Redes neurais profundas e aprendizagem de máquina aplicados na diferenciação de tumores pulmonares primários de metástases em exames de tomografia computadorizada
| Ano de defesa: | 2024 |
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| Tipo de documento: | Tese |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
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| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
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| Departamento: |
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| País: |
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| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/82/82131/tde-18062025-091358/ |
Resumo: | O câncer de pulmão é o tipo de câncer com maior mortalidade no mundo. A determinação da etiologia deste câncer, quanto a sua natureza primária ou metastática, é um dos fatores que pode influenciar o prognóstico e o manejo clínico do paciente. As Redes Neurais Profundas têm se mostrado como uma abordagem eficiente para classificar imagens em diversas áreas, com destaque na radiologia para as Redes Neurais Convolucionais (do inglês Convolucional Neural Network CNN)). Porém, como toda abordagem de aprendizado profundo, as CNNs demandam grande volume de dados anotados. Uma alternativa para suprir essa necessidade é aumentar bases de dados utilizando transformações geométricas como rotações e espelhamento. Nesse contexto, o objetivo desta pesquisa foi investigar a hipótese de que redes profundas do tipo CNN, como a VGG19, ResNet152V2 e a InceptionV3, treinadas em bases de imagens, fossem capazes de identificar a partir de tumores segmentados em imagens de exames de tomografia computadorizada, se o câncer de pulmão tem origem primária pulmonar ou se foi desenvolvido a partir de um processo metastático de um sítio primário localizado em outro órgão. Também combinamos essas redes com a Máquina de Vetores de Suporte a fim de explorar mais técnicas de aprendizado de máquina. Realizamos nossos experimentos separando os dados em grupos de treinamento e de teste independente. No grupo de treinamento, foi aplicada uma validação cruzada 10-fold. Os melhores resultados foram obtidos no uso da ResNet152V2 com aumento de base, entregando uma Área sob a Curva ROC (AUC-ROC) com média de 0,74 (desvio padrão de 0,7), F-score com média de 76% (desvio padrão de 7,0%), Acurácia com média de 74% (desvio padrão de 7,0%), Sensibilidade com média de 80% (desvio padrão de 12,0%) e Especificidade com média de 69% (desvio padrão de 16,0%) na base de teste da validação cruzada. Já na avaliação da base de teste independente, os valores obtidos foram de 0,78 para AUC, 66% para F-score, 79% para a Acurácia, 75% para a Sensibilidade e 80% para a Especificidade. |
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Redes neurais profundas e aprendizagem de máquina aplicados na diferenciação de tumores pulmonares primários de metástases em exames de tomografia computadorizadaDeep neural networks and radiotomic patterns applied in the differentiation of primary lung tumors from metastases in computed tomography scans.artificial intelligenceconvolutional neural networksinteligência artificialmetástase neoplásicaneoplasias primáriasneoplastic metastasisprimary neoplasmsradiômicaradiomicsredes neurais convolucionaisO câncer de pulmão é o tipo de câncer com maior mortalidade no mundo. A determinação da etiologia deste câncer, quanto a sua natureza primária ou metastática, é um dos fatores que pode influenciar o prognóstico e o manejo clínico do paciente. As Redes Neurais Profundas têm se mostrado como uma abordagem eficiente para classificar imagens em diversas áreas, com destaque na radiologia para as Redes Neurais Convolucionais (do inglês Convolucional Neural Network CNN)). Porém, como toda abordagem de aprendizado profundo, as CNNs demandam grande volume de dados anotados. Uma alternativa para suprir essa necessidade é aumentar bases de dados utilizando transformações geométricas como rotações e espelhamento. Nesse contexto, o objetivo desta pesquisa foi investigar a hipótese de que redes profundas do tipo CNN, como a VGG19, ResNet152V2 e a InceptionV3, treinadas em bases de imagens, fossem capazes de identificar a partir de tumores segmentados em imagens de exames de tomografia computadorizada, se o câncer de pulmão tem origem primária pulmonar ou se foi desenvolvido a partir de um processo metastático de um sítio primário localizado em outro órgão. Também combinamos essas redes com a Máquina de Vetores de Suporte a fim de explorar mais técnicas de aprendizado de máquina. Realizamos nossos experimentos separando os dados em grupos de treinamento e de teste independente. No grupo de treinamento, foi aplicada uma validação cruzada 10-fold. Os melhores resultados foram obtidos no uso da ResNet152V2 com aumento de base, entregando uma Área sob a Curva ROC (AUC-ROC) com média de 0,74 (desvio padrão de 0,7), F-score com média de 76% (desvio padrão de 7,0%), Acurácia com média de 74% (desvio padrão de 7,0%), Sensibilidade com média de 80% (desvio padrão de 12,0%) e Especificidade com média de 69% (desvio padrão de 16,0%) na base de teste da validação cruzada. Já na avaliação da base de teste independente, os valores obtidos foram de 0,78 para AUC, 66% para F-score, 79% para a Acurácia, 75% para a Sensibilidade e 80% para a Especificidade.Lung cancer is the type of cancer with the highest mortality rate in the world. The determination of the etiology of this cancer, regarding its primary or metastatic nature, is one of the factors which can influence the patients prognosis and clinical management. How Neural Networks Deeps are shown as an efficient approach to classify images in several areas, with emphasis on radiology for Convolutional Neural Networks (CNN)). However, like any learning approach deep, since CNNs require a large volume of annotated data. An alternative to meeting this need is to increase databases using geometric transformations such as rotations and mirroring. In this context, the objective of this research was to investigate The hypothesis that deep CNN-type networks, such as VGG19, ResNet152V2 and InceptionV3, trained on image databases, was able to identify from segmented tumors in computed tomography images, whether lung cancer has a primary pulmonary origin or was developed from a metastatic process from a primary site located in another organ. We also combined these networks with the Support Vector Machine to explore more machine learning techniques. We realized our experiments separating the data into independent training and test groups. In the training group, a 10-fold cross validation was applied. The best results were obtained using ResNet152V2 with an increased base, delivering an Area under the ROC Curve with an average of 0.74 (standard deviation of 0.7), F-score with an average of 76% (standard deviation of 7.0%), Accuracy with an average of 74% (standard deviation of 7.0%), Sensitivity with an average of 80% (standard deviation of 12.0%) and Specificity with an average of 69% (standard deviation of 16.0%) in the cross validation test base. In the evaluation of the independent test base, the values obtained were 0.78 for AUC, 66% for F-score, 79% for Accuracy, 75% for Sensitivity and 80% for Specificity. Keywords: ArtificialBiblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPMarques, Paulo Mazzoncini de AzevedoSantos, Marcel KoenigkamLima, Lucas Lins de2024-05-02info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/82/82131/tde-18062025-091358/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2025-06-23T13:57:02Zoai:teses.usp.br:tde-18062025-091358Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212025-06-23T13:57:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
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