Exportação concluída — 

Redes neurais profundas e aprendizagem de máquina aplicados na diferenciação de tumores pulmonares primários de metástases em exames de tomografia computadorizada

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2024
Autor(a) principal: Lima, Lucas Lins de
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/82/82131/tde-18062025-091358/
Resumo: O câncer de pulmão é o tipo de câncer com maior mortalidade no mundo. A determinação da etiologia deste câncer, quanto a sua natureza primária ou metastática, é um dos fatores que pode influenciar o prognóstico e o manejo clínico do paciente. As Redes Neurais Profundas têm se mostrado como uma abordagem eficiente para classificar imagens em diversas áreas, com destaque na radiologia para as Redes Neurais Convolucionais (do inglês Convolucional Neural Network CNN)). Porém, como toda abordagem de aprendizado profundo, as CNNs demandam grande volume de dados anotados. Uma alternativa para suprir essa necessidade é aumentar bases de dados utilizando transformações geométricas como rotações e espelhamento. Nesse contexto, o objetivo desta pesquisa foi investigar a hipótese de que redes profundas do tipo CNN, como a VGG19, ResNet152V2 e a InceptionV3, treinadas em bases de imagens, fossem capazes de identificar a partir de tumores segmentados em imagens de exames de tomografia computadorizada, se o câncer de pulmão tem origem primária pulmonar ou se foi desenvolvido a partir de um processo metastático de um sítio primário localizado em outro órgão. Também combinamos essas redes com a Máquina de Vetores de Suporte a fim de explorar mais técnicas de aprendizado de máquina. Realizamos nossos experimentos separando os dados em grupos de treinamento e de teste independente. No grupo de treinamento, foi aplicada uma validação cruzada 10-fold. Os melhores resultados foram obtidos no uso da ResNet152V2 com aumento de base, entregando uma Área sob a Curva ROC (AUC-ROC) com média de 0,74 (desvio padrão de 0,7), F-score com média de 76% (desvio padrão de 7,0%), Acurácia com média de 74% (desvio padrão de 7,0%), Sensibilidade com média de 80% (desvio padrão de 12,0%) e Especificidade com média de 69% (desvio padrão de 16,0%) na base de teste da validação cruzada. Já na avaliação da base de teste independente, os valores obtidos foram de 0,78 para AUC, 66% para F-score, 79% para a Acurácia, 75% para a Sensibilidade e 80% para a Especificidade.
id USP_a801e1dbbdbbbc68738c6b44cb0c1337
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-18062025-091358
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str
spelling Redes neurais profundas e aprendizagem de máquina aplicados na diferenciação de tumores pulmonares primários de metástases em exames de tomografia computadorizadaDeep neural networks and radiotomic patterns applied in the differentiation of primary lung tumors from metastases in computed tomography scans.artificial intelligenceconvolutional neural networksinteligência artificialmetástase neoplásicaneoplasias primáriasneoplastic metastasisprimary neoplasmsradiômicaradiomicsredes neurais convolucionaisO câncer de pulmão é o tipo de câncer com maior mortalidade no mundo. A determinação da etiologia deste câncer, quanto a sua natureza primária ou metastática, é um dos fatores que pode influenciar o prognóstico e o manejo clínico do paciente. As Redes Neurais Profundas têm se mostrado como uma abordagem eficiente para classificar imagens em diversas áreas, com destaque na radiologia para as Redes Neurais Convolucionais (do inglês Convolucional Neural Network CNN)). Porém, como toda abordagem de aprendizado profundo, as CNNs demandam grande volume de dados anotados. Uma alternativa para suprir essa necessidade é aumentar bases de dados utilizando transformações geométricas como rotações e espelhamento. Nesse contexto, o objetivo desta pesquisa foi investigar a hipótese de que redes profundas do tipo CNN, como a VGG19, ResNet152V2 e a InceptionV3, treinadas em bases de imagens, fossem capazes de identificar a partir de tumores segmentados em imagens de exames de tomografia computadorizada, se o câncer de pulmão tem origem primária pulmonar ou se foi desenvolvido a partir de um processo metastático de um sítio primário localizado em outro órgão. Também combinamos essas redes com a Máquina de Vetores de Suporte a fim de explorar mais técnicas de aprendizado de máquina. Realizamos nossos experimentos separando os dados em grupos de treinamento e de teste independente. No grupo de treinamento, foi aplicada uma validação cruzada 10-fold. Os melhores resultados foram obtidos no uso da ResNet152V2 com aumento de base, entregando uma Área sob a Curva ROC (AUC-ROC) com média de 0,74 (desvio padrão de 0,7), F-score com média de 76% (desvio padrão de 7,0%), Acurácia com média de 74% (desvio padrão de 7,0%), Sensibilidade com média de 80% (desvio padrão de 12,0%) e Especificidade com média de 69% (desvio padrão de 16,0%) na base de teste da validação cruzada. Já na avaliação da base de teste independente, os valores obtidos foram de 0,78 para AUC, 66% para F-score, 79% para a Acurácia, 75% para a Sensibilidade e 80% para a Especificidade.Lung cancer is the type of cancer with the highest mortality rate in the world. The determination of the etiology of this cancer, regarding its primary or metastatic nature, is one of the factors which can influence the patients prognosis and clinical management. How Neural Networks Deeps are shown as an efficient approach to classify images in several areas, with emphasis on radiology for Convolutional Neural Networks (CNN)). However, like any learning approach deep, since CNNs require a large volume of annotated data. An alternative to meeting this need is to increase databases using geometric transformations such as rotations and mirroring. In this context, the objective of this research was to investigate The hypothesis that deep CNN-type networks, such as VGG19, ResNet152V2 and InceptionV3, trained on image databases, was able to identify from segmented tumors in computed tomography images, whether lung cancer has a primary pulmonary origin or was developed from a metastatic process from a primary site located in another organ. We also combined these networks with the Support Vector Machine to explore more machine learning techniques. We realized our experiments separating the data into independent training and test groups. In the training group, a 10-fold cross validation was applied. The best results were obtained using ResNet152V2 with an increased base, delivering an Area under the ROC Curve with an average of 0.74 (standard deviation of 0.7), F-score with an average of 76% (standard deviation of 7.0%), Accuracy with an average of 74% (standard deviation of 7.0%), Sensitivity with an average of 80% (standard deviation of 12.0%) and Specificity with an average of 69% (standard deviation of 16.0%) in the cross validation test base. In the evaluation of the independent test base, the values obtained were 0.78 for AUC, 66% for F-score, 79% for Accuracy, 75% for Sensitivity and 80% for Specificity. Keywords: ArtificialBiblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPMarques, Paulo Mazzoncini de AzevedoSantos, Marcel KoenigkamLima, Lucas Lins de2024-05-02info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/82/82131/tde-18062025-091358/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2025-06-23T13:57:02Zoai:teses.usp.br:tde-18062025-091358Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212025-06-23T13:57:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Redes neurais profundas e aprendizagem de máquina aplicados na diferenciação de tumores pulmonares primários de metástases em exames de tomografia computadorizada
Deep neural networks and radiotomic patterns applied in the differentiation of primary lung tumors from metastases in computed tomography scans.
title Redes neurais profundas e aprendizagem de máquina aplicados na diferenciação de tumores pulmonares primários de metástases em exames de tomografia computadorizada
spellingShingle Redes neurais profundas e aprendizagem de máquina aplicados na diferenciação de tumores pulmonares primários de metástases em exames de tomografia computadorizada
Lima, Lucas Lins de
artificial intelligence
convolutional neural networks
inteligência artificial
metástase neoplásica
neoplasias primárias
neoplastic metastasis
primary neoplasms
radiômica
radiomics
redes neurais convolucionais
title_short Redes neurais profundas e aprendizagem de máquina aplicados na diferenciação de tumores pulmonares primários de metástases em exames de tomografia computadorizada
title_full Redes neurais profundas e aprendizagem de máquina aplicados na diferenciação de tumores pulmonares primários de metástases em exames de tomografia computadorizada
title_fullStr Redes neurais profundas e aprendizagem de máquina aplicados na diferenciação de tumores pulmonares primários de metástases em exames de tomografia computadorizada
title_full_unstemmed Redes neurais profundas e aprendizagem de máquina aplicados na diferenciação de tumores pulmonares primários de metástases em exames de tomografia computadorizada
title_sort Redes neurais profundas e aprendizagem de máquina aplicados na diferenciação de tumores pulmonares primários de metástases em exames de tomografia computadorizada
author Lima, Lucas Lins de
author_facet Lima, Lucas Lins de
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Marques, Paulo Mazzoncini de Azevedo
Santos, Marcel Koenigkam
dc.contributor.author.fl_str_mv Lima, Lucas Lins de
dc.subject.por.fl_str_mv artificial intelligence
convolutional neural networks
inteligência artificial
metástase neoplásica
neoplasias primárias
neoplastic metastasis
primary neoplasms
radiômica
radiomics
redes neurais convolucionais
topic artificial intelligence
convolutional neural networks
inteligência artificial
metástase neoplásica
neoplasias primárias
neoplastic metastasis
primary neoplasms
radiômica
radiomics
redes neurais convolucionais
description O câncer de pulmão é o tipo de câncer com maior mortalidade no mundo. A determinação da etiologia deste câncer, quanto a sua natureza primária ou metastática, é um dos fatores que pode influenciar o prognóstico e o manejo clínico do paciente. As Redes Neurais Profundas têm se mostrado como uma abordagem eficiente para classificar imagens em diversas áreas, com destaque na radiologia para as Redes Neurais Convolucionais (do inglês Convolucional Neural Network CNN)). Porém, como toda abordagem de aprendizado profundo, as CNNs demandam grande volume de dados anotados. Uma alternativa para suprir essa necessidade é aumentar bases de dados utilizando transformações geométricas como rotações e espelhamento. Nesse contexto, o objetivo desta pesquisa foi investigar a hipótese de que redes profundas do tipo CNN, como a VGG19, ResNet152V2 e a InceptionV3, treinadas em bases de imagens, fossem capazes de identificar a partir de tumores segmentados em imagens de exames de tomografia computadorizada, se o câncer de pulmão tem origem primária pulmonar ou se foi desenvolvido a partir de um processo metastático de um sítio primário localizado em outro órgão. Também combinamos essas redes com a Máquina de Vetores de Suporte a fim de explorar mais técnicas de aprendizado de máquina. Realizamos nossos experimentos separando os dados em grupos de treinamento e de teste independente. No grupo de treinamento, foi aplicada uma validação cruzada 10-fold. Os melhores resultados foram obtidos no uso da ResNet152V2 com aumento de base, entregando uma Área sob a Curva ROC (AUC-ROC) com média de 0,74 (desvio padrão de 0,7), F-score com média de 76% (desvio padrão de 7,0%), Acurácia com média de 74% (desvio padrão de 7,0%), Sensibilidade com média de 80% (desvio padrão de 12,0%) e Especificidade com média de 69% (desvio padrão de 16,0%) na base de teste da validação cruzada. Já na avaliação da base de teste independente, os valores obtidos foram de 0,78 para AUC, 66% para F-score, 79% para a Acurácia, 75% para a Sensibilidade e 80% para a Especificidade.
publishDate 2024
dc.date.none.fl_str_mv 2024-05-02
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/82/82131/tde-18062025-091358/
url https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/82/82131/tde-18062025-091358/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1844786337917435904