Análise de genes da família MtN3/saliva expressos no pistilo de Nicotiana tabacum L

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2011
Autor(a) principal: Amorim, Marcella de Francisco
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-02032026-101107/
Resumo: O pistilo é um órgão de importância central na reprodução de plantas, sendo responsável pela recepção, reconhecimento, seleção e aceitação de grãos de pólen. Muitos genes preferencialmente ou especificamente expressos no pistilo podem estar relacionados à reprodução. TOBC023B06, um clone identificado na biblioteca de cDNA de estigma/estilete de Nicotiana tabacum (TOBEST), foi previamente descrito com uma expressão específica no estigma/estilete. Análises in si/ico indicaram que este pertence à família MtN3/saliva de proteínas de transmembrana. Em plantas, algumas proteínas MtN3/saliva foram descritas (RPGl, Os8N3, NECI e SAG29) e todas estão de alguma forma associadas à reprodução. Apesar desses estudos, pouco se conhecia sobre a função dessas proteínas até recentemente e, assim, o objetivo deste trabalho foi estudar TOBC023B06 e outras proteínas MtN3/saliva expressas no pistilo de N. tabacum. Para entender a função de 23B06, plantas transgênicas de N . tabacum (super-expressando e silenciando 23B06) foram obtidas via Agrobacterium. Plantas de super-expressão apresentaram um estilete alongado (TO) e análises da segunda geração (TI) revelaram plântulas com retardo no crescimento em condições normais e hipersensibilidade à alta salinidade. Plantas silenciadas não apresentaram nenhum fenótipo visível (TO), entretanto sementes da planta com o menor nível de expressão de 23B06 apresentou dificuldades na germinação. Experimentos de expressão transiente (35S::TOBC023B06-eGFP) em folhas e protoplastos indicaram uma localização em membrana plasmática para a proteína 23B06. Análises in silico da proteína 23B06 revelaram a presença de 7 regiões de domínios transmembrânicos e uma porção C-terminal longa e localizada dentro da célula. Além disso, uma sequência genômica parcial correspondendo ao 23B06 foi obtida no Sol Genomics Network (Blastn), revelando 6 éxons e uma região promotora com elementos cis-regulatórios envolvidos com a resposta ao ABA e também alguns elementos necessários para expressão em endosperma. Esses elementos também foram encontrados no promotor do seu ortólogo em Arabidopsis (SAG29), o qual possui elevada expressão durante o desenvolvimento da semente e responde a tratamentos com ABA. Além de TOBC023B06, seis contigs/genes codificando proteínas MtN3/saliva foram encontrados no TOBEST e uma busca por sequências homólogas foram feitas nos genomas de Arabidopsis thaliana e Populus trichocarpa. Sequências de aminoácidos dessas proteínas MtN3/saliva foram alinhadas pelo programa MAFFT e uma árvore filogenética foi construída pelo PhyML3(aLTR). Cinco grupos de possíveis ortólogos entre essas três espécies foram definidos e genes homeólogos (TOBC023B06 e TOBC047C06; TOBC48E05 e TOBC17D07) f oram encontrados em N. tabacum. Cinco genes de Arabidopsis, identificados como ortólogos de proteínas MtN3/saliva de N. tabacum, possuem alta expressão em estruturas reprodutivas: estames, pólen, pistilo e sementes/embrião. Em Populus, dados de expressão para alguns genes foram também encontrados e revelaram altas expressões em inflorescências. Com relação às sequências de N. tabacum, análises de RT-qPCR demonstraram que TOBC017D07/TOBC048E05 é preferencialmente expresso em ovários e TOBC052Fl2 é expresso amplamente em todos os órgãos analisados. Além disso, realizamos novamente a análise de TOBC023B06, visando detectar a expressão desse gene separada do seu homeólogo. Os dados obtidos revelaram que, na verdade, TOBC023B06 possui elevadas expressões não apenas em estigma/estilete, mas também em pétalas e estames. Por outro lado, o seu homeólogo (TOBC047C06) possui expressão específica no estigma/estilete. Apesar dessas diferenças nos padrões de expressão dos homeólogos, ambos os genes são regulados durante o desenvolvimento do estigma/estilete, sendo mais expressos nos últimos estádios em direção a antese. Considerando a função de transportadores de açúcares estabelecida recentemente para proteínas da família MtN3/saliva, e a expressão destes genes em estigma/estilete, que coincide com a produção do exudato rico em açúcares, é possível propor que proteínas MtN3/saliva do pistilo estão envolvidas com o transporte de açúcares para o exudato.
id USP_eec08200e7e0cfb14b3347a13756c0d0
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-02032026-101107
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str
spelling Análise de genes da família MtN3/saliva expressos no pistilo de Nicotiana tabacum LAnalysis of genes from the MtN3/saliva family expressed in Nicotiana tabacum L. pistilNicotiana tabacumNicotiana tabacumEstigma/estileteExudateExudatoMtN3/salivaMtN3/salivaPistilPistiloProteínas transmembranasStigma/styleSugar transportersSWEETSWEETTransmembrane proteinsTransportadores de açúcaresO pistilo é um órgão de importância central na reprodução de plantas, sendo responsável pela recepção, reconhecimento, seleção e aceitação de grãos de pólen. Muitos genes preferencialmente ou especificamente expressos no pistilo podem estar relacionados à reprodução. TOBC023B06, um clone identificado na biblioteca de cDNA de estigma/estilete de Nicotiana tabacum (TOBEST), foi previamente descrito com uma expressão específica no estigma/estilete. Análises in si/ico indicaram que este pertence à família MtN3/saliva de proteínas de transmembrana. Em plantas, algumas proteínas MtN3/saliva foram descritas (RPGl, Os8N3, NECI e SAG29) e todas estão de alguma forma associadas à reprodução. Apesar desses estudos, pouco se conhecia sobre a função dessas proteínas até recentemente e, assim, o objetivo deste trabalho foi estudar TOBC023B06 e outras proteínas MtN3/saliva expressas no pistilo de N. tabacum. Para entender a função de 23B06, plantas transgênicas de N . tabacum (super-expressando e silenciando 23B06) foram obtidas via Agrobacterium. Plantas de super-expressão apresentaram um estilete alongado (TO) e análises da segunda geração (TI) revelaram plântulas com retardo no crescimento em condições normais e hipersensibilidade à alta salinidade. Plantas silenciadas não apresentaram nenhum fenótipo visível (TO), entretanto sementes da planta com o menor nível de expressão de 23B06 apresentou dificuldades na germinação. Experimentos de expressão transiente (35S::TOBC023B06-eGFP) em folhas e protoplastos indicaram uma localização em membrana plasmática para a proteína 23B06. Análises in silico da proteína 23B06 revelaram a presença de 7 regiões de domínios transmembrânicos e uma porção C-terminal longa e localizada dentro da célula. Além disso, uma sequência genômica parcial correspondendo ao 23B06 foi obtida no Sol Genomics Network (Blastn), revelando 6 éxons e uma região promotora com elementos cis-regulatórios envolvidos com a resposta ao ABA e também alguns elementos necessários para expressão em endosperma. Esses elementos também foram encontrados no promotor do seu ortólogo em Arabidopsis (SAG29), o qual possui elevada expressão durante o desenvolvimento da semente e responde a tratamentos com ABA. Além de TOBC023B06, seis contigs/genes codificando proteínas MtN3/saliva foram encontrados no TOBEST e uma busca por sequências homólogas foram feitas nos genomas de Arabidopsis thaliana e Populus trichocarpa. Sequências de aminoácidos dessas proteínas MtN3/saliva foram alinhadas pelo programa MAFFT e uma árvore filogenética foi construída pelo PhyML3(aLTR). Cinco grupos de possíveis ortólogos entre essas três espécies foram definidos e genes homeólogos (TOBC023B06 e TOBC047C06; TOBC48E05 e TOBC17D07) f oram encontrados em N. tabacum. Cinco genes de Arabidopsis, identificados como ortólogos de proteínas MtN3/saliva de N. tabacum, possuem alta expressão em estruturas reprodutivas: estames, pólen, pistilo e sementes/embrião. Em Populus, dados de expressão para alguns genes foram também encontrados e revelaram altas expressões em inflorescências. Com relação às sequências de N. tabacum, análises de RT-qPCR demonstraram que TOBC017D07/TOBC048E05 é preferencialmente expresso em ovários e TOBC052Fl2 é expresso amplamente em todos os órgãos analisados. Além disso, realizamos novamente a análise de TOBC023B06, visando detectar a expressão desse gene separada do seu homeólogo. Os dados obtidos revelaram que, na verdade, TOBC023B06 possui elevadas expressões não apenas em estigma/estilete, mas também em pétalas e estames. Por outro lado, o seu homeólogo (TOBC047C06) possui expressão específica no estigma/estilete. Apesar dessas diferenças nos padrões de expressão dos homeólogos, ambos os genes são regulados durante o desenvolvimento do estigma/estilete, sendo mais expressos nos últimos estádios em direção a antese. Considerando a função de transportadores de açúcares estabelecida recentemente para proteínas da família MtN3/saliva, e a expressão destes genes em estigma/estilete, que coincide com a produção do exudato rico em açúcares, é possível propor que proteínas MtN3/saliva do pistilo estão envolvidas com o transporte de açúcares para o exudato.The pistil is an organ of central importance in plant reproduction, being responsible for pollen grains reception, recognition, selection and acceptance. Many genes preferentially or specifically expressed in pistil may be related to reproduction. TOBC023B06, a clone identified in a Nicotiana tabacum L. stigma/style cDNA library (TOBEST), was previously described with a stigma/style-specific expression. ln silico analysis indicated that it belongs to the MtN3/saliva family of transmembrane proteins. ln plants, some MtN3/saliva proteins have already been described (RPGl, Os8N3, NECl and SAG29) and all of them are somehow associated with reproduction. Despite these studies, little was known about the function of these proteins until recently and so, the goal of this work was to study TOBC023B06 and other N. tabacum pistil expressed MtN3/saliva proteins. To understand the function of 023B06, tobacco transgenic plants ( overexpressing and silencing 023B06) were obtained via Agrobacterium. Overexpressing plants showed an elongated style (TO) and analysis at the second generation (TI) revealed seedlings with delayed growth under normal conditions and also hypersensitive to high salt concentration. Silencing plants had no visible phenotype in TO, however seeds from the plant with the lowest 23B06 expression level showed difficulties to germinate. Transient expression experiments (35S: :TOBC023B06-eGFP) in leaves and protoplasts indicated a plasma membrane localization for the 023B06 protein. ln silico analysis of the 023B06 protein showed the presence of seven transmembrane domains and a long e-terminal portion located inside the cell. Furthermore, a partial genomic sequence corresponding to 023B06 was obtained from the Sol Genomics Network (Blastn), revealing six exons and a promoter region with cis-acting regulatory elements involved in responsiveness to ABA and also some elements required for endosperm expression. These elements were also found in the promoter of its Arabidopsis ortholog (SAG29), which shows high expression during seed development and responds to ABA treatment. ln addition to TOBC023B06, six contigs/genes encoding MtN3/saliva proteins were found in the TOBEST and a search for their homologs was done in the Arabidopsis thaliana and Populus trichocarpa genomes. Amino acid sequences of MtN3/saliva proteins were aligned by the M AFFT program and a phylogenetic tree was constructed by PhyML3(aLTR). Five putative ortholog groups conceming these three species were defined and homeolog genes (TOBC023B06 and TOBC047C06; TOBC48E05 and TOBCl 7007) were also found in N. tabacum. Five Arabidopsis genes identified as orthologs of the N. tabacum MtN3/saliva proteins have high expression in reproductive structures: stamens, pollen, pistil and seeds/embryo. ln Populus, expression data for some of these genes was also found and revealed high expression in inflorescences. Conceming the N. tabacum sequences, RT-qPCR analysis demonstrated that TOBC0 17D07 /TOBC048E05 is preferentially expressed in ovary and TOBC052Fl2 is widely expressed in ali the analyzed organs. Moreover, we performed again the expression analysis of TOBC023B06, intending to detect its expression separately f rom its homeolog. Our data showed that actually TOBC023B06 is highly expressed not only in stigma/style, but also in petals and stamens. On the other side, its homeolog {TOBC047C06) has stigma/style-specific expression. Despite the differences in the homeolog expression patterns, both genes are regulated during stigma/style development, with the highest expression at the later stages toward anthesis. Considering the function as sugar transporter recently established for proteins of the MtN3/saliva family and the expression of these genes in stigma/style, which coincides with the production of exudate that is rich in sugars, it is possible to propose that the pistil MtN3/saliva proteins are involved in sugar transport to the exudate.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPGoldman, Maria Helena de SouzaAmorim, Marcella de Francisco2011-08-10info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-02032026-101107/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2026-03-02T14:05:50Zoai:teses.usp.br:tde-02032026-101107Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212026-03-02T14:05:50Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Análise de genes da família MtN3/saliva expressos no pistilo de Nicotiana tabacum L
Analysis of genes from the MtN3/saliva family expressed in Nicotiana tabacum L. pistil
title Análise de genes da família MtN3/saliva expressos no pistilo de Nicotiana tabacum L
spellingShingle Análise de genes da família MtN3/saliva expressos no pistilo de Nicotiana tabacum L
Amorim, Marcella de Francisco
Nicotiana tabacum
Nicotiana tabacum
Estigma/estilete
Exudate
Exudato
MtN3/saliva
MtN3/saliva
Pistil
Pistilo
Proteínas transmembranas
Stigma/style
Sugar transporters
SWEET
SWEET
Transmembrane proteins
Transportadores de açúcares
title_short Análise de genes da família MtN3/saliva expressos no pistilo de Nicotiana tabacum L
title_full Análise de genes da família MtN3/saliva expressos no pistilo de Nicotiana tabacum L
title_fullStr Análise de genes da família MtN3/saliva expressos no pistilo de Nicotiana tabacum L
title_full_unstemmed Análise de genes da família MtN3/saliva expressos no pistilo de Nicotiana tabacum L
title_sort Análise de genes da família MtN3/saliva expressos no pistilo de Nicotiana tabacum L
author Amorim, Marcella de Francisco
author_facet Amorim, Marcella de Francisco
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Goldman, Maria Helena de Souza
dc.contributor.author.fl_str_mv Amorim, Marcella de Francisco
dc.subject.por.fl_str_mv Nicotiana tabacum
Nicotiana tabacum
Estigma/estilete
Exudate
Exudato
MtN3/saliva
MtN3/saliva
Pistil
Pistilo
Proteínas transmembranas
Stigma/style
Sugar transporters
SWEET
SWEET
Transmembrane proteins
Transportadores de açúcares
topic Nicotiana tabacum
Nicotiana tabacum
Estigma/estilete
Exudate
Exudato
MtN3/saliva
MtN3/saliva
Pistil
Pistilo
Proteínas transmembranas
Stigma/style
Sugar transporters
SWEET
SWEET
Transmembrane proteins
Transportadores de açúcares
description O pistilo é um órgão de importância central na reprodução de plantas, sendo responsável pela recepção, reconhecimento, seleção e aceitação de grãos de pólen. Muitos genes preferencialmente ou especificamente expressos no pistilo podem estar relacionados à reprodução. TOBC023B06, um clone identificado na biblioteca de cDNA de estigma/estilete de Nicotiana tabacum (TOBEST), foi previamente descrito com uma expressão específica no estigma/estilete. Análises in si/ico indicaram que este pertence à família MtN3/saliva de proteínas de transmembrana. Em plantas, algumas proteínas MtN3/saliva foram descritas (RPGl, Os8N3, NECI e SAG29) e todas estão de alguma forma associadas à reprodução. Apesar desses estudos, pouco se conhecia sobre a função dessas proteínas até recentemente e, assim, o objetivo deste trabalho foi estudar TOBC023B06 e outras proteínas MtN3/saliva expressas no pistilo de N. tabacum. Para entender a função de 23B06, plantas transgênicas de N . tabacum (super-expressando e silenciando 23B06) foram obtidas via Agrobacterium. Plantas de super-expressão apresentaram um estilete alongado (TO) e análises da segunda geração (TI) revelaram plântulas com retardo no crescimento em condições normais e hipersensibilidade à alta salinidade. Plantas silenciadas não apresentaram nenhum fenótipo visível (TO), entretanto sementes da planta com o menor nível de expressão de 23B06 apresentou dificuldades na germinação. Experimentos de expressão transiente (35S::TOBC023B06-eGFP) em folhas e protoplastos indicaram uma localização em membrana plasmática para a proteína 23B06. Análises in silico da proteína 23B06 revelaram a presença de 7 regiões de domínios transmembrânicos e uma porção C-terminal longa e localizada dentro da célula. Além disso, uma sequência genômica parcial correspondendo ao 23B06 foi obtida no Sol Genomics Network (Blastn), revelando 6 éxons e uma região promotora com elementos cis-regulatórios envolvidos com a resposta ao ABA e também alguns elementos necessários para expressão em endosperma. Esses elementos também foram encontrados no promotor do seu ortólogo em Arabidopsis (SAG29), o qual possui elevada expressão durante o desenvolvimento da semente e responde a tratamentos com ABA. Além de TOBC023B06, seis contigs/genes codificando proteínas MtN3/saliva foram encontrados no TOBEST e uma busca por sequências homólogas foram feitas nos genomas de Arabidopsis thaliana e Populus trichocarpa. Sequências de aminoácidos dessas proteínas MtN3/saliva foram alinhadas pelo programa MAFFT e uma árvore filogenética foi construída pelo PhyML3(aLTR). Cinco grupos de possíveis ortólogos entre essas três espécies foram definidos e genes homeólogos (TOBC023B06 e TOBC047C06; TOBC48E05 e TOBC17D07) f oram encontrados em N. tabacum. Cinco genes de Arabidopsis, identificados como ortólogos de proteínas MtN3/saliva de N. tabacum, possuem alta expressão em estruturas reprodutivas: estames, pólen, pistilo e sementes/embrião. Em Populus, dados de expressão para alguns genes foram também encontrados e revelaram altas expressões em inflorescências. Com relação às sequências de N. tabacum, análises de RT-qPCR demonstraram que TOBC017D07/TOBC048E05 é preferencialmente expresso em ovários e TOBC052Fl2 é expresso amplamente em todos os órgãos analisados. Além disso, realizamos novamente a análise de TOBC023B06, visando detectar a expressão desse gene separada do seu homeólogo. Os dados obtidos revelaram que, na verdade, TOBC023B06 possui elevadas expressões não apenas em estigma/estilete, mas também em pétalas e estames. Por outro lado, o seu homeólogo (TOBC047C06) possui expressão específica no estigma/estilete. Apesar dessas diferenças nos padrões de expressão dos homeólogos, ambos os genes são regulados durante o desenvolvimento do estigma/estilete, sendo mais expressos nos últimos estádios em direção a antese. Considerando a função de transportadores de açúcares estabelecida recentemente para proteínas da família MtN3/saliva, e a expressão destes genes em estigma/estilete, que coincide com a produção do exudato rico em açúcares, é possível propor que proteínas MtN3/saliva do pistilo estão envolvidas com o transporte de açúcares para o exudato.
publishDate 2011
dc.date.none.fl_str_mv 2011-08-10
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-02032026-101107/
url https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-02032026-101107/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1862865725104848896