Equação de Fokker-Planck e enovelamento de proteínas
| Ano de defesa: | 2015 |
|---|---|
| Autor(a) principal: | |
| Orientador(a): | |
| Banca de defesa: | |
| Tipo de documento: | Tese |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Universidade Estadual Paulista (Unesp)
|
| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
|
| Departamento: |
Não Informado pela instituição
|
| País: |
Não Informado pela instituição
|
| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | http://hdl.handle.net/11449/127917 http://www.athena.biblioteca.unesp.br/exlibris/bd/cathedra/01-09-2015/000844436.pdf |
Resumo: | This work is presents a study of the Fokker-Planck equation using a polynomial function to simulate the free energy which is obtained from a fit of the values that emerge from computer simulations. Through a semi-analytical description, the Fokker-Planck equation is solved using its relationship with an equation of Schrödinger-type. It is used the supersymmetric quantum mechanics and the variational method. From the study of the probability distribution obtained for different profiles of free energy, it is possible to analyze the evolution of the system by varying the initial conditions and obtaining the characteristic time of the process |
| id |
UNSP_d856de5887d2625f1307205e88286e02 |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:repositorio.unesp.br:11449/127917 |
| network_acronym_str |
UNSP |
| network_name_str |
Repositório Institucional da UNESP |
| repository_id_str |
|
| spelling |
Equação de Fokker-Planck e enovelamento de proteínasBiologia molecularBiofísicaProteinas globularesFokker-Planck, Equação deDobramento de proteínaEquações diferenciais estocasticasThis work is presents a study of the Fokker-Planck equation using a polynomial function to simulate the free energy which is obtained from a fit of the values that emerge from computer simulations. Through a semi-analytical description, the Fokker-Planck equation is solved using its relationship with an equation of Schrödinger-type. It is used the supersymmetric quantum mechanics and the variational method. From the study of the probability distribution obtained for different profiles of free energy, it is possible to analyze the evolution of the system by varying the initial conditions and obtaining the characteristic time of the processO presente trabalho objetiva explorar a relação entre a equação de Fokker-Planck e a equação de Schrödinger para estudar o processo de enovelamento de proteínas a partir de potenciais obtidos dos valores de energia livre que emergem de simulações computacionais. A dinâmica do processo de enovelamento de proteínas é estudada a partir da evolução temporal das equações analisadas. A partir do estudo da distribuição de probabilidade, obtida para diferentes perfis de energia livre, é possível analisar a evolução do sistema através da variação das condições iniciais e obtendo o tempo característico do processoFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)Universidade Estadual Paulista (Unesp)Drigo Filho, Elso [UNESP]Universidade Estadual Paulista (Unesp)Polotto, Franciele [UNESP]2015-09-17T15:26:30Z2015-09-17T15:26:30Z2015-05-28info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis64 f. : il. grafs. tabs. color.application/pdfPOLOTTO, Franciele. Equação de Fokker-Planck e enovelamento de proteínas. 2015. 64 f. Tese (doutorado) - Universidade Estadual Paulista Julio de Mesquita Filho, Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, 2015.http://hdl.handle.net/11449/127917000844436http://www.athena.biblioteca.unesp.br/exlibris/bd/cathedra/01-09-2015/000844436.pdf33004153068P93277957413291567Alephreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESPporinfo:eu-repo/semantics/openAccess2024-11-04T15:27:25Zoai:repositorio.unesp.br:11449/127917Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestrepositoriounesp@unesp.bropendoar:29462024-11-04T15:27:25Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false |
| dc.title.none.fl_str_mv |
Equação de Fokker-Planck e enovelamento de proteínas |
| title |
Equação de Fokker-Planck e enovelamento de proteínas |
| spellingShingle |
Equação de Fokker-Planck e enovelamento de proteínas Polotto, Franciele [UNESP] Biologia molecular Biofísica Proteinas globulares Fokker-Planck, Equação de Dobramento de proteína Equações diferenciais estocasticas |
| title_short |
Equação de Fokker-Planck e enovelamento de proteínas |
| title_full |
Equação de Fokker-Planck e enovelamento de proteínas |
| title_fullStr |
Equação de Fokker-Planck e enovelamento de proteínas |
| title_full_unstemmed |
Equação de Fokker-Planck e enovelamento de proteínas |
| title_sort |
Equação de Fokker-Planck e enovelamento de proteínas |
| author |
Polotto, Franciele [UNESP] |
| author_facet |
Polotto, Franciele [UNESP] |
| author_role |
author |
| dc.contributor.none.fl_str_mv |
Drigo Filho, Elso [UNESP] Universidade Estadual Paulista (Unesp) |
| dc.contributor.author.fl_str_mv |
Polotto, Franciele [UNESP] |
| dc.subject.por.fl_str_mv |
Biologia molecular Biofísica Proteinas globulares Fokker-Planck, Equação de Dobramento de proteína Equações diferenciais estocasticas |
| topic |
Biologia molecular Biofísica Proteinas globulares Fokker-Planck, Equação de Dobramento de proteína Equações diferenciais estocasticas |
| description |
This work is presents a study of the Fokker-Planck equation using a polynomial function to simulate the free energy which is obtained from a fit of the values that emerge from computer simulations. Through a semi-analytical description, the Fokker-Planck equation is solved using its relationship with an equation of Schrödinger-type. It is used the supersymmetric quantum mechanics and the variational method. From the study of the probability distribution obtained for different profiles of free energy, it is possible to analyze the evolution of the system by varying the initial conditions and obtaining the characteristic time of the process |
| publishDate |
2015 |
| dc.date.none.fl_str_mv |
2015-09-17T15:26:30Z 2015-09-17T15:26:30Z 2015-05-28 |
| dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
| format |
doctoralThesis |
| status_str |
publishedVersion |
| dc.identifier.uri.fl_str_mv |
POLOTTO, Franciele. Equação de Fokker-Planck e enovelamento de proteínas. 2015. 64 f. Tese (doutorado) - Universidade Estadual Paulista Julio de Mesquita Filho, Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, 2015. http://hdl.handle.net/11449/127917 000844436 http://www.athena.biblioteca.unesp.br/exlibris/bd/cathedra/01-09-2015/000844436.pdf 33004153068P9 3277957413291567 |
| identifier_str_mv |
POLOTTO, Franciele. Equação de Fokker-Planck e enovelamento de proteínas. 2015. 64 f. Tese (doutorado) - Universidade Estadual Paulista Julio de Mesquita Filho, Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, 2015. 000844436 33004153068P9 3277957413291567 |
| url |
http://hdl.handle.net/11449/127917 http://www.athena.biblioteca.unesp.br/exlibris/bd/cathedra/01-09-2015/000844436.pdf |
| dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
| language |
por |
| dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| dc.format.none.fl_str_mv |
64 f. : il. grafs. tabs. color. application/pdf |
| dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Estadual Paulista (Unesp) |
| publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Estadual Paulista (Unesp) |
| dc.source.none.fl_str_mv |
Aleph reponame:Repositório Institucional da UNESP instname:Universidade Estadual Paulista (UNESP) instacron:UNESP |
| instname_str |
Universidade Estadual Paulista (UNESP) |
| instacron_str |
UNESP |
| institution |
UNESP |
| reponame_str |
Repositório Institucional da UNESP |
| collection |
Repositório Institucional da UNESP |
| repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP) |
| repository.mail.fl_str_mv |
repositoriounesp@unesp.br |
| _version_ |
1854954423880515584 |