Aplicação da equação de Fokker-Planck no estudo de canais iônicos

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2015
Autor(a) principal: Araújo, Marcelo Tozo de [UNESP]
Orientador(a): Drigo Filho, Elso [UNESP]
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Biologia molecular
Biofísica
Física estatística
Processo estocastico
Fokker-Planck, Equação de
Canais ionicos
Link de acesso: http://hdl.handle.net/11449/127824
http://www.athena.biblioteca.unesp.br/exlibris/bd/cathedra/14-09-2015/000846735.pdf
Resumo: Este trabalho versa sobre o emprego da equação de Fokker-Planck (EFP) na descrição da difusão através de canais iônicos presentes na estrutura celular. Os canais possuem grande importância para o funcionamento celular por promoverem o equilíbrio químico entre o meio interno e externo da célula. Este controle do equilíbrio químico é diretamente relacionado à sua capacidade de abertura e fechamento (gating) e seletividade. Inicialmente fazemos uma breve apresentação da equação de Fokker- Planck mostrando sua relação com a equação de Langevin e os métodos de solução para diferentes modelos. Dentre os modelos mencionados focamos a adoção de diferentes dependências temporais no termo referente ao drift e no coeficiente de difusão. Para estes casos as soluções foram obtidas por meio de um ansatz. Em seguida, buscamos associar estes modelos matemáticos de EFP com a difusão através de canais iônicos, mas desconsiderando o gating. Esta associação é feita através da descrição da mudança de potencial na membrana plasmática quando íons fluem entre o meio interno e externo da célula. Outro aspecto abordado em um dos modelos foi descrever a difusão quando há o fechamento do canal com o tempo. O resultado obtido para este exemplo foi comparado a dados da literatura. Por fim, apresentamos uma breve discussão sobre a equação de Fokker-Planck em um sistema de coordenadas cilíndricas
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Este controle do equilíbrio químico é diretamente relacionado à sua capacidade de abertura e fechamento (gating) e seletividade. Inicialmente fazemos uma breve apresentação da equação de Fokker- Planck mostrando sua relação com a equação de Langevin e os métodos de solução para diferentes modelos. Dentre os modelos mencionados focamos a adoção de diferentes dependências temporais no termo referente ao drift e no coeficiente de difusão. Para estes casos as soluções foram obtidas por meio de um ansatz. Em seguida, buscamos associar estes modelos matemáticos de EFP com a difusão através de canais iônicos, mas desconsiderando o gating. Esta associação é feita através da descrição da mudança de potencial na membrana plasmática quando íons fluem entre o meio interno e externo da célula. Outro aspecto abordado em um dos modelos foi descrever a difusão quando há o fechamento do canal com o tempo. O resultado obtido para este exemplo foi comparado a dados da literatura. Por fim, apresentamos uma breve discussão sobre a equação de Fokker-Planck em um sistema de coordenadas cilíndricasThis work focus on the use of the Fokker-Planck equation (FPE) to describe the diffusion through ionic channels located in the cell membrane. The channels are responsible by the control of the ionic chemical equilibrium between the internal and external cell environment. The regulation of the chemical equilibrium is related to its capacity of opening and closing (gating) and its selectivity. Initially, we brief by present of the Fokker-Planck equation, where we show its relation with the Langevin equation and the methods of solution to different models. Among the models mentioned, we focus on adoption of different temporal dependence in the drift term and diffusion coefficient. The solutions for these cases are obtained by an ansatz that satisfies the boundary conditions of the models. We associate these mathematic models of FPE with diffusion through ionic channels without consider the gating process. This association is done describing the change of the membrane potential when there is diffusion of ions between the inside and outside of the cell. Another aspect described by one of the models is the diffusion when there is the closing of the channel with the time. The result obtained for this case is compared with results from the literature. Finally, we present a brief discussion of the Fokker-Planck equation in a cylindrical coordinate systemConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)87 f. : il., gráfs. tabs. color.porUniversidade Estadual Paulista (Unesp)Alephreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESPBiologia molecularBiofísicaFísica estatísticaProcesso estocasticoFokker-Planck, Equação deCanais ionicosAplicação da equação de Fokker-Planck no estudo de canais iônicosinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessBiofísica Molecular - IBILCEBiofísica MolecularUniversidade Estadual Paulista (UNESP), Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas, São José do Rio Preto3277957413291567Publication43c38943-bd6f-4fb6-a9a5-8482a1f632c0virtual::296830-143c38943-bd6f-4fb6-a9a5-8482a1f632c0virtual::296830-15fd779aa-d3ec-4c8d-8834-8c88dba98a9fvirtual::306288-15fd779aa-d3ec-4c8d-8834-8c88dba98a9fvirtual::306288-1ORIGINAL000846735.pdfapplication/pdf4178375https://repositorio.unesp.br/bitstreams/1cf0488b-bab8-430c-8c71-1d64a1088bf5/download0b48d653f6d0491f468566e9d47fc572MD51trueAnonymousREADTEXT000846735.pdf.txtWritten by FormatFilter org.dspace.app.mediafilter.TikaTextExtractionFilter on 2023-12-25T06:21:09Z (GMT).Extracted texttext/plain226166https://repositorio.unesp.br/bitstreams/f8e19a2b-13e9-4209-9785-bc50f2e5fa3a/download5ed3335247dafa7f494d119ddab04296MD54falseAnonymousREADTHUMBNAIL000846735.pdf.jpgWritten by FormatFilter org.dspace.app.mediafilter.ImageMagickPdfThumbnailFilter on 2016-11-17T02:00:56Z (GMT).IM Thumbnailimage/jpeg4066https://repositorio.unesp.br/bitstreams/d90fd712-9b5d-4448-a5b2-88784d103cf6/downloada8665f6a22cab112be0285113715cb36MD53falseAnonymousREAD11449/1278242026-08-04T05:01:23.883816Zopen.accessoai:repositorio.unesp.br:11449/127824https://repositorio.unesp.brRepositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestrepositoriounesp@unesp.bropendoar:29462026-08-04T05:01:23Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false
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