Análise das sequências de nucleotídeos de novos subtipos de toxinas e proteínas de anêmonas do mar por sequenciamento de RNA de nova geração

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2017
Autor(a) principal: Boralli, Leandro Augusto Freire [UNIFESP]
Orientador(a): Kerkis, Irina [UNIFESP]
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
dARK ID: ark:/48912/001300001pf2v
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Anemonas
Bunodosoma
Toxinas
RNA-Seq
Palavras-chave em Inglês:
Anemones
Bunodosoma
Toxins
RNA-Seq
Link de acesso: https://sucupira.capes.gov.br/sucupira/public/consultas/coleta/trabalhoConclusao/viewTrabalhoConclusao.jsf?popup=true&id_trabalho=5031725
http://repositorio.unifesp.br/handle/11600/50217
Resumo: As anêmonas do mar são organismos sésseis que empregam um aparato peçonhento (localizado preferencialmente em seus tentáculos) para produzir e inocular toxinas paralisantes em suas presas ou para defender-se. Nosso grupo contribuiu recentemente na caracterização do peptidoma de 3 espécies de anêmonas do mar, mostrando que a diversidade molecular das toxinas desses organismos é muito maior que o esperado. Do ponto de vista da informação nucleotídica obtida das anêmonas, poucas espécies foram investigadas em detalhe, revelando que no momento apenas uma pequena fração do arsenal tóxico dos cnidários foi investigado. Adicionalmente, novas proteínas estruturais que ocorrem em anêmonas apresentam uma similaridade gênica e estrutural impressionante com proteínas de organismos derivados, tal como vertebrados. Neste sentido, pretendemos analisar e comparar o transcriptoma de duas populações da anêmona brasileira Bunodosoma caissarum, uma população da costa de São Paulo e outra população localizada no arquipélago isolado São Pedro e São Paulo. Essa análise será feita através do sequenciamento de RNA de nova geração, pelo sistema Illumina. Com esse sequenciamento e com análises de bioinformática esperamos encontrar informações referentes a novas toxinas nunca antes estudadas nessa espécie e também analisar as diferenças no perfil de expressão entre as duas populações
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Adicionalmente, novas proteínas estruturais que ocorrem em anêmonas apresentam uma similaridade gênica e estrutural impressionante com proteínas de organismos derivados, tal como vertebrados. Neste sentido, pretendemos analisar e comparar o transcriptoma de duas populações da anêmona brasileira Bunodosoma caissarum, uma população da costa de São Paulo e outra população localizada no arquipélago isolado São Pedro e São Paulo. Essa análise será feita através do sequenciamento de RNA de nova geração, pelo sistema Illumina. Com esse sequenciamento e com análises de bioinformática esperamos encontrar informações referentes a novas toxinas nunca antes estudadas nessa espécie e também analisar as diferenças no perfil de expressão entre as duas populaçõesSea anemones are sessile organisms that employ a venomous apparatus (preferably located in their tentacles) to produce and inoculate paralyzing toxins in their prey or to defend themselves. Our group recently contributed to the characterization of the peptidoma of 3 species of sea anemones, showing that the molecular diversity of the toxins of these organisms is much higher than expected. From the point of view of the nucleotide information obtained from anemones, few species were investigated in detail, revealing that at the moment only a small fraction of the toxic arsenal of the cnidarians was investigated. In addition, new structural proteins that occur in anemones present structural and genetic similarity to proteins of derived organisms, such as vertebrates. In this sense, we intend to analyze and compare the transcriptome of two populations of the Brazilian anemone Bunodosoma caissarum, a population of the São Paulo coast and another population located in the isolated São Pedro and São Paulo archipelago. This analysis will be done through the sequencing of new generation RNA, by the Illumina system. With this sequencing and with bioinformatics analyzes we hope to find information regarding new toxins never before studied in this species and also to analyze the differences in the expression profile between the two populationsDados abertos - Sucupira - Teses e dissertações (2017)83 f.https://sucupira.capes.gov.br/sucupira/public/consultas/coleta/trabalhoConclusao/viewTrabalhoConclusao.jsf?popup=true&id_trabalho=5031725http://repositorio.unifesp.br/handle/11600/50217ark:/48912/001300001pf2vporUniversidade Federal de São Paulo (UNIFESP)info:eu-repo/semantics/openAccessAnemonasBunodosomaToxinasRNA-SeqAnemonesBunodosomaToxinsRNA-SeqAnálise das sequências de nucleotídeos de novos subtipos de toxinas e proteínas de anêmonas do mar por sequenciamento de RNA de nova geraçãoAnalysis of nucleotide sequences of new toxin subtypes and proteins of sea anemones by next-generation sequencing of RNAinfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionreponame:Repositório Institucional da UNIFESPinstname:Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)instacron:UNIFESPEscola Paulista de Medicina (EPM)Biologia estrutural e funcionalBiologia Celular e MolecularBiologia Estrutural e Funcional AplicadaORIGINALLeandro Augusto Freire Boralli PDF A.pdfLeandro Augusto Freire Boralli PDF A.pdfDissertação de mestradoapplication/pdf3122547https://repositorio.unifesp.br/bitstreams/02ec25e1-2c85-4ef4-bc97-a7431fc5a499/download30abf01857837cbb330930da4438f104MD51TEXTLeandro Augusto Freire Boralli PDF A.pdf.txtLeandro Augusto Freire Boralli PDF A.pdf.txtExtracted texttext/plain115924https://repositorio.unifesp.br/bitstreams/fa0fde4c-2d63-44c1-be62-355d367965fc/downloadefa8fb23d4eb77aa732c246c32ad90fdMD52THUMBNAILLeandro Augusto Freire Boralli PDF A.pdf.jpgLeandro Augusto Freire Boralli PDF A.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg2986https://repositorio.unifesp.br/bitstreams/a5899d33-2658-4fda-a139-77535920bbba/download610346071dd1ae9fffef37649c4ce595MD5311600/502172024-08-02 16:23:15.235oai:repositorio.unifesp.br:11600/50217https://repositorio.unifesp.brRepositório InstitucionalPUBhttp://www.repositorio.unifesp.br/oai/requestbiblioteca.csp@unifesp.bropendoar:34652024-08-02T16:23:15Repositório Institucional da UNIFESP - Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)false
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