Novos compostos com propriedades antibióticas de Salinispora arenicola, uma bactéria associada ao sedimento marinho do Arquipélago de São Pedro e São Paulo
| Ano de defesa: | 2021 |
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Resumo: | This work describes the chemical investigation of the ethyl acetate extract (EtOAc) obtained from a bacterial strain identified as Salinispora arenicola, which was isolated from marine sediments collected in the Saint Peter and Saint Paul Archipelago-Brazil (ASPSP), aiming at the isolation of new bioactive compounds. The chemical investigation resulted in the isolation of thirteen new compounds: five aminonaphthoquinones designated as salinaphthoquinones A-E (SA-1 to SA-5), two N-methyl-2-oxindole derivatives 3-hydroxy-6-methoxy-3-(2-oxo-propyl)-N-methyl-2-oxindole (SA-6) and 5-chloro-3-hydroxy-6-methoxy-3-(2-oxo-propyl)-N-methyl-2-oxindole (SA-7), a tetraketide named 3-hydroxy-5-(1-hydroxy-1-phenylpropan-2-yl)-2- methyl-pyran-2-one (SA-8), besides five rifamycin derivatives designated as salinirifamycins A-E (SA-9 to SA-13). All isolated compounds were subjected to antibacterial assays against Staphylococcus aureus, including a methicillin-resistant strain, Enterococcus faecalis, also including a vancomycin-resistant strain and Escherichia coli. Salinirifamycins SA-9, SA-10, SA-11, and SA-13 showed potent activity against S. aureus and E. faecalis with MIC values ranging from 0.02 through 3.1 µg/mL. Salinirifamycin A (SA-9), the first example of rifamycin bearing a natural tetracyclic 5/6/6/6 pyridine-fused system isolated from Salinispora, revealed an activity (MIC of 0.02 µg/mL) similar to rifampicin (MIC 0.03 µg/mL), used as positive control. Regarding the other compounds, only Salinaphthoquinone B (SA-2) exhibited satisfactory activity (MIC 15.6-125.0 µg / mL) against both S. aureus and E. faecalis. |
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Silva, Álison Batista daPessoa, Otília Deusdênia Loiola2021-12-06T14:49:10Z2021-12-06T14:49:10Z2021SILVA, Álison Batista da. Novos compostos com propriedades antibióticas de Salinispora arenicola, uma bactéria associada ao sedimento marinho do Arquipélago de São Pedro e São Paulo. 2021. 193 f. Tese (Doutorado em Química) - Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2021.http://www.repositorio.ufc.br/handle/riufc/62758This work describes the chemical investigation of the ethyl acetate extract (EtOAc) obtained from a bacterial strain identified as Salinispora arenicola, which was isolated from marine sediments collected in the Saint Peter and Saint Paul Archipelago-Brazil (ASPSP), aiming at the isolation of new bioactive compounds. The chemical investigation resulted in the isolation of thirteen new compounds: five aminonaphthoquinones designated as salinaphthoquinones A-E (SA-1 to SA-5), two N-methyl-2-oxindole derivatives 3-hydroxy-6-methoxy-3-(2-oxo-propyl)-N-methyl-2-oxindole (SA-6) and 5-chloro-3-hydroxy-6-methoxy-3-(2-oxo-propyl)-N-methyl-2-oxindole (SA-7), a tetraketide named 3-hydroxy-5-(1-hydroxy-1-phenylpropan-2-yl)-2- methyl-pyran-2-one (SA-8), besides five rifamycin derivatives designated as salinirifamycins A-E (SA-9 to SA-13). All isolated compounds were subjected to antibacterial assays against Staphylococcus aureus, including a methicillin-resistant strain, Enterococcus faecalis, also including a vancomycin-resistant strain and Escherichia coli. Salinirifamycins SA-9, SA-10, SA-11, and SA-13 showed potent activity against S. aureus and E. faecalis with MIC values ranging from 0.02 through 3.1 µg/mL. Salinirifamycin A (SA-9), the first example of rifamycin bearing a natural tetracyclic 5/6/6/6 pyridine-fused system isolated from Salinispora, revealed an activity (MIC of 0.02 µg/mL) similar to rifampicin (MIC 0.03 µg/mL), used as positive control. Regarding the other compounds, only Salinaphthoquinone B (SA-2) exhibited satisfactory activity (MIC 15.6-125.0 µg / mL) against both S. aureus and E. faecalis.CAPESEste trabalho descreve a investigação química do extrato em acetato de etila (AcOEt) da bactéria Salinispora arenicola isolada a partir de sedimentos marinhos coletados no Arquipélago de São Pedro e São Paulo (ASPSP), visando o isolamento e a elucidação estrutural de novos compostos bioativos. A investigação química resultou no isolamento de treze novos compostos: cinco aminonaftoquinonas denominadas de salinaftoquinonas A-E (SA-1 a SA-5), dois derivados do N-metil-2-oxindol nomeados de 3-hidroxi-6-metoxi-3-(2-oxo-propil)-N-metil-2-oxindol (SA-6) e 5-cloro-3-hidroxi-6-metoxi-3-(2-oxo-propil)-N-metil-2-oxindol (SA-7), um tetracetídeo denominado de 3-hidroxi-5-(1-hidroxi-1-fenilpropan-2-il)-2-metil-piran-2-ona (SA-8), além de cinco rifamicinas designadas de salinirrifamicinas A-E (SA-9 a SA-13). Para fracionamento e isolamento dos compostos foram utilizadas técnicas cromatográficas como extração em fase sólida (SPE-C18), Sephadex LH-20 e cromatografia líquida de alta eficiência (CLAE). A determinação estrutural dos compostos isolados foi realizada através de técnicas espectroscópicas tais como ressonância magnética de 1H e 13C (RMN 1H e 13C, 1D e 2D), espectrometria de massas (EM), análise de difração de raios-X monocristal e por fim, comparação com dados da literatura para compostos análogos. Os compostos isolados de S. arenicola foram submetidos a testes antibacterianos utilizando cepas de Staphylococcus aureus incluindo uma cepa resistente à meticilina, Enterococcus faecalis, também incluindo uma cepa resistente à vancomicina, e Escherichia coli. As salinirrifamicinas SA-9, SA-10, SA-11 e SA-13 mostram potente atividade contra S. aureus e E. faecalis com valores de CIM variando entre 0,02 a 3,1 µg/mL. Salinirrifamicina A (SA-9), o primeiro exemplo natural de rifamicina com um sistema tetracíclico 5/6/6/6 fundido com piridina isolado de Salinispora, revelou uma atividade (CIM de 0,02 µg / mL) semelhante à rifampicina usada como controle positivo (CIM 0,03 µg/mL), enquanto a salinaftoquinona B (SA-2) mostrou moderada atividade contra S. aureus e E. faecalis com valores de CIM variando entre 15,6-125,0 µg/mL.Bactéria marinhaSalinispora arenicolaAminonaftoquinonasRifamicinasAtividade antimicrobianaNovos compostos com propriedades antibióticas de Salinispora arenicola, uma bactéria associada ao sedimento marinho do Arquipélago de São Pedro e São PauloNew compounds with antibiotic properties of Salinispora arenicola, a bacterium associated with the marine sediment of the São Pedro and São Paulo Archipelagoinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisporreponame:Repositório Institucional da Universidade Federal do Ceará (UFC)instname:Universidade Federal do Ceará (UFC)instacron:UFCinfo:eu-repo/semantics/openAccessORIGINAL2021_tese_absilva.pdf2021_tese_absilva.pdfapplication/pdf10977419http://repositorio.ufc.br/bitstream/riufc/62758/8/2021_tese_absilva.pdfbc16f7ceb33ef794acb3afbe9b3c25c7MD58LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748http://repositorio.ufc.br/bitstream/riufc/62758/7/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD57riufc/627582023-12-04 09:33:38.346oai:repositorio.ufc.br:riufc/62758Tk9URTogUExBQ0UgWU9VUiBPV04gTElDRU5TRSBIRVJFClRoaXMgc2FtcGxlIGxpY2Vuc2UgaXMgcHJvdmlkZWQgZm9yIGluZm9ybWF0aW9uYWwgcHVycG9zZXMgb25seS4KCk5PTi1FWENMVVNJVkUgRElTVFJJQlVUSU9OIExJQ0VOU0UKCkJ5IHNpZ25pbmcgYW5kIHN1Ym1pdHRpbmcgdGhpcyBsaWNlbnNlLCB5b3UgKHRoZSBhdXRob3Iocykgb3IgY29weXJpZ2h0Cm93bmVyKSBncmFudHMgdG8gRFNwYWNlIFVuaXZlcnNpdHkgKERTVSkgdGhlIG5vbi1leGNsdXNpdmUgcmlnaHQgdG8gcmVwcm9kdWNlLAp0cmFuc2xhdGUgKGFzIGRlZmluZWQgYmVsb3cpLCBhbmQvb3IgZGlzdHJpYnV0ZSB5b3VyIHN1Ym1pc3Npb24gKGluY2x1ZGluZwp0aGUgYWJzdHJhY3QpIHdvcmxkd2lkZSBpbiBwcmludCBhbmQgZWxlY3Ryb25pYyBmb3JtYXQgYW5kIGluIGFueSBtZWRpdW0sCmluY2x1ZGluZyBidXQgbm90IGxpbWl0ZWQgdG8gYXVkaW8gb3IgdmlkZW8uCgpZb3UgYWdyZWUgdGhhdCBEU1UgbWF5LCB3aXRob3V0IGNoYW5naW5nIHRoZSBjb250ZW50LCB0cmFuc2xhdGUgdGhlCnN1Ym1pc3Npb24gdG8gYW55IG1lZGl1bSBvciBmb3JtYXQgZm9yIHRoZSBwdXJwb3NlIG9mIHByZXNlcnZhdGlvbi4KCllvdSBhbHNvIGFncmVlIHRoYXQgRFNVIG1heSBrZWVwIG1vcmUgdGhhbiBvbmUgY29weSBvZiB0aGlzIHN1Ym1pc3Npb24gZm9yCnB1cnBvc2VzIG9mIHNlY3VyaXR5LCBiYWNrLXVwIGFuZCBwcmVzZXJ2YXRpb24uCgpZb3UgcmVwcmVzZW50IHRoYXQgdGhlIHN1Ym1pc3Npb24gaXMgeW91ciBvcmlnaW5hbCB3b3JrLCBhbmQgdGhhdCB5b3UgaGF2ZQp0aGUgcmlnaHQgdG8gZ3JhbnQgdGhlIHJpZ2h0cyBjb250YWluZWQgaW4gdGhpcyBsaWNlbnNlLiBZb3UgYWxzbyByZXByZXNlbnQKdGhhdCB5b3VyIHN1Ym1pc3Npb24gZG9lcyBub3QsIHRvIHRoZSBiZXN0IG9mIHlvdXIga25vd2xlZGdlLCBpbmZyaW5nZSB1cG9uCmFueW9uZSdzIGNvcHlyaWdodC4KCklmIHRoZSBzdWJtaXNzaW9uIGNvbnRhaW5zIG1hdGVyaWFsIGZvciB3aGljaCB5b3UgZG8gbm90IGhvbGQgY29weXJpZ2h0LAp5b3UgcmVwcmVzZW50IHRoYXQgeW91IGhhdmUgb2J0YWluZWQgdGhlIHVucmVzdHJpY3RlZCBwZXJtaXNzaW9uIG9mIHRoZQpjb3B5cmlnaHQgb3duZXIgdG8gZ3JhbnQgRFNVIHRoZSByaWdodHMgcmVxdWlyZWQgYnkgdGhpcyBsaWNlbnNlLCBhbmQgdGhhdApzdWNoIHRoaXJkLXBhcnR5IG93bmVkIG1hdGVyaWFsIGlzIGNsZWFybHkgaWRlbnRpZmllZCBhbmQgYWNrbm93bGVkZ2VkCndpdGhpbiB0aGUgdGV4dCBvciBjb250ZW50IG9mIHRoZSBzdWJtaXNzaW9uLgoKSUYgVEhFIFNVQk1JU1NJT04gSVMgQkFTRUQgVVBPTiBXT1JLIFRIQVQgSEFTIEJFRU4gU1BPTlNPUkVEIE9SIFNVUFBPUlRFRApCWSBBTiBBR0VOQ1kgT1IgT1JHQU5JWkFUSU9OIE9USEVSIFRIQU4gRFNVLCBZT1UgUkVQUkVTRU5UIFRIQVQgWU9VIEhBVkUKRlVMRklMTEVEIEFOWSBSSUdIVCBPRiBSRVZJRVcgT1IgT1RIRVIgT0JMSUdBVElPTlMgUkVRVUlSRUQgQlkgU1VDSApDT05UUkFDVCBPUiBBR1JFRU1FTlQuCgpEU1Ugd2lsbCBjbGVhcmx5IGlkZW50aWZ5IHlvdXIgbmFtZShzKSBhcyB0aGUgYXV0aG9yKHMpIG9yIG93bmVyKHMpIG9mIHRoZQpzdWJtaXNzaW9uLCBhbmQgd2lsbCBub3QgbWFrZSBhbnkgYWx0ZXJhdGlvbiwgb3RoZXIgdGhhbiBhcyBhbGxvd2VkIGJ5IHRoaXMKbGljZW5zZSwgdG8geW91ciBzdWJtaXNzaW9uLgo=Repositório InstitucionalPUBhttp://www.repositorio.ufc.br/ri-oai/requestbu@ufc.br || repositorio@ufc.bropendoar:2023-12-04T12:33:38Repositório Institucional da Universidade Federal do Ceará (UFC) - Universidade Federal do Ceará (UFC)false |
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