Perfil transcricional do metabolismo secundário de espécies de Piper ao longo da ontogenia
| Ano de defesa: | 2025 |
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| Tipo de documento: | Tese |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
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| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
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| Departamento: |
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| País: |
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| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-29092025-114830/ |
Resumo: | Por serem organismos sésseis, plantas evoluíram diversos mecanismos moleculares para se adaptar aos vários desafios bióticos e abióticos impostos pelo ambiente, tais como a capacidade de sintetizar metabólitos secundários, ou especializados. Ao longo das diferentes fases de sua vida, plantas podem ativar diferentes vias metabólicas para se adaptar aos desafios que se apresentam, fazendo o ajuste fino necessário para a sobrevivência durante cada fase de vida. Para explorar possíveis adaptações químicas que ocorrem em um desses estágios de vida, plantas de 4 espécies de Piper foram analisadas nas fases de plantas jovens e plantas adultas. Complementando estudos já existentes no nível de metabólitos, investigações foram realizadas no nível de expressão gênica, obtendo-se com RNASeq os perfis transcricionais das 4 espécies de Piper em ambas as fases de vida. Centenas de genes associados ao metabolismo secundário foram identificados, permitindo a obtenção de insights nessa classe de moléculas. Os resultados sugerem que, em todas as 4 espécies, as plantas jovens utilizam uma fração maior da capacidade biossintética total de seus genomas, quando comparadas com as respectivas plantas adultas. As sequências de nucleotídeos obtidas também forneceram pistas acerca da origem e evolução das piperamidas, indicando que a enzima bifuncional Lisina/Ornitina descarboxilase foi provavelmente um dos pontos de bifurcação na história evolutiva das pimentas. |
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Perfil transcricional do metabolismo secundário de espécies de Piper ao longo da ontogeniaSecondary metabolism transcriptional profile of Piper species during ontogenyMetabolismo secundárioOntogeniaOntogenyPiperPiperPiperamidasPiperamidesRNASeqRNAseqSecondary metabolismTranscriptomaTranscriptomePor serem organismos sésseis, plantas evoluíram diversos mecanismos moleculares para se adaptar aos vários desafios bióticos e abióticos impostos pelo ambiente, tais como a capacidade de sintetizar metabólitos secundários, ou especializados. Ao longo das diferentes fases de sua vida, plantas podem ativar diferentes vias metabólicas para se adaptar aos desafios que se apresentam, fazendo o ajuste fino necessário para a sobrevivência durante cada fase de vida. Para explorar possíveis adaptações químicas que ocorrem em um desses estágios de vida, plantas de 4 espécies de Piper foram analisadas nas fases de plantas jovens e plantas adultas. Complementando estudos já existentes no nível de metabólitos, investigações foram realizadas no nível de expressão gênica, obtendo-se com RNASeq os perfis transcricionais das 4 espécies de Piper em ambas as fases de vida. Centenas de genes associados ao metabolismo secundário foram identificados, permitindo a obtenção de insights nessa classe de moléculas. Os resultados sugerem que, em todas as 4 espécies, as plantas jovens utilizam uma fração maior da capacidade biossintética total de seus genomas, quando comparadas com as respectivas plantas adultas. As sequências de nucleotídeos obtidas também forneceram pistas acerca da origem e evolução das piperamidas, indicando que a enzima bifuncional Lisina/Ornitina descarboxilase foi provavelmente um dos pontos de bifurcação na história evolutiva das pimentas.Being sessile organisms, plants have evolved a myriad of molecular mechanisms to cope with the numerous biotic and abiotic challenges imposed by the environment, such as the capacity to synthesize a long list of secondary or specialized metabolites. Over the course of their different life stages, plants can activate specific metabolic pathways to adapt to the environment, fine tuning their transcript and metabolic networks to meet the demands of each life stage and survive. To explore possible chemical adaptations that occur in one of those life stages, 4 species of Piper plants were analyzed in seedling and adult phases. Complementing other existing metabolomic studies, investigations were carried out at the gene expression level by sequencing with RNASeq the transcripts of the 4 plant species in both life stages. Hundreds of genes related to secondary metabolism were compiled, offering insights with respect to this class of molecules. Results suggest that, in all 4 species, seedlings employ a larger fraction of their total genome biosynthetic capacity when compared to their corresponding adult plants. Assembled nucleotide sequences also provided clues about the origin and evolution of piperamides, indicating that the bifunctional Lysine/Ornithine decarboxylase was likely one of the branch points in the evolutionary history of spices.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPKato, Massuo JorgeYoshida, Leonardo2025-06-06info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-29092025-114830/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2025-10-03T14:06:02Zoai:teses.usp.br:tde-29092025-114830Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212025-10-03T14:06:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
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