Aplicação de marcadores microssatélites na caracterização genética de dois grupos de macacos-prego (Cebus apella nigritus) da Estação Ecológica de Ribeirão Preto - Mata de Santa Teresa - Ribeirão Preto, SP
| Ano de defesa: | 2006 |
|---|---|
| Autor(a) principal: | |
| Orientador(a): | |
| Banca de defesa: | |
| Tipo de documento: | Tese |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
|
| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
|
| Departamento: |
Não Informado pela instituição
|
| País: |
Não Informado pela instituição
|
| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-20102025-155157/ |
Resumo: | Há vários trabalhos utilizando-se microssatélites para a caracterização genética de espécies de primatas do Velho Mundo. Entretanto, as espécies do Novo Mundo são pouco estudadas e não há nenhum trabalho com Cebus apella de vida livre. Esta ausência se deve, em parte, à falta de polimorfismos descritos para esta espécie. O objetivo deste trabalho foi caracterizar dois grupos de macacos-prego, Cebus apella nigritus, que habitam a Estação Ecológica de Ribeirão Preto, Mata Santa Teresa, um fragmento de 156ha inserido na zona semi-urbana no município de Ribeirão Preto, SP, Brasil. Os resultados mostram que os alelos PEPC8*4 (0,411), PEPC3*2 (0,357), SB19*2 (0,343) são os mais freqüentes no grupo A, os alelos PEPC8*1 (0,469), PEPC3*4 (0,316) e SB19*3 (0,50), no grupo B e os alelos PEPC59*1 (0,557 e 0,55, respectivamente) e SB38*8 (0,343 e 0,40, respectivamente) são freqüentes em ambos os grupos. O grupo A apresentou desvio do equilíbrio de Hardy-Weinberg em todos os loci analisados. O grupo B apresentou desvio do equilíbrio de nos loci SB38 e SB 19 e foi encontrado déficit de heterozigotos no loci SB19 e SB38. A diversidade gênica (HS) variou de 0,619 no locus PEPC59 a 0,787 no locus SB38 no grupo A e de 0,612 no locus PEPC59 a 0,778 no locus PEPC3 no grupo B. Considerando-se os dois grupos para todos os loci, a diversidade gênica média (Hs) foi de 0,718. Os valores encontrados para os coeficientes de endogamia FIS (dentro de uma população) para os grupos A e B foram de 0,395 e 0,245, respectivamente, ambos significativos. O valor de FIS também foi significativo (0,342) quando os indivíduos dos dois grupos foram considerados como uma única população. Embora os grupos se comportem como populações diferentes, apenas os loci PEPC3 e SB19 foram capazes de diferenciar os dois grupos entre si na comparação gênica e genotípica. Estes resultados são corroborados pelo índice de diferenciação interpopulacional (FST) e pelo coeficiente de diferenciação genética (GST\', que também não diferenciaram os dois grupos (0,022 e 0,015, respectivamente). |
| id |
USP_d005ca74775dda1ef1f986c3517bd922 |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:teses.usp.br:tde-20102025-155157 |
| network_acronym_str |
USP |
| network_name_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
| repository_id_str |
|
| spelling |
Aplicação de marcadores microssatélites na caracterização genética de dois grupos de macacos-prego (Cebus apella nigritus) da Estação Ecológica de Ribeirão Preto - Mata de Santa Teresa - Ribeirão Preto, SPNão informado.Cebus apella nigritusDiversidade genéticaMacaco-pregoMata Santa TeresaNão informado.Há vários trabalhos utilizando-se microssatélites para a caracterização genética de espécies de primatas do Velho Mundo. Entretanto, as espécies do Novo Mundo são pouco estudadas e não há nenhum trabalho com Cebus apella de vida livre. Esta ausência se deve, em parte, à falta de polimorfismos descritos para esta espécie. O objetivo deste trabalho foi caracterizar dois grupos de macacos-prego, Cebus apella nigritus, que habitam a Estação Ecológica de Ribeirão Preto, Mata Santa Teresa, um fragmento de 156ha inserido na zona semi-urbana no município de Ribeirão Preto, SP, Brasil. Os resultados mostram que os alelos PEPC8*4 (0,411), PEPC3*2 (0,357), SB19*2 (0,343) são os mais freqüentes no grupo A, os alelos PEPC8*1 (0,469), PEPC3*4 (0,316) e SB19*3 (0,50), no grupo B e os alelos PEPC59*1 (0,557 e 0,55, respectivamente) e SB38*8 (0,343 e 0,40, respectivamente) são freqüentes em ambos os grupos. O grupo A apresentou desvio do equilíbrio de Hardy-Weinberg em todos os loci analisados. O grupo B apresentou desvio do equilíbrio de nos loci SB38 e SB 19 e foi encontrado déficit de heterozigotos no loci SB19 e SB38. A diversidade gênica (HS) variou de 0,619 no locus PEPC59 a 0,787 no locus SB38 no grupo A e de 0,612 no locus PEPC59 a 0,778 no locus PEPC3 no grupo B. Considerando-se os dois grupos para todos os loci, a diversidade gênica média (Hs) foi de 0,718. Os valores encontrados para os coeficientes de endogamia FIS (dentro de uma população) para os grupos A e B foram de 0,395 e 0,245, respectivamente, ambos significativos. O valor de FIS também foi significativo (0,342) quando os indivíduos dos dois grupos foram considerados como uma única população. Embora os grupos se comportem como populações diferentes, apenas os loci PEPC3 e SB19 foram capazes de diferenciar os dois grupos entre si na comparação gênica e genotípica. Estes resultados são corroborados pelo índice de diferenciação interpopulacional (FST) e pelo coeficiente de diferenciação genética (GST\', que também não diferenciaram os dois grupos (0,022 e 0,015, respectivamente).There have been numerous studies genetically characterizing Old World Primates using microsatellites. However, few studies have been made of New World species and none on free-ranging Cebus apella, even though it is probably the most widely distributed species of monkey in the New World. The paucity of studies is due, in part, to the lack of polymorphisms described for this species. We studied two groups of wild tufted capuchins, Cebus apella nigritus, which inhabit Mata Santa Teresa, the Ecological Reserve of Ribeirão Preto, a 158-ha Forest fragment in a semi-urban zone of Ribeirão Preto, SP, Brazil. Group 1 had about 60 animals, 35 of which were sampled, and group 2 had about 40 animals, 20 of which were sampled. These group sizes are much larger than the published reports of 6-30 for this species, despite, or perhaps due to the isolation and the size of the forest fragment. Alleles PEPC8*4 (0,411), PEPC3*2 (0,357), SB19*2 (0,343) were the most frequent of all alleles at lod in group A, alleles PEPC8*1 (0,469), PEPC3*4 (0,316) e SB19*3 (0,50) were the most common alleles in group B and alleles PEPC59*1 (0,557 and 0,55) and SB38*8 (0,343 and 0,40) were the most common in both groups. The group A has presented a deviation from Hardy-Weinberg equilibrium at all lod analyzeds. The Group B has presented a deviation from Hardy-Weinberg equilibrium at loci SB38 and SB19 and has been founded deficit of heterozygote at the loci SB19 and SB38. The genetic diversity (HS), considering each locus in each group, varied from 0,619 at locus PEPC59 to 0,787 at locus SB38 in group A, and from 0,612 at locus PEPC59 to 0,778 at locus PEPC3 in group B. The mean genetic diversity (HS), considering both groups for all of the loci, was 0,718. The inbreeding coefficient FIS (within each population) to the groups A and B was 0,395 and 0,245, both significant. The FIS when the individuals of the 2 groups were considered as only one population was 0,342, significant. Although the behaviour of groups is different from one to which other, just the PEPC3 loci and SB19 loci were able to make this difference at genetic and genotypic comparison. These results are confirmed by inter-group diversity (FST) and the (GST\'), that didn\'t make the differentiation between the 2 groups (0,022 and 0,015).Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPJong, David deAmaral, Jeanne Margareth Jimenes2006-08-31info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-20102025-155157/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2025-10-20T18:14:04Zoai:teses.usp.br:tde-20102025-155157Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212025-10-20T18:14:04Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
| dc.title.none.fl_str_mv |
Aplicação de marcadores microssatélites na caracterização genética de dois grupos de macacos-prego (Cebus apella nigritus) da Estação Ecológica de Ribeirão Preto - Mata de Santa Teresa - Ribeirão Preto, SP Não informado. |
| title |
Aplicação de marcadores microssatélites na caracterização genética de dois grupos de macacos-prego (Cebus apella nigritus) da Estação Ecológica de Ribeirão Preto - Mata de Santa Teresa - Ribeirão Preto, SP |
| spellingShingle |
Aplicação de marcadores microssatélites na caracterização genética de dois grupos de macacos-prego (Cebus apella nigritus) da Estação Ecológica de Ribeirão Preto - Mata de Santa Teresa - Ribeirão Preto, SP Amaral, Jeanne Margareth Jimenes Cebus apella nigritus Diversidade genética Macaco-prego Mata Santa Teresa Não informado. |
| title_short |
Aplicação de marcadores microssatélites na caracterização genética de dois grupos de macacos-prego (Cebus apella nigritus) da Estação Ecológica de Ribeirão Preto - Mata de Santa Teresa - Ribeirão Preto, SP |
| title_full |
Aplicação de marcadores microssatélites na caracterização genética de dois grupos de macacos-prego (Cebus apella nigritus) da Estação Ecológica de Ribeirão Preto - Mata de Santa Teresa - Ribeirão Preto, SP |
| title_fullStr |
Aplicação de marcadores microssatélites na caracterização genética de dois grupos de macacos-prego (Cebus apella nigritus) da Estação Ecológica de Ribeirão Preto - Mata de Santa Teresa - Ribeirão Preto, SP |
| title_full_unstemmed |
Aplicação de marcadores microssatélites na caracterização genética de dois grupos de macacos-prego (Cebus apella nigritus) da Estação Ecológica de Ribeirão Preto - Mata de Santa Teresa - Ribeirão Preto, SP |
| title_sort |
Aplicação de marcadores microssatélites na caracterização genética de dois grupos de macacos-prego (Cebus apella nigritus) da Estação Ecológica de Ribeirão Preto - Mata de Santa Teresa - Ribeirão Preto, SP |
| author |
Amaral, Jeanne Margareth Jimenes |
| author_facet |
Amaral, Jeanne Margareth Jimenes |
| author_role |
author |
| dc.contributor.none.fl_str_mv |
Jong, David de |
| dc.contributor.author.fl_str_mv |
Amaral, Jeanne Margareth Jimenes |
| dc.subject.por.fl_str_mv |
Cebus apella nigritus Diversidade genética Macaco-prego Mata Santa Teresa Não informado. |
| topic |
Cebus apella nigritus Diversidade genética Macaco-prego Mata Santa Teresa Não informado. |
| description |
Há vários trabalhos utilizando-se microssatélites para a caracterização genética de espécies de primatas do Velho Mundo. Entretanto, as espécies do Novo Mundo são pouco estudadas e não há nenhum trabalho com Cebus apella de vida livre. Esta ausência se deve, em parte, à falta de polimorfismos descritos para esta espécie. O objetivo deste trabalho foi caracterizar dois grupos de macacos-prego, Cebus apella nigritus, que habitam a Estação Ecológica de Ribeirão Preto, Mata Santa Teresa, um fragmento de 156ha inserido na zona semi-urbana no município de Ribeirão Preto, SP, Brasil. Os resultados mostram que os alelos PEPC8*4 (0,411), PEPC3*2 (0,357), SB19*2 (0,343) são os mais freqüentes no grupo A, os alelos PEPC8*1 (0,469), PEPC3*4 (0,316) e SB19*3 (0,50), no grupo B e os alelos PEPC59*1 (0,557 e 0,55, respectivamente) e SB38*8 (0,343 e 0,40, respectivamente) são freqüentes em ambos os grupos. O grupo A apresentou desvio do equilíbrio de Hardy-Weinberg em todos os loci analisados. O grupo B apresentou desvio do equilíbrio de nos loci SB38 e SB 19 e foi encontrado déficit de heterozigotos no loci SB19 e SB38. A diversidade gênica (HS) variou de 0,619 no locus PEPC59 a 0,787 no locus SB38 no grupo A e de 0,612 no locus PEPC59 a 0,778 no locus PEPC3 no grupo B. Considerando-se os dois grupos para todos os loci, a diversidade gênica média (Hs) foi de 0,718. Os valores encontrados para os coeficientes de endogamia FIS (dentro de uma população) para os grupos A e B foram de 0,395 e 0,245, respectivamente, ambos significativos. O valor de FIS também foi significativo (0,342) quando os indivíduos dos dois grupos foram considerados como uma única população. Embora os grupos se comportem como populações diferentes, apenas os loci PEPC3 e SB19 foram capazes de diferenciar os dois grupos entre si na comparação gênica e genotípica. Estes resultados são corroborados pelo índice de diferenciação interpopulacional (FST) e pelo coeficiente de diferenciação genética (GST\', que também não diferenciaram os dois grupos (0,022 e 0,015, respectivamente). |
| publishDate |
2006 |
| dc.date.none.fl_str_mv |
2006-08-31 |
| dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
| format |
doctoralThesis |
| status_str |
publishedVersion |
| dc.identifier.uri.fl_str_mv |
https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-20102025-155157/ |
| url |
https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-20102025-155157/ |
| dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
| language |
por |
| dc.relation.none.fl_str_mv |
|
| dc.rights.driver.fl_str_mv |
Liberar o conteúdo para acesso público. info:eu-repo/semantics/openAccess |
| rights_invalid_str_mv |
Liberar o conteúdo para acesso público. |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
| dc.coverage.none.fl_str_mv |
|
| dc.publisher.none.fl_str_mv |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP |
| publisher.none.fl_str_mv |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP |
| dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP instname:Universidade de São Paulo (USP) instacron:USP |
| instname_str |
Universidade de São Paulo (USP) |
| instacron_str |
USP |
| institution |
USP |
| reponame_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
| collection |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
| repository.name.fl_str_mv |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP) |
| repository.mail.fl_str_mv |
virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br |
| _version_ |
1865492354461335552 |