Pesquisa de variantes digênicas em genes relacionados à herança autossômica dominante em pacientes brasileiros com calcificação cerebral familial primária

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2021
Autor(a) principal: MEDEIROS, Rayssa Leal Borges de
Orientador(a): OLIVEIRA, João Ricardo Mendes de
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de Pernambuco
Programa de Pós-Graduação: Programa de Pos Graduacao em Biologia Aplicada a Saude
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Brasil
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/42420
Resumo: A calcificação cerebral familial primária (CCFP), amplamente conhecida por doença de Fahr, é uma desordem neuropsiquiátrica ocasionada por variantes patogênicas nos genes SLC20A2, PDGFB, PDGFRB, XPR1, MYORG ou JAM2. É caracterizada pela deposição ectópica de fosfato de cálcio principalmente nos gânglios da base, apresentando-se em padrão bilateral e simétrico. Pacientes com CCFP apresentam amplo espectro de sinais e sintomas, que incluem alterações motoras, cognitivas e psiquiátricas. Entretanto, é bem estabelecido que pacientes com essa doença apresentam alta heterogeneidade clínica inter e intrafamiliar, não identificando-se, ainda, a origem genética capaz de promover tal heterogeneidade. Porém, estudos recentes vêm mostrando que variantes em segundo gene (não associado à CCFP), foram identificadas em pacientes previamente diagnosticados com CCFP, promovendo nos indivíduos afetados um fenótipo complexo e heterogêneo. Nesse contexto, nosso estudo objetivou a pesquisa de variantes patogênicas em um segundo gene relacionado à CCFP e associado à herança autossômica dominante (SLC20A2, PDGFB, PDGFRB e XPR1). A coorte é composta por 13 pacientes brasileiros previamente diagnosticados com CCFP. Após a triagem por sequenciamento de Sanger, foram identificadas 25 variantes de nucleotídeos únicos (SNVs). O rs246391 (c.3137+4A>G), identificado em dois pacientes em heterozigose e dois em homozigose, se destacou por estar localizado próximo a um sítio de splicing. A análise in silico sugere que a variante altere o splicing e, consequentemente, a função proteica. Nosso estudo não conseguiu resultado significativo sobre a análise de expressão do transcrito. Entretanto, pela alta frequência populacional (MAF: 0.30) e por ser considerada benigna por banco de dados, acreditamos que esta variante não atue modulando as manifestações clínicas dos pacientes portadores das variantes. Assim, nosso estudo não identificou nenhuma variante patogênica em um segundo gene relacionado à herança autossômica da CCFP que esclareça tal complexidade fenotípica.
id UFPE_4f7000eeba7964e6504ebb47101474d2
oai_identifier_str oai:repositorio.ufpe.br:123456789/42420
network_acronym_str UFPE
network_name_str Repositório Institucional da UFPE
repository_id_str
spelling MEDEIROS, Rayssa Leal Borges dehttp://lattes.cnpq.br/2614615977036047http://lattes.cnpq.br/6651024132073862OLIVEIRA, João Ricardo Mendes de2022-01-05T17:54:51Z2022-01-05T17:54:51Z2021-06-18MEDEIROS, Rayssa Leal Borges de. Pesquisa de variantes digênicas em genes relacionados à herança autossômica dominante em pacientes brasileiros com calcificação cerebral familial primária. 2021. Tese (Doutorado em Biologia Aplicada à Saúde) - Universidade Federal de Pernambuco, Recife, 2021.https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/42420A calcificação cerebral familial primária (CCFP), amplamente conhecida por doença de Fahr, é uma desordem neuropsiquiátrica ocasionada por variantes patogênicas nos genes SLC20A2, PDGFB, PDGFRB, XPR1, MYORG ou JAM2. É caracterizada pela deposição ectópica de fosfato de cálcio principalmente nos gânglios da base, apresentando-se em padrão bilateral e simétrico. Pacientes com CCFP apresentam amplo espectro de sinais e sintomas, que incluem alterações motoras, cognitivas e psiquiátricas. Entretanto, é bem estabelecido que pacientes com essa doença apresentam alta heterogeneidade clínica inter e intrafamiliar, não identificando-se, ainda, a origem genética capaz de promover tal heterogeneidade. Porém, estudos recentes vêm mostrando que variantes em segundo gene (não associado à CCFP), foram identificadas em pacientes previamente diagnosticados com CCFP, promovendo nos indivíduos afetados um fenótipo complexo e heterogêneo. Nesse contexto, nosso estudo objetivou a pesquisa de variantes patogênicas em um segundo gene relacionado à CCFP e associado à herança autossômica dominante (SLC20A2, PDGFB, PDGFRB e XPR1). A coorte é composta por 13 pacientes brasileiros previamente diagnosticados com CCFP. Após a triagem por sequenciamento de Sanger, foram identificadas 25 variantes de nucleotídeos únicos (SNVs). O rs246391 (c.3137+4A>G), identificado em dois pacientes em heterozigose e dois em homozigose, se destacou por estar localizado próximo a um sítio de splicing. A análise in silico sugere que a variante altere o splicing e, consequentemente, a função proteica. Nosso estudo não conseguiu resultado significativo sobre a análise de expressão do transcrito. Entretanto, pela alta frequência populacional (MAF: 0.30) e por ser considerada benigna por banco de dados, acreditamos que esta variante não atue modulando as manifestações clínicas dos pacientes portadores das variantes. Assim, nosso estudo não identificou nenhuma variante patogênica em um segundo gene relacionado à herança autossômica da CCFP que esclareça tal complexidade fenotípica.FACEPEPrimary familial brain calcification (PFBC), also known as Fahr’s disease, is a neuropsychiatric disorder caused by pathogenic variants on SLC20A2, PDGFB, PDGFRB, XPR1, MYORG or JAM2 genes. It is characterized by ectopic brain calcification, on symmetrical and bilateral pattern, located mainly in basal ganglia. PFBC patients present a wide spectrum symptoms including motor, cognitive and psychiatric alterations. However, it is well stablished that PFBC individuals also present high clinical intra and interfamilial heterogeneity, where the genetic base of this phenotypic heterogeneity is still not understood. However, recent studies have been shown that variants in a secondary gene, not related to PFBC, were identified in patients previously diagnosed with this disorder, promoting a complex and heterogenous phonotype. Based on this, we aimed in this study to screen pathogenic variants in a second gene associated to autosomal dominant PFBC (SLC20A2, PDGFB, PDGFRB e XPR1) in 13 Brazilian patients. After the Sanger sequencing of intended genes, were identified 25 single nucleotides variants (SNVs). The rs246391 (c.3137+4A>G), identified in four individuals, stood out to be located near to a splice site and predicted to affect splicing, and consequently, the protein function. In spite of that, our gene expression analysis did no show a significant result. Despite this, the high population frequency (MAF: 0.30) and the classification as benign in several data base, this variant seems not acting as modulator of the patient’s clinical manifestations. Thus, no pathogenic variant in a second gene linked to PFBC was identified in our PFBC patients, that could clarify the complex PFBC phenotype. Therefore, still remains necessary that others studies search for variants in a second gene, allowing clarify the complex clinical heterogeneity in PFBC patients.porUniversidade Federal de PernambucoPrograma de Pos Graduacao em Biologia Aplicada a SaudeUFPEBrasilhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/info:eu-repo/semantics/openAccessDoença de FahrDoença digênicaHeterogeneidade clínicaPesquisa de variantes digênicas em genes relacionados à herança autossômica dominante em pacientes brasileiros com calcificação cerebral familial primáriainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisdoutoradoreponame:Repositório Institucional da UFPEinstname:Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)instacron:UFPEORIGINALTESE Rayssa Leal Borges de Medeiros.pdfTESE Rayssa Leal Borges de Medeiros.pdfapplication/pdf1319610https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/42420/1/TESE%20Rayssa%20Leal%20Borges%20de%20Medeiros.pdf2f9f688392ba51a0db8fefaf331a1a66MD51CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8811https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/42420/2/license_rdfe39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34MD52LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82142https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/42420/3/license.txt6928b9260b07fb2755249a5ca9903395MD53TEXTTESE Rayssa Leal Borges de Medeiros.pdf.txtTESE Rayssa Leal Borges de Medeiros.pdf.txtExtracted texttext/plain82272https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/42420/4/TESE%20Rayssa%20Leal%20Borges%20de%20Medeiros.pdf.txt29ed7040967261972963193229e1e756MD54THUMBNAILTESE Rayssa Leal Borges de Medeiros.pdf.jpgTESE Rayssa Leal Borges de Medeiros.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1206https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/42420/5/TESE%20Rayssa%20Leal%20Borges%20de%20Medeiros.pdf.jpg3dc4e6bb6869aaaac275bad000f760cfMD55123456789/424202022-01-06 02:10:37.125oai:repositorio.ufpe.br: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ório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufpe.br/oai/requestattena@ufpe.bropendoar:22212022-01-06T05:10:37Repositório Institucional da UFPE - Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Pesquisa de variantes digênicas em genes relacionados à herança autossômica dominante em pacientes brasileiros com calcificação cerebral familial primária
title Pesquisa de variantes digênicas em genes relacionados à herança autossômica dominante em pacientes brasileiros com calcificação cerebral familial primária
spellingShingle Pesquisa de variantes digênicas em genes relacionados à herança autossômica dominante em pacientes brasileiros com calcificação cerebral familial primária
MEDEIROS, Rayssa Leal Borges de
Doença de Fahr
Doença digênica
Heterogeneidade clínica
title_short Pesquisa de variantes digênicas em genes relacionados à herança autossômica dominante em pacientes brasileiros com calcificação cerebral familial primária
title_full Pesquisa de variantes digênicas em genes relacionados à herança autossômica dominante em pacientes brasileiros com calcificação cerebral familial primária
title_fullStr Pesquisa de variantes digênicas em genes relacionados à herança autossômica dominante em pacientes brasileiros com calcificação cerebral familial primária
title_full_unstemmed Pesquisa de variantes digênicas em genes relacionados à herança autossômica dominante em pacientes brasileiros com calcificação cerebral familial primária
title_sort Pesquisa de variantes digênicas em genes relacionados à herança autossômica dominante em pacientes brasileiros com calcificação cerebral familial primária
author MEDEIROS, Rayssa Leal Borges de
author_facet MEDEIROS, Rayssa Leal Borges de
author_role author
dc.contributor.authorLattes.pt_BR.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/2614615977036047
dc.contributor.advisorLattes.pt_BR.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/6651024132073862
dc.contributor.author.fl_str_mv MEDEIROS, Rayssa Leal Borges de
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv OLIVEIRA, João Ricardo Mendes de
contributor_str_mv OLIVEIRA, João Ricardo Mendes de
dc.subject.por.fl_str_mv Doença de Fahr
Doença digênica
Heterogeneidade clínica
topic Doença de Fahr
Doença digênica
Heterogeneidade clínica
description A calcificação cerebral familial primária (CCFP), amplamente conhecida por doença de Fahr, é uma desordem neuropsiquiátrica ocasionada por variantes patogênicas nos genes SLC20A2, PDGFB, PDGFRB, XPR1, MYORG ou JAM2. É caracterizada pela deposição ectópica de fosfato de cálcio principalmente nos gânglios da base, apresentando-se em padrão bilateral e simétrico. Pacientes com CCFP apresentam amplo espectro de sinais e sintomas, que incluem alterações motoras, cognitivas e psiquiátricas. Entretanto, é bem estabelecido que pacientes com essa doença apresentam alta heterogeneidade clínica inter e intrafamiliar, não identificando-se, ainda, a origem genética capaz de promover tal heterogeneidade. Porém, estudos recentes vêm mostrando que variantes em segundo gene (não associado à CCFP), foram identificadas em pacientes previamente diagnosticados com CCFP, promovendo nos indivíduos afetados um fenótipo complexo e heterogêneo. Nesse contexto, nosso estudo objetivou a pesquisa de variantes patogênicas em um segundo gene relacionado à CCFP e associado à herança autossômica dominante (SLC20A2, PDGFB, PDGFRB e XPR1). A coorte é composta por 13 pacientes brasileiros previamente diagnosticados com CCFP. Após a triagem por sequenciamento de Sanger, foram identificadas 25 variantes de nucleotídeos únicos (SNVs). O rs246391 (c.3137+4A>G), identificado em dois pacientes em heterozigose e dois em homozigose, se destacou por estar localizado próximo a um sítio de splicing. A análise in silico sugere que a variante altere o splicing e, consequentemente, a função proteica. Nosso estudo não conseguiu resultado significativo sobre a análise de expressão do transcrito. Entretanto, pela alta frequência populacional (MAF: 0.30) e por ser considerada benigna por banco de dados, acreditamos que esta variante não atue modulando as manifestações clínicas dos pacientes portadores das variantes. Assim, nosso estudo não identificou nenhuma variante patogênica em um segundo gene relacionado à herança autossômica da CCFP que esclareça tal complexidade fenotípica.
publishDate 2021
dc.date.issued.fl_str_mv 2021-06-18
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2022-01-05T17:54:51Z
dc.date.available.fl_str_mv 2022-01-05T17:54:51Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv MEDEIROS, Rayssa Leal Borges de. Pesquisa de variantes digênicas em genes relacionados à herança autossômica dominante em pacientes brasileiros com calcificação cerebral familial primária. 2021. Tese (Doutorado em Biologia Aplicada à Saúde) - Universidade Federal de Pernambuco, Recife, 2021.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/42420
identifier_str_mv MEDEIROS, Rayssa Leal Borges de. Pesquisa de variantes digênicas em genes relacionados à herança autossômica dominante em pacientes brasileiros com calcificação cerebral familial primária. 2021. Tese (Doutorado em Biologia Aplicada à Saúde) - Universidade Federal de Pernambuco, Recife, 2021.
url https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/42420
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Pernambuco
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de Pos Graduacao em Biologia Aplicada a Saude
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFPE
dc.publisher.country.fl_str_mv Brasil
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Pernambuco
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFPE
instname:Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)
instacron:UFPE
instname_str Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)
instacron_str UFPE
institution UFPE
reponame_str Repositório Institucional da UFPE
collection Repositório Institucional da UFPE
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/42420/1/TESE%20Rayssa%20Leal%20Borges%20de%20Medeiros.pdf
https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/42420/2/license_rdf
https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/42420/3/license.txt
https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/42420/4/TESE%20Rayssa%20Leal%20Borges%20de%20Medeiros.pdf.txt
https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/42420/5/TESE%20Rayssa%20Leal%20Borges%20de%20Medeiros.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv 2f9f688392ba51a0db8fefaf331a1a66
e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34
6928b9260b07fb2755249a5ca9903395
29ed7040967261972963193229e1e756
3dc4e6bb6869aaaac275bad000f760cf
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFPE - Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)
repository.mail.fl_str_mv attena@ufpe.br
_version_ 1862742068299825152