Exportação concluída — 

Estudo de complexos de vanádio 51V em solução por dinâmica molecular ab initio e cálculos relativísticos de RMN

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2025
Autor(a) principal: Rodrigues, Eduardo Alves
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
DFT
NMR
RMN
Link de acesso: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46136/tde-13062025-113710/
Resumo: Esta dissertação aborda a questão do efeito da adoção de um modelo de solvatação mais realista e de correções relativísticas sobre os valores de deslocamento químico (δ51V) em diferentes complexos de vanádio, cujos compostos apresentam o metal em questão na forma de bisperoxovanádio [VO(O2)2L]-, com grupos peroxo (—O—O—) ligados em ponte, um grupo oxo (=O) ligado axialmente e L sendo outros grupos químicos que interagem com o centro metálico, em que L=Ah (Alanina-Histidina), L-Prolina, 4-Metilimidazol, Histidina e Carnosina. Para este fim, foram combinadas as técnicas de Dinâmica Molecular de CarParrinello (CPMD) e a Teoria do Funcional de Densidade (DFT) para descrever as interações soluto-solvente e explorar e quantificar os efeitos das correções relativísticas através dos valores de δ. Para verificar as contribuições dos orbitais sobre a propriedade magnética, empregou-se a análise de Orbitais de Ligação Natural (NBO). Os valores estáticos calculados de δ superestimaram os valores experimentais em até 17% ao incluir um modelo de solvata- ção implícita. Ao mesmo tempo, os valores de δ com as correções relativísticas apresentaram uma diferença de, no máximo, 3%. Nos valores dinâmicos de δ, a inclusão do efeito de solvatação explícita através das simulações de CPMD resultou em uma leve superestimação em relação aos valores estáticos, melhorando os resultados de alguns adutos e, em alguns casos, indicando uma tendência oposta à esperada através da influência direta e indireta do solvente. Nos efeitos relativísticos, a observação feita para os valores estáticos também se estendeu para os valores dinâmicos. Assim, os cálculos dinâmicos mostraram que o conjunto de 10 moléculas de água mais o modelo COSMO de solvatação implícita, no nível teórico PBE0 SR foram suficientes para descrever os dados representativos da metodologia proposta. Nas NBOs, apenas uma espécie mostrou contribuições significativas provenientes de duas NBOs, enquanto os outros adutos apresentaram contribuições distribuídas ao longo das decomposições. Além disso, três diferentes NBOs, comuns para todos os adutos, exibiram um comportamento irregular com relação à natureza diamagnética/paramagnética, explicado através do Modelo de Rotação de Orbitais.
id USP_be90204ea28497841fb0d590f246c425
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-13062025-113710
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str
spelling Estudo de complexos de vanádio 51V em solução por dinâmica molecular ab initio e cálculos relativísticos de RMNExploring vanadium 51V solution complexes using ab initio molecular dynamics and NMR relativistic calculationsab initio Molecular DynamicsCálculos relativísticosChemical ShiftDeslocamento QuímicoDFTDFTDinâmica Molecular ab initioNMRRelativistic calculationsRMNVanádioVanadiumEsta dissertação aborda a questão do efeito da adoção de um modelo de solvatação mais realista e de correções relativísticas sobre os valores de deslocamento químico (δ51V) em diferentes complexos de vanádio, cujos compostos apresentam o metal em questão na forma de bisperoxovanádio [VO(O2)2L]-, com grupos peroxo (—O—O—) ligados em ponte, um grupo oxo (=O) ligado axialmente e L sendo outros grupos químicos que interagem com o centro metálico, em que L=Ah (Alanina-Histidina), L-Prolina, 4-Metilimidazol, Histidina e Carnosina. Para este fim, foram combinadas as técnicas de Dinâmica Molecular de CarParrinello (CPMD) e a Teoria do Funcional de Densidade (DFT) para descrever as interações soluto-solvente e explorar e quantificar os efeitos das correções relativísticas através dos valores de δ. Para verificar as contribuições dos orbitais sobre a propriedade magnética, empregou-se a análise de Orbitais de Ligação Natural (NBO). Os valores estáticos calculados de δ superestimaram os valores experimentais em até 17% ao incluir um modelo de solvata- ção implícita. Ao mesmo tempo, os valores de δ com as correções relativísticas apresentaram uma diferença de, no máximo, 3%. Nos valores dinâmicos de δ, a inclusão do efeito de solvatação explícita através das simulações de CPMD resultou em uma leve superestimação em relação aos valores estáticos, melhorando os resultados de alguns adutos e, em alguns casos, indicando uma tendência oposta à esperada através da influência direta e indireta do solvente. Nos efeitos relativísticos, a observação feita para os valores estáticos também se estendeu para os valores dinâmicos. Assim, os cálculos dinâmicos mostraram que o conjunto de 10 moléculas de água mais o modelo COSMO de solvatação implícita, no nível teórico PBE0 SR foram suficientes para descrever os dados representativos da metodologia proposta. Nas NBOs, apenas uma espécie mostrou contribuições significativas provenientes de duas NBOs, enquanto os outros adutos apresentaram contribuições distribuídas ao longo das decomposições. Além disso, três diferentes NBOs, comuns para todos os adutos, exibiram um comportamento irregular com relação à natureza diamagnética/paramagnética, explicado através do Modelo de Rotação de Orbitais.This dissertation addresses the effect of adopting a more realistic solvation model and relativistic corrections on the chemical shift values (δ51V) in different vanadium complexes, whose compounds presents the refered metal as bisperoxovanadium [VO(O2)2L]-, with peroxo groups as bridging ligands (—O—O—), an oxo group as axial ligand and L being other chemical groups that interact with the adduct, where L=Ah (Alanyl-Histidine), L-Proline, 4-Methylimidazole, Histidine and Carnosine. To achieve this goal, the Car-Parrinello Molecular Dynamics (CPMD) and Density Functional Theory (DFT) techniques were combined to describe the solvent-solute organization and explore and quantify through chemical shift values the relativistic corrections effects. The Natural Bond Orbital (NBO) was used to verify the orbitals contribuitions to the magnetic properties. The δ static values overestimated the experimental values up to 17 % when including a implicit solvation model. At the same time, the included relativistic corrections showed no significative differences, with values up to 3%. In the δ dynamic values, the inclusion of the explicit solvation through CPMD simulations resulted in a slight overestimation in relation to the static values, improving the results of some adducts and, in some cases, indicating a trend opposite to that expected through the direct and indirect influence of the solvent. Thus, the dynamic calculations showed that 10 molecules of the water solvent plus the COSMO implicit solvation model, at the PBE0 SR theoretical level were sufficient to describe the representative data of the proposed methodology. In NBOs, only one species showed significant contribuitions originating from two NBOs, while the other adducts presented contribuitions distributed throughout the decompositions. Furthermore, irregular behavior was observed regarding the signal and the diamagnetic/paramagnetic nature over three different NBO, common to all the adducts. This was explained by the Orbital Rotation Model.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPDucati, Lucas ColucciRodrigues, Eduardo Alves2025-04-04info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46136/tde-13062025-113710/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2025-07-16T20:36:02Zoai:teses.usp.br:tde-13062025-113710Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212025-07-16T20:36:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Estudo de complexos de vanádio 51V em solução por dinâmica molecular ab initio e cálculos relativísticos de RMN
Exploring vanadium 51V solution complexes using ab initio molecular dynamics and NMR relativistic calculations
title Estudo de complexos de vanádio 51V em solução por dinâmica molecular ab initio e cálculos relativísticos de RMN
spellingShingle Estudo de complexos de vanádio 51V em solução por dinâmica molecular ab initio e cálculos relativísticos de RMN
Rodrigues, Eduardo Alves
ab initio Molecular Dynamics
Cálculos relativísticos
Chemical Shift
Deslocamento Químico
DFT
DFT
Dinâmica Molecular ab initio
NMR
Relativistic calculations
RMN
Vanádio
Vanadium
title_short Estudo de complexos de vanádio 51V em solução por dinâmica molecular ab initio e cálculos relativísticos de RMN
title_full Estudo de complexos de vanádio 51V em solução por dinâmica molecular ab initio e cálculos relativísticos de RMN
title_fullStr Estudo de complexos de vanádio 51V em solução por dinâmica molecular ab initio e cálculos relativísticos de RMN
title_full_unstemmed Estudo de complexos de vanádio 51V em solução por dinâmica molecular ab initio e cálculos relativísticos de RMN
title_sort Estudo de complexos de vanádio 51V em solução por dinâmica molecular ab initio e cálculos relativísticos de RMN
author Rodrigues, Eduardo Alves
author_facet Rodrigues, Eduardo Alves
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Ducati, Lucas Colucci
dc.contributor.author.fl_str_mv Rodrigues, Eduardo Alves
dc.subject.por.fl_str_mv ab initio Molecular Dynamics
Cálculos relativísticos
Chemical Shift
Deslocamento Químico
DFT
DFT
Dinâmica Molecular ab initio
NMR
Relativistic calculations
RMN
Vanádio
Vanadium
topic ab initio Molecular Dynamics
Cálculos relativísticos
Chemical Shift
Deslocamento Químico
DFT
DFT
Dinâmica Molecular ab initio
NMR
Relativistic calculations
RMN
Vanádio
Vanadium
description Esta dissertação aborda a questão do efeito da adoção de um modelo de solvatação mais realista e de correções relativísticas sobre os valores de deslocamento químico (δ51V) em diferentes complexos de vanádio, cujos compostos apresentam o metal em questão na forma de bisperoxovanádio [VO(O2)2L]-, com grupos peroxo (—O—O—) ligados em ponte, um grupo oxo (=O) ligado axialmente e L sendo outros grupos químicos que interagem com o centro metálico, em que L=Ah (Alanina-Histidina), L-Prolina, 4-Metilimidazol, Histidina e Carnosina. Para este fim, foram combinadas as técnicas de Dinâmica Molecular de CarParrinello (CPMD) e a Teoria do Funcional de Densidade (DFT) para descrever as interações soluto-solvente e explorar e quantificar os efeitos das correções relativísticas através dos valores de δ. Para verificar as contribuições dos orbitais sobre a propriedade magnética, empregou-se a análise de Orbitais de Ligação Natural (NBO). Os valores estáticos calculados de δ superestimaram os valores experimentais em até 17% ao incluir um modelo de solvata- ção implícita. Ao mesmo tempo, os valores de δ com as correções relativísticas apresentaram uma diferença de, no máximo, 3%. Nos valores dinâmicos de δ, a inclusão do efeito de solvatação explícita através das simulações de CPMD resultou em uma leve superestimação em relação aos valores estáticos, melhorando os resultados de alguns adutos e, em alguns casos, indicando uma tendência oposta à esperada através da influência direta e indireta do solvente. Nos efeitos relativísticos, a observação feita para os valores estáticos também se estendeu para os valores dinâmicos. Assim, os cálculos dinâmicos mostraram que o conjunto de 10 moléculas de água mais o modelo COSMO de solvatação implícita, no nível teórico PBE0 SR foram suficientes para descrever os dados representativos da metodologia proposta. Nas NBOs, apenas uma espécie mostrou contribuições significativas provenientes de duas NBOs, enquanto os outros adutos apresentaram contribuições distribuídas ao longo das decomposições. Além disso, três diferentes NBOs, comuns para todos os adutos, exibiram um comportamento irregular com relação à natureza diamagnética/paramagnética, explicado através do Modelo de Rotação de Orbitais.
publishDate 2025
dc.date.none.fl_str_mv 2025-04-04
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46136/tde-13062025-113710/
url https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46136/tde-13062025-113710/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1844786334502223872