Investigação de variantes genéticas raras em indivíduos com arrinia/hemiarrinia e/ou hipoplasia maxilonasal

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2024
Autor(a) principal: Segarra, Vinicius Contrucci Dantas
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/61/61132/tde-04102024-141433/
Resumo: A formação craniofacial é um processo complexo e dinâmico, com início a partir da formação e migração das células da crista neural. Durante o período embrionário e fetal diversos genes comandam esse desenvolvimento e, qualquer alteração nesse processo, seja por alteração gênica, influência ambiental ou interação entre ambos, pode resultar em anomalias craniofaciais. Dentre essas anomalias estão as alterações nasais. De maior raridade estão a arrinia (ausência nasal total) e a hemiarrinia (ausência nasal parcial), caracterizando diferentes quadros, como a Síndrome de Bosma (SBAM), caracterizada pela tríade compreendendo arrinia, microftalmia e hipogonadismo hipogonadotrófico, podendo ser causada por variação patogênica no gene SMCHD1. Entre as condições sobrepostas encontra-se a síndrome de Binder, a Holoprosencefalia-like, a síndrome da baixa estatura, atraso mental, agenesia de corpo caloso, hipoplasia heminasal, microftalmia e fissura atípica e alterações nasais e/ou maxilonasais a esclarecer. O objetivo deste trabalho foi estudar a etiologia de anomalias craniofaciais complexas com arrinia/hemiarrinia ou hipoplasia maxilonasal, correlacionando ao fenótipo, quando possível, variações no gene SMCHD1 ou outros genes, quando pertinente, além de prover meios para melhoria no aconselhamento genético dos indivíduos incluídos no estudo. Foram incluídos 22 indivíduos para análise genética por sequenciamento de Sanger na região de ATPase do gene SMCHD1 (exons 3, 5-13), quando possível, e caracterização fenotípica. Desses, 5 preencheram o critério para a SBAM, 2 para síndrome de Binder, 6 para holoprosencefalia-like, 2 com provável síndrome nova e 7 com alterações nasais e/ou maxilonasais a esclarecer. Foi possível identificar variante provavelmente patogênica e de significância incerta no domínio ATPase do gene SMCHD1 em 3 indivíduos com diagnóstico clínico de SBAM. Variantes nos genes GLI2 e FOXA2 foram identificadas em indivíduos com diagnóstico de alteração nasal e/ou maxilonasal à esclarecer e provável síndrome nova, respectivamente. Com os dados obtidos pelo estudo, foi possível concluir que o fenótipo da SBAM é variável, com indivíduos não apresentando a tríade de achados clínicos característicos, podendo, ainda, variações no gene SMCHD1 resultar em forma mais leve do fenótipo, caracterizada pela hemiarrinia associada a microftalmia e/ou hipogonadismo hipogonadotrófico. Além disso, o sequenciamento completo do exoma ou total do genoma mostra-se de extrema importância para um esclarecimento da etiologia genética da síndrome de Bosma sem variante patogênica ou provavelmente patogênica no domínio ATPase do gene SMCHD1, da síndrome de Binder, da holoprosencefalia-like, da síndrome nova (síndrome da baixa estatura, atraso mental, agenesia de corpo caloso, hipoplasia heminasal, microftalmia e fissura atípica) e dos casos com alteração nasal e/ou maxilonasal a esclarecer.
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spelling Investigação de variantes genéticas raras em indivíduos com arrinia/hemiarrinia e/ou hipoplasia maxilonasalInvestigation of rare genetic variants in individuals with arrhinia/hemiarrhinia and/or maxillonasal hypoplasiaAnomalias craniofaciaisArrhinia/hemiarrhiniaArrinia/hemiarriniaBosma syndrome arrhinia/microphthalmiaCraniofacial anomaliesHipoplasia maxilonasalMaxillonasal hypoplasiaSequenciamentoSequencingSíndrome de Bosma arrinia/microftalmiaA formação craniofacial é um processo complexo e dinâmico, com início a partir da formação e migração das células da crista neural. Durante o período embrionário e fetal diversos genes comandam esse desenvolvimento e, qualquer alteração nesse processo, seja por alteração gênica, influência ambiental ou interação entre ambos, pode resultar em anomalias craniofaciais. Dentre essas anomalias estão as alterações nasais. De maior raridade estão a arrinia (ausência nasal total) e a hemiarrinia (ausência nasal parcial), caracterizando diferentes quadros, como a Síndrome de Bosma (SBAM), caracterizada pela tríade compreendendo arrinia, microftalmia e hipogonadismo hipogonadotrófico, podendo ser causada por variação patogênica no gene SMCHD1. Entre as condições sobrepostas encontra-se a síndrome de Binder, a Holoprosencefalia-like, a síndrome da baixa estatura, atraso mental, agenesia de corpo caloso, hipoplasia heminasal, microftalmia e fissura atípica e alterações nasais e/ou maxilonasais a esclarecer. O objetivo deste trabalho foi estudar a etiologia de anomalias craniofaciais complexas com arrinia/hemiarrinia ou hipoplasia maxilonasal, correlacionando ao fenótipo, quando possível, variações no gene SMCHD1 ou outros genes, quando pertinente, além de prover meios para melhoria no aconselhamento genético dos indivíduos incluídos no estudo. Foram incluídos 22 indivíduos para análise genética por sequenciamento de Sanger na região de ATPase do gene SMCHD1 (exons 3, 5-13), quando possível, e caracterização fenotípica. Desses, 5 preencheram o critério para a SBAM, 2 para síndrome de Binder, 6 para holoprosencefalia-like, 2 com provável síndrome nova e 7 com alterações nasais e/ou maxilonasais a esclarecer. Foi possível identificar variante provavelmente patogênica e de significância incerta no domínio ATPase do gene SMCHD1 em 3 indivíduos com diagnóstico clínico de SBAM. Variantes nos genes GLI2 e FOXA2 foram identificadas em indivíduos com diagnóstico de alteração nasal e/ou maxilonasal à esclarecer e provável síndrome nova, respectivamente. Com os dados obtidos pelo estudo, foi possível concluir que o fenótipo da SBAM é variável, com indivíduos não apresentando a tríade de achados clínicos característicos, podendo, ainda, variações no gene SMCHD1 resultar em forma mais leve do fenótipo, caracterizada pela hemiarrinia associada a microftalmia e/ou hipogonadismo hipogonadotrófico. Além disso, o sequenciamento completo do exoma ou total do genoma mostra-se de extrema importância para um esclarecimento da etiologia genética da síndrome de Bosma sem variante patogênica ou provavelmente patogênica no domínio ATPase do gene SMCHD1, da síndrome de Binder, da holoprosencefalia-like, da síndrome nova (síndrome da baixa estatura, atraso mental, agenesia de corpo caloso, hipoplasia heminasal, microftalmia e fissura atípica) e dos casos com alteração nasal e/ou maxilonasal a esclarecer.Craniofacial formation is a complex and dynamic process, beginning with the formation and migration of neural crest cells. During the embryonic and fetal period, several genes control this development and any alteration in this process, whether due to gene alteration, environmental influence or interaction between the two, can result in craniofacial anomalies. Among these anomalies are nasal alterations. Less common are arhinia (total nasal absence) and hemiarhinia (partial nasal absence), characterizing different conditions, such as Bosma Syndrome (SBAM), characterized by the triad comprising arhinia, microphthalmia and hypogonadotrophic hypogonadism, which may be caused by a pathogenic variation in the SMCHD1 gene. Overlapping conditions include Binder syndrome, Holoprosencephaly-like, short stature syndrome, mental retardation, corpus callosum agenesis, heminasal hypoplasia, microphthalmia and atypical cleft and nasal and/or maxillonasal alterations to be clarified. The aim of this study was to investigate the etiology of complex craniofacial anomalies with arrhinia/hemiarhinia or maxillonasal hypoplasia, correlating variations in the SMCHD1 gene or other genes, when possible, to the phenotype, as well as providing means to improve the genetic counseling of the individuals included in the study. 22 individuals were included for genetic analysis by Sanger sequencing of the ATPase region of the SMCHD1 gene (exons 3, 5-13), when possible, and phenotypic characterization. Of these, 5 met the criteria for SBAM, 2 for Binder syndrome, 6 for holoprosencephaly-like, 2 with probable new syndrome and 7 with nasal and/or maxillonasal alterations to be clarified. It was possible to identify a probably pathogenic variant of uncertain significance in the ATPase domain of the SMCHD1 gene in 3 individuals with a clinical diagnosis of SBAM. Variants in the GLI2 and FOXA2 genes were identified in individuals diagnosed with undefined nasal and/or maxillonasal alterations and probable new syndrome, respectively. With the data obtained from the study, it was possible to conclude that the phenotype of SBAM is variable, with individuals not presenting the triad of characteristic clinical findings, and that variations in the SMCHD1 gene may result in a mild form of the phenotype, characterized by hemiarhinia associated with microphthalmia and/or hypogonadotrophic hypogonadism. In addition, whole exome or whole genome sequencing is extremely important for clarifying the genetic etiology of Bosma syndrome without a pathogenic or probably pathogenic variant in the ATPase domain of the SMCHD1 gene, Binder syndrome, holoprosencephaly-like, new syndrome (short stature syndrome, mental retardation, corpus callosum agenesis, heminasal hypoplasia, microphthalmia and atypical cleft) and cases with nasal and/or maxillonasal alterations to be clarified.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPCeide, Roseli Maria ZechiNakata, Nancy Mizue KokitsuSegarra, Vinicius Contrucci Dantas2024-07-19info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/61/61132/tde-04102024-141433/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPReter o conteúdo por motivos de patente, publicação e/ou direitos autoriais.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2024-10-29T19:42:02Zoai:teses.usp.br:tde-04102024-141433Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212024-10-29T19:42:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
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Segarra, Vinicius Contrucci Dantas
Anomalias craniofaciais
Arrhinia/hemiarrhinia
Arrinia/hemiarrinia
Bosma syndrome arrhinia/microphthalmia
Craniofacial anomalies
Hipoplasia maxilonasal
Maxillonasal hypoplasia
Sequenciamento
Sequencing
Síndrome de Bosma arrinia/microftalmia
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