) and hemorrhagic dengue fever with or without shock (DHF/DSS). Recently, a dramatically increase of DHF/DSS cases in the Americas have been seen, and this increase coincided with the introduction of the dengue virus type 3, genotype III. ln this work, three overlapping fragments representing the entire genome of Brazilian isolates (D3BR/RP1/2003) of DENV-3 were constructed. The three fragments are inserted in plasmid vectors, two of them represent the 5\' half of the genome and the third the 3\' half. These fragments will be used in the future to construct an infectious cDNA clone, which could be used as a tool to study the processes involved in pathogenesis, replication, immune system evasion, and even for the production of vaccines. Genetic diversity of DENV-3 isolated worldwide was studied by analysis of the protein E gene. The phylogenetic analysis showed that D3BR/RP1/2003 belongs to genotype III. On the other hand, this analysis showed the existences of distinct genetic groups within three of the four known genotypes of DENV-3. Thus, genotypes I posses two lineages and two sublineages; genotype II has two lineages and four sub-lineages; and genotype III includes two lineages and two sub-lineages. These data could provide information for a better understanding of the evolution of these viruses, and even for the selection of a candidate vaccine.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPQuintana, Victor Hugo AquinoAmarilla Ortiz, Alberto Anastacio2008-04-14info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17147/tde-19122025-172441/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2025-12-19T19:33:02Zoai:teses.usp.br:tde-19122025-172441Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212025-12-19T19:33:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
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