Estudo teórico de novos compostos intercalantes ao DNA com atividade antimalárica utilizando metodologias ab initio e dinâmica molecular

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2015
Autor(a) principal: Fontineles, Tancredo Augusto de Carvalho
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Não Informado pela instituição
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
INTERCALAÇÃO
DNA
MALÁRIA
INTERCALATION
PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM CIÊNCIA E TECNOLOGIA/QUÍMICA - UFABC
Link de acesso: http://biblioteca.ufabc.edu.br/index.php?codigo_sophia=77142
Resumo: Orientador: Prof. Dr. Maurício Domingues Coutinho Neto
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spelling Estudo teórico de novos compostos intercalantes ao DNA com atividade antimalárica utilizando metodologias ab initio e dinâmica molecularINTERCALAÇÃODNAMALÁRIAINTERCALATIONPROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM CIÊNCIA E TECNOLOGIA/QUÍMICA - UFABCOrientador: Prof. Dr. Maurício Domingues Coutinho NetoTese (doutorado) - Universidade Federal do ABC. Programa de Pós-Graduação em Ciência e Tecnologia/Química, 2015.The theoretical study of the interaction between biomolecules that interact with DNA has been growing in recent years. Understanding the mechanism of action of these biomolecules in the process of intercalation with DNA is of fundamental importance in the development of new drugs for the treatment of genetic and parasites diseases. Among these diseases, malaria is one of the most important worldwide and is caused by a protozoan parasite. The resistance of plasmodium P. falciparum, which causes the most severe form of the disease to antimalarial drugs, has become a growing problem and the search for more effective drugs is urgent. Many of these drugs interact with DNA by intercalation process mediated mainly by dispersion interactions that contribute significantly to the stability of the complex intercalator-DNA. With this idea, we propose to investigate theoretically the interactions that occur between an antimalarial drug, the cryptolepine and its derivatives, when intercalated between base pairs of DNA by means of first principles methods based on Density Functional Theory and classical molecular dynamics methods. The dispersion effects were included in the DCACP approach ( Dispersion Correct-Atom Centered Potentials). In the classical approach, we used specific force fields such as ff99bsc0 and GAFF for the treatment and quality of intercalation energy. The DCACP results showed that the cryptolepine interacts strongly with DNA, whose the interaction energy was -38.6 kcal/mol. Furthermore, the cryptolepine intercalation preference between non-alternating CG sites was confirmed by more stable configuration energy in the crystal. The free intercalation energy of drug calculated by molecular dynamics was about -30 kcal/mol showing that this process can be energetically favorable. The cryptolepine has a potent in vitro activity against malaria parasites in addition to being the first of a class of intercalating agents preferably having a intercalation sites of the DNA cytosine-guanine by a non-alternating and parallel intercalation mode. This suggests that this new intercalating process should lead to the development of new drugs against malaria and the theoretical study proposed in this work can assist in the design of experimental work.Coutinho Neto, Maurício DominguesCordeiro, Rodrigo MaghdissianHonório, Káthia MariaAmorim, Rodrigo GarciaDias, Luis GustavoFontineles, Tancredo Augusto de Carvalho2015info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdf125 f. : il.http://biblioteca.ufabc.edu.br/index.php?codigo_sophia=77142http://biblioteca.ufabc.edu.br/index.php?codigo_sophia=77142&midiaext=70495http://biblioteca.ufabc.edu.br/index.php?codigo_sophia=77142&midiaext=70496Cover: http://biblioteca.ufabc.edu.br/php/capa.php?obra=77142porreponame:Repositório Institucional da UFABCinstname:Universidade Federal do ABC (UFABC)instacron:UFABCinfo:eu-repo/semantics/openAccess2016-08-18T13:24:35Zoai:BDTD:77142Repositório InstitucionalPUBhttp://www.biblioteca.ufabc.edu.br/oai/oai.phpopendoar:2016-08-18T13:24:35Repositório Institucional da UFABC - Universidade Federal do ABC (UFABC)false
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