Estudo do papel dos fatores sigma alternativos <font face=\"symbol\">sE e <font face=\"symbol\">sN de Xylella fastidiosa.
| Ano de defesa: | 2007 |
|---|---|
| Autor(a) principal: | |
| Orientador(a): | |
| Banca de defesa: | |
| Tipo de documento: | Tese |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
|
| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
|
| Departamento: |
Não Informado pela instituição
|
| País: |
Não Informado pela instituição
|
| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-29012008-125605/ |
Resumo: | Linhagens mutantes foram obtidas para os fatores sigma <font face=\"symbol\">sE (RpoE) e <font face=\"symbol\">sN (RpoN) da bactéria Xylella fastidiosa. O mutante rpoE mostrou-se sensível a etanol e a choque térmico. Análises de microarranjo de DNA, de RT-PCR quantitativo e mapeamento de sítios de início de transcrição permitiram definir o regulon <font face=\"symbol\">sE em resposta ao choque térmico. Verificou-se co-transcrição entre os genes que codificam para <font face=\"symbol\">sE, seu anti-sigma e uma protease, e <font face=\"symbol\">sE não se mostrou auto-regulado, mas regulou o gene do anti-sigma. Análises similares às acima indicaram que o gene pilA, codificando a pilina da fímbria tipo IV, é positivamente regulado por <font face=\"symbol\">sN, enquanto o operon codificando proteínas da fímbria tipo I é regulado negativamente, explicando a maior formação de biofilme e auto-agregação no mutante rpoN. O perfil temporal de expressão da linhagem selvagem J1a12 em carência de nitrogênio foi determinado, além de genes induzidos por carência de nitrogênio via <font face=\"symbol\">sN. Assim, <font face=\"symbol\">sN regula genes de fímbrias e de resposta à carência de nitrogênio em Xylella fastidiosa. |
| id |
USP_fd98789592e834fe4d8a00748d0ffaa9 |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:teses.usp.br:tde-29012008-125605 |
| network_acronym_str |
USP |
| network_name_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
| repository_id_str |
|
| spelling |
Estudo do papel dos fatores sigma alternativos <font face=\"symbol\">sE e <font face=\"symbol\">sN de Xylella fastidiosa.Role of the alternative sigma factors <font face=\"symbol\">sE and <font face=\"symbol\">sN in Xylella fastidiosa.Xylella fastidiosaXylella fastidiosa.Bacterial stress responseBiologia MolecularFatores SigmaGene RegulationMicrobiologiaMicrobiologyMolecular BiologyRegulação gênicaRespostas a estresse em bactériasSigma factorsLinhagens mutantes foram obtidas para os fatores sigma <font face=\"symbol\">sE (RpoE) e <font face=\"symbol\">sN (RpoN) da bactéria Xylella fastidiosa. O mutante rpoE mostrou-se sensível a etanol e a choque térmico. Análises de microarranjo de DNA, de RT-PCR quantitativo e mapeamento de sítios de início de transcrição permitiram definir o regulon <font face=\"symbol\">sE em resposta ao choque térmico. Verificou-se co-transcrição entre os genes que codificam para <font face=\"symbol\">sE, seu anti-sigma e uma protease, e <font face=\"symbol\">sE não se mostrou auto-regulado, mas regulou o gene do anti-sigma. Análises similares às acima indicaram que o gene pilA, codificando a pilina da fímbria tipo IV, é positivamente regulado por <font face=\"symbol\">sN, enquanto o operon codificando proteínas da fímbria tipo I é regulado negativamente, explicando a maior formação de biofilme e auto-agregação no mutante rpoN. O perfil temporal de expressão da linhagem selvagem J1a12 em carência de nitrogênio foi determinado, além de genes induzidos por carência de nitrogênio via <font face=\"symbol\">sN. Assim, <font face=\"symbol\">sN regula genes de fímbrias e de resposta à carência de nitrogênio em Xylella fastidiosa.Mutant strains were obtained for the sigma factors <font face=\"symbol\">sE (RpoE) and <font face=\"symbol\">sN (RpoN) in Xylella fastidiosa. The rpoE mutant showed to be sensitive to ethanol and heat shock. Microarray and quantitative RT-PCR analyses and determination of transcription start sites permitted to define the <font face=\"symbol\">sE regulon under heat shock. Co-transcription of the genes encoding <font face=\"symbol\">sE , its anti-sigma factor and a protease was observed, and <font face=\"symbol\">sE did not present auto-regulation, but it regulated the gene encoding the anti-sigma. Similar analyses indicated that the pilA gene, encoding the pilin of the type IV fimbriae, is positively regulated by <font face=\"symbol\">sN, while the operon encoding proteins of the type I fimbriae is negatively regulated, what explains the increased biofilm formation and auto-aggregation in the rpoN strain. Temporal expression profile of wild type strain J1a12 under nitrogen starvation was determined, as well as genes induced by nitrogen starvation via <font face=\"symbol\">sN. Thus, <font face=\"symbol\">sN regulates genes encoding fimbriae and genes for nitrogen starvation response in Xylella fastidiosa.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPMarques, Marilis do ValleSilva Neto, José Freire da2007-12-17info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttp://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-29012008-125605/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2016-07-28T16:09:55Zoai:teses.usp.br:tde-29012008-125605Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212016-07-28T16:09:55Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
| dc.title.none.fl_str_mv |
Estudo do papel dos fatores sigma alternativos <font face=\"symbol\">sE e <font face=\"symbol\">sN de Xylella fastidiosa. Role of the alternative sigma factors <font face=\"symbol\">sE and <font face=\"symbol\">sN in Xylella fastidiosa. |
| title |
Estudo do papel dos fatores sigma alternativos <font face=\"symbol\">sE e <font face=\"symbol\">sN de Xylella fastidiosa. |
| spellingShingle |
Estudo do papel dos fatores sigma alternativos <font face=\"symbol\">sE e <font face=\"symbol\">sN de Xylella fastidiosa. Silva Neto, José Freire da Xylella fastidiosa Xylella fastidiosa. Bacterial stress response Biologia Molecular Fatores Sigma Gene Regulation Microbiologia Microbiology Molecular Biology Regulação gênica Respostas a estresse em bactérias Sigma factors |
| title_short |
Estudo do papel dos fatores sigma alternativos <font face=\"symbol\">sE e <font face=\"symbol\">sN de Xylella fastidiosa. |
| title_full |
Estudo do papel dos fatores sigma alternativos <font face=\"symbol\">sE e <font face=\"symbol\">sN de Xylella fastidiosa. |
| title_fullStr |
Estudo do papel dos fatores sigma alternativos <font face=\"symbol\">sE e <font face=\"symbol\">sN de Xylella fastidiosa. |
| title_full_unstemmed |
Estudo do papel dos fatores sigma alternativos <font face=\"symbol\">sE e <font face=\"symbol\">sN de Xylella fastidiosa. |
| title_sort |
Estudo do papel dos fatores sigma alternativos <font face=\"symbol\">sE e <font face=\"symbol\">sN de Xylella fastidiosa. |
| author |
Silva Neto, José Freire da |
| author_facet |
Silva Neto, José Freire da |
| author_role |
author |
| dc.contributor.none.fl_str_mv |
Marques, Marilis do Valle |
| dc.contributor.author.fl_str_mv |
Silva Neto, José Freire da |
| dc.subject.por.fl_str_mv |
Xylella fastidiosa Xylella fastidiosa. Bacterial stress response Biologia Molecular Fatores Sigma Gene Regulation Microbiologia Microbiology Molecular Biology Regulação gênica Respostas a estresse em bactérias Sigma factors |
| topic |
Xylella fastidiosa Xylella fastidiosa. Bacterial stress response Biologia Molecular Fatores Sigma Gene Regulation Microbiologia Microbiology Molecular Biology Regulação gênica Respostas a estresse em bactérias Sigma factors |
| description |
Linhagens mutantes foram obtidas para os fatores sigma <font face=\"symbol\">sE (RpoE) e <font face=\"symbol\">sN (RpoN) da bactéria Xylella fastidiosa. O mutante rpoE mostrou-se sensível a etanol e a choque térmico. Análises de microarranjo de DNA, de RT-PCR quantitativo e mapeamento de sítios de início de transcrição permitiram definir o regulon <font face=\"symbol\">sE em resposta ao choque térmico. Verificou-se co-transcrição entre os genes que codificam para <font face=\"symbol\">sE, seu anti-sigma e uma protease, e <font face=\"symbol\">sE não se mostrou auto-regulado, mas regulou o gene do anti-sigma. Análises similares às acima indicaram que o gene pilA, codificando a pilina da fímbria tipo IV, é positivamente regulado por <font face=\"symbol\">sN, enquanto o operon codificando proteínas da fímbria tipo I é regulado negativamente, explicando a maior formação de biofilme e auto-agregação no mutante rpoN. O perfil temporal de expressão da linhagem selvagem J1a12 em carência de nitrogênio foi determinado, além de genes induzidos por carência de nitrogênio via <font face=\"symbol\">sN. Assim, <font face=\"symbol\">sN regula genes de fímbrias e de resposta à carência de nitrogênio em Xylella fastidiosa. |
| publishDate |
2007 |
| dc.date.none.fl_str_mv |
2007-12-17 |
| dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
| format |
doctoralThesis |
| status_str |
publishedVersion |
| dc.identifier.uri.fl_str_mv |
http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-29012008-125605/ |
| url |
http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-29012008-125605/ |
| dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
| language |
por |
| dc.relation.none.fl_str_mv |
|
| dc.rights.driver.fl_str_mv |
Liberar o conteúdo para acesso público. info:eu-repo/semantics/openAccess |
| rights_invalid_str_mv |
Liberar o conteúdo para acesso público. |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
| dc.coverage.none.fl_str_mv |
|
| dc.publisher.none.fl_str_mv |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP |
| publisher.none.fl_str_mv |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP |
| dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP instname:Universidade de São Paulo (USP) instacron:USP |
| instname_str |
Universidade de São Paulo (USP) |
| instacron_str |
USP |
| institution |
USP |
| reponame_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
| collection |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
| repository.name.fl_str_mv |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP) |
| repository.mail.fl_str_mv |
virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br |
| _version_ |
1815258544400760832 |