Dinâmica epidemiológica, genômica e espacial do SARS-CoV-2 no estado da Paraíba de 2020 a 2024

• Ano de defesa: 2026
• Autor(a) principal: Carneiro, Thiago Franco de Oliveira
• Orientador(a): Bezerra, João Felipe
• Banca de defesa: Gurgel, Ana Pavla Almeida Diniz , Silva, Maria Angélica Ramos da
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Federal da Paraíba; 24001015057P0
• Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular
• Departamento: Biologia Celular e Molecular
• País: Brasil
• Palavras-chave em Português: SARS-CoV-2; Vigilância genômica; Epidemiologia molecular; Evolução viral; Genomic surveillance; Molecular epidemiology; Viral evolution
• Área do conhecimento CNPq: CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL
• Link de acesso: https://repositorio.ufpb.br/jspui/handle/123456789/39187

A pandemia de COVID-19 representou um dos maiores desafios sanitários do século XXI, destacando a relevância da vigilância epidemiológica e genômica para o monitoramento da transmissão e da evolução do SARS-CoV-2. Este estudo teve como objetivo analisar, de forma integrada, a dinâmica epidemiológica e molecular da COVID-19 no estado da Paraíba, no período de março de 2020 a dezembro de 2024. Trata-se de um estudo observacional, ecológico, de delineamento misto (retrospectivo e prospectivo), com abordagem quantitativa, baseado na análise de dados secundários de vigilância epidemiológica e genômica, bem como na produção primária de dados genômicos do SARS-CoV-2. Foram utilizados dados de casos e óbitos provenientes dos sistemas SIVEP-Gripe e e-SUS Notifica, além de genomas depositados na plataforma GISAID. No período analisado, foram registrados 727.242 casos confirmados de COVID-19 e 10.690 óbitos no estado. Do total de casos, 591.470 (81,33%) foram confirmados por critério laboratorial. Entre 444.069 exames realizados por RT-PCR em tempo real, 140.460 apresentaram resultado detectável, correspondendo a uma taxa de positividade de 31,63%. A incidência acumulada anual foi de 4.752,58/100.000 habitantes em 2020, atingiu pico de 6.808,34/100.000 em 2021, reduziu para 5.878,46/100.000 em 2022 e caiu acentuadamente em 2023 (327,84/100.000) e 2024 (169,71/100.000). A vigilância genômica incluiu 4.114 genomas, provenientes de 174 municípios (78,03% do estado), dos quais 96,89% apresentaram cobertura superior a 95% do genoma viral. Observou-se substituição sucessiva das linhagens B.1 e descendentes pelas variantes de preocupação Gama, Delta e, posteriormente, Ômicron e suas sublinhagens. A predominância da variante Gama coincidiu com o período de maior impacto epidemiológico, com aumento acentuado de casos, óbitos e letalidade, enquanto a introdução da variante Ômicron, especialmente BA.1, esteve associada a aumento expressivo de casos sem elevação proporcional dos óbitos. Verificou-se maior letalidade entre indivíduos do sexo masculino, com 41% maior chance de óbito em relação ao sexo feminino (OR = 1,41; IC95%: 1,33–1,48), e forte associação entre aumento da idade e risco de morte, alcançando OR = 66,48 (IC95%: 56,76–77,90) na faixa etária de 80 anos ou mais. Apesar da ampla cobertura territorial e da elevada qualidade dos genomas, o tempo entre coleta e depósito das sequências no GISAID foi prolongado, com média de 113,49 dias e mediana de 66 dias (IIQ: 41–148), limitando sua aplicação para ações oportunas de saúde pública. Conclui-se que a integração entre vigilância epidemiológica e genômica foi fundamental para compreender a dinâmica da COVID-19 na Paraíba, evidenciando o papel das variantes virais, da imunidade populacional e das capacidades operacionais do sistema de saúde na modulação do impacto da pandemia. Os achados reforçam a necessidade de fortalecimento contínuo da vigilância genômica como estratégia essencial para o enfrentamento de futuras emergências sanitárias.