Estudos de potenciais inibidores da enzima Tirosina Quinase de Bruton

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2014
Autor(a) principal: Garcia, Letícia Santos
Orientador(a): Cunha, Elaine Fontes Ferreira da
Banca de defesa: Mancini, Daiana Teixeira, Caetano, Melissa Soares, Ramalho, Teodorico de Castro
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS
Programa de Pós-Graduação: DQI - Programa de Pós-graduação
Departamento: Não Informado pela instituição
País: BRASIL
Palavras-chave em Português:
Linfócito B
Tirosina Quinase de Bruton
Ancoramento molecular
QSAR-4D DR
Bruton’s Tyrosine Kinase
Molecular docking
RD 4D-QSAR
B-lymphocyte
Área do conhecimento CNPq:
CNPQ_NÃO_INFORMADO
Link de acesso: https://repositorio.ufla.br/handle/1/2179
Resumo: Dissertação apresentada à Universidade Federal de Lavras, como parte das exigências do Programa de Pós-Graduação em Agroquímica, área de concentração em Agroquímica, para a obtenção do título de Mestre.
id UFLA_75f45341b630e080ffcdaf74f2ec253e
oai_identifier_str oai:repositorio.ufla.br:1/2179
network_acronym_str UFLA
network_name_str Repositório Institucional da UFLA
repository_id_str
spelling 2014-08-05T12:28:24Z2014-02-272014-08-05T12:28:24Z201420142014-02-27GARCIA, L. S. Estudos de potenciais inibidores da enzima Tirosina Quinase de Bruton. 2014. 100 p. Dissertação (Mestrado em Agroquímica) - Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2014.https://repositorio.ufla.br/handle/1/2179Dissertação apresentada à Universidade Federal de Lavras, como parte das exigências do Programa de Pós-Graduação em Agroquímica, área de concentração em Agroquímica, para a obtenção do título de Mestre.A Tirosina Quinase de Bruton (Btk) é uma enzima importante para o desenvolvimento e diferenciação dos linfócitos B. Além disso, a expressão da Btk é considerada como essencial para a proliferação e sobrevivência dessas células. A inibição da Btk tem se tornado um alvo atrativo para o tratamento de doenças autoimunes, leucemias e linfomas de células B. Objetivando-se propor novos candidatos a fármacos inibidores da Btk, técnicas computacionais foram aplicadas neste estudo. Foi realizado um estudo de ancoramento molecular a fim de avaliar o modo de interação de 96 inibidores nicotinamídicos da Btk (DELUCCA et al., 2010). Os valores dos termos de energia para as melhores conformações ancoradas mostrou um coeficiente de determinação de 0,80. A metodologia de QSAR-4D DR também foi utilizada. As conformações obtidas por simulação da dinâmica molecular foram sobrepostas, de acordo com os três alinhamentos testados, em uma caixa virtual tridimensional composta por células de 2 e 5Å. Os modelos foram gerados pela técnica combinada de algoritmos genéticos (GA, do inglês Genetic Algorithm) e mínimos quadrados parciais (PLS, do ingês Partial Least Square). O melhor modelo gerou valores de validação cruzada ajustado (q2ajustado) e coeficiente de determinação (R2) de 0,67 e 0,74, respectivamente. A análise do QSAR-4D DR, além de corroborar com os resultados do docking, sugeriu uma boa correlação com os resultados experimentais e, ainda, forneceu informações mais detalhadas do que o ancoramento molecular. A boa potência predita para o composto M2 proposto indica que este composto é um potencial candidato a inibidor da Btk.Bruton’s Tyrosine Kinase (Btk) is an important enzyme in B-lymphocyte development and differentiation. Furthermore, Btk expression is considered essential for the proliferation and survival of these cells. Btk inhibition has become an attractive target for treating autoimmune diseases, and B-cell leukemia and lymphomas. With the objective of proposing new candidates for Btk inhibitor pharmaceuticals, we applied computational techniques in this study. A study using molecular docking was performed in order to evaluate the mode of interaction of 96 nicotinamidic Btk inhibitors (DELUCCA et al., 2010). The energy term values of the best docked conformations showed a coefficient of correlation (R2) equal to 0.80. We aslo used the receptor-dependent four-dimensional quantitative structure-activity relationship (RD 4D-QSAR) methodology. The conformations obtained by molecular dynamic simulation were overlapped in a virtual three dimensional box comprised of 2 and 5Å cells, according to the three trial alignments. The models were generated by a combined genetic algorithm (GA) and partial least squares (PLS) regression technique. The best model generated adjusted cross-validate value (q2adjusted) and correlation coefficient value (R2) of 0.67 and 0.74, respectively. The RD 4D-QSAR analysis, in addition to corroborating with the docking results, suggested a good correlation with the experimental results and provided more detailed information than the molecular docking. The good potency predicted for the proposed M2 compound indicates this compound as a potential candidate of Btk inhibitor.Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)AgroquímicaUNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRASDQI - Programa de Pós-graduaçãoUFLABRASILCNPQ_NÃO_INFORMADOLinfócito BTirosina Quinase de BrutonAncoramento molecularQSAR-4D DRBruton’s Tyrosine KinaseMolecular dockingRD 4D-QSARB-lymphocyteEstudos de potenciais inibidores da enzima Tirosina Quinase de Brutoninfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisCunha, Elaine Fontes Ferreira daMancini, Daiana TeixeiraCaetano, Melissa SoaresRamalho, Teodorico de CastroGarcia, Letícia Santosinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFLAinstname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)instacron:UFLALICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-8953https://repositorio.ufla.br/bitstreams/c0e8b656-4a3e-40ce-a5de-785e9e0cc37d/download760884c1e72224de569e74f79eb87ce3MD52falseAnonymousREADORIGINALDISSERTAÇÃO Estudos de potenciais inibidores da enzima Tirosina Quinase de Bruton.pdfDISSERTAÇÃO Estudos de potenciais inibidores da enzima Tirosina Quinase de Bruton.pdfapplication/pdf1515852https://repositorio.ufla.br/bitstreams/dffca46e-a190-47e2-b4f1-40f73993855a/downloade5b5a119053b37a984ecc4ade401a074MD53trueAnonymousREADTEXTDISSERTAÇÃO Estudos de potenciais inibidores da enzima Tirosina Quinase de Bruton.pdf.txtDISSERTAÇÃO Estudos de potenciais inibidores da enzima Tirosina Quinase de Bruton.pdf.txtExtracted texttext/plain102441https://repositorio.ufla.br/bitstreams/cf73b1e5-8739-4dc2-87b8-dfb6355756ad/download3c996e2f21f0ea3194e41fb64302e879MD54falseAnonymousREADTHUMBNAILDISSERTAÇÃO Estudos de potenciais inibidores da enzima Tirosina Quinase de Bruton.pdf.jpgDISSERTAÇÃO Estudos de potenciais inibidores da enzima Tirosina Quinase de Bruton.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg2759https://repositorio.ufla.br/bitstreams/b78a9216-f672-40aa-b2be-c65966ae9b25/downloadcac77309d3461cbc99709ade4ea9abb7MD55falseAnonymousREAD1/21792025-08-07 07:30:28.339open.accessoai:repositorio.ufla.br:1/2179https://repositorio.ufla.brRepositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufla.br/server/oai/requestnivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.bropendoar:2025-08-07T10:30:28Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)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
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Estudos de potenciais inibidores da enzima Tirosina Quinase de Bruton
title Estudos de potenciais inibidores da enzima Tirosina Quinase de Bruton
spellingShingle Estudos de potenciais inibidores da enzima Tirosina Quinase de Bruton
Garcia, Letícia Santos
CNPQ_NÃO_INFORMADO
Linfócito B
Tirosina Quinase de Bruton
Ancoramento molecular
QSAR-4D DR
Bruton’s Tyrosine Kinase
Molecular docking
RD 4D-QSAR
B-lymphocyte
title_short Estudos de potenciais inibidores da enzima Tirosina Quinase de Bruton
title_full Estudos de potenciais inibidores da enzima Tirosina Quinase de Bruton
title_fullStr Estudos de potenciais inibidores da enzima Tirosina Quinase de Bruton
title_full_unstemmed Estudos de potenciais inibidores da enzima Tirosina Quinase de Bruton
title_sort Estudos de potenciais inibidores da enzima Tirosina Quinase de Bruton
author Garcia, Letícia Santos
author_facet Garcia, Letícia Santos
author_role author
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Cunha, Elaine Fontes Ferreira da
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Mancini, Daiana Teixeira
Caetano, Melissa Soares
Ramalho, Teodorico de Castro
dc.contributor.author.fl_str_mv Garcia, Letícia Santos
contributor_str_mv Cunha, Elaine Fontes Ferreira da
Mancini, Daiana Teixeira
Caetano, Melissa Soares
Ramalho, Teodorico de Castro
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CNPQ_NÃO_INFORMADO
topic CNPQ_NÃO_INFORMADO
Linfócito B
Tirosina Quinase de Bruton
Ancoramento molecular
QSAR-4D DR
Bruton’s Tyrosine Kinase
Molecular docking
RD 4D-QSAR
B-lymphocyte
dc.subject.por.fl_str_mv Linfócito B
Tirosina Quinase de Bruton
Ancoramento molecular
QSAR-4D DR
Bruton’s Tyrosine Kinase
Molecular docking
RD 4D-QSAR
B-lymphocyte
description Dissertação apresentada à Universidade Federal de Lavras, como parte das exigências do Programa de Pós-Graduação em Agroquímica, área de concentração em Agroquímica, para a obtenção do título de Mestre.
publishDate 2014
dc.date.copyright.none.fl_str_mv 2014
dc.date.submitted.none.fl_str_mv 2014-02-27
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2014-08-05T12:28:24Z
dc.date.available.fl_str_mv 2014-02-27
2014-08-05T12:28:24Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2014
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv GARCIA, L. S. Estudos de potenciais inibidores da enzima Tirosina Quinase de Bruton. 2014. 100 p. Dissertação (Mestrado em Agroquímica) - Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2014.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.ufla.br/handle/1/2179
identifier_str_mv GARCIA, L. S. Estudos de potenciais inibidores da enzima Tirosina Quinase de Bruton. 2014. 100 p. Dissertação (Mestrado em Agroquímica) - Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2014.
url https://repositorio.ufla.br/handle/1/2179
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS
dc.publisher.program.fl_str_mv DQI - Programa de Pós-graduação
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFLA
dc.publisher.country.fl_str_mv BRASIL
publisher.none.fl_str_mv UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFLA
instname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)
instacron:UFLA
instname_str Universidade Federal de Lavras (UFLA)
instacron_str UFLA
institution UFLA
reponame_str Repositório Institucional da UFLA
collection Repositório Institucional da UFLA
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufla.br/bitstreams/c0e8b656-4a3e-40ce-a5de-785e9e0cc37d/download
https://repositorio.ufla.br/bitstreams/dffca46e-a190-47e2-b4f1-40f73993855a/download
https://repositorio.ufla.br/bitstreams/cf73b1e5-8739-4dc2-87b8-dfb6355756ad/download
https://repositorio.ufla.br/bitstreams/b78a9216-f672-40aa-b2be-c65966ae9b25/download
bitstream.checksum.fl_str_mv 760884c1e72224de569e74f79eb87ce3
e5b5a119053b37a984ecc4ade401a074
3c996e2f21f0ea3194e41fb64302e879
cac77309d3461cbc99709ade4ea9abb7
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)
repository.mail.fl_str_mv nivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.br
_version_ 1854947788777848832

Registros relacionados