Estudo de associação do polimorfismo R577X do gene ACTN3 com variações da região promotora do gene DPP3 em pacientes em hemodiálise

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2025
Autor(a) principal: Scheer, Alice Künzgen
Orientador(a): Barros, Carlos Castilho de
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de Pelotas
Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Nutrição e Alimentos
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Brasil
Palavras-chave em Português:
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/handle/prefix/17532
Resumo: A Doença Renal Crônica (DRC) é um sério problema de saúde pública, com prognóstico preocupante. Embora diabetes e hipertensão sejam fatores centrais, a predisposição genética tem se destacado como elemento chave no risco e na progressão da doença. Estudos prévios conduzidos em nosso laboratório identificaram uma maior frequência do alelo “X” do polimorfismo R577X do gene (alfa-actinina-3) ACTN3 em pacientes em hemodiálise. Dado que o gene ACTN3 possui expressão limitada nos tecidos renais, levantou-se a hipótese de que essa associação pudesse decorrer de desequilíbrio de ligação com variantes em genes vizinhos, como o DPP3, localizado a aproximadamente 37 mil pares de base de distância e envolvido em vias de estresse oxidativo e regulação da pressão arterial. Diante disso, este trabalho teve como objetivo investigar possíveis associações entre variações genéticas na região promotora do gene DPP3 e o polimorfismo R577X do gene ACTN3 em pacientes com DRC em hemodiálise. Foram analisadas 20 amostras de DNA de pacientes homozigotos para o polimorfismo (10 RR e 10 XX), por meio de genotipagem e sequenciamento. A região de cobertura escolhida para análise foi a região promotora proximal, primeiro éxon e início do primeiro íntron do gene DPP3. A seleção dessa região teve como objetivo abranger elementos funcionais essenciais, como a caixa TATA e Open Reading Frame. Sete variações foram identificadas, das quais cinco são inéditas em bancos de dados públicos. As variações das posições -209 (rs2279863) e -61 (rs2279864) e seus respectivos polimorfismos já conhecidos apresentaram frequência suficiente para avaliação de associação com os genótipos do polimorfismo em estudo. Embora a variante rs2279864 (-61 G>A) tenha sido observada exclusivamente em indivíduos com o genótipo RR para ACTN3, a análise estatística (teste exato de Fisher) não indicou associação significativa (p = 0,2105), apesar da tendência observada. Já o polimorfismo rs2279863 (-209 G>T) apresentou distribuição simétrica entre os genótipos RR e XX, sem qualquer indicação de associação (p > 0,9999). Apesar da ausência de associações estatisticamente significativas, os resultados indicam alta variabilidade genética local, sugerindo a necessidade de investigações adicionais em amostras ampliadas.
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Dado que o gene ACTN3 possui expressão limitada nos tecidos renais, levantou-se a hipótese de que essa associação pudesse decorrer de desequilíbrio de ligação com variantes em genes vizinhos, como o DPP3, localizado a aproximadamente 37 mil pares de base de distância e envolvido em vias de estresse oxidativo e regulação da pressão arterial. Diante disso, este trabalho teve como objetivo investigar possíveis associações entre variações genéticas na região promotora do gene DPP3 e o polimorfismo R577X do gene ACTN3 em pacientes com DRC em hemodiálise. Foram analisadas 20 amostras de DNA de pacientes homozigotos para o polimorfismo (10 RR e 10 XX), por meio de genotipagem e sequenciamento. A região de cobertura escolhida para análise foi a região promotora proximal, primeiro éxon e início do primeiro íntron do gene DPP3. A seleção dessa região teve como objetivo abranger elementos funcionais essenciais, como a caixa TATA e Open Reading Frame. Sete variações foram identificadas, das quais cinco são inéditas em bancos de dados públicos. As variações das posições -209 (rs2279863) e -61 (rs2279864) e seus respectivos polimorfismos já conhecidos apresentaram frequência suficiente para avaliação de associação com os genótipos do polimorfismo em estudo. Embora a variante rs2279864 (-61 G>A) tenha sido observada exclusivamente em indivíduos com o genótipo RR para ACTN3, a análise estatística (teste exato de Fisher) não indicou associação significativa (p = 0,2105), apesar da tendência observada. Já o polimorfismo rs2279863 (-209 G>T) apresentou distribuição simétrica entre os genótipos RR e XX, sem qualquer indicação de associação (p > 0,9999). Apesar da ausência de associações estatisticamente significativas, os resultados indicam alta variabilidade genética local, sugerindo a necessidade de investigações adicionais em amostras ampliadas.Chronic Kidney Disease (CKD) is a serious public health problem with a worrying prognosis. Although diabetes and hypertension are central factors, genetic predisposition has emerged as a key element in disease risk and progression. Previous studies conducted in our laboratory identified a higher frequency of the "X" allele of the R577X polymorphism of the ACTN3 gene (Alpha-Actinin-3) in hemodialysis patients. Given that the ACTN3 gene has limited expression in renal tissue, we hypothesized that this association could result from linkage disequilibrium with variants in neighboring genes, such as DPP3, located approximately 37,000 base pairs away and involved in oxidative stress pathways and blood pressure regulation. Therefore, this study aimed to investigate possible associations between genetic variations in the promoter region of the DPP3 gene and the R577X polymorphism of the ACTN3 gene in CKD patients on hemodialysis. Twenty DNA samples from patients homozygous for the polymorphism (10 RR and 10 XX) were analyzed by genotyping and sequencing. The coverage region chosen for analysis was the proximal promoter region, the first exon, and the beginning of the first intron of the DPP3 gene. This region was selected to encompass essential functional elements, such as the TATA box and open reading frame. Seven variations were identified, five of which are new to public databases. Variations at positions -209 (rs2279863) and -61 (rs2279864) and their respective known polymorphisms presented sufficient frequency to assess their association with the genotypes of the polymorphism under study. Although the rs2279864 (-61 G>A) variant was observed exclusively in individuals with the RR genotype for ACTN3, statistical analysis (Fisher's exact test) did not indicate a significant association (p = 0.2105), despite the observed trend. The rs2279863 (-209 G>T) polymorphism showed a symmetrical distribution between the RR and XX genotypes, with no indication of association (p > 0.9999). Despite the absence of statistically significant associations, the results indicate high local genetic variability, suggesting the need for further investigations in larger samples.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESporUniversidade Federal de PelotasPrograma de Pós-Graduação em Nutrição e AlimentosUFPelBrasilCC BY-NC-SAinfo:eu-repo/semantics/openAccessCIENCIAS DA SAUDENUTRICAODoença renalACTN3DPP3Desequilíbrio de ligaçãors1815739Kidney diseaseLinkage disequilibriumEstudo de associação do polimorfismo R577X do gene ACTN3 com variações da região promotora do gene DPP3 em pacientes em hemodiáliseAssociation study of the R577X polymorphism of the ACTN3 gene with variations in the promoter region of the DPP3 gene in hemodialysis patientsinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesishttp://lattes.cnpq.br/3111329035255282http://lattes.cnpq.br/7429609548804288Barros, Carlos Castilho deScheer, Alice Künzgenreponame:Repositório Institucional da UFPel - Guaiacainstname:Universidade Federal de Pelotas (UFPEL)instacron:UFPELORIGINALDissertação_Alice Künzgen Scheer.pdfDissertação_Alice Künzgen Scheer.pdfapplication/pdf878486http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/17532/1/Disserta%c3%a7%c3%a3o_Alice%20K%c3%bcnzgen%20Scheer.pdf3e3db5f564b34eb2d3db8c10add9d2adMD51open accessLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; 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