Quantificação de radiodermatite utilizando radiomics a partir de imagens digitais da pele
| Ano de defesa: | 2024 |
|---|---|
| Autor(a) principal: | |
| Orientador(a): | |
| Banca de defesa: | |
| Tipo de documento: | Dissertação |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
|
| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
|
| Departamento: |
Não Informado pela instituição
|
| País: |
Não Informado pela instituição
|
| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/59/59135/tde-25092024-160356/ |
Resumo: | Radiodermatite é uma das consequências do tratamento de radioterapia, pode ser classificada pela sua extensão e severidade, sendo avaliada visualmente por médicos de acordo com os critérios de toxicidade da RTOG. A aprendizagem de máquina (AM) é uma técnica amplamente utilizada a fim de otimizar tarefas. Foram estudados três modelos Naïve-Bayes, K-Nearest Neighbour, Random Forest, a escolha desses modelos foi feita a partir de quantidade de hiperparâmetros. Para a AM realizar a aprendizagem, é necessário um banco de dados, no caso, será utilizado características radiômicas e classificação da radiodermatite a partir de imagens digitais de pacientes que receberam tratamento de radioterapia na região da mama. Regiões de interesse foram delimitadas e classificadas por um médico radioterapeuta, as fotos foram convertidas para escala de cinza de duas maneiras, também foi aplicado filtros e ondaletas nas imagens, e finalmente extraídas características radiômicas. 212 fotos foram utilizadas, resultando em graus de classificação diferentes. Para a AM, a aprendizagem é influenciada pela classe majoritária, então fez-se o balanceamento pela técnica SMOTE. Com isso, tem-se o banco de dados, e separou-se a uma porcentagem de 88%/12%. 88% dos dados foram utilizados para treinamento e 12% para teste. Também se estudou a influência da quantidade de características, então utilizou-se os métodos SelectKBest e Recursive Feature Elimination para seleção das características. O melhor modelo selecionado é RF munido de imagens convertidas para cinza com filtros e ondaletas e 5 características com 0.92 de acurácia e com matriz de confusão normalizada de 1 para grau 0, 1 e 3 e 0,77 para grau 2. |
| id |
USP_af5974318f6b28edeb99531dd10abae6 |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:teses.usp.br:tde-25092024-160356 |
| network_acronym_str |
USP |
| network_name_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
| repository_id_str |
|
| spelling |
Quantificação de radiodermatite utilizando radiomics a partir de imagens digitais da peleQuantification of radiodermatitis using radiomics from digital images of the skinAprendizagem de máquinaAprendizagem supervisionadaMachine learningRadiodermatitisRadiodermiteRadiomicsRadiomicsSupervised learningRadiodermatite é uma das consequências do tratamento de radioterapia, pode ser classificada pela sua extensão e severidade, sendo avaliada visualmente por médicos de acordo com os critérios de toxicidade da RTOG. A aprendizagem de máquina (AM) é uma técnica amplamente utilizada a fim de otimizar tarefas. Foram estudados três modelos Naïve-Bayes, K-Nearest Neighbour, Random Forest, a escolha desses modelos foi feita a partir de quantidade de hiperparâmetros. Para a AM realizar a aprendizagem, é necessário um banco de dados, no caso, será utilizado características radiômicas e classificação da radiodermatite a partir de imagens digitais de pacientes que receberam tratamento de radioterapia na região da mama. Regiões de interesse foram delimitadas e classificadas por um médico radioterapeuta, as fotos foram convertidas para escala de cinza de duas maneiras, também foi aplicado filtros e ondaletas nas imagens, e finalmente extraídas características radiômicas. 212 fotos foram utilizadas, resultando em graus de classificação diferentes. Para a AM, a aprendizagem é influenciada pela classe majoritária, então fez-se o balanceamento pela técnica SMOTE. Com isso, tem-se o banco de dados, e separou-se a uma porcentagem de 88%/12%. 88% dos dados foram utilizados para treinamento e 12% para teste. Também se estudou a influência da quantidade de características, então utilizou-se os métodos SelectKBest e Recursive Feature Elimination para seleção das características. O melhor modelo selecionado é RF munido de imagens convertidas para cinza com filtros e ondaletas e 5 características com 0.92 de acurácia e com matriz de confusão normalizada de 1 para grau 0, 1 e 3 e 0,77 para grau 2.Radiodermatitis is one of the consequences of radiotherapy treatment, it can be classified by its extent and severity, being visually evaluated by doctors according to the toxicity criteria of RTOG. Machine learning (ML) is a widely used technique in order to optimize tasks. Three models were studied - Naïve-Bayes, K-Nearest Neighbor, Random Forest, the choice of these models was made based on the number of hyperparameters. For AM to perform the learning, a database is necessary, in this case, radiomics characteristics and classification of radiodermatitis will be used from digital images of patients who received radiotherapy treatment in the breast region. Regions of interest were delimited and classified by a radiotherapist, the photos were converted to grayscale in two ways, filters and wavelets were also applied to the images, and finally radiomics characteristics were extracted. 212 photos were used, resulting in different grading grades. For AM, learning is influenced by the majority class, so the balance was made using the SMOTE technique. With this, we have the database, and it was separated to a percentage of 88%/12%, 88% of the data was used for training and 12% for testing. The influence of the number of features was also studied, so the SelectKBest and Recursive Feature Elimination methods were used to select the features. The best model selected is RF with images converted to gray with filters and wavelets and 5 features with 0.92 accuracy with normalized confusion matrix of 1 for grade 0, 1 and 3 and 0.77 for grade 2.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPCardoso, George CunhaPavoni, Juliana FernandesFonseca, Marcos Eduardo2024-08-15info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/59/59135/tde-25092024-160356/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2024-11-08T14:34:02Zoai:teses.usp.br:tde-25092024-160356Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212024-11-08T14:34:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
| dc.title.none.fl_str_mv |
Quantificação de radiodermatite utilizando radiomics a partir de imagens digitais da pele Quantification of radiodermatitis using radiomics from digital images of the skin |
| title |
Quantificação de radiodermatite utilizando radiomics a partir de imagens digitais da pele |
| spellingShingle |
Quantificação de radiodermatite utilizando radiomics a partir de imagens digitais da pele Fonseca, Marcos Eduardo Aprendizagem de máquina Aprendizagem supervisionada Machine learning Radiodermatitis Radiodermite Radiomics Radiomics Supervised learning |
| title_short |
Quantificação de radiodermatite utilizando radiomics a partir de imagens digitais da pele |
| title_full |
Quantificação de radiodermatite utilizando radiomics a partir de imagens digitais da pele |
| title_fullStr |
Quantificação de radiodermatite utilizando radiomics a partir de imagens digitais da pele |
| title_full_unstemmed |
Quantificação de radiodermatite utilizando radiomics a partir de imagens digitais da pele |
| title_sort |
Quantificação de radiodermatite utilizando radiomics a partir de imagens digitais da pele |
| author |
Fonseca, Marcos Eduardo |
| author_facet |
Fonseca, Marcos Eduardo |
| author_role |
author |
| dc.contributor.none.fl_str_mv |
Cardoso, George Cunha Pavoni, Juliana Fernandes |
| dc.contributor.author.fl_str_mv |
Fonseca, Marcos Eduardo |
| dc.subject.por.fl_str_mv |
Aprendizagem de máquina Aprendizagem supervisionada Machine learning Radiodermatitis Radiodermite Radiomics Radiomics Supervised learning |
| topic |
Aprendizagem de máquina Aprendizagem supervisionada Machine learning Radiodermatitis Radiodermite Radiomics Radiomics Supervised learning |
| description |
Radiodermatite é uma das consequências do tratamento de radioterapia, pode ser classificada pela sua extensão e severidade, sendo avaliada visualmente por médicos de acordo com os critérios de toxicidade da RTOG. A aprendizagem de máquina (AM) é uma técnica amplamente utilizada a fim de otimizar tarefas. Foram estudados três modelos Naïve-Bayes, K-Nearest Neighbour, Random Forest, a escolha desses modelos foi feita a partir de quantidade de hiperparâmetros. Para a AM realizar a aprendizagem, é necessário um banco de dados, no caso, será utilizado características radiômicas e classificação da radiodermatite a partir de imagens digitais de pacientes que receberam tratamento de radioterapia na região da mama. Regiões de interesse foram delimitadas e classificadas por um médico radioterapeuta, as fotos foram convertidas para escala de cinza de duas maneiras, também foi aplicado filtros e ondaletas nas imagens, e finalmente extraídas características radiômicas. 212 fotos foram utilizadas, resultando em graus de classificação diferentes. Para a AM, a aprendizagem é influenciada pela classe majoritária, então fez-se o balanceamento pela técnica SMOTE. Com isso, tem-se o banco de dados, e separou-se a uma porcentagem de 88%/12%. 88% dos dados foram utilizados para treinamento e 12% para teste. Também se estudou a influência da quantidade de características, então utilizou-se os métodos SelectKBest e Recursive Feature Elimination para seleção das características. O melhor modelo selecionado é RF munido de imagens convertidas para cinza com filtros e ondaletas e 5 características com 0.92 de acurácia e com matriz de confusão normalizada de 1 para grau 0, 1 e 3 e 0,77 para grau 2. |
| publishDate |
2024 |
| dc.date.none.fl_str_mv |
2024-08-15 |
| dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| format |
masterThesis |
| status_str |
publishedVersion |
| dc.identifier.uri.fl_str_mv |
https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/59/59135/tde-25092024-160356/ |
| url |
https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/59/59135/tde-25092024-160356/ |
| dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
| language |
por |
| dc.relation.none.fl_str_mv |
|
| dc.rights.driver.fl_str_mv |
Liberar o conteúdo para acesso público. info:eu-repo/semantics/openAccess |
| rights_invalid_str_mv |
Liberar o conteúdo para acesso público. |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
| dc.coverage.none.fl_str_mv |
|
| dc.publisher.none.fl_str_mv |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP |
| publisher.none.fl_str_mv |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP |
| dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP instname:Universidade de São Paulo (USP) instacron:USP |
| instname_str |
Universidade de São Paulo (USP) |
| instacron_str |
USP |
| institution |
USP |
| reponame_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
| collection |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
| repository.name.fl_str_mv |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP) |
| repository.mail.fl_str_mv |
virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br |
| _version_ |
1818598508242927616 |