Estudos da enzima purina nucleosídeo fosforilase de Schistosoma Mansoni

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 1999
Autor(a) principal: Pereira, Humberto D\'Muniz
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/75/75131/tde-15102025-165820/
Resumo: O parasita Schistosoma mansoni não possui a via de síntese de bases púricas e depende integralmente da via de salvação de purinas para o seu requerimento dessas bases. Uma das enzimas participantes dessa via é a Purina Nucleosídeo Fosforilase (PNP) (E.C. 2.4.2.1). A PNP catalisa a fosforólise reversível de nucleosídeos de purina para gerar a base correspondente e ribose-1-fosfato. No Projeto Genoma de Schistosoma mansoni, o gene para esta enzima foi identificado. O cDNA para a PNP de S. mansoni possui 1055 pb e codifica uma proteína de 287 aminoácidos, que apresenta 49% de identidade sequencial quando comparada à PNP de eritrócitos humanos. O gene foi clonado no vetor de expressão pMAL, e uma grande quantidade de proteína de fusão foi produzida (30 mg·L-1). A proteína de fusão é composta por uma proteína ligante de maltose (MBP) e a PNP. Após a purificação da proteína de fusão em uma coluna de amilose, foi realizada a clivagem das duas proteínas utilizando o Fator Xa. O produto de clivagem purificado rendeu cerca de 7 mg de PNP pura, a partir de 30 mg de proteína de fusão. O KM da SmPNP para a fosforólise de inosina é 6,96 µM valor 6,4 vezes menor que o da enzima humana (45 µM) e 1,6 vezes menor que o obtido para a bovPNP (11,34 µM) com o mesmo substrato (inosina). Com relação ao kcat, a enzima humana apresenta valor 32 vezes superior ao da SmPNP: 1,78 s-1 para a SmPNP e 57 s-1 para a enzima humana. Cerca de 30 mg de SmPNP purificada foram utilizados em experimentos de cristalização (~700 condições), e duas condições promissoras foram obtidas: uma utilizando PEG 4000 e 0,1 M de acetato de sódio pH 4,6, e outra utilizando sulfato de amônio em pHs de 6 a 8. Utilizando o programa Modeller, foi construído um modelo tridimensional para a SmPNP tendo como molde as coordenadas da PNP de baço bovino. O modelo mostrou-se razoável quando avaliado segundo critérios de empacotamento e estereoquímicos. O modelo revela duas substituições no sítio ativo quando comparado com a PNP humana; essas diferenças poderão ser exploradas no desenho de inibidores específicos.
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O gene foi clonado no vetor de expressão pMAL, e uma grande quantidade de proteína de fusão foi produzida (30 mg·L-1). A proteína de fusão é composta por uma proteína ligante de maltose (MBP) e a PNP. Após a purificação da proteína de fusão em uma coluna de amilose, foi realizada a clivagem das duas proteínas utilizando o Fator Xa. O produto de clivagem purificado rendeu cerca de 7 mg de PNP pura, a partir de 30 mg de proteína de fusão. O KM da SmPNP para a fosforólise de inosina é 6,96 µM valor 6,4 vezes menor que o da enzima humana (45 µM) e 1,6 vezes menor que o obtido para a bovPNP (11,34 µM) com o mesmo substrato (inosina). Com relação ao kcat, a enzima humana apresenta valor 32 vezes superior ao da SmPNP: 1,78 s-1 para a SmPNP e 57 s-1 para a enzima humana. Cerca de 30 mg de SmPNP purificada foram utilizados em experimentos de cristalização (~700 condições), e duas condições promissoras foram obtidas: uma utilizando PEG 4000 e 0,1 M de acetato de sódio pH 4,6, e outra utilizando sulfato de amônio em pHs de 6 a 8. Utilizando o programa Modeller, foi construído um modelo tridimensional para a SmPNP tendo como molde as coordenadas da PNP de baço bovino. O modelo mostrou-se razoável quando avaliado segundo critérios de empacotamento e estereoquímicos. O modelo revela duas substituições no sítio ativo quando comparado com a PNP humana; essas diferenças poderão ser exploradas no desenho de inibidores específicos.The parasite Schistosoma mansoni, unlike its mammalian hosts, lacks the \"de novo\" pathway for purine biosynthesis and depends on the salvage pathways for its purine requirements. One component of this pathway is Purine Nucleoside Phosphorylase (PNP) (E.C. 2.4.2.1). PNP catalyzes the reversible phosphorolysis of purine nucleosides to generate the corresponding purine base and ribose-1-phosphate. In the Schistosoma mansoni Genome Project, the gene for this enzyme was isolated. The SmPNP cDNA was sequenced, corresponding to 1055 bases that code for a 287-amino-acid protein with 49% sequence identity to its human erythrocyte homologue. The SmPNP gene was cloned into the pMAL expression vector, and the recombinant fusion protein was produced (approx. 30 mg/mL) and purified using an amylose affinity resin. The fusion protein is composed of a Maltose Binding Protein (MBP) adjoined to the SmPNP. After cleavage with Factor Xa, the cleavage product was purified, yielding approximately 7 mg of purified PNP from 30 mg of fusion protein. The KM of SmPNP for inosine phosphorolysis was determined to be 6.96 µM, 6.4 times lower than the corresponding value for human PNP (45 µM), and 1.6 times lower than that for bovine PNP (11.34 µM). The human enzyme is reported to have a catalytic constant, kcat, 32 times greater than that obtained for SmPNP (1.78 s-1 compared with 57 s-1). About 30 mg of purified SmPNP has been used in crystallization experiments (~700 conditions), and two promising conditions have been obtained: one using PEG 4000 and 0.1 M sodium acetate (pH 4.6), and another using ammonium sulfate at pH values between 6 and 8. A three-dimensional model for SmPNP was built using the program MODELLER, based on the crystallographic coordinates for bovine PNP. The model was shown to be chemically reasonable using both stereochemical and packing criteria. The model reveals two substitutions within the active site compared with the human PNP, which may be explored in the design of specific inhibitors.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPGarratt, Richard CharlesPereira, Humberto D\'Muniz1999-10-29info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/75/75131/tde-15102025-165820/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2025-10-16T12:10:02Zoai:teses.usp.br:tde-15102025-165820Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212025-10-16T12:10:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
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