Análise metabolômica da quimiodiversidade molecular da caatinga baseada em CLAE-EM-ESI
| Ano de defesa: | 2024 |
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| Tipo de documento: | Tese |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
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| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
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| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/60/60138/tde-19082025-144305/ |
Resumo: | No Brasil, especificamente no Nordeste, está a maior área de Florestas Tropicais Sazonalmente Secas (do inglês, Seasonally dry tropical forests - SDTF) e Matas das Américas, conhecida como o núcleo da caatinga sendo o maior e com um alto nível de diversidade taxonômica de plantas e endemismo. A caatinga apresenta cerca de 3.150 espécies classificadas em 950 gêneros e 152 famílias de angiosperma. As espécies da família Fabaceae são predominantes na caatinga, por exemplo, a espécie endêmica Cenostigma nordestinum Gagnon & G. P. Lewis, que passou por revisões taxonômicas significativas e carece de estudos acerca da sua diversidade química. Quanto a preservação da caatinga somente 1,2% da região está protegida. Com base nisso, o objetivo deste projeto, que é parte integrante do projeto temático intitulado \"NORDESTE: uma nova ciência para um importante, porém negligenciado bioma\", consistiu em contribuir para o conhecimento da diversidade química encontrada na flora da caatinga, mais especificamente da espécie de Cenostigma nordestinum. Para isso, abordagens utilizadas nas análises metabolômicas foram empregadas para obtenção dos perfis metabólicos de folhas das espécies pertencentes a familia Fabaceae na caatinga, com um foco na diversidade química de C. nordestinum. Os perfis metabólicos das 132 amostras coletadas foram adquiridos por Cromatografia Liquida de Alta Eficiência acoplada a Espectrometria de Massas (CLAE-EM/EM) e analisados com ferramentas computacionais de anotação de substâncias presentes na plataforma Global Natural Products Social Molecular Networking (GNPS) e software Sirius. Através da análise discriminante por mínimos quadrados parciais ortogonais (OPLS-DA) do conjunto de amostras da familia Fabaceae foi observado que amostras do gênero Cenostigma foram agrupadas separadamente dos outros gêneros, e as principais substâncias responsáveis por essa discriminância pertencem as classes dos taninos hidrolisáveis e flavonoides glicosilados. Além disso, a análise metabolômica da espécie C. nordestinum permitiu a anotação de 107 substâncias contribuindo desta forma para o conhecimento da diversidade química desta espécie na caatinga. |
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Análise metabolômica da quimiodiversidade molecular da caatinga baseada em CLAE-EM-ESIMetabolomic analysis of the caatinga molecular chemodiversity HPLC-ESI-MS basedCenostigma nordestinumCenostigma nordestinumCaatingaCaatingaCLAE-EM/EMHPLC-MS/MSMetabolomicMetabolômicaNo Brasil, especificamente no Nordeste, está a maior área de Florestas Tropicais Sazonalmente Secas (do inglês, Seasonally dry tropical forests - SDTF) e Matas das Américas, conhecida como o núcleo da caatinga sendo o maior e com um alto nível de diversidade taxonômica de plantas e endemismo. A caatinga apresenta cerca de 3.150 espécies classificadas em 950 gêneros e 152 famílias de angiosperma. As espécies da família Fabaceae são predominantes na caatinga, por exemplo, a espécie endêmica Cenostigma nordestinum Gagnon & G. P. Lewis, que passou por revisões taxonômicas significativas e carece de estudos acerca da sua diversidade química. Quanto a preservação da caatinga somente 1,2% da região está protegida. Com base nisso, o objetivo deste projeto, que é parte integrante do projeto temático intitulado \"NORDESTE: uma nova ciência para um importante, porém negligenciado bioma\", consistiu em contribuir para o conhecimento da diversidade química encontrada na flora da caatinga, mais especificamente da espécie de Cenostigma nordestinum. Para isso, abordagens utilizadas nas análises metabolômicas foram empregadas para obtenção dos perfis metabólicos de folhas das espécies pertencentes a familia Fabaceae na caatinga, com um foco na diversidade química de C. nordestinum. Os perfis metabólicos das 132 amostras coletadas foram adquiridos por Cromatografia Liquida de Alta Eficiência acoplada a Espectrometria de Massas (CLAE-EM/EM) e analisados com ferramentas computacionais de anotação de substâncias presentes na plataforma Global Natural Products Social Molecular Networking (GNPS) e software Sirius. Através da análise discriminante por mínimos quadrados parciais ortogonais (OPLS-DA) do conjunto de amostras da familia Fabaceae foi observado que amostras do gênero Cenostigma foram agrupadas separadamente dos outros gêneros, e as principais substâncias responsáveis por essa discriminância pertencem as classes dos taninos hidrolisáveis e flavonoides glicosilados. Além disso, a análise metabolômica da espécie C. nordestinum permitiu a anotação de 107 substâncias contribuindo desta forma para o conhecimento da diversidade química desta espécie na caatinga.Brazil, specifically in the Northeast, is home to the largest area of Seasonally Dry Tropical Forests (SDTF) and woodlands in the Americas, known as the core of the caatinga, which is the largest and has a high level of plant taxonomic diversity and endemism. The caatinga has around 3,150 species classified into 950 genera and 152 angiosperm families. Species from the Fabaceae family are predominant in the caatinga, for example, the endemic specie Cenostigma nordestinum Gagnon & G. P. Lewis, which has undergone significant taxonomic revisions and lacks studies on its chemical diversity. As for the preservation of the caatinga, only 1.2% of the region is protected. Based on this, the aim of this project, which is an integral part of the thematic project entitled \"NORDESTE: a new science for an important but neglected biome\", was to contribute to the knowledge of the chemical diversity found in the flora of the caatinga, more specifically the species of Cenostigma nordestinum. To this end, approaches used in metabolomic analysis were employed to obtain the metabolic profiles of leaves of species belonging to the Fabaceae family in the caatinga, with a focus on the chemical diversity of C. nordestinum. The metabolic profiles of the 132 samples collected were acquired by High Performance Liquid Chromatography coupled with Mass Spectrometry (HPLC-MS/MS) and analyzed using the substance annotation computational tools available on the Global Natural Products Social Molecular Networking (GNPS) platform and Sirius software. Through the orthogonal partial least squares discriminant analysis (OPLS-DA) of the set of samples from the Fabaceae family, it was observed that samples from the Cenostigma genus were grouped separately from the other genres, and the main substances responsible for this discrimination belong to the classes of hydrolysable tannins and glycosylated flavonoids. In addition, the metabolomic analysis of the C. nordestinum species enabled the annotation of 107 substances, thus contributing to the knowledge of the chemical diversity of this species in the caatinga.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPLopes, Norberto PeporineBarros, Danielle Rocha Pinho2024-08-16info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/60/60138/tde-19082025-144305/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPReter o conteúdo por motivos de patente, publicação e/ou direitos autoriais.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2025-09-15T17:51:02Zoai:teses.usp.br:tde-19082025-144305Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212025-09-15T17:51:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
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