Perfil transcricional do metabolismo secundário de espécies de Piper ao longo da ontogenia

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2025
Autor(a) principal: Yoshida, Leonardo
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-29092025-114830/
Resumo: Por serem organismos sésseis, plantas evoluíram diversos mecanismos moleculares para se adaptar aos vários desafios bióticos e abióticos impostos pelo ambiente, tais como a capacidade de sintetizar metabólitos secundários, ou especializados. Ao longo das diferentes fases de sua vida, plantas podem ativar diferentes vias metabólicas para se adaptar aos desafios que se apresentam, fazendo o ajuste fino necessário para a sobrevivência durante cada fase de vida. Para explorar possíveis adaptações químicas que ocorrem em um desses estágios de vida, plantas de 4 espécies de Piper foram analisadas nas fases de plantas jovens e plantas adultas. Complementando estudos já existentes no nível de metabólitos, investigações foram realizadas no nível de expressão gênica, obtendo-se com RNASeq os perfis transcricionais das 4 espécies de Piper em ambas as fases de vida. Centenas de genes associados ao metabolismo secundário foram identificados, permitindo a obtenção de insights nessa classe de moléculas. Os resultados sugerem que, em todas as 4 espécies, as plantas jovens utilizam uma fração maior da capacidade biossintética total de seus genomas, quando comparadas com as respectivas plantas adultas. As sequências de nucleotídeos obtidas também forneceram pistas acerca da origem e evolução das piperamidas, indicando que a enzima bifuncional Lisina/Ornitina descarboxilase foi provavelmente um dos pontos de bifurcação na história evolutiva das pimentas.
id USP_af77e22a7c72484acd79eccc69c7bc6f
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-29092025-114830
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str
spelling Perfil transcricional do metabolismo secundário de espécies de Piper ao longo da ontogeniaSecondary metabolism transcriptional profile of Piper species during ontogenyMetabolismo secundárioOntogeniaOntogenyPiperPiperPiperamidasPiperamidesRNASeqRNAseqSecondary metabolismTranscriptomaTranscriptomePor serem organismos sésseis, plantas evoluíram diversos mecanismos moleculares para se adaptar aos vários desafios bióticos e abióticos impostos pelo ambiente, tais como a capacidade de sintetizar metabólitos secundários, ou especializados. Ao longo das diferentes fases de sua vida, plantas podem ativar diferentes vias metabólicas para se adaptar aos desafios que se apresentam, fazendo o ajuste fino necessário para a sobrevivência durante cada fase de vida. Para explorar possíveis adaptações químicas que ocorrem em um desses estágios de vida, plantas de 4 espécies de Piper foram analisadas nas fases de plantas jovens e plantas adultas. Complementando estudos já existentes no nível de metabólitos, investigações foram realizadas no nível de expressão gênica, obtendo-se com RNASeq os perfis transcricionais das 4 espécies de Piper em ambas as fases de vida. Centenas de genes associados ao metabolismo secundário foram identificados, permitindo a obtenção de insights nessa classe de moléculas. Os resultados sugerem que, em todas as 4 espécies, as plantas jovens utilizam uma fração maior da capacidade biossintética total de seus genomas, quando comparadas com as respectivas plantas adultas. As sequências de nucleotídeos obtidas também forneceram pistas acerca da origem e evolução das piperamidas, indicando que a enzima bifuncional Lisina/Ornitina descarboxilase foi provavelmente um dos pontos de bifurcação na história evolutiva das pimentas.Being sessile organisms, plants have evolved a myriad of molecular mechanisms to cope with the numerous biotic and abiotic challenges imposed by the environment, such as the capacity to synthesize a long list of secondary or specialized metabolites. Over the course of their different life stages, plants can activate specific metabolic pathways to adapt to the environment, fine tuning their transcript and metabolic networks to meet the demands of each life stage and survive. To explore possible chemical adaptations that occur in one of those life stages, 4 species of Piper plants were analyzed in seedling and adult phases. Complementing other existing metabolomic studies, investigations were carried out at the gene expression level by sequencing with RNASeq the transcripts of the 4 plant species in both life stages. Hundreds of genes related to secondary metabolism were compiled, offering insights with respect to this class of molecules. Results suggest that, in all 4 species, seedlings employ a larger fraction of their total genome biosynthetic capacity when compared to their corresponding adult plants. Assembled nucleotide sequences also provided clues about the origin and evolution of piperamides, indicating that the bifunctional Lysine/Ornithine decarboxylase was likely one of the branch points in the evolutionary history of spices.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPKato, Massuo JorgeYoshida, Leonardo2025-06-06info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-29092025-114830/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2025-10-03T14:06:02Zoai:teses.usp.br:tde-29092025-114830Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212025-10-03T14:06:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Perfil transcricional do metabolismo secundário de espécies de Piper ao longo da ontogenia
Secondary metabolism transcriptional profile of Piper species during ontogeny
title Perfil transcricional do metabolismo secundário de espécies de Piper ao longo da ontogenia
spellingShingle Perfil transcricional do metabolismo secundário de espécies de Piper ao longo da ontogenia
Yoshida, Leonardo
Metabolismo secundário
Ontogenia
Ontogeny
Piper
Piper
Piperamidas
Piperamides
RNASeq
RNAseq
Secondary metabolism
Transcriptoma
Transcriptome
title_short Perfil transcricional do metabolismo secundário de espécies de Piper ao longo da ontogenia
title_full Perfil transcricional do metabolismo secundário de espécies de Piper ao longo da ontogenia
title_fullStr Perfil transcricional do metabolismo secundário de espécies de Piper ao longo da ontogenia
title_full_unstemmed Perfil transcricional do metabolismo secundário de espécies de Piper ao longo da ontogenia
title_sort Perfil transcricional do metabolismo secundário de espécies de Piper ao longo da ontogenia
author Yoshida, Leonardo
author_facet Yoshida, Leonardo
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Kato, Massuo Jorge
dc.contributor.author.fl_str_mv Yoshida, Leonardo
dc.subject.por.fl_str_mv Metabolismo secundário
Ontogenia
Ontogeny
Piper
Piper
Piperamidas
Piperamides
RNASeq
RNAseq
Secondary metabolism
Transcriptoma
Transcriptome
topic Metabolismo secundário
Ontogenia
Ontogeny
Piper
Piper
Piperamidas
Piperamides
RNASeq
RNAseq
Secondary metabolism
Transcriptoma
Transcriptome
description Por serem organismos sésseis, plantas evoluíram diversos mecanismos moleculares para se adaptar aos vários desafios bióticos e abióticos impostos pelo ambiente, tais como a capacidade de sintetizar metabólitos secundários, ou especializados. Ao longo das diferentes fases de sua vida, plantas podem ativar diferentes vias metabólicas para se adaptar aos desafios que se apresentam, fazendo o ajuste fino necessário para a sobrevivência durante cada fase de vida. Para explorar possíveis adaptações químicas que ocorrem em um desses estágios de vida, plantas de 4 espécies de Piper foram analisadas nas fases de plantas jovens e plantas adultas. Complementando estudos já existentes no nível de metabólitos, investigações foram realizadas no nível de expressão gênica, obtendo-se com RNASeq os perfis transcricionais das 4 espécies de Piper em ambas as fases de vida. Centenas de genes associados ao metabolismo secundário foram identificados, permitindo a obtenção de insights nessa classe de moléculas. Os resultados sugerem que, em todas as 4 espécies, as plantas jovens utilizam uma fração maior da capacidade biossintética total de seus genomas, quando comparadas com as respectivas plantas adultas. As sequências de nucleotídeos obtidas também forneceram pistas acerca da origem e evolução das piperamidas, indicando que a enzima bifuncional Lisina/Ornitina descarboxilase foi provavelmente um dos pontos de bifurcação na história evolutiva das pimentas.
publishDate 2025
dc.date.none.fl_str_mv 2025-06-06
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-29092025-114830/
url https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-29092025-114830/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1865492358259277824