Análises in silico e in vitro da inativação do cromossomo X em primatas

• Ano de defesa: 2021
• Autor(a) principal: Cidral, Ana Luíza
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
• Palavras-chave em Português: Compensação de dose; Desenvolvimento embrionário; Dosage compensation; Embryo development; Inativação do cromossomo X; scRNA-seq; X-chromosome inactivation
• Link de acesso: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-10052024-090309/

A inativação do cromossomo X (ICX) é um mecanismo de compensação de dose executado por mamíferos eutérios como forma de equilibrar a expressão de genes ligados ao X entre machos e fêmeas. Este mecanismo consiste no silenciamento transcricional dos genes localizados em um dos cromossomos X das fêmeas, de forma que a presença de apenas um X transcricionalmente ativo corresponde ao único X presente nos machos. Estudos deste mecanismo em embriões humanos apresentam divergências significativas entre si, e também apontam diferenças com relação aos camundongos, que constituem o principal modelo experimental da inativação do cromossomo X. Buscando expandir os conhecimentos a respeito deste mecanismo, o presente trabalho estuda a ICX em duas frentes. A primeira delas caracteriza, através da análise de expressão alelo-específica, aspectos relativos a este processo em duas espécies de primatas não-humanos, Macaca fascicularis e Callithrix jacchus. Nesta última, este estudo mostra, em embriões pré-implantação, a presença concomitante da ICX e da suprarregulação do X ativo, um segundo mecanismo de compensação de dose inicialmente proposto nos anos 1960. Em M. fascicularis não foram observadas evidências significativas destes fenômenos. Na segunda parte do trabalho, buscou-se caracterizar e avaliar o potencial de células-tronco pluripotentes humanas naïve como modelo da ICX in vitro. Estas células apresentam maior similaridade com o epiblasto pré-implantação do que as células-tronco convencionais, e devem apresentar dois cromossomos X ativos. Em contraste, as células-tronco pluripotentes convencionais se encontram no estado primed, no qual um dos X já foi silenciado. Neste trabalho, foi considerada a hipótese de que a transição do estado naïve para primed é capaz de recapitular a ICX in vitro. Apesar de variações nos resultados, linhagens celulares naïve que foram convertidas em primed apresentaram acúmulo do RNA longo não codificante XIST, fator característico do X inativo. Conclui-se, desta forma, que as células-tronco pluripotentes naïve femininas podem constituir um modelo de estudo in vitro da inativação do cromossomo X em humanos.