Perfil de metilação do DNA de pacientes com lúpus eritematoso sistêmico com e sem excesso de peso: estudo exploratório
| Ano de defesa: | 2024 |
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| Tipo de documento: | Dissertação |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
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| Instituição de defesa: |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
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| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
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| Departamento: |
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| País: |
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| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5140/tde-16102024-144504/ |
Resumo: | O lúpus eritematoso sistêmico (LES) é uma doença inflamatória autoimune cuja fisiopatologia envolve a interação de fatores ambientais, hormonais, genéticos e epigenéticos. Estudos têm revelado um perfil de hipometilação do DNA em pacientes com LES, especialmente em células e vias do sistema imune. A literatura aponta que o excesso de peso nesses pacientes pode acarretar uma maior atividade da doença, com piora da qualidade de vida e aumento do risco de doenças cardiovasculares. Apesar de já ser descrito que o excesso de peso e obesidade também modulam o perfil de metilação do DNA, estudos sobre modificações epigenéticas no binômio LES e excesso de peso ainda são escassos. Assim, o presente estudo transversal e exploratório teve como objetivo avaliar se existe um perfil epigenético específico em pacientes com LES com excesso de peso e com peso adequado. Selecionou-se 51 pacientes do sexo feminino, no período pré-menopausa, com idade entre 18 e 45 anos, atividade da doença controlada, sob tratamento com prednisona em dosagem <10 mg/dia e sob tratamento com cloroquina em dose estável. As pacientes foram divididas em dois grupos de acordo com o estado nutricional segundo o índice de massa corporal (IMC): grupo EUT composto por 23 pacientes com peso adequado (IMC entre 18,5 e 24,9 kg/m²) e grupo EP composto por 28 pacientes com excesso de peso (IMC >25 kg/m²). Avaliou-se parâmetros sociodemográficos, clínicos, bioquímicos, hematológicos, imunológicos e inflamatórios. Para análise de metilação do DNA e expressão gênica coletou-se amostra de tecido adiposo subcutâneo abdominal por procedimento de biópsia. A análise de metilação do DNA foi conduzida com o ensaio Infinium Human Methylation EPIC Beadchip (Illumina), considerando mudanças no nível de metilação de cada CpGs com valor mínimo de 5%, p<0,001 e taxa de falsa descoberta <0,05. A análise da expressão dos genes alvos foi realizada por reação em cadeia de polimerase, utilizando o método 2-Ct. O grupo EP apresentou valores IMC, percentual de gordura, frações de colesterol total e porcentagem de linfócitos superiores ao grupo EUT. Em contrapartida, concentrações séricas de ácido fólico foram menores no grupo EP. Observou-se 28.577 sítios CpGs diferencialmente metilados entre os grupos (36,6% na região promotora). Destes, 3.730 CpGs estavam hipometilados em pacientes com excesso de peso e foram relacionados a via metabólica da autoimunidade e interação das citocinas com seus receptores. Por outro lado, 3.342 CpGs estavam hipermetilados em pacientes do grupo EP, sendo relacionados ao metabolismo e degradação de ácidos graxos. Observou-se maiores níveis de expressão de DNMT1, TNF-, IL-6, LEP, ADIPOQ nos pacientes do grupo EP. Pacientes com LES e excesso de peso apresentam uma assinatura epigenética distinta daqueles com peso adequado, a qual pode estar relacionada as manifestações da doença |
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Perfil de metilação do DNA de pacientes com lúpus eritematoso sistêmico com e sem excesso de peso: estudo exploratórioDNA Methylation profile of patients with systemic lupus erythematosus and normal weight or excess body weight: an exploratory studyAdipose tissueDNA methylationEpigenéticaEpigeneticsInflamaçãoInflammationLúpus eritematoso sistêmicoMetilação do DNAObesidadeObesitySystemic lupus erythematosusTecido adiposoO lúpus eritematoso sistêmico (LES) é uma doença inflamatória autoimune cuja fisiopatologia envolve a interação de fatores ambientais, hormonais, genéticos e epigenéticos. Estudos têm revelado um perfil de hipometilação do DNA em pacientes com LES, especialmente em células e vias do sistema imune. A literatura aponta que o excesso de peso nesses pacientes pode acarretar uma maior atividade da doença, com piora da qualidade de vida e aumento do risco de doenças cardiovasculares. Apesar de já ser descrito que o excesso de peso e obesidade também modulam o perfil de metilação do DNA, estudos sobre modificações epigenéticas no binômio LES e excesso de peso ainda são escassos. Assim, o presente estudo transversal e exploratório teve como objetivo avaliar se existe um perfil epigenético específico em pacientes com LES com excesso de peso e com peso adequado. Selecionou-se 51 pacientes do sexo feminino, no período pré-menopausa, com idade entre 18 e 45 anos, atividade da doença controlada, sob tratamento com prednisona em dosagem <10 mg/dia e sob tratamento com cloroquina em dose estável. As pacientes foram divididas em dois grupos de acordo com o estado nutricional segundo o índice de massa corporal (IMC): grupo EUT composto por 23 pacientes com peso adequado (IMC entre 18,5 e 24,9 kg/m²) e grupo EP composto por 28 pacientes com excesso de peso (IMC >25 kg/m²). Avaliou-se parâmetros sociodemográficos, clínicos, bioquímicos, hematológicos, imunológicos e inflamatórios. Para análise de metilação do DNA e expressão gênica coletou-se amostra de tecido adiposo subcutâneo abdominal por procedimento de biópsia. A análise de metilação do DNA foi conduzida com o ensaio Infinium Human Methylation EPIC Beadchip (Illumina), considerando mudanças no nível de metilação de cada CpGs com valor mínimo de 5%, p<0,001 e taxa de falsa descoberta <0,05. A análise da expressão dos genes alvos foi realizada por reação em cadeia de polimerase, utilizando o método 2-Ct. O grupo EP apresentou valores IMC, percentual de gordura, frações de colesterol total e porcentagem de linfócitos superiores ao grupo EUT. Em contrapartida, concentrações séricas de ácido fólico foram menores no grupo EP. Observou-se 28.577 sítios CpGs diferencialmente metilados entre os grupos (36,6% na região promotora). Destes, 3.730 CpGs estavam hipometilados em pacientes com excesso de peso e foram relacionados a via metabólica da autoimunidade e interação das citocinas com seus receptores. Por outro lado, 3.342 CpGs estavam hipermetilados em pacientes do grupo EP, sendo relacionados ao metabolismo e degradação de ácidos graxos. Observou-se maiores níveis de expressão de DNMT1, TNF-, IL-6, LEP, ADIPOQ nos pacientes do grupo EP. Pacientes com LES e excesso de peso apresentam uma assinatura epigenética distinta daqueles com peso adequado, a qual pode estar relacionada as manifestações da doençaSystemic lupus erythematosus (SLE) is an autoimmune inflammatory disease whose pathophysiology involves the interaction of environmental, hormonal, genetic, and epigenetic factors. Studies have revealed a profile of DNA hypomethylation in SLE patients, especially in cells and pathways related to immune system. The literature suggests that excess body weight in these patients may lead to increased disease activity, worsening quality of life, and elevated risk of cardiovascular diseases. Despite the known modulation of DNA methylation profiles by overweight and obesity, studies on epigenetic modifications in the context of SLE and excess body weight remain scarce. Therefore, this cross-sectional and exploratory study aimed to assess whether there is a specific epigenetic profile in SLE patients with excess weight or normal weight. Fifty-one premenopausal female patients, aged 18 to 45 years, with controlled disease activity, under treatment with prednisone with dose <10 mg/day, and stable chloroquine dose, were enrolled. Patients were divided into two groups based on body mass index (BMI): the normal weight group consisting of 23 patients with BMI between 18.5 and 24.9 kg/m², and the excess weight group consisting of 28 patients with BMI >25 kg/m². Sociodemographic, clinical, biochemical, hematological, immunological, and inflammatory parameters were evaluated. For DNA methylation and gene expression analysis, samples of abdominal subcutaneous adipose tissue were collected by biopsy. DNA methylation analysis was performed using the Infinium Human Methylation EPIC Beadchip assay (Illumina), considering changes in methylation levels of each CpG with a minimum value of 5%, p <0.001, and false discovery rate <0.05. Gene expression analysis of target genes was performed by polymerase chain reaction, using the 2Ct method. The excess weight group showed higher BMI, percentage of body fat, total cholesterol fractions, and lymphocyte percentage compared to the normal weight group. Conversely, serum concentrations of folic acid were lower in the excess weight group. A total of 28,577 CpG sites were differentially methylated between the groups (36.6% in the promoter region). Of these, 3,730 CpG sites were hypomethylated in patients with excess weight and were associated with the autoimmunity and cytokine-receptor interaction pathway. On the other hand, 3,342 CpG sites were hypermethylated in patients of the excess weight group and were related to the metabolism and degradation of fatty acids. Also, higher levels of DNMT1, TNF-, IL-6, LEP, and ADIPOQ expression were observed in patients of the excess weight group. Patients with SLE and excess body weight show a unique epigenetic signature than patients with normal weight, which may be related to disease´s clinical manifestationBiblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPFino, Carolina Nicoletti FerreiraCarvalho, Lucas de Moura2024-07-12info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5140/tde-16102024-144504/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2024-11-13T17:56:28Zoai:teses.usp.br:tde-16102024-144504Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212024-11-13T17:56:28Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
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O lúpus eritematoso sistêmico (LES) é uma doença inflamatória autoimune cuja fisiopatologia envolve a interação de fatores ambientais, hormonais, genéticos e epigenéticos. Estudos têm revelado um perfil de hipometilação do DNA em pacientes com LES, especialmente em células e vias do sistema imune. A literatura aponta que o excesso de peso nesses pacientes pode acarretar uma maior atividade da doença, com piora da qualidade de vida e aumento do risco de doenças cardiovasculares. Apesar de já ser descrito que o excesso de peso e obesidade também modulam o perfil de metilação do DNA, estudos sobre modificações epigenéticas no binômio LES e excesso de peso ainda são escassos. Assim, o presente estudo transversal e exploratório teve como objetivo avaliar se existe um perfil epigenético específico em pacientes com LES com excesso de peso e com peso adequado. Selecionou-se 51 pacientes do sexo feminino, no período pré-menopausa, com idade entre 18 e 45 anos, atividade da doença controlada, sob tratamento com prednisona em dosagem <10 mg/dia e sob tratamento com cloroquina em dose estável. As pacientes foram divididas em dois grupos de acordo com o estado nutricional segundo o índice de massa corporal (IMC): grupo EUT composto por 23 pacientes com peso adequado (IMC entre 18,5 e 24,9 kg/m²) e grupo EP composto por 28 pacientes com excesso de peso (IMC >25 kg/m²). Avaliou-se parâmetros sociodemográficos, clínicos, bioquímicos, hematológicos, imunológicos e inflamatórios. Para análise de metilação do DNA e expressão gênica coletou-se amostra de tecido adiposo subcutâneo abdominal por procedimento de biópsia. A análise de metilação do DNA foi conduzida com o ensaio Infinium Human Methylation EPIC Beadchip (Illumina), considerando mudanças no nível de metilação de cada CpGs com valor mínimo de 5%, p<0,001 e taxa de falsa descoberta <0,05. A análise da expressão dos genes alvos foi realizada por reação em cadeia de polimerase, utilizando o método 2-Ct. O grupo EP apresentou valores IMC, percentual de gordura, frações de colesterol total e porcentagem de linfócitos superiores ao grupo EUT. Em contrapartida, concentrações séricas de ácido fólico foram menores no grupo EP. Observou-se 28.577 sítios CpGs diferencialmente metilados entre os grupos (36,6% na região promotora). Destes, 3.730 CpGs estavam hipometilados em pacientes com excesso de peso e foram relacionados a via metabólica da autoimunidade e interação das citocinas com seus receptores. Por outro lado, 3.342 CpGs estavam hipermetilados em pacientes do grupo EP, sendo relacionados ao metabolismo e degradação de ácidos graxos. Observou-se maiores níveis de expressão de DNMT1, TNF-, IL-6, LEP, ADIPOQ nos pacientes do grupo EP. Pacientes com LES e excesso de peso apresentam uma assinatura epigenética distinta daqueles com peso adequado, a qual pode estar relacionada as manifestações da doença |
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