Análise da atividade transcricional dos promotores precoces de E6 e E7 de diferentes variantes dos HPVs 6 e 11 durante a diferenciação celular
| Ano de defesa: | 2025 |
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| Tipo de documento: | Tese |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
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| Instituição de defesa: |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
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| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5155/tde-25032026-122526/ |
Resumo: | Os papilomavírus humanos (HPV) são um grupo de vírus que infectam epitélios mucoso e cutâneo e cujo genoma dupla fita possui uma região não codificante, responsável pela regulação da transcrição e replicação viral (LCR). O ciclo de vida do HPV está intimamente ligado ao programa de diferenciação do epitélio hospedeiro. Os mecanismos que controlam esta sincronização se devem em parte à composição variável dos sítios de ligação dos fatores de transcrição (FTs) na LCR viral e à expressão diferencial desses fatores entre as diferentes camadas de epitélio estratificado. Embora os HPVs de baixo risco oncogênico (LR-HPV) sejam considerados não carcinogênicos para humanos, as infecções por LR-HPV apresentam importantes implicações clínicas, com elevados custos para a saúde. LR-HPVs possuem três promotores precoces (P90, P270 e P680) responsáveis pela regulação diferencial dos transcritos E6, E7 e E1^E4, respectivamente, através das camadas epiteliais, indicando que a regulação independente é importante para o ciclo de vida viral. Até o momento, poucos trabalhos abordaram a expressão gênica de LR-HPV no contexto dos diferentes estágios do ciclo de vida viral. Pelo exposto, este estudo teve como objetivo investigar a atividade transcricional dos promotores precoces P90 e P270 de HPV-6 e HPV-11 durante a diferenciação celular. Para isso, construíram-se vetores recombinantes contendo as sequencências das LCRs destes vírus até os promotores P90 ou P270, os quais foram utilizados em ensaios de transfecção em células C-33A e HaCat. Inicialmente, ensaios de transfecção em larga escala com 498 fatores de transcrição (FTs) identificaram 212 FTs que impactavam a atividade transcricional de pelo menos um dos promotores precoces em ao menos um dos tipos virais estudados. Análises in silico dos sítios de ligação putativos desses fatores, aliadas à revisão da literatura, permitiram a seleção de oito fatores de transcrição para os ensaios de validação dose-dependente: MAFB, CTNNB1, FOS, FOXA1, HEY1, LMO4, SFRS2 e TP53. Nestes ensaios, MAFB apresentou tendência à repressão do promotor P90 e à ativação do P270; HEY e CTNNB1 inibiram apenas P270, enquanto TP53, LMO4 e SFRS2 inibiram ambos os promotores. FOS e FOXA1 ativaram ambos os promotores. Em ensaios de validação diferenciação-dependente realizados com MAFB, não foi possível observar diferenças nas atividades transcricionais dos promotores P90 e P270. Entretanto, foi possível observar que a atividade dos promotores tende a se intensificar nas células diferenciadas. Esses achados ampliam o conhecimento sobre a regulação transcricional dos promotores precoces de HPVs de baixo risco, evidenciando que fatores celulares específicos podem modular o ciclo de vida viral durante a diferenciação epitelial, o que poderá orientar futuras estratégias diagnósticas e terapêuticas. |
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Análise da atividade transcricional dos promotores precoces de E6 e E7 de diferentes variantes dos HPVs 6 e 11 durante a diferenciação celularTranscriptional analysis of E6 and E7 early promoters from different variants of HPVs 6 and 11 during cellular differentiationCell differentiationDiferenciação celularFatores de transcriçãoHuman papillomavirus 11Human papillomavirus 6Papilomavírus humano 11Papilomavírus humano 6Regulação transcricionalTranscription factorsTranscriptional regulationOs papilomavírus humanos (HPV) são um grupo de vírus que infectam epitélios mucoso e cutâneo e cujo genoma dupla fita possui uma região não codificante, responsável pela regulação da transcrição e replicação viral (LCR). O ciclo de vida do HPV está intimamente ligado ao programa de diferenciação do epitélio hospedeiro. Os mecanismos que controlam esta sincronização se devem em parte à composição variável dos sítios de ligação dos fatores de transcrição (FTs) na LCR viral e à expressão diferencial desses fatores entre as diferentes camadas de epitélio estratificado. Embora os HPVs de baixo risco oncogênico (LR-HPV) sejam considerados não carcinogênicos para humanos, as infecções por LR-HPV apresentam importantes implicações clínicas, com elevados custos para a saúde. LR-HPVs possuem três promotores precoces (P90, P270 e P680) responsáveis pela regulação diferencial dos transcritos E6, E7 e E1^E4, respectivamente, através das camadas epiteliais, indicando que a regulação independente é importante para o ciclo de vida viral. Até o momento, poucos trabalhos abordaram a expressão gênica de LR-HPV no contexto dos diferentes estágios do ciclo de vida viral. Pelo exposto, este estudo teve como objetivo investigar a atividade transcricional dos promotores precoces P90 e P270 de HPV-6 e HPV-11 durante a diferenciação celular. Para isso, construíram-se vetores recombinantes contendo as sequencências das LCRs destes vírus até os promotores P90 ou P270, os quais foram utilizados em ensaios de transfecção em células C-33A e HaCat. Inicialmente, ensaios de transfecção em larga escala com 498 fatores de transcrição (FTs) identificaram 212 FTs que impactavam a atividade transcricional de pelo menos um dos promotores precoces em ao menos um dos tipos virais estudados. Análises in silico dos sítios de ligação putativos desses fatores, aliadas à revisão da literatura, permitiram a seleção de oito fatores de transcrição para os ensaios de validação dose-dependente: MAFB, CTNNB1, FOS, FOXA1, HEY1, LMO4, SFRS2 e TP53. Nestes ensaios, MAFB apresentou tendência à repressão do promotor P90 e à ativação do P270; HEY e CTNNB1 inibiram apenas P270, enquanto TP53, LMO4 e SFRS2 inibiram ambos os promotores. FOS e FOXA1 ativaram ambos os promotores. Em ensaios de validação diferenciação-dependente realizados com MAFB, não foi possível observar diferenças nas atividades transcricionais dos promotores P90 e P270. Entretanto, foi possível observar que a atividade dos promotores tende a se intensificar nas células diferenciadas. Esses achados ampliam o conhecimento sobre a regulação transcricional dos promotores precoces de HPVs de baixo risco, evidenciando que fatores celulares específicos podem modular o ciclo de vida viral durante a diferenciação epitelial, o que poderá orientar futuras estratégias diagnósticas e terapêuticas.Human papillomaviruses (HPVs) are a group of viruses that infect mucosal and cutaneous epithelia, and whose double-stranded DNA genome contains a non-coding regionlong control region (LCR)responsible for regulating viral transcription and replication. The HPV life cycle is tightly linked to the host epithelial differentiation program. This synchronization is partially governed by the diverse repertoire of transcription factor (TF) binding sites within the LCR and the differential expression of these TFs across the stratified epithelium. Although low-risk HPVs (LR-HPVs) are considered non-carcinogenic, LR-HPV infections carry significant clinical implications and pose substantial healthcare costs. LR-HPVs presents three early promoters (P90, P270, and P680), which independently regulate across the epithelial layers the expression of E6, E7, and E1^E4 transcripts, respectively, demonstrating the importance of their independent regulation for the viral life cycle. To date, few studies have addressed LR-HPV gene expression in the context of different stages of the viral life cycle. In this manner, the aim of this study was to investigate the transcriptional activity of the early promoters P90 and P270 of HPV-6 and HPV 11 during cellular differentiation. Recombinant vectors were constructed containing the LCR sequences of these viruses up to the P90 or P270 promoters, which were then used in transfection assays in C-33A and HaCat cells. A high-throughput transfection screening with 498 TFs identified 212 TFs that modulated the transcriptional activity of at least one early promoter in one or both viral types. In silico analysis of putative TF binding sites, along with literature review, led to the selection of eight TFs for dose-dependent validation assays: MAFB, CTNNB1, FOS, FOXA1, HEY1, LMO4, SFRS2, and TP53. In these assays, MAFB showed a trend toward P90 repression and P270 activation; HEY1 and CTNNB1 inhibited P270, while TP53, LMO4, and SFRS2 repressed both promoters. FOS and FOXA1 activated both P90 and P270. In differentiation-dependent validation assays performed with MAFB, no differential promoter activity was observed. However, promoter activity tended to increase in differentiated cells. These findings broaden the understanding of the transcriptional regulation of the early promoters of low risk HPVs, highlighting that specific cellular factors may modulate the viral life cycle during epithelial differentiation, which could guide future diagnostic and therapeutic strategies.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPPierulivo, Enrique Mario BoccardoVettorazzo, Laura Cristina SicheroCaodaglio, Amanda Schiersner2025-11-24info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5155/tde-25032026-122526/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2026-03-25T15:35:02Zoai:teses.usp.br:tde-25032026-122526Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212026-03-25T15:35:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
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Os papilomavírus humanos (HPV) são um grupo de vírus que infectam epitélios mucoso e cutâneo e cujo genoma dupla fita possui uma região não codificante, responsável pela regulação da transcrição e replicação viral (LCR). O ciclo de vida do HPV está intimamente ligado ao programa de diferenciação do epitélio hospedeiro. Os mecanismos que controlam esta sincronização se devem em parte à composição variável dos sítios de ligação dos fatores de transcrição (FTs) na LCR viral e à expressão diferencial desses fatores entre as diferentes camadas de epitélio estratificado. Embora os HPVs de baixo risco oncogênico (LR-HPV) sejam considerados não carcinogênicos para humanos, as infecções por LR-HPV apresentam importantes implicações clínicas, com elevados custos para a saúde. LR-HPVs possuem três promotores precoces (P90, P270 e P680) responsáveis pela regulação diferencial dos transcritos E6, E7 e E1^E4, respectivamente, através das camadas epiteliais, indicando que a regulação independente é importante para o ciclo de vida viral. Até o momento, poucos trabalhos abordaram a expressão gênica de LR-HPV no contexto dos diferentes estágios do ciclo de vida viral. Pelo exposto, este estudo teve como objetivo investigar a atividade transcricional dos promotores precoces P90 e P270 de HPV-6 e HPV-11 durante a diferenciação celular. Para isso, construíram-se vetores recombinantes contendo as sequencências das LCRs destes vírus até os promotores P90 ou P270, os quais foram utilizados em ensaios de transfecção em células C-33A e HaCat. Inicialmente, ensaios de transfecção em larga escala com 498 fatores de transcrição (FTs) identificaram 212 FTs que impactavam a atividade transcricional de pelo menos um dos promotores precoces em ao menos um dos tipos virais estudados. Análises in silico dos sítios de ligação putativos desses fatores, aliadas à revisão da literatura, permitiram a seleção de oito fatores de transcrição para os ensaios de validação dose-dependente: MAFB, CTNNB1, FOS, FOXA1, HEY1, LMO4, SFRS2 e TP53. Nestes ensaios, MAFB apresentou tendência à repressão do promotor P90 e à ativação do P270; HEY e CTNNB1 inibiram apenas P270, enquanto TP53, LMO4 e SFRS2 inibiram ambos os promotores. FOS e FOXA1 ativaram ambos os promotores. Em ensaios de validação diferenciação-dependente realizados com MAFB, não foi possível observar diferenças nas atividades transcricionais dos promotores P90 e P270. Entretanto, foi possível observar que a atividade dos promotores tende a se intensificar nas células diferenciadas. Esses achados ampliam o conhecimento sobre a regulação transcricional dos promotores precoces de HPVs de baixo risco, evidenciando que fatores celulares específicos podem modular o ciclo de vida viral durante a diferenciação epitelial, o que poderá orientar futuras estratégias diagnósticas e terapêuticas. |
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