Equação de Fokker-Planck e enovelamento de proteínas

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2015
Autor(a) principal: Polotto, Franciele [UNESP]
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: http://hdl.handle.net/11449/127917
http://www.athena.biblioteca.unesp.br/exlibris/bd/cathedra/01-09-2015/000844436.pdf
Resumo: This work is presents a study of the Fokker-Planck equation using a polynomial function to simulate the free energy which is obtained from a fit of the values that emerge from computer simulations. Through a semi-analytical description, the Fokker-Planck equation is solved using its relationship with an equation of Schrödinger-type. It is used the supersymmetric quantum mechanics and the variational method. From the study of the probability distribution obtained for different profiles of free energy, it is possible to analyze the evolution of the system by varying the initial conditions and obtaining the characteristic time of the process
id UNSP_d856de5887d2625f1307205e88286e02
oai_identifier_str oai:repositorio.unesp.br:11449/127917
network_acronym_str UNSP
network_name_str Repositório Institucional da UNESP
repository_id_str
spelling Equação de Fokker-Planck e enovelamento de proteínasBiologia molecularBiofísicaProteinas globularesFokker-Planck, Equação deDobramento de proteínaEquações diferenciais estocasticasThis work is presents a study of the Fokker-Planck equation using a polynomial function to simulate the free energy which is obtained from a fit of the values that emerge from computer simulations. Through a semi-analytical description, the Fokker-Planck equation is solved using its relationship with an equation of Schrödinger-type. It is used the supersymmetric quantum mechanics and the variational method. From the study of the probability distribution obtained for different profiles of free energy, it is possible to analyze the evolution of the system by varying the initial conditions and obtaining the characteristic time of the processO presente trabalho objetiva explorar a relação entre a equação de Fokker-Planck e a equação de Schrödinger para estudar o processo de enovelamento de proteínas a partir de potenciais obtidos dos valores de energia livre que emergem de simulações computacionais. A dinâmica do processo de enovelamento de proteínas é estudada a partir da evolução temporal das equações analisadas. A partir do estudo da distribuição de probabilidade, obtida para diferentes perfis de energia livre, é possível analisar a evolução do sistema através da variação das condições iniciais e obtendo o tempo característico do processoFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)Universidade Estadual Paulista (Unesp)Drigo Filho, Elso [UNESP]Universidade Estadual Paulista (Unesp)Polotto, Franciele [UNESP]2015-09-17T15:26:30Z2015-09-17T15:26:30Z2015-05-28info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis64 f. : il. grafs. tabs. color.application/pdfPOLOTTO, Franciele. Equação de Fokker-Planck e enovelamento de proteínas. 2015. 64 f. Tese (doutorado) - Universidade Estadual Paulista Julio de Mesquita Filho, Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, 2015.http://hdl.handle.net/11449/127917000844436http://www.athena.biblioteca.unesp.br/exlibris/bd/cathedra/01-09-2015/000844436.pdf33004153068P93277957413291567Alephreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESPporinfo:eu-repo/semantics/openAccess2024-11-04T15:27:25Zoai:repositorio.unesp.br:11449/127917Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestrepositoriounesp@unesp.bropendoar:29462024-11-04T15:27:25Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false
dc.title.none.fl_str_mv Equação de Fokker-Planck e enovelamento de proteínas
title Equação de Fokker-Planck e enovelamento de proteínas
spellingShingle Equação de Fokker-Planck e enovelamento de proteínas
Polotto, Franciele [UNESP]
Biologia molecular
Biofísica
Proteinas globulares
Fokker-Planck, Equação de
Dobramento de proteína
Equações diferenciais estocasticas
title_short Equação de Fokker-Planck e enovelamento de proteínas
title_full Equação de Fokker-Planck e enovelamento de proteínas
title_fullStr Equação de Fokker-Planck e enovelamento de proteínas
title_full_unstemmed Equação de Fokker-Planck e enovelamento de proteínas
title_sort Equação de Fokker-Planck e enovelamento de proteínas
author Polotto, Franciele [UNESP]
author_facet Polotto, Franciele [UNESP]
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Drigo Filho, Elso [UNESP]
Universidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.contributor.author.fl_str_mv Polotto, Franciele [UNESP]
dc.subject.por.fl_str_mv Biologia molecular
Biofísica
Proteinas globulares
Fokker-Planck, Equação de
Dobramento de proteína
Equações diferenciais estocasticas
topic Biologia molecular
Biofísica
Proteinas globulares
Fokker-Planck, Equação de
Dobramento de proteína
Equações diferenciais estocasticas
description This work is presents a study of the Fokker-Planck equation using a polynomial function to simulate the free energy which is obtained from a fit of the values that emerge from computer simulations. Through a semi-analytical description, the Fokker-Planck equation is solved using its relationship with an equation of Schrödinger-type. It is used the supersymmetric quantum mechanics and the variational method. From the study of the probability distribution obtained for different profiles of free energy, it is possible to analyze the evolution of the system by varying the initial conditions and obtaining the characteristic time of the process
publishDate 2015
dc.date.none.fl_str_mv 2015-09-17T15:26:30Z
2015-09-17T15:26:30Z
2015-05-28
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv POLOTTO, Franciele. Equação de Fokker-Planck e enovelamento de proteínas. 2015. 64 f. Tese (doutorado) - Universidade Estadual Paulista Julio de Mesquita Filho, Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, 2015.
http://hdl.handle.net/11449/127917
000844436
http://www.athena.biblioteca.unesp.br/exlibris/bd/cathedra/01-09-2015/000844436.pdf
33004153068P9
3277957413291567
identifier_str_mv POLOTTO, Franciele. Equação de Fokker-Planck e enovelamento de proteínas. 2015. 64 f. Tese (doutorado) - Universidade Estadual Paulista Julio de Mesquita Filho, Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, 2015.
000844436
33004153068P9
3277957413291567
url http://hdl.handle.net/11449/127917
http://www.athena.biblioteca.unesp.br/exlibris/bd/cathedra/01-09-2015/000844436.pdf
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 64 f. : il. grafs. tabs. color.
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
publisher.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.source.none.fl_str_mv Aleph
reponame:Repositório Institucional da UNESP
instname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron:UNESP
instname_str Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron_str UNESP
institution UNESP
reponame_str Repositório Institucional da UNESP
collection Repositório Institucional da UNESP
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)
repository.mail.fl_str_mv repositoriounesp@unesp.br
_version_ 1854954423880515584