Diversidade genética do gene MICA em populações mundiais

• Ano de defesa: 2023
• Autor(a) principal: Ciriaco, Viviane Aparecida de Oliveira [UNESP]
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Estadual Paulista (Unesp)
• Palavras-chave em Português: MICA; MICA*del; Diversidade; NGS; Diversity
• Link de acesso: http://hdl.handle.net/11449/250464

O gene MICA codifica glicoproteínas expressas em situações de estresse celular, como no caso de infecções, câncer e estresse oxidativo. Quando MICA é expresso na membrana, a molécula interage com o receptor ativador NKG2D presente na superfície de células Natural Killer (NK), linfócitos Tαβ CD8 e linfócitos Tγδ, levando a morte das células-alvo. Porém, essa proteína pode ser liberada na forma solúvel, quando isso acontece, ela interage com o mesmo receptor ativador NKG2D, mas leva a regulação negativa das células NK. O gene MICA é altamente polimórfico, com mais 531 alelos descritos até o momento, alguns desses polimorfismos apresentam impacto funcional descritos. MICA também pode estar ausente em alguns indivíduos, devido a uma deleção de 100pb que acontece entre os genes HLA-B e MICB, deletando toda a região de MICA, dessa forma, não há produção da molécula de MICA. Assim, este trabalho utilizou um pipeline de bioinformática utilizando o hla-mapper para trabalhar com os polimorfismos dos genes MICA e criamos uma estratégia específica para analisar a deleção do gene. Analisamos a diversidade de MICA em mais de 5.000 amostras de populações do mundo todo, incluindo amostras brasileiras, população altamente miscigenada. Encontramos MICA*del em todas as populações analisadas, exceto na Oceania, com maior frequência na população asiática e americana, especialmente em amostras com ancestralidade nativo americanas. A maioria das amostras com a deleção de MICA, são heterozigotas e apresentam ao menos uma cópia funcional da molécula de MIC, porém encontramos duas amostras com a deleção completa de MICA e MICB nulo, sugerindo que outros mecanismos devem compensar a ausência das moléculas MIC.